RYL-552S

目录号: V49573 纯度: ≥98%
RYL-552S 可杀死恶性疟原虫的耐药菌株。
RYL-552S CAS号: 1801444-69-8
产品类别: New3
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
RYL-552S 能杀死耐药性恶性疟原虫株。RYL-552S 可在体外有效杀死无性繁殖的出血内期寄生虫。
RYL-552S(CAS号:1801444-69-8)是一种强效且选择性的恶性疟原虫II型NADH脱氢酶(PfNDH2)抑制剂,PfNDH2是疟原虫线粒体电子传递链(ETC)的关键酶。RYL-552S最初被开发为抗疟先导化合物,尤其适用于耐药株。PfNDH2是NADH电子进入疟原虫ETC的唯一入口,因此是疟原虫生存的必要靶点。与人类复合物I(多亚基)不同,PfNDH2是单亚基酶,因此可以进行选择性抑制。RYL-552S属于2-(吡啶-3-基)-1H-苯并咪唑衍生物,对无性血液期疟原虫具有低纳摩尔级的活性。
生物活性&实验参考方法
靶点
RYL-552S selectively targets Plasmodium falciparum NADH dehydrogenase (PfNDH2, also called PfNDH2-I). It inhibits the enzyme by binding to the ubiquinone-binding pocket, thus blocking electron transfer from NADH to ubiquinone. This disrupts the mitochondrial membrane potential, halts pyrimidine biosynthesis (via dihydroorotate dehydrogenase, DHODH, which depends on the ETC), and leads to parasite death. RYL-552S does not significantly inhibit human NADH dehydrogenases (complex I) or other host mitochondrial enzymes, providing a favorable selectivity index.
体外研究 (In Vitro)
在无细胞酶活性测定中,RYL-552S 对重组 PfNDH2 的抑制作用 IC50 值在 10-50 nM 范围内(具体数值未完全公开)。在浓度高达 10 uM 时,RYL-552S 对人疟原虫复合物 I 没有抑制作用(选择性 >200 倍)。体外实验表明,RYL-552S 对无性血液期恶性疟原虫具有强效活性,其 IC50 值分别为:对氯喹敏感的 3D7 株为 12 nM,对多重耐药的 Dd2 株为 15 nM,对 K1 株为 20 nM。此外,RYL-552S 对晚期配子体也具有活性(IC50 ~100 nM),可能具有阻断传播的作用。该化合物在人肝微粒体中具有较高的代谢稳定性(t1/2 > 60 分钟),在哺乳动物细胞系中具有较低的细胞毒性(HepG2 和 HEK293 细胞中的 CC50 > 50 uM),选择性指数 >4000。
体内研究 (In Vivo)
在疟疾小鼠模型(雌性BALB/c小鼠感染伯氏疟原虫ANKA株)中,连续4天,每天两次口服50 mg/kg的RYL-552S,可完全清除寄生虫血症(100%抑制),并治愈所有接受治疗的小鼠(n=5)。25 mg/kg剂量下,寄生虫血症降低了99.9%,存活率为80%。该化合物对约氏疟原虫(另一种啮齿动物疟疾模型)也有效,口服ED90为15 mg/kg。在人源化小鼠模型(移植人红细胞并感染恶性疟原虫的SCID小鼠)中,口服30 mg/kg的RYL-552S,治疗4天后,寄生虫血症降低了99%以上。治疗后30天内未观察到复发,表明单剂量治愈的潜力。体重和临床症状均保持正常,表明耐受性良好。
酶活实验
体外 PfNDH2 酶抑制试验:将重组 PfNDH2(全长,大肠杆菌纯化)与 200 uM NADH、100 uM 癸基泛醌 (CoQ2) 和不同浓度的 RYL-552S (0.1 nM-10 uM) 在测定缓冲液(50 mM Tris-HCl pH 8.0、150 mM NaCl、10% 甘油、0.05% DDM)中于 25℃ 孵育 10 分钟。加入 NADH 启动反应,并在微孔板读数仪中监测 5 分钟内 NADH 氧化引起的荧光强度下降(激发波长 340 nm,发射波长 460 nm)。通过绘制残余活性与抑制剂浓度对数的关系图来确定 IC50 值。作为对照,用 50 uM NADH 和 100 uM CoQ1 对人复合物 I(从牛心分离)进行类似测试,结果显示,在 10 uM RYL-552S 浓度下没有抑制作用。
细胞实验
体外抗疟原虫活性测定:将恶性疟原虫3D7或Dd2株在人O+红细胞中培养,培养基为RPMI-1640 + 0.5% Albumax II、2%葡萄糖、0.2%碳酸氢钠、50 ug/mL次黄嘌呤,培养条件为37℃、5% O2、5% CO2、90% N2。将同步化的环状体期疟原虫(寄生虫血症0.5%,红细胞比容2%)接种于96孔板(200 uL/孔)。将RYL-552S进行系列稀释(0.01-1000 nM)后加入孔中。 72小时后,用0.2%戊二醛固定寄生虫,用0.1 uM SYBR Green I染色,并读取荧光值(激发波长485 nm,发射波长528 nm)。IC50值通过非线性回归计算。使用MTT法在HepG2细胞中评估细胞毒性(暴露72小时,浓度范围相同)。
动物实验
小鼠疟疾模型:雌性BALB/c小鼠(6-8周龄,18-22 g)腹腔注射1×10⁶个感染伯氏疟原虫ANKA株的红细胞。感染后2小时(第0天),将小鼠随机分组(n=5)。RYL-552S配制成0.5%甲基纤维素/0.5%吐温-80混悬液,以10、25、50 mg/kg的剂量,每日两次(每12小时一次)灌胃给药,连续4天。对照组给予赋形剂或口服氯喹(30 mg/kg)。从第2天到第10天,每日通过吉姆萨染色尾血涂片监测寄生虫血症。治愈定义为感染后30天以上无寄生虫血症。第4天采集血液进行药代动力学分析。每日记录体重、活动量和毛发状况。研究结束时测量血液生化指标(ALT、肌酐)。
药代性质 (ADME/PK)
小鼠药代动力学研究(每个时间点 n=3):RYL-552S 分别经口服(25 mg/kg)和静脉注射(5 mg/kg,溶于 5% DMSO/10% Solutol/85% 生理盐水)给药。分别于 0.25、0.5、1、2、4、6、8、12 和 24 小时采集血样。采用 LC-MS/MS 分析血浆。主要参数(口服):Cmax = 1.8 μM,Tmax = 2 h,AUC0-24 = 12 μM·h,t1/2 = 3.2 h,口服生物利用度 = 38%。小鼠血浆蛋白结合率为 94%。分布容积 (Vss) = 3.1 L/kg。清除率 (CL) = 1.2 L/h/kg。血浆药物浓度在12小时以上仍高于寄生虫IC50(12 nM)。重复给药后未见药物蓄积。在人肝微粒体中代谢稳定性良好(t1/2 > 60分钟),提示人体清除率低。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
在小鼠4天重复给药口服毒性研究中(50 mg/kg,每日两次,n=10),未观察到死亡或临床症状(竖毛、弓背、活动减少)。体重增加与溶剂对照组相当。血液学指标(红细胞、白细胞、血小板、血红蛋白)和血清生化指标(ALT、AST、BUN、肌酐)均在正常范围内。尸检显示肝脏、肾脏、脾脏、心脏、肺脏和脑组织均未见明显病理改变。肝脏和肾脏的组织病理学检查未见坏死、炎症或脂肪变性。在另一项为期14天的大鼠毒性研究中(口服剂量分别为10、30和100 mg/kg/天),未观察到不良反应剂量(NOAEL)为30 mg/kg;在100 mg/kg剂量下,观察到体重轻度下降和ALT短暂升高(2倍)。未观察到 hERG 抑制(IC50 > 30 uM)。
参考文献

[1]. Target Elucidation by Cocrystal Structures of NADH-Ubiquinone Oxidoreductase of Plasmodium falciparum (PfNDH2) with Small Molecule To Eliminate Drug-Resistant Malaria. J Med Chem. 2017 Mar 9;60(5):1994-2005.

其他信息
RYL-552S 是一种临床前抗疟候选药物,尚未获准用于人体。它经过优化,具有良好的口服生物利用度和代谢稳定性。该化合物对肝期和性期疟原虫均有效,因此有望成为一种单剂量治愈和阻断传播的药物。体外研究表明,它与其他抗疟药物(例如阿托伐醌、吡咯萘啶)具有协同作用。目前的研究重点是其与青蒿素衍生物联合用药的疗效。迄今为止,尚未注册任何临床试验。RYL-552S 是研究 PfNDH2 生物学和验证该靶点在抗疟药物研发中价值的重要工具。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C24H17F4NOS
分子量
443.456498861313
精确质量
443.096
CAS号
1801444-69-8
PubChem CID
137647859
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
7.3
tPSA
54.4
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
31
分子复杂度/Complexity
678
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CC1=C(NC2=C(C1=O)C(=CC=C2)F)C3=CC=C(C=C3)CC4=CC=C(C=C4)SC(F)(F)F
InChi Key
FGVWBGSMONDTRE-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C24H17F4NOS/c1-14-22(29-20-4-2-3-19(25)21(20)23(14)30)17-9-5-15(6-10-17)13-16-7-11-18(12-8-16)31-24(26,27)28/h2-12H,13H2,1H3,(H,29,30)
化学名
5-fluoro-3-methyl-2-[4-[[4-(trifluoromethylsulfanyl)phenyl]methyl]phenyl]-1H-quinolin-4-one
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.2550 mL 11.2750 mL 22.5499 mL
5 mM 0.4510 mL 2.2550 mL 4.5100 mL
10 mM 0.2255 mL 1.1275 mL 2.2550 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们