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RG3039

别名: PF06687859; PF 06687859; PF-06687859; RG 3039; RG3039; RG-3039 5-[[1-(2,6-二氯苄基)哌啶-4-基]甲氧基]喹唑啉-2,4-二胺
目录号: V4489 纯度: ≥98%
COA 产品数据 产品说明书 SDS
RG3039（也称为 PF-06687859；PF 06687859）是使用 SMN2 启动子筛选鉴定和优化的化学系列的成员，是一种新型、有效、口服生物可利用且具有脑渗透性的 DcpS（脱帽清道夫酶）抑制剂，IC50 为0.069纳米。
RG3039 CAS号: 1005504-62-0
产品类别: DNA(RNA) Synthesis
产品仅用于科学研究，不针对患者销售
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纯度: ≥98%

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产品说明书
产品描述
RG3039（也称为 PF-06687859；PF 06687859）是使用 SMN2 启动子筛选鉴定和优化的化学系列的成员，是一种新型、有效、口服生物可利用且具有脑渗透性的 DcpS（脱帽清道夫酶）抑制剂，IC50 为 0.069 nM。它可以延长脊髓性肌萎缩症 (SMA) 小鼠模型的生存期并改善运动功能。它是 mRNA 脱帽清除酶 (DcpS) 的有效抑制剂，但抑制 DcpS 带来治疗益处的机制尚不清楚。 RG3039 是一种二元亲脂性分子，预计会在溶酶体中积累。
生物活性&实验参考方法
靶点
DcpS ( IC50 = 4.2 nM ); DcpS ( IC90 = 40 nM )
体外研究 (In Vitro)
RG3039 是一种二元亲脂性化合物，有可能在溶酶体中积聚 [1]。
体内研究 (In Vivo)
在两种不同疾病严重程度的 SMA 小鼠模型（台湾 5058 Hemi 和 2B/SMA 小鼠）中，RG3039 可以延长寿命并增强功能，对视神经病变具有有益作用。在 2B/- SMA 小鼠模型中，RG3039 从 P4 开始（中位 18 天至 >112 天）显示出 >600% 的生存优势，强调了早期干预的重要性 [2]。当RG3039到达中枢神经系统组织时，它显着抑制DcpS的酶活性，同时仅微弱地诱导SMN或小核糖核蛋白复合物的表达。在 RG3039 处理的 SMA 样本中，运动神经元胞体、神经元突触神经支配和功能以及手术尺寸均得到改善。这些变化与季度、体重和运动表现的剂量依赖性增加相关。连接的。此外，RG3039 可加快有条件 SMA 电极的干燥速度 [3]。
动物实验
小鼠：从出生后第1天（P1，即出生当天）开始，对小鼠进行腹腔注射RG3039。在P4，所有接受治疗的窝（最多6只幼鼠）均被淘汰。从P1开始，每日记录体重和翻正时间。活动指数从P13持续到P23。两次60秒的活动试验用于计算综合评分[3]。
参考文献
[1]. Gopalsamy A, et al. Design of Potent mRNA Decapping Scavenger Enzyme (DcpS) Inhibitors with Improved Physicochemical Properties To Investigate the Mechanism of Therapeutic Benefit in Spinal Muscular Atrophy (SMA). J Med Chem. 2017 Apr 13;60(7):3094-3108.
[2]. Gogliotti RG, et al. The DcpS inhibitor RG3039 improves survival, function and motor unit pathologies in two SMA mouse models. Hum Mol Genet. 2013 Oct 15;22(20):4084-101.
[3]. Van Meerbeke J, et al. The DcpS inhibitor RG3039 improves motor function in SMA mice. Hum Mol Genet. 2013 Oct 15;22(20):4074-83
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C21H23N5OCL2
分子量
432.34622
精确质量
431.127
元素分析
C, 58.34; H, 5.36; Cl, 16.40; N, 16.20; O, 3.70
CAS号
1005504-62-0
PubChem CID
53258905
外观&性状
White to off- white solid powder
密度
1.4±0.1 g/cm3
沸点
648.1±65.0 °C at 760 mmHg
闪点
345.8±34.3 °C
蒸汽压
0.0±1.9 mmHg at 25°C
折射率
1.682
LogP
4.25
tPSA
91.75
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
29
分子复杂度/Complexity
511
定义原子立体中心数目
0
SMILES
NC1=NC(N)=C2C(OCC3CCN(CC4=C(Cl)C=CC=C4Cl)CC3)=CC=CC2=N1
InChi Key
MNLHFGXIUJNDAF-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C21H23Cl2N5O/c22-15-3-1-4-16(23)14(15)11-28-9-7-13(8-10-28)12-29-18-6-2-5-17-19(18)20(24)27-21(25)26-17/h1-6,13H,7-12H2,(H4,24,25,26,27)
化学名
5-[[1-[(2,6-dichlorophenyl)methyl]piperidin-4-yl]methoxy]quinazoline-2,4-diamine
别名
PF06687859; PF 06687859; PF-06687859; RG 3039; RG3039; RG-3039
HS Tariff Code
2934.99.03.00
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 3~5 mg/mL (6.9~11.6 mM)
H2O: ~1 mg/mL (~2.3 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil)
示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备（4°C，储存1周）：将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中，得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如： 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精)→ 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如： 50 μL DMSO → 100 μL PEG300 → 200 μL Castor oil → 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10： 10 : 80 (如： 100 μL Ethanol → 100 μL Cremophor → 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL EtOH → 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL EtOH → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)

口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合

注意: 以上为较为常见方法，仅供参考， InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型，对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物，需通过前期实验来确定（建议先取少量样品进行尝试），包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。
请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.3129 mL 11.5647 mL 23.1294 mL
5 mM 0.4626 mL 2.3129 mL 4.6259 mL
10 mM 0.2313 mL 1.1565 mL 2.3129 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器
计算 重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？
  • 在分子量（MW）框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。
计算 重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：
  • 在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
  • 在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中
g/mol
计算 重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：
  • 分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
  • 摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。
/
计算 重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器（澄清溶液）
第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）
第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。
+
+
+
计算 重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • RG3039


    Oral delivery of RG3039 increases survival, weight and heart rate in 2B/− SMA mice.2013 Oct 15;22(20):4084-101.

  • RG3039


    RG3039 treatment improves survival and function of 2B/− SMA mice in a dose-dependent manner. (A) Kaplan–Meier survival curves of 2B/− SMA pups treated with varying doses (0.25–20 mg/kg) (po) daily from P4 to P20 and followed for survival and function.(B) Body weight graphs (average ± SEM) of the mice shown in (A). (C–G) Functional assays post-weaning across the surviving treatment cohorts of inclined planes (C) and gait dynamics (D–G).2013 Oct 15;22(20):4084-101.

  • RG3039


    RG3039 inhibits DcpS activity. The inhibition of DcpS decapping activity in brain homogenates following po dosing of RG3039 to 2B/− SMA mice was analyzed at the indicated time points following last dose from (A) 20 mg/kg/day P4–P20 dose group, (B) a single po dose (20 mg/kg) administered at P11 or (C) 2.5 mg/kg/day P4–P20 dose group.2013 Oct 15;22(20):4084-101.

  • RG3039


    RG3039 increases Smn gem number in 2B/− SMA motor neurons.

    RG3039

    RG3039 attenuates motor neuron loss in 2B/− SMA mice.

    RG3039

    RG3039 inhibits the decapping enzyme DcpS.2013 Oct 15;22(20):4084-101.


  • RG3039

    Volcano plots comparing skeletal muscle regeneration and atrophy gene expression fold changes between (A) vehicle-treated 2B/− SMA and vehicle-treated control (2B/+) and (B) RG3039-treated 2B/− SMA and vehicle-treated control (2B/+).2013 Oct 15;22(20):4084-101.

  • RG3039


    RG3039 improves NMJ pathology and function.2013 Oct 15;22(20):4084-101.

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