Ribulose, L-

别名: L-erythro-2-PentuloseRibulose, L- L-Erythro-pentuloseL-Ribulose L-Adonose L-核酮糖
目录号: V9591 纯度: ≥98%
L-核酮糖是L-核糖的对映体,是合成其他稀有糖和L-核苷类似物的重要前体。
Ribulose, L- CAS号: 2042-27-5
产品类别: New1
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产品描述
L-核酮糖是L-核糖的对映异构体,也是合成其他稀有糖和L-核苷类似物的重要前体。
L-核酮糖(CAS:2042-27-5)是一种内源性代谢物,也是磷酸戊糖途径中的关键中间体,尤其参与戊糖的相互转化。它是一种稀有糖,可作为多种酶的底物,包括L-核糖异构酶和核糖-5-磷酸异构酶,这些酶催化L-核糖和L-核酮糖之间的可逆异构化。L-核酮糖是合成其他稀有糖和L-核苷类似物的重要前体。它被应用于代谢工程、酶学等领域的研究,并可用作有机合成的手性化合物。
生物活性&实验参考方法
靶点
The primary targets of L-Ribulose are enzymes involved in carbohydrate metabolism, particularly L-arabinose isomerase and ribose-5-phosphate isomerase (Rpi). These enzymes catalyze the reversible isomerization between L-ribose and L-ribulose. L-Ribulose interacts with its target enzymes to undergo isomerization reactions. It is also a substrate for L-ribose isomerase, an enzyme that catalyzes the conversion between L-ribose and L-ribulose. As an endogenous metabolite, L-ribulose plays a role in cellular metabolism and is used in metabolic engineering applications, such as engineering yeast for xylose metabolism.
体外研究 (In Vitro)
在体外,L-核酮糖被用作研究酶动力学和特异性的底物。它被用于分析L-核糖异构酶和核糖-5-磷酸异构酶的活性。该化合物还用于代谢工程研究,以改善酵母中木糖的发酵,因为它是磷酸戊糖途径的中间体。然而,L-核酮糖本身并不具有传统意义上的药理活性;它的“活性”主要体现在作为代谢底物和研究碳水化合物代谢的工具。
体内研究 (In Vivo)
L-核酮糖并非传统意义上的药理活性化合物,因此不具备药物的体内活性。它是一种内源性代谢产物,天然存在于生物体内,是正常碳水化合物代谢的一部分。在研究环境中,L-核酮糖可用于动物实验或代谢研究,以追踪代谢途径或研究碳水化合物代谢对生理的影响。然而,目前尚无针对该化合物的具体体内药理学数据。
酶活实验
体外L-核酮糖酶活性测定通常涉及测量以L-核酮糖为底物的异构酶的活性。例如,L-核糖异构酶活性测定是通过将酶与L-核酮糖孵育并测量L-核糖的生成量来进行的。该反应可使用高效液相色谱法(HPLC)、比色法或偶联酶法进行监测。类似地,核糖-5-磷酸异构酶活性也可以使用L-核酮糖作为底物进行测定。这些测定方法用于表征酶动力学、确定底物特异性以及筛选酶抑制剂或激活剂。
细胞实验
L-核酮糖的细胞分析通常在代谢工程或代谢通量分析的背景下进行。例如,将经基因工程改造以代谢木糖的酵母细胞培养在含有L-核酮糖的培养基中,并测定下游代谢物的产量。通过测量各种代谢物的水平、基因表达或细胞生长情况,可以评估该化合物对细胞代谢的影响。这些分析用于研究涉及L-核酮糖的代谢途径,并优化用于生产生物燃料或其他高价值化合物的代谢工程策略。
动物实验
由于L-核酮糖是一种内源性代谢物而非药物,因此通常不进行体内动物实验以研究其药理作用。在研究环境中,标记的L-核酮糖可用于代谢示踪实验,以追踪碳在代谢途径中的流动。然而,现有文献中并未详细描述L-核酮糖的具体体内给药方案。由于该化合物是一种代谢物,因此无法在传统的体内药理学模型中进行评估。
药代性质 (ADME/PK)
作为一种内源性代谢产物,L-核酮糖是细胞代谢的正常成分,不被视为外源性物质。因此,其药代动力学参数,例如半衰期、清除率和生物利用度,并不适用于传统意义上的药物。该化合物是一种小分子水溶性糖(分子量150.13),可通过正常的碳水化合物代谢途径进行代谢。粉末状L-核酮糖在-20℃下可稳定保存长达3年,溶液状L-核酮糖在-80℃下可稳定保存长达1年。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
L-核酮糖是一种内源性代谢产物,在正常的细胞代谢过程中不被认为具有毒性。它是一种天然存在的糖,参与多种基础代谢过程。在研究应用中,它被用作底物或代谢中间体,通常不被认为具有毒性。然而,与任何化合物一样,高浓度或长期暴露可能产生代谢效应。目前文献中尚未报道该化合物的具体毒理学数据。
参考文献

[1]. Recent advances in properties, production, and applications of L-ribulose. Appl Microbiol Biotechnol. 2020 Jul;104(13):5663-5672.

其他信息
L-核酮糖是一种核酮糖。它在大肠杆菌中发挥代谢作用。L-核酮糖存在于大肠杆菌(K12菌株、MG1655菌株)中或由其产生。据报道,水蚤(Daphnia pulex)中也存在L-核酮糖,相关数据可供参考。L-核酮糖是一种内源性代谢物,属于研究级化合物。它并非药物,也未获准用于临床。其主要应用领域是生物化学、酶学和代谢工程。它可用作研究异构酶的底物,作为合成稀有糖和L-核苷类似物的结构单元,以及作为改造酵母进行木糖发酵的工具。此外,它还可用作有机合成中的手性化合物。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C5H10O5
分子量
150.13
精确质量
150.053
CAS号
2042-27-5
PubChem CID
644111
外观&性状
Light yellow to brown liquid
密度
1.711g/cm3
沸点
364.2ºC at 760mmHg
闪点
174.1ºC
蒸汽压
8.85E-07mmHg at 25°C
折射率
1.545
LogP
-2.6
tPSA
97.99
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
10
分子复杂度/Complexity
113
定义原子立体中心数目
2
SMILES
OC[C@@H]([C@@H](C(CO)=O)O)O
InChi Key
ZAQJHHRNXZUBTE-UCORVYFPSA-N
InChi Code
InChI=1S/C5H10O5/c6-1-3(8)5(10)4(9)2-7/h3,5-8,10H,1-2H2/t3-,5-/m0/s1
化学名
(3S,4S)-1,3,4,5-tetrahydroxypentan-2-one
别名
L-erythro-2-PentuloseRibulose, L- L-Erythro-pentuloseL-Ribulose L-Adonose
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 6.6609 mL 33.3045 mL 66.6089 mL
5 mM 1.3322 mL 6.6609 mL 13.3218 mL
10 mM 0.6661 mL 3.3304 mL 6.6609 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们