SIRT5 inhibitor 3

目录号: V47376
SIRT5抑制剂3(化合物46)是一种有效的竞争性SIRT5抑制剂(拮抗剂),IC50为5.9 μM。
SIRT5 inhibitor 3 CAS号: 2128651-12-5
产品类别: New3
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
SIRT5抑制剂3(化合物46)是一种强效的竞争性SIRT5抑制剂(拮抗剂),IC50值为5.9 μM。SIRT5抑制剂3抑制SIRT5的去乙酰化。SIRT5抑制剂3可用于癌症和神经退行性疾病的研究。
SIRT5抑制剂3(2128651-12-5,化合物3)是一种选择性SIRT5抑制剂。SIRT5是一种III类组蛋白去乙酰化酶,可去除赖氨酸残基上的琥珀酰基、丙二酰基和戊二酰基。SIRT5在代谢、氧化应激和癌症中发挥作用。该抑制剂是研究SIRT5功能及其作为潜在治疗靶点的重要工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
Target: SIRT5 (Sirtuin 5, an NAD+-dependent lysine deacylase). SIRT5 preferentially removes negatively charged acyl modifications (succinyl, malonyl, glutaryl) from lysine residues, regulating enzymes involved in fatty acid oxidation, ketogenesis, and the urea cycle. SIRT5 is upregulated in some cancers and contributes to metabolic reprogramming and resistance to oxidative stress. SIRT5 inhibitor 3 is a potent and selective SIRT5 inhibitor, with IC50 in the low micromolar range.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,SIRT5抑制剂3能有效抑制无细胞体系中的SIRT5脱酰酶活性,其IC50值在低uM范围内(具体数值未公开)。该抑制剂对SIRT5具有选择性,优于其他sirtuins(SIRT1、SIRT2、SIRT3、SIRT6)。在细胞实验中,该抑制剂可提高已知SIRT5底物(例如,氨甲酰磷酸合成酶1,CPS1;丙酮酸脱氢酶,PDH)的琥珀酰化和戊二酰化水平。它可能影响细胞代谢和氧化应激反应。
体内研究 (In Vivo)
目前尚未发表针对SIRT5抑制剂3在动物模型中的体内疗效数据。作为一种SIRT5抑制剂,预计其对SIRT5过表达的癌症(例如结直肠癌、肝癌、乳腺癌)小鼠模型以及代谢性疾病和缺血再灌注损伤均有疗效。但尚未有详细的动物研究报道。
酶活实验
对于无细胞SIRT5脱酰酶活性测定:将重组SIRT5蛋白(50-100 ng)与不同浓度的SIRT5抑制剂3(0-100 uM)、NAD+(1-2 mM)和荧光肽底物(例如Ac-Arg-His-Lys-Succinyl-Lys-AMC或Ac-Arg-His-Lys-Glutaryl-Lys-AMC)在测定缓冲液(50 mM Tris-HCl pH 8.0、137 mM NaCl、2.7 mM KCl、1 mM MgCl2、1 mg/mL BSA、1 mM DTT)中于37℃孵育30-60分钟。加入含有胰蛋白酶和烟酰胺的显色液终止反应,并在360/460 nm处测量荧光强度。 IC50值由剂量反应曲线计算得出。为了评估选择性,对SIRT1、SIRT2、SIRT3和SIRT6进行了类似的检测。
细胞实验
对于基于细胞的检测:将癌细胞系(例如 HCT116、HepG2、MCF7)接种于 6 孔板中,并用 SIRT5 抑制剂 3(1-100 uM,24-48 小时)处理。裂解细胞,并使用针对琥珀酰赖氨酸、戊二酰赖氨酸和丙二酰赖氨酸的抗体,通过蛋白质印迹法分析蛋白裂解液,以评估酰化水平的整体变化。对特定的 SIRT5 底物(例如 CPS1、PDH)进行免疫沉淀,并分析其琥珀酰化水平的升高。使用 MTT 法测定细胞活力。代谢分析(例如耗氧率、细胞外酸化率)可使用 Seahorse 分析仪进行。
动物实验
对于体内动物研究:潜在方案包括使用携带SIRT5过表达肿瘤(例如HCT116、HepG2)的异种移植小鼠模型。SIRT5抑制剂3将配制成10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45%生理盐水溶液,并腹腔注射(10-50 mg/kg),每日一次,持续2-3周。测量肿瘤体积。收集肿瘤组织,用于分析琥珀酰化/戊二酰化水平、代谢标志物和细胞凋亡情况。目前尚无已发表的数据。
药代性质 (ADME/PK)
目前尚无SIRT5抑制剂3的药代动力学数据。对于一种小分子SIRT5抑制剂(分子量约400-500,LogP值约2-3),腹腔注射后在啮齿动物体内的预测药代动力学参数为:生物利用度中等,达峰时间(Tmax)0.5-1小时,血浆半衰期2-4小时。该化合物可溶于DMSO。体内制剂为:10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45%生理盐水。口服生物利用度未知。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚未有关于SIRT5抑制剂3的毒性数据报告。SIRT5参与活性氧和氨的解毒,因此抑制SIRT5可能导致氧化应激和高氨血症。然而,SIRT5基因敲除小鼠能够存活且健康,表明该化合物具有一定的安全范围。该化合物仅供研究使用,不得用于人体。
参考文献

[1]. Overview of SIRT5 as a potential therapeutic target: Structure, function and inhibitors. Eur J Med Chem. 2022;236:114363.

其他信息
SIRT5抑制剂3是一种尚未获准用于临床的研究化合物。它是研究SIRT5在代谢、氧化应激、癌症和其他疾病中作用的重要工具。它在癌症研究(代谢重编程、耐药性)、代谢紊乱(肥胖、糖尿病、脂肪肝)和神经退行性疾病方面具有潜在的应用价值。该化合物还可用作化学探针,以验证SIRT5作为治疗靶点的有效性。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C22H12FN3O4
分子量
401.346788406372
精确质量
401.081
CAS号
2128651-12-5
PubChem CID
137639138
外观&性状
Orange to red solid powder
LogP
3.8
tPSA
127
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
30
分子复杂度/Complexity
787
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C(O)(=O)C1=CC=C(C2=CC=C(/C=C(\C#N)/C(NC3=CC=C(C#N)C(F)=C3)=O)O2)C=C1
InChi Key
ZXUUSUJEPKBBBB-CXUHLZMHSA-N
InChi Code
InChI=1S/C22H12FN3O4/c23-19-10-17(6-5-15(19)11-24)26-21(27)16(12-25)9-18-7-8-20(30-18)13-1-3-14(4-2-13)22(28)29/h1-10H,(H,26,27)(H,28,29)/b16-9+
化学名
4-[5-[(E)-2-cyano-3-(4-cyano-3-fluoroanilino)-3-oxoprop-1-enyl]furan-2-yl]benzoic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~25 mg/mL (~62.29 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.4916 mL 12.4580 mL 24.9159 mL
5 mM 0.4983 mL 2.4916 mL 4.9832 mL
10 mM 0.2492 mL 1.2458 mL 2.4916 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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