SJFδ

目录号: V31415 纯度: ≥98%
SJFδ 是一种基于 von Hippel-Lindau 的 PROTAC,具有 10 个原子长度的连接体。
SJFδ CAS号: 2254609-23-7
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
SJFδ 是一种基于 von Hippel-Lindau 配体的 PROTAC,具有 10 个原子长的连接臂。SJFδ 能以 46.17 nM 的 DC50 值降解 p38δ,但不会降解其他 p38 亚型(p38α、p38β 和 p38γ)。
SJFδ(CAS 2254609-23-7)是一种新型的亚型选择性 PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)p38δ 降解剂。它基于 von Hippel-Lindau (VHL) 配体,并具有 10 个原子长的连接臂。SJFδ 能以 46.17 nM 的 DC50 值选择性降解 p38δ,而不会降解其他 p38 亚型(p38α、p38β 或 p38γ)。它的分子式为 C₆₂H₆₃F₂N₇O₁₂S,分子量为 1168.27。
生物活性&实验参考方法
靶点
The primary target of SJFδ is the p38δ protein, a member of the p38 MAP kinase family. It acts as a PROTAC by simultaneously binding to p38δ and the E3 ubiquitin ligase VHL. This brings the target protein into proximity with the ubiquitin-proteasome system, leading to its ubiquitination and subsequent degradation. SJFδ is highly selective, degrading p38δ with a DC50 of 46.17 nM while sparing p38α, p38β, and p38γ.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,SJFδ 能以浓度依赖的方式选择性降解 p38δ 蛋白。该降解过程由 VHL E3 连接酶途径介导。由于其对 p38δ 的选择性优于其他 p38 亚型,因此可作为研究 p38δ 特定生物学功能的有力工具,且不会对其他 p38 家族成员产生脱靶效应。该化合物的活性通过蛋白质印迹法检测 p38δ 蛋白水平的降低来评估,其半数抑制浓度 (DC50) 为 46.17 nM。
体内研究 (In Vivo)
SJFδ的体内疗效数据有限。作为一种PROTAC,其活性有望转化为体内模型中的活性,但具体研究尚不详尽。该化合物分子量较大(1168.27),可能影响其口服生物利用度,但可通过腹腔注射或静脉注射给药。需要开展进一步研究以确定其体内药代动力学、疗效和安全性。
酶活实验
在细胞降解实验中,将表达p38δ的细胞培养于合适的培养基中。用不同浓度的SJFδ处理细胞特定时间。然后裂解细胞,并使用抗p38δ和抗p38(泛)抗体通过Western blot分析蛋白水平。通过密度扫描法定量降解效率,并计算DC50值。为了验证选择性,还检测了其他p38亚型的水平。
细胞实验
在细胞学研究中,将细胞接种于6孔板或96孔板中,并用浓度为1 nM至10 µM的SJFδ处理4-24小时。用含蛋白酶抑制剂的RIPA裂解缓冲液裂解细胞。通过Western blot分析靶蛋白水平。处理48-72小时后,采用MTT或CellTiter-Glo法评估细胞活力。通过Annexin V/PI染色评估细胞凋亡。
动物实验
在体内疗效研究中,可使用6-8周龄的雌性免疫缺陷小鼠。将癌细胞皮下植入小鼠体内。当肿瘤体积达到约100-200 mm³时,将动物随机分组进行治疗。SJFδ以溶剂配制,并通过静脉或腹腔注射给药。每周测量两次肿瘤体积。研究结束时,切除肿瘤并进行Western blot分析,以检测p38δ的降解情况。
药代性质 (ADME/PK)
SJFδ的药代动力学特性尚未得到充分报道。作为一种较大的PROTAC分子(分子量1168.27),其口服生物利用度预计较低,可能需要肠外给药。任何治疗开发都需要对其药代动力学特征进行表征,包括半衰期、清除率和组织分布。连接基和配体组成均旨在发挥PROTAC功能。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于SJFδ是一种研究性化合物,其毒理学数据有限。目前尚未有关于其急性毒性、器官特异性毒性或致突变性的数据报道。与所有研究性化合物一样,在处理SJFδ时应采取适当的安全预防措施,包括使用个人防护装备。
参考文献

[1]. Differential PROTAC substrate specificity dictated by orientation of recruited E3 ligase. Nat Commun. 2019 Jan 10;10(1):131.

其他信息
SJFδ(CAS 2254609-23-7)是一种选择性降解p38δ的PROTAC,其DC50值为46.17 nM。它基于VHL配体,并具有10原子连接基。它不会降解p38α、p38β或p38γ。其分子式为C₆₂H₆₃F₂N₇O₁₂S,分子量为1168.27。它是研究p38δ生物学的重要工具,仅供科研使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C62H63F2N7O12S
分子量
1168.26514172554
精确质量
1119.458
CAS号
2254609-23-7
PubChem CID
155885775
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
LogP
7.4
tPSA
262
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
16
可旋转键数目(RBC)
27
重原子数目
80
分子复杂度/Complexity
2030
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
CGOWEGDPCPSDKZ-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C59H67F2N7O11S/c1-36-52(80-35-65-36)38-12-10-37(11-13-38)32-64-54(71)46-29-42(69)33-67(46)55(72)53(58(2,3)4)66-51(70)34-77-26-7-6-24-76-25-8-9-27-78-50-31-45-43(30-49(50)75-5)47(20-23-63-45)79-48-19-18-41(28-44(48)61)68(40-16-14-39(60)15-17-40)57(74)59(21-22-59)56(62)73/h10-20,23,28,30-31,35,42,46,53,69H,6-9,21-22,24-27,29,32-34H2,1-5H3,(H2,62,73)(H,64,71)(H,66,70)
化学名
1-N'-[3-fluoro-4-[7-[4-[4-[2-[[1-[4-hydroxy-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]pyrrolidin-1-yl]-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-2-oxoethoxy]butoxy]butoxy]-6-methoxyquinolin-4-yl]oxyphenyl]-1-N'-(4-fluorophenyl)cyclopropane-1,1-dicarboxamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 0.8560 mL 4.2798 mL 8.5597 mL
5 mM 0.1712 mL 0.8560 mL 1.7119 mL
10 mM 0.0856 mL 0.4280 mL 0.8560 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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