TL13-112

别名: TL13112 TL13 112
目录号: V38005 纯度: ≥98%
TL13-112 (TL-13112; TL13 112) 是一种新型、有效的间变性淋巴瘤激酶 (ALK) PROTAC 降解剂,由 LDK378 与 pomalidomide 结合而成。
TL13-112 CAS号: 2229037-19-6
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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5mg
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产品描述
TL13-112(TL-13112;TL13 112)是一种新型高效的PROTAC降解剂,通过将LDK378与泊马度胺偶联,可降解间变性淋巴瘤激酶(ALK)。
TL13-112 是一种高效且选择性的 PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)降解剂,靶向间变性淋巴瘤激酶 (ALK)。它是一种杂合分子,能够同时抑制 ALK 激酶活性,并通过泊马度胺衍生的 cereblon 配体募集 E3 连接酶 CRL4CRBN,从而靶向 ALK,使其通过 E3 连接酶介导的泛素化和蛋白酶体降解而被破坏。其 ALK 靶向功能基于 ALK 抑制剂 NVP-TAE684。
生物活性&实验参考方法
靶点

TL13-112 targets anaplastic lymphoma kinase (ALK), an oncogenic receptor tyrosine kinase involved in various cancers including non-small cell lung cancer, anaplastic large cell lymphoma, and neuroblastoma. The compound binds to ALK via its ceritinib-based targeting moiety and recruits the E3 ubiquitin ligase cereblon (CRBN) via its pomalidomide ligand, inducing ALK ubiquitination and subsequent proteasomal degradation. TL13-112 also induces degradation of additional kinases including Aurora A (IC50 = 8550 nM), FER (IC50 = 42.4 nM), PTK2 (focal adhesion kinase, IC50 = 25.4 nM), and RPS6KA1 (RSK1, IC50 = 677 nM).

IC50: 0.14 nM (ALK)[1]

体外研究 (In Vitro)
TL13-112 与 cereblon 结合的 IC50 为 2.4 μM。[1] TL13-112(0.01 μM-1 μM;16 小时)选择性降解 ALK,在 H3122 细胞和 Karpas 299 细胞中的 DC50 分别为 10 nM 和 40 nM。H3122 细胞经 TL13-112 处理 4 小时后即可观察到 ALK 降解,而 Karpas 299 细胞经 TL13-112 处理 8 小时后即可观察到 ALK 降解。两种细胞系中,16 小时后 ALK 降解率均达到最高。[1] TL13-112(0.01 μM-1 μM;16 小时)以剂量依赖的方式降低 H3122、Karpas 299 和 Kelly 细胞中 PTK2、ALK、FER、RPS6KA1 和 Aurora A 的表达。[1]
体外实验表明,TL13-112 能以 0.14 nM 的 IC50 值抑制 ALK 活性。它对 ALK 具有降解活性,在 H3122 细胞中的 DC50 值为 10 nM,在 Karpas 299 细胞中的 DC50 值为 40 nM。TL13-112 呈剂量依赖性地抑制 ALK 阳性细胞系(包括 H3122、Karpas 299、SU-DHL-1、Kelly、Lan5、SH-SY5Y 和 CHLA20 细胞)的增殖。该化合物具有选择性,仅降解少数几种激酶(ALK、Aurora A、FER、PTK2 和 RPS6KA1)。
体内研究 (In Vivo)
目前尚无TL13-112的具体体内活性数据。作为一种PROTAC降解剂,它有望在ALK驱动型癌症的异种移植模型中发挥体内疗效,但已发表的研究尚未报告详细的体内结果。该化合物主要用作研究细胞系统中ALK降解的工具。
酶活实验
体外激酶抑制实验(ALK):将重组ALK激酶(5-20 ng)与不同浓度的TL13-112(0.001-1000 nM)在激酶缓冲液(50 mM HEPES,pH 7.5,10 mM MgCl2,2 mM DTT,0.01% Triton X-100)中孵育。加入ATP(10-100 uM)和肽底物(例如,poly(Glu, Tyr) 4:1)。于30℃孵育30-60分钟。使用抗磷酸酪氨酸抗体进行ELISA检测或使用放射性测定法(33P-ATP)测定磷酸化水平。计算IC50值。
细胞实验
Western Blot 分析[1]
细胞类型: H3122 和 Karpas 299 细胞
测试浓度: 0.01 μM;0.05 μM;0.1 μM;0.5 μM;1 μM
孵育时间: 16 小时
实验结果: 在 1 μM 浓度下完全抑制 ALK 和 Aurora A 的表达。

Western Blot 分析[1]
细胞类型: H3122 和 Karpas 299 细胞
测试浓度: 0.01 μM;0.05 μM;0.1 μM;0.5 μM; 1 μM
孵育时间: 16 小时
实验结果: PTK2、ALK、FER、RPS6KA1 和 Aurora A 表达降低。
降解实验(Western blot):在合适的培养基中培养ALK阳性癌细胞(H3122、Karpas 299、SU-DHL-1)。用浓度为1 nM至10 μM的TL13-112处理细胞4-24小时。测定DC50时,用0.1-1000 nM的TL13-112处理细胞16-24小时。用含有蛋白酶和磷酸酶抑制剂的RIPA缓冲液制备全细胞裂解液。进行SDS-PAGE电泳,转移至硝酸纤维素膜,并用抗ALK抗体进行Western blot分析。使用抗GAPDH或抗β-肌动蛋白抗体作为上样对照。通过密度扫描法定量分析条带强度。H3122细胞的DC50为10 nM,Karpas 299细胞的DC50为40 nM。细胞增殖实验:将ALK阳性细胞接种于96孔板中(5,000-10,000个细胞/孔)。用浓度为0.01-10,000 nM的TL13-112处理72小时。采用CellTiter-Glo或MTT法检测细胞活力。计算GI50值。时间进程降解实验:用固定浓度(例如100 nM)的TL13-112处理细胞,并在0、1、2、4、8、12和24小时收集细胞。泛素化实验:从处理后的细胞裂解液中免疫沉淀ALK,并用抗泛素抗体进行免疫印迹分析。
动物实验
目前尚无体内实验方案。对于潜在的异种移植研究:将ALK阳性癌细胞(例如H3122、Karpas 299)皮下接种到免疫缺陷小鼠体内。当肿瘤体积达到约150 mm³时,腹腔或静脉注射TL13-112,剂量为10-50 mg/kg。TL13-112配制于10% DMSO、40% PEG300、5% Tween-80和45%生理盐水中。监测肿瘤体积和体重。收集肿瘤组织,通过Western blot分析ALK降解情况。
药代性质 (ADME/PK)
目前尚无药代动力学数据。TL13-112 的分子量为 1001.39 g/mol(游离碱)或 1002.6 g/mol。该化合物分子量高且结构复杂,可能影响其口服生物利用度。它可溶于二甲基亚砜 (DMSO)。体外研究通常使用标准 DMSO 制剂。该化合物应以粉末形式储存于 -20℃,避光防潮。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚无毒性数据。作为一种能募集cereblon E3连接酶的PROTAC,它可能与其他cereblon调节药物(例如沙利度胺类似物)一样,具有脱靶降解效应。由于泊马度胺衍生物部分可能具有致畸性,因此应谨慎使用,尤其是在孕妇的情况下。使用时请佩戴适当的个人防护装备。
参考文献

[1]. Chemically Induced Degradation of Anaplastic Lymphoma Kinase (ALK).J Med Chem. 2018 May 10;61(9):4249-4255.

其他信息
TL13-112 是一种仅供实验室研究使用的 PROTAC 化合物,不可用于人体治疗。它是研究 ALK 生物学以及验证靶向蛋白降解作为 ALK 驱动型癌症治疗策略的重要工具。该化合物由 ALK 抑制剂色瑞替尼与泊马度胺连接而成。与传统激酶抑制剂不同,PROTAC 可诱导靶蛋白降解,从而有可能克服耐药突变。目前该研究化合物尚未进行临床试验或获得批准。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C₄₉H₆₀CLN₉O₁₀S
分子量
1002.57
精确质量
1001.387
元素分析
C, 58.70; H, 6.03; Cl, 3.54; N, 12.57; O, 15.96; S, 3.20
CAS号
2229037-19-6
相关CAS号
2229037-19-6;
PubChem CID
138108958
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
密度
1.4±0.1 g/cm3
折射率
1.620
LogP
3.02
tPSA
248
氢键供体(HBD)数目
5
氢键受体(HBA)数目
16
可旋转键数目(RBC)
22
重原子数目
70
分子复杂度/Complexity
1890
定义原子立体中心数目
0
SMILES
ClC1C=NC(=NC=1NC1C=CC=CC=1S(C(C)C)(=O)=O)NC1=CC(C)=C(C=C1OC(C)C)C1CCN(CCOCCOCCNC(CNC2=CC=CC3C(N(C(C=32)=O)C2C(NC(CC2)=O)=O)=O)=O)CC1
InChi Key
XIRQUXILNXIWDI-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C49H60ClN9O10S/c1-29(2)69-40-26-34(31(5)25-38(40)55-49-53-27-35(50)45(57-49)54-36-10-6-7-12-41(36)70(65,66)30(3)4)32-15-18-58(19-16-32)20-22-68-24-23-67-21-17-51-43(61)28-52-37-11-8-9-33-44(37)48(64)59(47(33)63)39-13-14-42(60)56-46(39)62/h6-12,25-27,29-30,32,39,52H,13-24,28H2,1-5H3,(H,51,61)(H,56,60,62)(H2,53,54,55,57)
化学名
N-[2-[2-[2-[4-[4-[[5-chloro-4-(2-propan-2-ylsulfonylanilino)pyrimidin-2-yl]amino]-2-methyl-5-propan-2-yloxyphenyl]piperidin-1-yl]ethoxy]ethoxy]ethyl]-2-[[2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindol-4-yl]amino]acetamide
别名
TL13112 TL13 112
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~99.74 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 0.9974 mL 4.9872 mL 9.9744 mL
5 mM 0.1995 mL 0.9974 mL 1.9949 mL
10 mM 0.0997 mL 0.4987 mL 0.9974 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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