Pseudouridimycin

目录号: V32592 纯度: ≥98%
Pseudouridimycin (PUM) 是一种抗生素和选择性细菌 RNA 聚合酶 (RNAP) 抑制剂。
Pseudouridimycin CAS号: 1566586-52-4
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
100mg
Other Sizes
点击了解更多
  • 与全球5000+客户建立关系
  • 覆盖全球主要大学、医院、科研院所、生物/制药公司等
  • 产品被大量CNS顶刊文章引用
InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用
产品描述
假尿苷霉素(PUM)是一种抗生素和选择性细菌RNA聚合酶(RNAP)抑制剂。假尿苷霉素是一种C-核苷类似物,对革兰氏阴性菌(Gram-)和革兰氏阳性菌(Gram+)均有活性。
假尿苷霉素(CAS 1566586-52-4),又称PUM,是一种突破性的C-核苷类似物抗生素,通过微生物发酵从白色链霉菌(Streptomyces albus)中发现。其分子式为C17H26N8O9,分子量为486.44,代表了一类新型抗菌剂,能够选择性抑制细菌RNA聚合酶(RNAP)。由于其独特的抗菌机制以及对革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌均具有强大的活性,假尿苷霉素因其在对抗多重耐药病原体方面的潜力而备受关注。
生物活性&实验参考方法
靶点
Bacterial RNA polymerase (RNAP), specifically the enzyme's active site. Pseudouridimycin is a selective bacterial RNA polymerase inhibitor that competes with UTP for access to the RNAP active site, thereby blocking transcription initiation and bacterial growth. The compound does not inhibit mammalian RNA polymerases, making it a highly selective antibacterial agent. Its unique mechanism of action differs from traditional antibiotics, offering potential against drug-resistant strains.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,假尿苷霉素对多种革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌均具有强效抗菌活性。它能有效抑制细菌RNA聚合酶(RNAP),IC50值为0.1 uM,并能抑制细菌生长,IC50值范围为2至16 uM。该化合物通过与RNAP活性位点结合,阻止转录起始复合物的形成而发挥作用。其独特的化学结构和作用机制使其成为治疗细菌感染(尤其是多重耐药菌感染)的潜在候选药物。
体内研究 (In Vivo)
在体内,假尿苷霉素已在动物感染模型中显示出疗效。在小鼠化脓性链球菌腹膜炎模型中,静脉注射该化合物,剂量为3.2-50 mg/kg时可清除感染,其ED50为9 mg/kg。腹腔注射后,该化合物在雌性ICR小鼠体内也显示出抗菌活性。假尿苷霉素在体外培养中可抑制细菌生长,并在动物感染模型中显示出体内疗效,使其成为一种有前景的新型抗生素候选药物。
酶活实验
假尿苷霉素的体外RNA聚合酶抑制试验用于测定其对细菌RNA聚合酶(RNAP)酶活性的抑制作用。该试验使用重组细菌RNA聚合酶(核心酶或全酶)和带有荧光或放射性标记核苷酸底物的DNA模板。将化合物在试验缓冲液中进行系列稀释,并与酶预孵育15-30分钟。加入DNA模板和核苷酸启动反应,在37℃孵育后,通过荧光法、闪烁计数法或凝胶电泳法测定RNA合成情况。IC50值根据剂量-反应曲线计算得出。
细胞实验
按照CLSI指南,采用标准肉汤微量稀释法进行假尿素霉素的体外抗菌药物敏感性试验。将细菌菌株(革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌)培养至对数生长期中期。在96孔板中进行假尿素霉素的系列稀释,并加入细菌悬液,使最终浓度达到约5×10⁵ CFU/mL。将培养板置于37℃培养18-24小时。最小抑菌浓度(MIC)定义为抑制可见细菌生长的最低浓度。细菌生长抑制的IC50值根据剂量-反应曲线计算得出。
动物实验
假尿苷霉素的体内动物研究是在细菌感染的小鼠模型中进行的。在化脓性链球菌腹膜炎模型中,将4×10³ CFU的化脓性链球菌溶于0.5 mL含1%蛋白胨的生理盐水中,腹腔注射感染雌性ICR小鼠(23-25 g)。感染后10分钟和6小时分别静脉注射假尿苷霉素,剂量为3.2-50 mg/kg。监测小鼠的存活率和细菌清除情况。计算得出ED50为9 mg/kg。
药代性质 (ADME/PK)
假尿苷霉素的药代动力学特性已在临床前研究中得到表征。该化合物分子量为486.44,分子式为C17H26N8O9,可溶于二甲基亚砜(DMSO)。通常以粉末形式储存于-20℃,可保存长达3年;或以溶液形式储存于-80℃,可保存长达1年。该化合物的预测密度为1.91±0.1 g/cm3。在临床前动物模型中,可通过静脉和口服给药测定标准药代动力学参数(清除率、分布容积、半衰期和生物利用度)。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
假尿苷霉素仅供研究用途,不可用于人类治疗。处理化学品时应遵守标准安全预防措施。该化合物尚未获准用于临床。在进行临床开发之前,需要进行临床前毒性研究。
参考文献

[1]. Characterization of C-nucleoside Antimicrobials from Streptomyces albus DSM 40763: Strepturidin is Pseudouridimycin. Sci Rep. 2019 Jun 20;9(1):8935.

其他信息
假尿苷霉素是谷氨酰胺衍生物。据报道,链霉菌属和白纹伊氏链霉菌中均含有假尿苷霉素,相关数据可供参考。
假尿苷霉素是一种研究级C-核苷类似物抗生素,可选择性抑制细菌RNA聚合酶。其同义词包括PUM和(1S)-1,4-脱水-5-[(N-氨基甲酰甘氨酰-N2-羟基-L-谷氨酰)氨基]-5-脱氧-1-(2,4-二氧代-1,2,3,4-四氢-5-嘧啶基)-D-核糖醇。纯度通常≥95%。该化合物对革兰氏阴性菌和革兰氏阳性菌均有效,来源于链霉菌属。其独特的靶向细菌RNA聚合酶的作用机制使其成为治疗多重耐药感染的潜在候选药物。尚未获准用于临床。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C17H26N8O9
分子量
486.436542987823
精确质量
486.182
CAS号
1566586-52-4
PubChem CID
72792467
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
LogP
-5.9
tPSA
285
氢键供体(HBD)数目
9
氢键受体(HBA)数目
10
可旋转键数目(RBC)
10
重原子数目
34
分子复杂度/Complexity
903
定义原子立体中心数目
5
SMILES
O1[C@@H](C2=CNC(NC2=O)=O)[C@@H]([C@@H]([C@H]1CNC([C@H](CCC(N)=O)N(C(C/N=C(\N)/N)=O)O)=O)O)O
InChi Key
XDEYHXABZOKKDZ-YFKLLHAASA-N
InChi Code
InChI=1S/C17H26N8O9/c18-9(26)2-1-7(25(33)10(27)5-22-16(19)20)15(31)21-4-8-11(28)12(29)13(34-8)6-3-23-17(32)24-14(6)30/h3,7-8,11-13,28-29,33H,1-2,4-5H2,(H2,18,26)(H,21,31)(H4,19,20,22)(H2,23,24,30,32)/t7-,8+,11+,12+,13-/m0/s1
化学名
(2S)-2-[[2-(diaminomethylideneamino)acetyl]-hydroxyamino]-N-[[(2R,3S,4R,5S)-5-(2,4-dioxo-1H-pyrimidin-5-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl]pentanediamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
View More

注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
View More

口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.0558 mL 10.2788 mL 20.5575 mL
5 mM 0.4112 mL 2.0558 mL 4.1115 mL
10 mM 0.2056 mL 1.0279 mL 2.0558 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
+
+

计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们