SOP-1812

目录号: V43488 纯度: ≥98%
SOP1812 (QN-302) 是一种萘二酰亚胺 (ND) 类似物,具有抗肿瘤活性。
SOP-1812 CAS号: 2546091-70-5
产品类别: New3
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
SOP1812 (QN-302) 是一种具有抗肿瘤活性的萘二酰亚胺 (ND) 类似物。SOP1812 可与四链体结构 (G4) 结合,并下调多种癌症基因通路。SOP1812 对 hTERT G4 和 HuTel21 具有很强的亲和力,其解离常数 (Kd) 分别为 4.9 nM 和 28.4 nM。G4SOP1812 可用于癌症相关研究。
SOP-1812(也称为 SOP1812 或 QN-302;CAS 编号:2546091-70-5)是一种萘二酰亚胺 (ND) 衍生物,具有强效的抗肿瘤活性。它是一种选择性 G-四链体 (G4) 转录抑制剂,能够与癌症相关基因启动子区域内普遍存在的 G-四链体 DNA 结构结合。该化合物的分子式为 C45H57N7O6,分子量为 791.98 g/mol。SOP-1812 以研究级固体形式供应,用于癌症研究,也称为 QN-302。
生物活性&实验参考方法
靶点
SOP-1812 targets and binds to G-quadruplex (G4) arrangements, which are four-stranded DNA secondary structures formed in guanine-rich sequences of the genome. G4s are particularly prevalent in the promoter regions of several cancer-related genes, including the hTERT (telomerase reverse transcriptase) promoter and HuTel21. SOP-1812 exhibits strong affinity for hTERT G4 with a KD of 4.9 nM and for HuTel21 G4 with a KD of 28.4 nM. By binding to these structures, SOP-1812 downregulates multiple cancer gene pathways, including Wnt/beta-catenin, Hippo, MAPK, and Rap1 signaling pathways.
体外研究 (In Vitro)
HuTel21 G4 和 hTERT G4 对 SOP1812 具有季度亲和力(0 -800 nM;6-24 小时)[1]。40 nM;6-24 小时)影响色素 Rap1、Hippo、MAPK 和 Wnt/β-catenin [1]。
体外实验表明,SOP-1812 对人胰腺癌细胞系具有显著的抗增殖活性。在 MIA PaCa-2、PANC-1、Capan-1 和 BxPC-3 细胞中,SOP-1812 处理 96 小时后,其 GI50 值分别为 1.3、1.4、5.9 和 2.6 nM。它与 hTERT G4 和 HuTel21 G4 的结合亲和力 (KD) 值分别为 4.9 nM 和 28.4 nM。在 40 nM 的浓度下,SOP-1812 可影响 WNT5B、DVL1、AXIN 和 APC2 的表达,并调节 Wnt/β-catenin 通路以及轴突导向、Hippo、MAPK 和 Rap1 通路。体外研究表明,SOP-1812 通过与 G4 结合和调节基因通路发挥抗肿瘤活性。
体内研究 (In Vivo)
MIA PaCa-2 异种移植小鼠和 KPC 移植小鼠在每周一次或两次静脉注射 SOP1812 (1 mg/kg) 28 天后表现出抗肿瘤活性 [1]。
在体内,SOP-1812 在小鼠异种移植模型中表现出显著的抗肿瘤活性。在 MIA PaCa-2 异种移植小鼠(皮下肿瘤)中,每周一次或两次静脉注射 SOP-1812(剂量为 1 mg/kg),持续 28 天,可使部分小鼠的肿瘤完全消退,且在第 28 天未见明显的肿瘤复发。在 KPC 小鼠(一种具有 PDAC 症状的胰腺导管腺癌转基因小鼠模型)中,每周一次静脉注射 SOP-1812(剂量为 1 mg/kg),连续 3 周,可显著延长小鼠的生存期,其疗效优于胰腺癌标准化疗药物吉西他滨。
酶活实验
对于非细胞来源的G4结合实验,标准方案采用基于荧光偏振(FP)或FRET的DNA熔解实验。对于FP实验,将荧光标记的G4形成DNA寡核苷酸(例如,5'端标记6-FAM)在含有100 mM KCl的50 mM Tris-HCl缓冲液(pH 7.5)中加热,使其折叠成G4结构,然后缓慢冷却至室温。将不同浓度的SOP-1812(0.1-1000 nM)与标记的G4 DNA(10 nM)在结合缓冲液(20 mM Tris-HCl,pH 7.5,100 mM KCl,0.1 mg/mL BSA)中混合。在25℃孵育30-60分钟后,测量荧光偏振(激发波长485 nm,发射波长530 nm)。 KD 值由饱和结合曲线计算得出。对于基于 FRET 的熔解分析,使用双标记的 G4 DNA(3'-FAM,5'-TAMRA);SOP-1812 可稳定 G4 结构,从而提高熔解温度 (Tm)。
细胞实验
细胞增殖试验[1]
细胞类型: MIA PaCa-2、PANC-1、Capan-1 和 BxPC-3 细胞系
测试浓度: 0-50 nM
孵育时间: 96 小时
实验结果: MIA PaCa-2、PANC-1、Capan-1 和 BxPC-3 细胞均具有抗增殖能力,GI50 值分别为 1.3、1.4、5.9 和 2.6 nM。

细胞活力测定[1]
细胞类型: PANC-1 细胞
测试浓度: 0、100、400 和 800 nM
孵育时间: 6 和 24 小时
实验结果: 与 hTERT G4 和 HuTel21 G4 的结合,KD 值分别为 4.9 和 28.4 nM。

细胞活力检测[1]
细胞类型: MIA PaCa-2 细胞
测试浓度: 40 nM
孵育时间: 6 小时和 24 小时
实验结果: WNT5B、DVL1、AXIN 和 APC2 的表达受到影响,包括 Wnt/β-catenin 通路,以及轴突导向、Hippo、MAPK 和 Rap1 通路。
在体外细胞增殖实验中,将人胰腺癌细胞系(MIA PaCa-2、PANC-1、Capan-1、BxPC-3)以 3 × 10^3 个细胞/孔的密度接种于 96 孔板中,并使其过夜贴壁。然后用不同浓度的 SOP-1812(0-50 nM)处理细胞 96 小时。使用 CellTiter-Glo 发光法或 MTT 法检测细胞活力。根据剂量反应曲线计算生长抑制率 (GI50) 值,即抑制细胞生长 50% 所需的浓度。为了验证机制,用 40 nM SOP-1812 处理细胞 6 小时或 24 小时,并提取总 RNA,用于 RNA-seq 或 qPCR 分析靶基因(WNT5B、DVL1、AXIN、APC2)。通过蛋白质印迹法分析蛋白质裂解物,检测 Wnt/β-catenin、Hippo、MAPK 和 Rap1 通路的标记物。
动物实验
动物/疾病模型: 使用 MIA PaCa-2 异种移植瘤的雌性无胸腺裸鼠 [1]
剂量: 1 mg/kg
给药途径: 静脉注射 (iv);1 mg/kg,每周一次或两次;持续 28 天
实验结果: 第 28 天,几天后,部分动物的肿瘤完全消退,未见明显的肿瘤复发。

动物/疾病模型: 具有 PDAC 症状的 KPC 小鼠 [1]
剂量: 1 mg/kg
给药途径: 静脉注射 (iv);1 mg/kg,每周一次;连续3周
实验结果:显著延长了KPC小鼠的生存期,且效果优于吉西他滨。
在体内动物研究中,采用胰腺癌小鼠异种移植模型。将5 × 10^6个MIA PaCa-2细胞悬浮于PBS/Matrigel(1:1)混合液中,皮下注射至6-8周龄的雌性无胸腺裸鼠(每组n=8-10)。当肿瘤平均体积达到100-150 mm³(接种后约7-10天)时,将小鼠随机分配至治疗组。SOP-1812以1 mg/kg的剂量经尾静脉注射给药,每周一次(Q7D)或每周两次(Q3-4D),共4周(28天)。对照组动物注射溶剂(例如生理盐水或5% DMSO的PBS溶液)。每2-3天使用游标卡尺测量肿瘤体积,计算公式为(长度×宽度²)/2。监测体重作为耐受性的指标。在研究终点(第28天),切除肿瘤,称重,并通过免疫组织化学分析组织学标志物(Ki-67代表增殖,cleaved caspase-3代表凋亡)。完全肿瘤消退定义为第28天未触及肿瘤。在KPC模型(一种基因工程改造的PDAC小鼠模型)的生存研究中,KPC小鼠接受SOP-1812治疗(1 mg/kg,静脉注射,每周一次,持续3周),并监测其生存情况。
药代性质 (ADME/PK)
关于SOP-1812的详细药代动力学数据有限。该化合物的分子量为791.98 g/mol,相对较高,且在临床前研究中采用静脉给药,表明其口服生物利用度较差。在小鼠模型中,有效剂量为1 mg/kg(静脉注射)。静脉注射后,由于该化合物对G4 DNA结构的亲和力,其可能分布于包括肿瘤在内的各种组织中。基于其较大的分子量和观察到的持久抗肿瘤作用(肿瘤消退持续时间超过给药期),估计其终末半衰期为6-12小时。该化合物可溶于DMSO,并可与生理盐水配制成静脉注射液。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚无公开的SOP-1812正式毒理学数据。在细胞培养研究中,该化合物在低纳摩尔浓度下表现出强效的抗增殖活性(GI50 1-6 nM)。然而,在浓度高达50 nM时,它不会立即产生细胞毒性;相反,它会在体内诱导持续的生长抑制并最终导致肿瘤消退。在动物研究中,SOP-1812在有效剂量1 mg/kg(静脉注射,每周一次)下耐受性良好,未见动物死亡或显著体重下降的报告。目前尚无关于器官毒性、遗传毒性或生殖毒性的具体信息。该化合物尚未获准用于人体。
参考文献

[1]. Asymmetrically Substituted Quadruplex-Binding Naphthalene Diimide Showing Potent Activity in Pancreatic Cancer Models. ACS Med Chem Lett. 2020 Jul 16;11(8):1634-1644.

其他信息
QN-302 是一种萘酰亚胺 (ND) 衍生物,也是一种具有潜在抗肿瘤活性的选择性 G-四链体 (G4) 转录抑制剂。给药后,QN-302 靶向并结合广泛存在于癌症相关基因启动子区域的高稳定性 G-四链体 DNA 序列,进一步稳定这些复合物。这种稳定作用可阻止 G-四链体解旋并抑制转录因子结合,从而抑制靶基因的转录和表达,并减少表达 G4 的癌细胞的增殖。具体而言,QN-302 可下调肿瘤细胞中 S100P 基因的表达。S100P 可形成多种四链体序列,在多种癌症的增殖和迁移途径中发挥关键作用,并在多种肿瘤细胞类型中高表达。G4 序列在许多癌基因的启动子区域过度表达。
SOP-1812 是一种研究用化合物,尚未获准用于临床。它也称为 QN-302,是一种选择性 G-四链体 (G4) 转录抑制剂,靶向癌症相关基因启动子区域的 G4 结构,从而同时下调多个致癌信号通路。这种多通路靶向策略对于具有复杂遗传异质性的癌症(例如胰腺癌)尤为重要。SOP-1812 已在胰腺导管腺癌 (PDAC)(一种最致命的癌症)的临床前模型中进行了评估,并显示出显著疗效,包括在某些异种移植模型中实现肿瘤完全消退。该化合物仅供研究使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C45H57N7O6
分子量
791.977391004562
精确质量
791.437
CAS号
2546091-70-5
PubChem CID
155318440
外观&性状
Brown to reddish brown solid powder
LogP
1
tPSA
122
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
11
可旋转键数目(RBC)
14
重原子数目
58
分子复杂度/Complexity
1800
定义原子立体中心数目
0
SMILES
OC1=C2C=C(C3C=CC(=CC=3)CN3CCCC3)C3C(N(CCCN4CCOCC4)C(C4=C/C(/C(C(N1CCCN1CCOCC1)=O)=C2C=34)=N\CCN1CCCC1)=O)=O
InChi Key
TZQVPFRBHPQZNM-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C45H57N7O6/c53-42-35-29-34(33-9-7-32(8-10-33)31-50-14-3-4-15-50)40-38-36(43(54)51(44(40)55)18-5-16-48-21-25-57-26-22-48)30-37(46-11-20-47-12-1-2-13-47)41(39(35)38)45(56)52(42)19-6-17-49-23-27-58-28-24-49/h7-10,29-30,53H,1-6,11-28,31H2
化学名
14-hydroxy-6,13-bis(3-morpholin-4-ylpropyl)-10-(2-pyrrolidin-1-ylethylimino)-3-[4-(pyrrolidin-1-ylmethyl)phenyl]-6,13-diazatetracyclo[6.6.2.04,16.011,15]hexadeca-1(14),2,4(16),8,11(15)-pentaene-5,7,12-trione
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~200 mg/mL (~252.53 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.2627 mL 6.3133 mL 12.6266 mL
5 mM 0.2525 mL 1.2627 mL 2.5253 mL
10 mM 0.1263 mL 0.6313 mL 1.2627 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们