TDP1 Inhibitor-2

目录号: V46134 纯度: ≥98%
TDP1 Inhibitor-2 (Compound 5) 是一种有效的 TDP1(酪氨酰 DNA 磷酸二酯酶 1)抑制剂(拮抗剂),IC50 为 99 nM。
TDP1 Inhibitor-2 CAS号: 859142-95-3
产品类别: New3
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产品描述
TDP1 抑制剂-2(化合物 5)是一种强效的 TDP1(酪氨酰-DNA 磷酸二酯酶 1)抑制剂(拮抗剂),IC50 为 99 nM。TDP1 抑制剂-2 还能抑制 SCAN1(伴轴突神经病变的脊髓小脑性共济失调综合征),IC50 为 3.5 μM。
TDP1抑制剂-2(CAS号:859142-95-3)是一种强效的酪氨酰-DNA磷酸二酯酶1(TDP1)抑制剂,IC50值为99 nM。它还能抑制SCAN1(脊髓小脑性共济失调伴轴索性神经病变综合征),IC50值为3.5 microM。TDP1抑制剂-2细胞毒性低,且与拓扑替康(一种Top1类抗癌药物)具有协同作用,使其成为癌症治疗的潜在辅助药物。
生物活性&实验参考方法
靶点
TDP1 (tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1). TDP1 is a DNA repair enzyme that removes topoisomerase I-DNA cleavage complexes. TDP1 Inhibitor-2 is a potent TDP1 inhibitor (IC50=99 nM) that also inhibits the mutant SCAN1 TDP1 variant (IC50=3.5 microM). By inhibiting TDP1, the compound sensitizes cancer cells to Top1-targeting chemotherapy drugs like topotecan, blocking DNA repair and enhancing anti-cancer efficacy.
体外研究 (In Vitro)
TDP1 抑制剂-2(化合物 5)表现出强大的抗 TDP1 活性、最小的细胞毒性,并且与众所周知的 Top1 抗癌药物拓扑替康具有协同作用 [1]。
TDP1抑制剂-2在体外表现出强效的抗TDP1活性,IC50值为99 nM,细胞毒性低,并且与拓扑异构酶I类抗癌药物拓扑替康具有协同作用。与拓扑替康联合使用时,TDP1抑制剂-2通过抑制拓扑异构酶I介导的DNA损伤修复,增强化疗的抗增殖作用。其单独使用时细胞毒性低,表明联合用药具有良好的安全性。
体内研究 (In Vivo)
参考文献中未提供TDP1抑制剂-2的体内活性数据。作为一种旨在增强癌细胞对拓扑异构酶I抑制剂敏感性的TDP1抑制剂,体内研究可能需要采用异种移植小鼠模型,并联合使用TDP1抑制剂-2和拓扑替康进行治疗,以评估其对肿瘤生长的抑制作用和生存获益。
酶活实验
参考文献中未明确详细描述。典型的TDP1酶活性测定方法是将重组TDP1与含有磷酸酪氨酸键的荧光标记DNA底物孵育,该底物模拟拓扑异构酶I-DNA切割复合物。加入不同浓度的TDP1抑制剂-2,并在37℃下通过测定荧光产物随时间的释放量来评估酶活性。IC50值由剂量反应曲线计算得出。
细胞实验
参考文献中未明确详细说明。TDP1抑制剂-2的标准细胞毒性试验包括:用递增浓度的TDP1抑制剂-2单独或与拓扑替康联合处理癌细胞系72小时,并使用MTT或克隆形成试验检测细胞活力。通过计算联合指数值来评估协同作用。应确认该抑制剂单独使用时的低细胞毒性。
动物实验
参考文献中未提供TDP1抑制剂-2的体内动物实验方案。典型的异种移植研究是将癌细胞皮下接种到裸鼠体内。待肿瘤达到一定大小后,对小鼠进行TDP1抑制剂-2(例如,口服或腹腔注射)治疗,可联合或不联合拓扑替康,疗程为2-4周。每2-3天测量一次肿瘤体积。
药代性质 (ADME/PK)
TDP1抑制剂-2的分子量为465.28,分子式为C25H14Cl2O5。它是一种有机化合物,呈白色至黄色固体状。粉末状应储存于-20℃;溶液状的TDP1抑制剂-2在-80℃下可稳定保存6个月,或在-20℃下可稳定保存1个月。参考文献中未提供其溶解度信息。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
参考文献中未提供TDP1抑制剂-2的详细毒性数据。据报道,该化合物单独使用时体外细胞毒性较低,这对于化学增敏剂而言是理想的。然而,仍需进行全面的动物毒性研究以评估其潜在治疗用途的安全性。
参考文献

[1]. Identification of novel inhibitors for the tyrosyl-DNA-phosphodiesterase 1 (Tdp1) mutant SCAN1 using virtual screening. Bioorg Med Chem. 2020 Jan 1;28(1):115234.

其他信息
TDP1抑制剂-2通过抑制TDP1(一种DNA修复酶,可抵消Top1抑制剂的作用),展现出一种有前景的化疗增敏策略。体外实验表明,该化合物与拓扑替康具有协同作用,提示其可能增强现有化疗药物的疗效。该化合物目前仍处于研究阶段,尚未获准用于临床。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C25H14CL2O5
分子量
465.281665325165
精确质量
464.021
CAS号
859142-95-3
PubChem CID
1767837
外观&性状
White to yellow solid powder
LogP
5.8
tPSA
61.8
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
32
分子复杂度/Complexity
798
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C1(=O)OC2=CC=CC=C2C=C1C1C2=CC=C(OCC3=C(Cl)C=CC=C3Cl)C=C2OC(=O)C=1
InChi Key
QEOYHBDGERTIQV-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C25H14Cl2O5/c26-20-5-3-6-21(27)19(20)13-30-15-8-9-16-17(12-24(28)31-23(16)11-15)18-10-14-4-1-2-7-22(14)32-25(18)29/h1-12H,13H2
化学名
7-[(2,6-dichlorophenyl)methoxy]-4-(2-oxochromen-3-yl)chromen-2-one
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.1492 mL 10.7462 mL 21.4924 mL
5 mM 0.4298 mL 2.1492 mL 4.2985 mL
10 mM 0.2149 mL 1.0746 mL 2.1492 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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