TP-004

别名: TP004; TP 004
目录号: V40460 纯度: ≥98%
TP-004 是一种有效、可逆的 MetAP2 抑制剂(拮抗剂),IC50 为 6 nM。
TP-004 CAS号: 1454299-21-8
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
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产品描述
TP-004 是一种强效、可逆的 MetAP2 抑制剂(拮抗剂),IC50 为 6 nM。
TP-004(CAS号:1454299-21-8)是一种强效、可逆且选择性的甲硫氨酸氨肽酶2 (MetAP2) 抑制剂。MetAP2是一种金属蛋白酶,可催化新合成蛋白质N端甲硫氨酸残基的去除。TP-004是一种特性明确的化学探针,可用于研究血管生成、癌症、肥胖症和代谢紊乱中MetAP2的生物学功能。
生物活性&实验参考方法
靶点
Methionine aminopeptidase 2 (MetAP2). TP-004 binds to the active site of MetAP2 and chelates the divalent metal ion (e.g., Mn2+, Co2+, or Zn2+) essential for enzymatic activity, acting as a non-covalent, reversible inhibitor with an IC50 of 6 nM. It is highly selective for MetAP2 over the closely related MetAP1 (IC50 > 10 uM) and other metalloproteases, making it an excellent chemical probe.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,TP-004 可抑制 MetAP2 的酶活性,阻断新生多肽 N 端甲硫氨酸残基的裂解。这会损害靶蛋白(包括血管生成和细胞增殖的关键调节因子)的正常成熟、稳定性和功能。在人脐静脉内皮细胞 (HUVEC) 中,TP-004 抑制 MetAP2 活性的 EC50 为 15 nM,该值通过检测 N 端甲硫氨酸形式的 14-3-3γ 蛋白的积累量来测定。TP-004 可抑制细胞增殖和血管生成,其抑制 HUVEC 生长的 IC50 值在低纳摩尔至微摩尔范围内。研究表明,TP-004 可通过诱导 G1 期细胞周期阻滞来抑制多种癌细胞系(例如,HCT-116 结肠癌细胞系和 MDA-MB-231 乳腺癌细胞系)的增殖。
体内研究 (In Vivo)
目前尚无已发表的TP-004单药体内研究。基于MetAP2在血管生成中的已知功能以及其他MetAP2抑制剂(例如,富马吉林、TNP-470、M8891)的作用,预计TP-004在小鼠异种移植模型中给药后可抑制肿瘤生长和血管生成。预计TP-004能够穿过血脑屏障(与其他MetAP2抑制剂类似),并可能对原位脑肿瘤模型有效。然而,目前尚未有关于TP-004的此类数据报道。
酶活实验
非细胞 MetAP2 抑制实验:将重组人 MetAP2(大肠杆菌表达)与不同浓度的 TP-004(0.1-1000 nM)在测定缓冲液(50 mM HEPES pH 7.2、50 mM NaCl、5 mM MnCl2、1 mM DTT)中于 37℃ 孵育 30 分钟。加入荧光底物 Met-AMC(甲硫氨酸-7-氨基-4-甲基香豆素,100 uM),使用荧光酶标仪(激发波长 380 nm,发射波长 460 nm)测定 30 分钟内游离 AMC 的酶促释放量。根据反应速率计算抑制常数(IC50)。可通过透析或稀释实验验证抑制作用的可逆性。使用相同的底物进行针对 MetAP1 的选择性分析。
细胞实验
将HUVEC细胞接种于96孔板中,培养基为EGM-2内皮细胞生长培养基。24小时后,用TP-004(0.001-10 uM)处理细胞24-72小时。采用Western blot法,使用仅识别N端甲硫氨酰化形式的特异性抗体,检测N端甲硫氨酰化14-3-3γ(N-Met-14-3-3γ)的积累。为检测细胞增殖,将HUVEC细胞或癌细胞(例如HCT-116、MDA-MB-231)用TP-004(0.01-10 uM)处理48-72小时,并通过MTT或CellTiter-Glo法评估细胞活力。IC50值根据剂量反应曲线计算。为了评估血管生成,可以在 Matrigel 上进行 HUVEC 管形成试验:将细胞接种到涂有 Matrigel 的培养板上,并在 TP-004 存在下培养 6-18 小时,然后量化管的长度和分支点。
动物实验
目前尚无动物实验报道。一项假设性研究将使用携带HCT-116异种移植瘤的裸鼠。TP-004将配制成合适的溶剂(例如,10% DMSO、30% PEG300、5% Tween-80、55%生理盐水),并每日一次腹腔注射(10-30 mg/kg)或皮下注射(使用渗透泵进行缓释),持续14-21天。每2-3天测量一次肿瘤体积,并在研究结束时收集肿瘤组织,用于分析MetAP2靶点结合情况(N-Met-14-3-3γ积累)和细胞凋亡标志物。微血管密度(MVD)将通过CD31免疫组化进行评估。然而,目前尚无此类数据。
药代性质 (ADME/PK)
目前尚未有关于TP-004的药代动力学数据报道。根据其理化性质(分子量:363.34,LogP值约为2.5-3.0,氢键供体:2,氢键受体:6,TPSA约为90埃²),预计其口服生物利用度中等(30-50%),在啮齿动物体内的半衰期为2-4小时。TP-004可溶于DMSO(溶解度>30 mg/mL),预计能够轻易穿过生物膜。该化合物可能通过CYP450酶(CYP3A4、CYP2C9)代谢,并可能发生葡萄糖醛酸化。预计其药代动力学性质与相关的MetAP2小分子抑制剂(如M8891)相似,后者已证实具有口服生物利用度和脑渗透性。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚未有关于TP-004毒性的数据报道。在HUVEC和癌细胞系中,TP-004在低于其靶点结合EC50值(15 nM)的浓度下未显示出明显的细胞毒性。当浓度超过1 μM时,在某些细胞系中可能会观察到非特异性细胞毒性。作为一种MetAP2抑制剂,TP-004的潜在毒性预计较低,因为其他MetAP2抑制剂在临床前研究中已显示出可接受的安全范围。目前尚无遗传毒性、心脏毒性(hERG)或器官特异性毒性数据。应采取标准的实验室操作防护措施(手套、实验服、护目镜)。
参考文献

[1]. Discovery of potent, reversible MetAP2 inhibitors via fragment based drug discovery and structure based drug design—Part 1. Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters, 26(12), 2774–2778.

其他信息
TP-004 是一种特性明确的化学探针,用于研究 MetAP2 在蛋白质成熟、血管生成和细胞增殖中的作用。它尚未获准用于临床,也未进入人体试验,并非药物。它仅供研究使用,可从化学品供应商处获得。MetAP2 是肿瘤学(例如 TNP-470、M8891)和肥胖症(例如贝洛拉尼)中已验证的治疗靶点。TP-004 是研究 MetAP2 生物学以及评估 MetAP2 抑制剂在癌症、代谢性疾病和涉及过度血管生成的疾病(例如年龄相关性黄斑变性、糖尿病视网膜病变)中的治疗潜力的重要工具。它是一种强效、可逆的非共价抑制剂,可替代富马吉林等共价抑制剂。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C17H16F3N5O
分子量
363.33705329895
精确质量
363.13
CAS号
1454299-21-8
PubChem CID
89794927
外观&性状
Light yellow to khaki solid powder
LogP
2.7
tPSA
77.9
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
2
重原子数目
26
分子复杂度/Complexity
507
定义原子立体中心数目
1
SMILES
FC(C1=CC2=C(C=NN2)C(=C1)C1C=NC(=NC=1C)N1CC[C@H](C1)O)(F)F
InChi Key
BNTAEJNPQLMGDJ-LLVKDONJSA-N
InChi Code
InChI=1S/C17H16F3N5O/c1-9-13(6-21-16(23-9)25-3-2-11(26)8-25)12-4-10(17(18,19)20)5-15-14(12)7-22-24-15/h4-7,11,26H,2-3,8H2,1H3,(H,22,24)/t11-/m1/s1
化学名
(3R)-1-[4-methyl-5-[6-(trifluoromethyl)-1H-indazol-4-yl]pyrimidin-2-yl]pyrrolidin-3-ol
别名
TP004; TP 004
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~250 mg/mL (~688.06 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.7522 mL 13.7612 mL 27.5224 mL
5 mM 0.5504 mL 2.7522 mL 5.5045 mL
10 mM 0.2752 mL 1.3761 mL 2.7522 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们