TAMRA-Azide-PEG-Biotin

目录号: V15723 纯度: ≥98%
TAMRA-Azide-PEG-biotin 是 TAMRA 的染料类似物。
TAMRA-Azide-PEG-Biotin CAS号: 1797415-74-7
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
TAMRA-叠氮-PEG-生物素是TAMRA的染料类似物。TAMRA-叠氮-PEG-生物素含有叠氮(N3)基团,可与带有炔基的化合物发生CuAAc(铜催化叠氮-炔环加成反应)。对于带有BCN或DBCO基团的化合物,也可发生SPAAC(应变促进的炔-叠氮环加成反应)。
TAMRA-叠氮-PEG-生物素(CAS号:1797415-74-7)是一种三功能点击化学试剂,由四甲基罗丹明(TAMRA)荧光团、生物素亲和基团和叠氮反应基团组成,并通过亲水性聚乙二醇(PEG)间隔基连接。它能够同时进行CuAAC/SPAAC偶联、直接在凝胶内进行荧光可视化以及近乎不可逆的链霉亲和素捕获。它以纯度≥98%的固体粉末形式供应。
生物活性&实验参考方法
靶点
This compound is a multifunctional bioconjugation reagent rather than a drug with a specific biological target. The azide group enables copper-catalyzed azide-alkyne cycloaddition (CuAAC) with alkyne-tagged molecules. The biotin group provides high-affinity binding to streptavidin (Kd ~10⁻¹⁵ M). The TAMRA fluorophore allows for fluorescent detection (Abs/Em ~545/565 nm).
体外研究 (In Vitro)
PROTAC 包含两个不同的配体,一个与 E3 泛素连接酶结合,另一个与靶蛋白结合,二者通过连接子连接。PROTAC 通过细胞内泛素-蛋白酶体系统选择性地降解靶蛋白 [1]。
由于该化合物本身是一个连接子,因此不具有直接的生物活性。其体外应用价值在于能够通过点击化学反应形成稳定的缀合物,从而实现生物分子的标记和检测。亲水性 PEG 间隔基可提高其水溶性。它可用作连接子和间隔基,将 PEG 部分连接到蛋白质、肽、寡核苷酸、小分子和纳米颗粒上。
体内研究 (In Vivo)
该化合物是一种化学试剂,本身不具有直接的体内生物活性。其在体内的应用是作为生物偶联物的组成部分,可用于成像和亲和纯化等应用。生物素基团可实现基于链霉亲和素的捕获和富集,而TAMRA荧光团则可用于生物样品中的荧光检测。
酶活实验
作为化学连接剂,该化合物不用于生物酶活性测定。其用途在于化学偶联反应。叠氮基团可通过铜催化炔烃-炔烃偶联反应(CuAAC)与炔烃反应。该反应通常在铜催化剂和还原剂存在下进行。生物素基团可用于链霉亲和素磁珠的亲和纯化。偶联效率可通过高效液相色谱(HPLC)、液相色谱-质谱联用(LC-MS)或凝胶电泳进行监测。
细胞实验
对于使用该连接子合成的缀合物进行的体外细胞检测,靶细胞需用不同浓度的缀合物处理。生物活性取决于缀合分子而非连接子本身。TAMRA荧光团可用于荧光显微镜或流式细胞术观察。生物素基团可用于链霉亲和素偶联探针的检测。
药代性质 (ADME/PK)
TAMRA-叠氮化物-PEG-生物素(CAS 1797415-74-7)为固体粉末,可溶于DMSO、水、DMF和DCM。短期储存应置于0-4℃干燥避光处,长期储存应置于-20℃。分子式为C57H79N11O14S,分子量为1174.38。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
作为化学连接剂,该化合物本身不具有药理活性,也不直接具有毒性。毒性可能与使用该连接剂合成的最终缀合物有关。聚乙二醇(PEG)组分通常被认为具有生物相容性和无毒性。现有文献中未提供具体的毒性数据。
参考文献

[1]. Small-molecule PROTACs: An emerging and promising approach for the development of targeted therapy drugs. EBioMedicine. 2018 Oct;36:553-562.

其他信息
该化合物是一种功能强大的多功能生物偶联试剂,可用于亲和纯化、蛋白质富集和点击化学反应。本品仅供研究使用,不得用于人体或临床用途。目前尚未有获批的治疗用途报告。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C57H79N11O14S
分子量
1174.36747288704
精确质量
2348.109
CAS号
1797415-74-7
PubChem CID
146026259
外观&性状
Purple to purplish red solid powder
tPSA
599
氢键供体(HBD)数目
10
氢键受体(HBA)数目
36
可旋转键数目(RBC)
76
重原子数目
166
分子复杂度/Complexity
4530
定义原子立体中心数目
0
SMILES
S1C[C@H]2[C@@H]([C@@H]1CCCCC(NCCOCCOCCOCCNC(CCN(C(CCNC(C1C=CC(=C(C(=O)[O-])C=1)C1C3C=CC(=CC=3OC3=C/C(/C=CC=13)=[N+](\C)/C)N(C)C)=O)=O)CCOCCOCCOCCN=[N+]=[N-])=O)=O)NC(N2)=O
InChi Key
OLNZJSRKGRJBHG-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/2C57H79N11O14S/c1-66(2)40-10-13-44-48(36-40)82-49-37-41(67(3)4)11-14-45(49)53(44)46-35-39(9-12-43(46)56(73)74)54(72)61-17-15-52(71)68(22-26-79-30-34-81-33-29-78-25-20-62-65-58)21-16-51(70)60-19-24-77-28-32-80-31-27-76-23-18-59-50(69)8-6-5-7-42-38-47-55(83-42)64-57(75)63-47;1-66(2)40-10-13-44-48(36-40)82-49-37-41(67(3)4)11-14-45(49)53(44)43-12-9-39(35-46(43)56(73)74)54(72)61-17-15-52(71)68(22-26-79-30-34-81-33-29-78-25-20-62-65-58)21-16-51(70)60-19-24-77-28-32-80-31-27-76-23-18-59-50(69)8-6-5-7-42-38-47-55(83-42)64-57(75)63-47/h2*9-14,35-37,42,47,55H,5-8,15-34,38H2,1-4H3,(H5-,59,60,61,63,64,69,70,72,73,74,75)
化学名
4-[[3-[2-[2-[2-(2-azidoethoxy)ethoxy]ethoxy]ethyl-[3-oxo-3-[2-[2-[2-[2-[5-(2-oxo-1,3,3a,5,6,6a-hexahydrothieno[2,3-d]imidazol-5-yl)pentanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]propyl]amino]-3-oxopropyl]carbamoyl]-2-[3-(dimethylamino)-6-dimethylazaniumylidenexanthen-9-yl]benzoate;5-[[3-[2-[2-[2-(2-azidoethoxy)ethoxy]ethoxy]ethyl-[3-oxo-3-[2-[2-[2-[2-[5-(2-oxo-1,3,3a,5,6,6a-hexahydrothieno[2,3-d]imidazol-5-yl)pentanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]propyl]amino]-3-oxopropyl]carbamoyl]-2-[3-(dimethylamino)-6-dimethylazaniumylidenexanthen-9-yl]benzoate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 0.8515 mL 4.2576 mL 8.5152 mL
5 mM 0.1703 mL 0.8515 mL 1.7030 mL
10 mM 0.0852 mL 0.4258 mL 0.8515 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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