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MTR-106

别名: ZYN57939; ZYN-57939; ZYN 57939;
目录号: V2385 纯度: ≥98%
COA 产品数据 产品说明书 SDS
MTR-106 是一种口服生物可利用的 G-四联体稳定剂和 RNA 聚合酶 I 抑制剂。
MTR-106 CAS号: 1639357-93-9
产品类别: Others 6
产品仅用于科学研究，不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
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产品描述
MTR-106 是一种口服生物可利用的 G-四联体稳定剂和 RNA 聚合酶 I 抑制剂。 MTR-106 引起细胞凋亡并抑制细胞生长。 MTR-106可用于癌症相关研究。
生物活性&实验参考方法
靶点
MTR-106 targets G-quadruplex (G4) structures, with a DC₅₀ value of 0.32 μM (concentration required to stabilize 50% of G4) in FRET melting assay; it shows 25-fold selectivity for G4 over double-stranded DNA (dsDNA) [1]
体外研究 (In Vitro)
MTR-106（0-100 μM；7 d）插入细胞中，在 PARPi 和 HR 缺陷细胞中均表现出抗肿瘤活性 [1]。 MTR-106（0-100 μM；7 d）细胞周期和工作的诱导
MTR-106 对BRCA缺陷癌细胞系具有强效抗增殖活性：IC₅₀ = 0.18 μM（MDA-MB-436，BRCA1⁻/⁻）、IC₅₀ = 0.22 μM（HCC1937，BRCA1⁻/⁻）、IC₅₀ = 0.25 μM（Capan-1，BRCA2⁻/⁻） [1]
- 该化合物对BRCA正常细胞毒性较低：IC₅₀ > 10 μM（MCF-7，BRCA1⁺）、IC₅₀ > 10 μM（HT-29，BRCA2⁺） [1]
- MTR-106（0.5 μM）可稳定癌细胞中rDNA的G4结构，通过实时荧光定量PCR检测，其抑制RNA聚合酶I介导的rRNA转录效率约为70% [1]
- 用MTR-106（0.2–1 μM）处理后，BRCA缺陷细胞出现DNA损伤，表现为γ-H2AX灶点形成增加和PARP剪切（Western blot验证） [1]
- MTR-106（0.5 μM）可将BRCA缺陷细胞阻滞在G2/M期（流式细胞术检测）并促进凋亡，凋亡率较对照组增加约35% [1]
体内研究 (In Vivo)
MTR-106（10-30 mg/kg；侧向；每周两次，持续 29 天）可抑制裸鼠中 BRCA 缺陷和 PARPi 异种移植肿瘤的生长 [1]。
在MDA-MB-436（BRCA1⁻/⁻）异种移植小鼠模型中，腹腔注射MTR-106（10 mg/kg，每周2次，连续3周），与溶媒对照组相比，肿瘤生长抑制率达68% [1]
- MTR-106（10 mg/kg）治疗未导致小鼠明显体重下降（体重变化≤5%）或器官损伤 [1]
- 肿瘤组织免疫组织化学染色显示，MTR-106 使增殖标志物Ki-67表达降低约50%，γ-H2AX表达增加，证实其在体内具有DNA损伤作用和抗增殖活性 [1]
酶活实验
FRET熔解实验：将荧光标记的G4 DNA或dsDNA与系列稀释的MTR-106共同孵育，通过荧光强度变化检测DNA的熔解温度（Tm），计算DC₅₀值以评估G4稳定活性 [1]
- RNA聚合酶I转录实验：制备BRCA缺陷细胞的核提取物，与MTR-106和rDNA启动子模板共同孵育，通过实时荧光定量PCR定量转录产物，评估抑制效率 [1]
- 圆二色谱（CD）光谱实验：将G4 DNA与MTR-106孵育后，记录CD光谱，验证G4结构稳定性及结合特异性 [1]
细胞实验
细胞活力测定 [1]
细胞类型： HR 缺陷和 PARPi 耐药癌细胞
测试浓度： 0-100 μM
孵育时间：7天
实验结果：抑制缺陷细胞和PARPi-的HR活力。耐药细胞呈剂量依赖性。
细胞周期分析 [1]
细胞类型： Capan-1 细胞
测试浓度： 0.1、0.3 和 1 μM
孵育时间：24小时
实验结果：G2/M细胞数量增加，G1细胞数量减少。
蛋白质印迹分析[1]
细胞类型： Capan-1 细胞
测试浓度： 1、5 和 10 μM
孵育持续时间：24 小时
实验结果：裂解的半胱天冬酶 3、7 和 9 以及裂解的 PARP 呈剂量依赖性增加。
细胞增殖实验：将BRCA缺陷/正常癌细胞接种于96孔板，用系列稀释的MTR-106处理72小时，通过比色法检测细胞活力，计算IC₅₀值 [1]
- 细胞周期与凋亡实验：细胞经MTR-106（0.2–1 μM）处理48小时后，用碘化丙啶（PI）染色进行细胞周期分析，或用Annexin V-FITC/PI染色检测凋亡，通过流式细胞术分析结果 [1]
- Western blot分析：药物处理后的细胞经裂解，提取蛋白质进行SDS-PAGE电泳，转膜后用γ-H2AX、PARP、剪切型caspase-3抗体及内参GAPDH抗体孵育，通过密度分析法对条带强度定量 [1]
- 免疫荧光实验：细胞经MTR-106处理后固定、透化，与抗γ-H2AX抗体孵育，通过共聚焦显微镜观察荧光灶点，定量DNA损伤程度 [1]
动物实验
动物/疾病模型： BRCA缺陷和PARPi耐药的裸鼠异种移植模型[1]
剂量： 10、20、30 mg/kg
给药途径： 口服；每周两次，持续29天
实验结果： 肿瘤生长呈剂量依赖性抑制。
异种移植模型建立：将MDA-MB-436细胞（5×10⁶个细胞/只）皮下注射到6-8周龄雌性裸鼠的右侧腹部。肿瘤生长至约100 mm³后进行治疗[1]
- 药物配制：将MTR-106溶解于二甲基亚砜(DMSO)中，并用聚乙二醇400(PEG400)和生理盐水(v/v/v = 1:4:5)进一步稀释至所需浓度[1]
- 给药方案：将小鼠随机分为溶剂对照组和药物治疗组（每组n=6）。MTR-106以10 mg/kg的剂量腹腔注射给药，每周两次，持续3周[1]
- 样本采集：治疗结束后，处死小鼠。切除肿瘤，称重，并用福尔马林固定，用于免疫组织化学分析；收集主要器官（心脏、肝脏、脾脏、肺、肾脏）进行病理学检查[1]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
体外毒性：MTR-106 对正常人成纤维细胞的细胞毒性较低（IC₅₀ > 10 μM）[1]
- 体内毒性：MTR-106 处理的小鼠主要器官的病理切片未观察到明显异常；血浆丙氨酸氨基转移酶 (ALT) 和天冬氨酸氨基转移酶 (AST) 水平在正常范围内[1]
- 血浆蛋白结合率：采用超滤法测定，MTR-106 与血浆蛋白的结合率约为 89%[1]
参考文献

[1]. Discovery of MTR-106 as a highly potent G-quadruplex stabilizer for treating BRCA-deficient cancers. Invest New Drugs. 2021 Oct;39(5):1213-1221.
其他信息
MTR-106 是一种合成小分子化合物，设计为高选择性 G-四链体稳定剂 [1]。其抗癌机制包括稳定 rDNA G-四链体、抑制 RNA 聚合酶 I 转录、诱导核仁应激和 DNA 损伤，最终导致 BRCA 缺陷型癌症细胞周期阻滞和凋亡 [1]。MTR-106 与 BRCA 缺陷具有合成致死性，使其成为 BRCA 突变型乳腺癌、卵巢癌和胰腺癌的潜在靶向治疗药物 [1]。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C29H28N6O2S
分子量
524.6366
精确质量
524.2
元素分析
C, 66.39; H, 5.38; N, 16.02; O, 6.10; S, 6.11
CAS号
1639357-93-9
PubChem CID
155908174
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
3.6
tPSA
117
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
38
分子复杂度/Complexity
976
定义原子立体中心数目
2
SMILES
CC1=CN=C(C=N1)CNC(=O)C2=C3N(C4=CC=CC=C4S3)C5=C(C2=O)C=CC(=N5)C6C[C@@H]7CN(C[C@@H]7C6)C
InChi Key
ZAOCPDXRBFOCQL-YQQQUEKLSA-N
InChi Code
InChI=1S/C29H28N6O2S/c1-16-11-31-20(12-30-16)13-32-28(37)25-26(36)21-7-8-22(17-9-18-14-34(2)15-19(18)10-17)33-27(21)35-23-5-3-4-6-24(23)38-29(25)35/h3-8,11-12,17-19H,9-10,13-15H2,1-2H3,(H,32,37)/t17?,18-,19+
化学名
2-[(3aR,6aS)-2-methyl-3,3a,4,5,6,6a-hexahydro-1H-cyclopenta[c]pyrrol-5-yl]-N-[(5-methylpyrazin-2-yl)methyl]-5-oxo-[1,3]benzothiazolo[3,2-a][1,8]naphthyridine-6-carboxamide
别名
ZYN57939; ZYN-57939; ZYN 57939;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ~2 mg/mL (3.8 mM）
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil)
示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备（4°C，储存1周）：将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中，得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如： 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精)→ 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如： 50 μL DMSO → 100 μL PEG300 → 200 μL Castor oil → 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10： 10 : 80 (如： 100 μL Ethanol → 100 μL Cremophor → 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL EtOH → 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL EtOH → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)

口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合

注意: 以上为较为常见方法，仅供参考， InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型，对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物，需通过前期实验来确定（建议先取少量样品进行尝试），包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。
请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.9061 mL 9.5303 mL 19.0607 mL
5 mM 0.3812 mL 1.9061 mL 3.8121 mL
10 mM 0.1906 mL 0.9530 mL 1.9061 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器
计算 重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？
  • 在分子量（MW）框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。
计算 重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：
  • 在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
  • 在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中
g/mol
计算 重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：
  • 分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
  • 摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。
/
计算 重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器（澄清溶液）
第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）
第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。
+
+
+
计算 重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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