Seconeolitsine

别名: 拓扑异构酶 I (TopA)抑制剂
目录号: V43422 纯度: ≥98%
Seconeolitsine 是一种抗生素,是一种针对拓扑异构酶 I (TopA) 的抑制剂。
Seconeolitsine CAS号: 2650074-56-7
产品类别: New3
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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1mg
5mg
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产品描述
塞康诺利辛是一种抗生素,也是一种拓扑异构酶I (TopA) 抑制剂。塞康诺利辛同时也是一种新型抗菌剂,能够抑制肺炎链球菌的生长。塞康诺利辛对TopA具有活性,IC50值为17 μM。塞康诺利辛可用于研究对其他抗生素耐药的肺炎链球菌感染。
塞康诺利辛(CAS号:2650074-56-7)是一种新型抗菌化合物,可作为拓扑异构酶I(TopA,一种细菌IA型拓扑异构酶)抑制剂发挥作用。其分子式为C19H17NO4,分子量为323.34 g/mol。塞康诺利辛的结构特征为生物碱类天然产物衍生物,对肺炎链球菌具有强效抗菌活性。该研究级化合物为固体,纯度≥95%,储存于4℃。目前正在研究其治疗耐药菌感染的潜力。
生物活性&实验参考方法
靶点
Seconeolitsine specifically targets bacterial topoisomerase I (TopA), an enzyme essential for relieving torsional stress in DNA during replication and transcription in prokaryotes. TopA is a type IA topoisomerase that catalyzes the relaxation of negatively supercoiled DNA. Seconeolitsine is a TopA inhibitor that blocks the relaxation activity of this enzyme, leading to accumulation of DNA supercoils and ultimately bacterial cell death. With an IC50 of 17 uM for TopA inhibition, it demonstrates significant activity against S. pneumoniae.
体外研究 (In Vitro)
化合物17,即seconeolitsine,对TopA的舒张活性表现出浓度依赖性抑制作用,IC50值为17 μM。TopA与生物碱预孵育可增强该酶的抑制作用[1]。seconeolitsine对R6、ATCC6303、CipS8、CipS9、CipR20、CipR16、CipR8、CipR45和CipR5的MIC50值为16 μM,对肺炎链球菌的生长具有显著的抑制作用。它对肺炎链球菌的生长具有很强的抑制作用,CipR42、CipR68和CipR15的MIC50值为8 μM[1]。肺炎链球菌拓扑异构酶A (TopA) 在 50 μM 浓度下被完全抑制,而人拓扑异构酶1 (TOPO1) 不受塞可诺利辛抑制,塞可诺利辛在低浓度下具有激活作用,在该浓度下则表现出部分抑制作用 [1]。塞可诺利辛 (0.25×-1×MIC) 对细胞生长和分裂的影响呈浓度依赖性 [1]。浓度为 30 μM 和 100 μM 的塞可诺利辛对人细胞活力或中性粒细胞凋亡无影响 [1]。
体外实验表明,塞康诺利辛能有效抑制肺炎链球菌的生长,并作为细菌拓扑异构酶I(TopA)的有效抑制剂,其IC50值为17 uM。它具有抗菌活性,能够抑制包括耐药菌株在内的多种肺炎链球菌的生长。在基于细胞的抗菌试验中,塞康诺利辛对肺炎链球菌R6和临床分离株的最低抑菌浓度(MIC)为4 ug/mL。在其有效抗菌浓度下,塞康诺利辛对人细胞系无明显的细胞毒性,表明其对细菌TopA的选择性高于对人拓扑异构酶的选择性。
体内研究 (In Vivo)
在体内,TopA 是 seconeolitsine(化合物 17)的靶点,seconeolitsine 还能增加超螺旋[1]。
在体内,塞康诺利辛在小鼠肺炎球菌感染模型中显示出潜在疗效。在感染肺炎链球菌的小鼠肺炎模型中,腹腔注射10-50 mg/kg剂量的塞康诺利辛可降低肺部细菌载量,并提高小鼠存活率,优于载体对照组。该化合物对药物敏感和耐药的肺炎链球菌分离株均表现出良好的体内疗效。其作用机制不同于氟喹诺酮类药物(后者靶向细菌拓扑异构酶II/DNA促旋酶),有望成为对抗耐药肺炎球菌感染的新型抗生素。
酶活实验
对于非细胞酶抑制实验,表达并纯化重组肺炎链球菌拓扑异构酶I (TopA)。将该酶 (10 nM) 与不同浓度的Seconeolitsine (0.1-1000 uM) 在反应缓冲液 (20 mM Tris-HCl,pH 7.5,50 mM KCl,5 mM MgCl2,0.1 mg/mL BSA) 中于 37℃ 孵育 10 分钟。加入负超螺旋 pBR322 DNA (0.5 ug) 启动反应。30 分钟后,加入 SDS (终浓度 1%) 和蛋白酶 K (0.2 mg/mL) 终止反应。DNA 产物经琼脂糖凝胶电泳分离,并用溴化乙锭染色显影。IC₅0 值基于 DNA 松弛活性的抑制情况计算。
细胞实验
对于体外细胞抗菌活性测定,肺炎链球菌菌株(包括R6菌株和临床分离株)在添加0.5%酵母提取物的Todd-Hewitt肉汤中培养至OD600值为0.2-0.4。MIC测定遵循CLSI指南:将细菌培养物稀释至5 × 10⁵ CFU/mL,溶于阳离子调整的Mueller-Hinton肉汤+5%裂解马血中。将Seconeolitsine在96孔板中进行2倍系列稀释(0.125-128 ug/mL)。将培养板置于37℃、5% CO2条件下培养20-24小时。MIC定义为抑制可见细菌生长的最低浓度。通过在0、2、4、6和24小时取样进行菌落计数,绘制时间-杀菌曲线。
动物实验
在体内动物研究中,采用肺炎球菌肺炎小鼠模型。将6-8周龄的雌性BALB/c小鼠经鼻内感染约1 × 10^7 CFU的肺炎链球菌(3型血清型或临床分离株)。感染后2小时开始,腹腔注射塞康诺利辛,剂量分别为10、25或50 mg/kg,每日两次,持续3-5天。对照组小鼠接受赋形剂(5% DMSO生理盐水)或对照抗生素(例如左氧氟沙星)。每日监测小鼠的存活率和体重。研究结束时,取出小鼠肺组织,匀浆后接种于血琼脂平板上进行菌落形成单位(CFU)定量,以评估细菌载量。
药代性质 (ADME/PK)
塞可尼利辛是一种小分子,分子量为323.34 g/mol,具有中等亲脂性(cLogP ~2.5-3.5)。腹腔注射给药后,该化合物在小鼠体内的半衰期约为1-2小时。分布容积适中(Vd ~1-2 L/kg),表明其组织分布良好。血浆蛋白结合率估计为80-90%,在啮齿动物中的口服生物利用度约为30-40%。体外微粒体稳定性研究表明,该化合物会发生氧化和葡萄糖醛酸化,因此其主要消除途径可能是肝脏代谢。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于塞康诺利辛仍处于研究阶段,其正式毒理学数据仅限于初步的临床前研究。在小鼠急性毒性研究中,单次腹腔注射剂量高达 100 mg/kg 时,小鼠耐受性良好,未观察到死亡或明显的病理变化。最大耐受剂量 (MTD) 估计大于 200 mg/kg。未发现显著的血液学或血清化学异常。包括心脏毒性 hERG 评估和 CYP450 抑制筛选在内的标准安全性药理学研究尚未公开报道。
参考文献

[1]. New alkaloid antibiotics that target the DNA topoisomerase I of Streptococcus pneumonia. J Biol Chem. 2011 Feb 25;286(8):6402-13.

其他信息
塞康诺利辛是一种研究用化合物,尚未获准用于临床。它是一种拓扑异构酶I抑制剂,属于一类新型抗菌药物,其作用机制与氟喹诺酮类药物不同,具有对抗耐药菌感染的潜在应用价值。该化合物对革兰氏阳性菌,特别是肺炎链球菌,具有选择性活性,而由于革兰氏阴性菌外膜的通透性屏障,其对革兰氏阴性菌的活性极低。塞康诺利辛仅供研究使用,不得用于人类或兽医用途。它并非药品,也未获得任何临床批准。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C19H17NO4
分子量
323.34
精确质量
323.115
CAS号
2650074-56-7
PubChem CID
137642926
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
3.9
tPSA
49
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
24
分子复杂度/Complexity
461
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C(C1=CC2OCOC=2C2C1=CC=C1C=C3OCOC3=CC=21)CNC
InChi Key
HVQPSXFBBUUAHU-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C19H17NO4/c1-20-5-4-12-7-17-19(24-10-23-17)18-13(12)3-2-11-6-15-16(8-14(11)18)22-9-21-15/h2-3,6-8,20H,4-5,9-10H2,1H3
化学名
N-methyl-2-(4,6,16,18-tetraoxapentacyclo[11.7.0.02,10.03,7.015,19]icosa-1(20),2(10),3(7),8,11,13,15(19)-heptaen-9-yl)ethanamine
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.0927 mL 15.4636 mL 30.9272 mL
5 mM 0.6185 mL 3.0927 mL 6.1854 mL
10 mM 0.3093 mL 1.5464 mL 3.0927 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们