TP2

别名: TP 2 TP-2 TP2
目录号: V16653 纯度: ≥98%
Thiophene-2 (TP2) 是一种新型有效的聚酮合酶 13 (Pks13) 抑制剂,对结核分枝杆菌具有抗结核活性,MIC 值为 1 μM。
TP2 CAS号: 420089-51-6
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
噻吩-2 (TP2) 是一种新型高效的聚酮合酶13 (Pks13) 抑制剂,对结核分枝杆菌具有抗结核活性,其最小抑菌浓度 (MIC) 为1 μM。作为一种特异性的聚酮合酶13 (Pks13) 抑制剂,噻吩-2 可抑制分枝菌酸的生物合成,并迅速导致分枝杆菌细胞死亡。
TP2(噻吩-2)是聚酮合酶13 (Pks13) 的特异性抑制剂,Pks13是结核分枝杆菌细胞壁中分枝菌酸生物合成的关键酶。TP2 是一种经过充分验证的抗分枝杆菌研究化学探针。TP2 对结核分枝杆菌具有杀菌活性,并被用作靶向 Pks13 的新型化合物的参考标准。
生物活性&实验参考方法
靶点
Polyketide synthase 13 (Pks13). TP2 is a specific inhibitor of Pks13, an essential enzyme in the biosynthesis of mycolic acids in the Mycobacterium tuberculosis cell wall. It uniquely blocks the N-ACP domain, preventing meromycolyl chain loading.
体外研究 (In Vitro)
噻吩-2 (TP2; 0-125 μM) 可阻止脂肪酰腺苷酸 (FAMP) 在体外与 Pks13 结合。TP2 以剂量依赖的方式抑制野生型结核分枝杆菌 (Mtb) Pks13 (Pks13_WT) 的脂肪酰腺苷酸结合。此外,噻吩-2 也无法将棕榈酸 (FL C16) 结合到 TP 抗性 F79S 突变蛋白上 [1]。噻吩-2 对人肝癌 HepG2 细胞和猴肾 Vero 细胞的 IC50 值分别为 17.5 μM 和 7.30 μM。在噻吩-2浓度为12.8 μM时,在BCG感染的J774A.1巨噬细胞中观察到显著的细胞内杀伤活性[1]。体外实验表明,TP2在0-125 μM的浓度范围内以剂量依赖的方式抑制脂肪酰-AMP加载到Pks13上。它还能抑制棕榈酸(FL C16)加载到TP耐药的F79S突变蛋白上。TP2对结核分枝杆菌具有活性,MIC值为1 μM。它对猴肾Vero细胞和人肝癌HepG2细胞的IC₅₀值分别为17.5 μM和7.30 μM。在浓度为12.8 μM时,在BCG感染的J774A.1巨噬细胞中观察到显著的细胞内杀伤活性。
体内研究 (In Vivo)
TP2已在结核病动物模型中进行了体内研究。该化合物的杀菌活性与异烟肼相当。TP2通过抑制分枝菌酸的生物合成,迅速导致分枝杆菌细胞死亡。有关体内疗效的更多详细信息,请参阅原始研究文献。该化合物已被用于验证Pks13作为结核病治疗药物靶点的有效性。
酶活实验
使用重组Pks13蛋白进行非细胞酶活性测定。将该酶与脂肪酰-AMP底物和不同浓度的TP2(0-125 μM)孵育。通过放射性或荧光测定法测量脂肪酰基团与Pks13的结合情况。定量分析结合抑制情况,并根据剂量反应曲线计算IC₅₀值。该化合物的作用机制是阻断N-ACP结构域,从而阻止霉酰链的结合。
细胞实验
细胞活性测定采用在 Middlebrook 7H9 肉汤中培养的结核分枝杆菌。最小抑菌浓度 (MIC) 根据 CLSI 指南通过肉汤微量稀释法测定。胞内杀菌试验中,用浓度为 12.8 μM 的 TP2 处理 BCG 感染的 J774A.1 巨噬细胞。细菌存活率通过菌落形成单位 (CFU) 计数进行评估。细胞毒性评估采用 Vero 和 HepG2 细胞,IC₅₀ 值分别为 17.5 μM 和 7.30 μM。
动物实验
体内动物研究采用结核病感染的小鼠模型进行。TP2 通过腹腔注射或口服给药,剂量根据药代动力学研究确定。疗效终点包括肺和脾脏中的细菌载量(菌落形成单位计数)、存活率以及组织病理学分析。该化合物的杀菌活性与异烟肼(阳性对照)进行比较。
药代性质 (ADME/PK)
已发表的TP2药代动力学数据有限。该化合物(分子量:419.4,CAS号:420089-51-6)可溶于DMSO。通常以固体粉末形式储存于0-4℃(短期)或-20℃(长期)。为进行治疗开发,需要进一步研究其口服生物利用度、半衰期和代谢情况。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
TP2 的全面毒理学数据仅限于研究用途。该化合物对 Vero 细胞(IC₅₀ = 17.5 μM)和 HepG2 细胞(IC₅₀ = 7.30 μM)均显示出细胞毒性。已发表的研究表明,在有效剂量下未观察到明显的体内毒性。若要进行治疗开发,则需要进行标准的安全性药理学研究。该化合物仅供研究使用。
参考文献
[1]. Regina Wilson, et al. Antituberculosis Thiophenes Define a Requirement for Pks13 in Mycolic Acid Biosynthesis. Nat Chem Biol. 2013 Aug;9(8):499-506.
其他信息
噻吩-2 是一种有机硫杂环化合物。
TP2(噻吩-2)是一种经过充分验证的用于分枝杆菌 Pks13 研究的化学探针。其化学名称为 2-[(2,3,4,5,6-五氟苯甲酰基)氨基]-5,6,7,8-四氢-4H-环庚[b]噻吩-3-羧酸甲酯。该化合物具有明确的 F79S 耐药突变,使其成为评估新型化合物和验证靶点结合的重要参考标准。TP2 尚未获准用于临床。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C18H14F5NO3S
分子量
419.3657
精确质量
419.061
CAS号
420089-51-6
PubChem CID
1740847
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
LogP
5.4
tPSA
83.6
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
9
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
28
分子复杂度/Complexity
584
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
AVRWEULSKHQETA-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C18H14F5NO3S/c1-27-18(26)9-7-5-3-2-4-6-8(7)28-17(9)24-16(25)10-11(19)13(21)15(23)14(22)12(10)20/h2-6H2,1H3,(H,24,25)
化学名
methyl 2-[(2,3,4,5,6-pentafluorobenzoyl)amino]-5,6,7,8-tetrahydro-4H-cyclohepta[b]thiophene-3-carboxylate
别名
TP 2 TP-2 TP2
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.3845 mL 11.9226 mL 23.8453 mL
5 mM 0.4769 mL 2.3845 mL 4.7691 mL
10 mM 0.2385 mL 1.1923 mL 2.3845 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们