Secologanin

别名: Secologanin; 19351-63-4; loniceroside; (-)-Secologanin; NK7B26K93T; methyl (2S,3R,4S)-3-ethenyl-4-(2-oxoethyl)-2-[(2S,3R,4S,5S,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-3,4-dihydro-2H-pyran-5-carboxylate; CHEBI:18002; tert-butyl 3-[[5-(1,1,1,3,3,3-hexafluoro-2-hydroxypropan-2-yl)-4,5-dihydro-1,2-oxazole-3-carbonyl]amino]butanoate; 裂环马钱子苷;开链马钱子甙;裂环马钱素;马钱子苷;开联番木鳖甙;环烯醚萜苷类化合物, 是生物活性单萜类吲哚类生物碱 (如利血平、Ajmaline 和长春碱) 生物合成的关键萜类中间体。
目录号: V8654 纯度: ≥98%
Secologanin 是一种环烯醚萜苷,是生物活性单萜吲哚生物碱(如利血平、阿马林和长春花碱)生物合成中的关键萜类中间体。
Secologanin CAS号: 19351-63-4
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
Secologanin 是一种环烯醚萜苷,是生物活性单萜吲哚生物碱(如利血平、阿马林和长春花碱)生物合成中的关键萜类中间体。山竹素合酶(细胞色素 P450 亚型 CYP72A1)催化马钱素氧化裂解为山竹素。
生物活性&实验参考方法
靶点
Precursor for monoterpenoid
体外研究 (In Vitro)
二萜苷是一种二环烯醚萜苷,是生物活性单萜吲哚生物碱(如利血平、阿马林和长春花碱)生物合成中的关键萜类中间体,这些生物碱是通过由二萜苷和色胺形成的生物碱苷stritosidine生物合成的。在马钱素生物合成中,马钱素氧化裂解为马钱素和7-脱氧马钱素羟基化为马钱蛋白的过程在酶学和机理上仍然未知。山茱萸皂苷是一种具有4-羟基-2,5-环己二烯-1-酮(苯醌)环的独特糖苷,广泛存在于山茱萸科、木犀科和玄参科等科中,但其生物合成,尤其是氧化过程仍有待研究。紫草素是一种红色萘扎素色素,来源于紫草根,通过细胞培养生物技术生产。对其生物合成,包括生产调控机制进行了详细的研究。然而,石脑油环的形成过程,可能始于紫草素生物合成后期关键中间体香叶基氢醌侧链的羟基化,仍然未知。在本综述中,细胞色素P450单加氧酶参与了三种结构和生物合成上有趣的化合物的生物合成,即裂豆素、矢车菊苷和紫草素,并与之前和最近的生物合成研究结果一起进行了描述。还讨论了相关化合物的生物合成[1]。
酶活实验
近十年前,对长春花(马达加斯加长春花)CYP72A1的分子特征进行了描述,但酶的功能仍然未知。我们现在通过原位杂交和免疫组织化学表明,未成熟叶片中的表达是表皮特异性的。因此,它遵循了之前为吲哚生物碱途径中的早期酶建立的模式,表明CYP72A1可能参与了它们的生物合成。该途径中的早期反应,即从香叶醇到曲妥苷,含有几种P450活性的候选物。在这项工作中,我们研究了两种反应,7-脱氧马钱素转化为马钱素(脱氧马钱蛋白7-羟化酶,DL7H)和氧化环切割将马钱素转换为裂马钱蛋白(裂马钱素合酶,SLS)。DL7H的作用以前没有在体外得到证实,SLS最近才在另一种植物中被鉴定为P450活性。我们首次证明,这两种酶活性都存在于玫瑰红酵母细胞培养物的微粒体中。然后,我们测试了在大肠杆菌中表达的CYP72A1作为与玫瑰色念珠菌P450还原酶(P450Red)的翻译融合物是否具有其中一种或两种活性。结果表明,CYP72A1将马钱素转化为裂马钱素[2]。
参考文献

[1]. Inoue K. Yakugaku Zasshi. 2005;125(1):31-49. doi:10.1248/yakushi.125.31.

[2]. Indole alkaloid biosynthesis in Catharanthus roseus: new enzyme activities and identification of cytochrome P450 CYP72A1 as secologanin synthase. Plant J. 2000;24(6):797-804.

其他信息
(-)-secologanin 是一种环烯醚萜单萜,其结构为乙醛,其中一个甲基上的氢原子被 2-(β-D-吡喃葡萄糖基氧基)-3,4-二氢-2H-吡喃-4-基取代,该基团的 3 位和 5 位分别被乙烯基和甲氧羰基取代(2S,3R,4S 立体异构体)。它是一种植物代谢产物。它是一种 β-D-葡萄糖苷、甲酯、醛、烯酸酯、裂环烯醚萜苷,也属于吡喃类化合物。
据报道,Secologanin 存在于 Dipsacus inermis、Adina pilulifera 和其他一些有相关数据的生物体中。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C17H24O10
分子量
507.74400
精确质量
506.051
元素分析
C, 52.58; H, 6.23; O, 41.20
CAS号
19351-63-4
PubChem CID
161276
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.42g/cm3
沸点
595.5ºC at 760mmHg
闪点
212.2ºC
蒸汽压
1.15E-16mmHg at 25°C
折射率
1.571
LogP
0.209
tPSA
151.98
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
10
可旋转键数目(RBC)
8
重原子数目
27
分子复杂度/Complexity
576
定义原子立体中心数目
8
SMILES
COC(=O)C1=CO[C@H]([C@@H]([C@@H]1CC=O)C=C)O[C@H]2[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O2)CO)O)O)O
InChi Key
CSKKDSFETGLMSB-NRZPKYKESA-N
InChi Code
InChI=1S/C17H24O10/c1-3-8-9(4-5-18)10(15(23)24-2)7-25-16(8)27-17-14(22)13(21)12(20)11(6-19)26-17/h3,5,7-9,11-14,16-17,19-22H,1,4,6H2,2H3/t8-,9+,11-,12-,13+,14-,16+,17+/m1/s1
化学名
methyl (2S,3R,4S)-3-ethenyl-4-(2-oxoethyl)-2-[(2S,3R,4S,5S,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-3,4-dihydro-2H-pyran-5-carboxylate
别名
Secologanin; 19351-63-4; loniceroside; (-)-Secologanin; NK7B26K93T; methyl (2S,3R,4S)-3-ethenyl-4-(2-oxoethyl)-2-[(2S,3R,4S,5S,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-3,4-dihydro-2H-pyran-5-carboxylate; CHEBI:18002; tert-butyl 3-[[5-(1,1,1,3,3,3-hexafluoro-2-hydroxypropan-2-yl)-4,5-dihydro-1,2-oxazole-3-carbonyl]amino]butanoate;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.9695 mL 9.8476 mL 19.6951 mL
5 mM 0.3939 mL 1.9695 mL 3.9390 mL
10 mM 0.1970 mL 0.9848 mL 1.9695 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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