RA-9

别名: RA9; RA 9; RA-9
目录号: V13569 纯度: ≥98%
RA-9是一种高效、选择性的蛋白酶体相关DUBs抑制剂,具有良好的毒性和抗癌活性。
RA-9 CAS号: 1262295-74-8
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
RA-9 是一种高效且选择性的蛋白酶体相关去泛素化酶 (DUB) 抑制剂,具有良好的毒性和抗癌活性。RA-9 可阻断泛素依赖性蛋白降解,而不影响 20S 蛋白酶体的蛋白水解活性。RA-9 可选择性地诱导卵巢癌/肿瘤细胞系和供体原代培养细胞凋亡。RA-9 可诱导卵巢癌/肿瘤细胞发生内质网应激反应。
RA-9(CAS 编号:1262295-74-8)是一种小分子抑制剂,可选择性地靶向蛋白酶体相关去泛素化酶 (DUB),特别是 19S 调节颗粒 (19S RP) 相关的 DUB,包括 USP14 和 UCHL5。其分子式为 C32H37Cl4N7O5,分子量为 741.49 g/mol。 RA-9 能阻断泛素依赖性蛋白降解,同时独特地保留了 20S 蛋白酶体的全部三种催化活性(胰凝乳蛋白酶样活性、胰蛋白酶样活性和半胱天冬酶样活性)。这一与经典蛋白酶体抑制剂(如硼替佐米)的关键区别,使得 RA-9 成为研究癌症生物学中泛素-蛋白酶体系统、内质网 (ER) 应激和未折叠蛋白反应 (UPR) 的宝贵研究工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
RA-9's primary targets are proteasome-associated deubiquitinating enzymes (DUBs), specifically the 19S regulatory particle (19S RP)-associated DUBs including USP14 and UCHL5. It also inhibits other 19S RP-associated DUBs such as USP8, UCH-L1, and UCH-L3. By inhibiting these DUBs, RA-9 blocks the removal of ubiquitin chains from proteasome substrates, thereby preventing ubiquitin-dependent protein degradation. Importantly, RA-9 does not affect the 20S proteasome's catalytic core activity, distinguishing it from bortezomib and other classical proteasome inhibitors.
体外研究 (In Vitro)
RA-9(10-30 μM;48 小时)可抑制卵巢癌原代培养细胞和细胞系的生长[1]。在卵巢癌细胞中,RA-9(1.25-5 μM;18 小时)可诱导 caspase 介导的细胞凋亡和细胞周期阻滞[1]。在卵巢癌细胞中,RA-9(5 μM;0-24 小时)可引起内质网应激[1]。RA-9(5 μM;24 小时以上)处理 8 小时后即可引起 PARP 裂解产物的时效性积累[1]。体外实验表明,RA-9 在 20 μM 浓度下可抑制蛋白酶体去泛素化酶(DUB)活性,同时不影响所有三种 20S 蛋白酶体的催化活性。它能选择性地诱导卵巢癌细胞系和供体来源的原代培养细胞的凋亡。 RA-9 可诱导卵巢癌细胞发生内质网应激反应并激活未折叠蛋白反应 (UPR)。它已证实对硼替佐米耐药的多发性骨髓瘤细胞有效,从而能够进行耐药机制研究。该化合物具有良好的毒性特征和强大的抗癌活性。
体内研究 (In Vivo)
在卵巢癌小鼠模型中,RA-9(5 mg/kg;腹腔注射;给药一天,停药两天)可延长体内生存期并抑制人卵巢癌细胞的增殖[1]。
在体内,RA-9已在ES-2卵巢癌异种移植模型中得到验证,其给药方案为腹腔注射5 mg/kg,给药一天,停药两天。该化合物在临床前研究中显示出治疗卵巢癌的潜力。其作用机制包括通过抑制19S RP相关DUB活性并随后激活内质网应激反应,选择性地诱导癌细胞凋亡。
酶活实验
RA-9 的体外活性采用无细胞 DUB 酶活性测定法进行评估。在这些测定中,将纯化的 19S 蛋白酶体相关 DUB(例如 USP14 或 UCHL5)与泛素-AMC(7-氨基-4-甲基香豆素)底物在不同浓度的 RA-9 存在下孵育。DUB 对泛素-AMC 底物的切割释放出游离的 AMC,其产生可在 380/460 nm 激发/发射波长下测量的荧光信号。IC50 定义为抑制 50% DUB 活性所需的 RA-9 浓度。重要的是,RA-9 对 DUBs 的选择性高于 20S 蛋白酶体的催化活性,这一结论是通过平行测定,在化合物存在下使用荧光肽底物(例如 Suc-LLVY-AMC、Boc-LRR-AMC 和 Z-LLE-AMC)测量胰凝乳蛋白酶样、胰蛋白酶样和半胱天冬酶样活性而得出的。
细胞实验
细胞活力检测[1]
细胞类型: 顺铂敏感型卵巢癌细胞系 TOV-21G 和 ES-2,顺铂耐药型卵巢癌细胞系 HEY 和 OVCAR-3,原代卵巢癌细胞
测试浓度: 10、20、30 μM
孵育时间: 48 小时
实验结果: 以剂量依赖的方式损害卵巢癌细胞的活力。
细胞周期分析[1]
细胞类型: ES-2 细胞
测试浓度: 1.25、5 μM
孵育时间: 18 小时
实验结果: 导致 ES-2 细胞处于 G2-M 细胞周期阶段的比例呈剂量依赖性增加。
蛋白质印迹分析[1]
细胞类型: ES-2、SKOV-3 和 TOV-21G 卵巢癌细胞
测试浓度: 5 μM
孵育时间: 0-24 小时
实验结果: 导致早期内质网应激标志物 GRP-78 以及晚期内质网应激标志物 IRE1-α 和 Ero1L-α 的稳态水平随时间推移而增加。
对于细胞实验,将包括卵巢癌细胞(例如 ES-2、Caov-3、A2780)和硼替佐米耐药的多发性骨髓瘤细胞在内的各种癌细胞系培养在合适的培养基(例如含 10% 胎牛血清的 RPMI-1640 或 DMEM)中。将细胞用不同浓度的RA-9(通常为0.1至50 μM)处理不同时间(例如24-72小时)。采用MTT或CellTiter-Glo法评估细胞活力。通过检测caspase-3/7活性、Annexin V/PI染色流式细胞术或Western blotting检测裂解型caspase和PARP来评估细胞凋亡。使用抗泛素抗体通过Western blotting检测泛素化蛋白的积累。通过Western blotting分析内质网应激标志物,例如BiP、CHOP和磷酸化eIF2α。
动物实验
动物/疾病模型: 六周龄雌性免疫缺陷(NCr nu/nu)小鼠[1]
剂量: 5 mg/kg
给药途径: 腹腔注射;给药一天,停药两天
实验结果: 第12天肿瘤负荷显著降低。
在体内,RA-9通常通过腹腔注射给药于携带人源肿瘤异种移植瘤的小鼠。该化合物配制于合适的溶剂(例如,DMSO或DMSO与生理盐水的混合物)中,并以5 mg/kg的剂量,采用给药一天、停药两天的方案给药。通过测量肿瘤体积随时间的变化来监测肿瘤生长。在研究结束时,切除肿瘤并分析泛素化蛋白积累、细胞凋亡标志物和内质网应激标志物,以确认靶点结合和作用机制。可以通过在给药后不同时间点收集肿瘤组织来进行药效学研究。
药代性质 (ADME/PK)
RA-9 的分子量为 741.49 g/mol,分子式为 C32H37Cl4N7O5。它可溶于 DMSO,短期储存(数天至数周)应置于 0-4°C 的干燥避光处,长期储存(数月至数年)应置于 -20°C 的低温环境中。该化合物为固体粉末。用于体内给药时,可将其配制成合适的载体。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
RA-9在临床前研究中表现出良好的毒性特征。与直接靶向20S蛋白酶体催化活性并可能导致显著毒性的硼替佐米和其他经典蛋白酶体抑制剂不同,RA-9选择性抑制19S核糖体蛋白相关去泛素化酶(DUBs),同时保留20S蛋白酶体的蛋白水解活性。这种选择性可能有助于其获得更佳的安全性。体外研究表明,RA-9选择性地诱导癌细胞凋亡,而对正常细胞无害。但仍需进行全面的毒理学研究以确定其完整的安全性。
参考文献

[1]. Small-molecule RA-9 inhibits proteasome-associated DUBs and ovarian cancer in vitro and in vivo via exacerbating unfolded protein responses. Clin Cancer Res. 2014;20(12):3174-3186.

其他信息
RA-9 是一种研究化合物,被开发为一种选择性抑制 19S 蛋白酶体相关去泛素化酶 (DUB) 的抑制剂。其独特的作用机制——阻断泛素依赖性蛋白降解而不影响 20S 蛋白酶体的催化活性——使其区别于经典的蛋白酶体抑制剂(例如硼替佐米)和广谱 DUB 抑制剂。RA-9 已展现出治疗卵巢癌的潜力,并对硼替佐米耐药的多发性骨髓瘤细胞显示出疗效。目前,RA-9 尚未获准用于临床,仅供研究用途。RA-9 的研发为深入了解 19S RP 相关 DUB 在癌症生物学中的作用以及靶向这些酶进行癌症治疗的潜力提供了宝贵的见解。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C32H37CL4N7O5
分子量
741.492083311081
精确质量
739.161
CAS号
1262295-74-8
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
SMILES
ClC1=C(C=CC(=C1)/C=C1/C(/C(=C/C2C=CC(=C(C=2)Cl)Cl)/CN(C(N[C@H](C(N[C@H](C(=O)O)CCCCN)=O)CCC/N=C(\N)/N)=O)C/1)=O)Cl
别名
RA9; RA 9; RA-9
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.3486 mL 6.7432 mL 13.4864 mL
5 mM 0.2697 mL 1.3486 mL 2.6973 mL
10 mM 0.1349 mL 0.6743 mL 1.3486 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们