ZINC69391

别名: ZINC69391 ZINC-69391 ZINC 69391
目录号: V8121 纯度: ≥98%
ZINC69391 是一种特异性 Rac1 抑制剂,通过掩蔽 Rac1 表面上的 Trp56 残基来干扰 Rac1-GEF 相互作用。
ZINC69391 CAS号: 303094-67-9
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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5mg
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产品描述
ZINC69391 是一种特异性 Rac1 抑制剂,它通过掩盖 Rac1 表面的 Trp56 残基来干扰 Rac1 与 GEF 的相互作用。ZINC69391 干扰 Rac1 与 Dock180 的相互作用,并降低 Rac1-GTP 的水平。ZINC69391 可诱导细胞凋亡,并具有抗增殖和抗转移作用。
生物活性&实验参考方法
靶点
Rac1 (Rac1 GTPase). ZINC69391 is a Rac1-GEF interaction inhibitor that reduces Rac1 activation levels. [1]
体外研究 (In Vitro)
ZINC69391 的 IC50 值范围为 41 至 54 μM,可抑制 U937、HL-60、KG1A 和 Jurkat 细胞的增殖[1]。ZINC69391(50-100 μM;24 小时)可浓度依赖性地增强 caspase 3 的酶活性[1]。ZINC69391(0-125 μM;72 小时)可抑制人胶质瘤细胞的生长[2]。ZINC69391 在 50-100 μM 浓度下可导致细胞周期阻滞 48 小时[2]。人类急性白血病细胞在 ZINC69391 (50 μM; 24 小时) 的作用下发生凋亡 [1]。
ZINC69391 处理 48 小时后,以浓度依赖的方式抑制人类急性白血病细胞系 U937、HL-60、KG1A 和 Jurkat 的增殖,IC50 值分别为 43.4 μM (95% CI: 38-49)、41.7 μM (95% CI: 37.4-46.6)、54.1 μM (95% CI: 41-71) 和 41 μM (95% CI: 29.6-58.5)。 [1]
在HL-60和KG1A细胞中,用50 μM ZINC69391处理24小时后,G2/M期细胞亚群显著增加。在U937和Jurkat细胞中也观察到类似的趋势。[1]
用50 μM ZINC69391处理24小时后,HL-60、U937和KG1A细胞系的细胞凋亡(Annexin V阳性)显著增加,而Jurkat细胞未观察到显著变化。未诱导坏死。 [1]
ZINC69391处理(50 μM和100 μM)以浓度和时间依赖的方式增加caspase 3活性(通过比色法测定),并增加HL-60、U937、KG1A和Jurkat细胞中cleaved caspase 3蛋白水平(通过Western blot检测)。[1]
在HL-60细胞中,用50 μM ZINC69391处理12小时后,Mcl-1 mRNA水平显著降低,而Bcl-2和Bcl-xL mRNA水平无显著变化。在Jurkat细胞中,Bcl-2、Bcl-xL和Mcl-1的mRNA水平均升高。 [1]
ZINC69391处理12小时后,HL-60、KG1A和Jurkat细胞中Bcl-2蛋白在Western blot上的迁移率发生改变,这与Bcl-2磷酸化一致。[1]
在U937、HL-60和KG1A细胞中,ZINC69391(50 μM)诱导线粒体膜电位随时间推移而降低(DiOC6阴性细胞增加),并在处理后4小时达到最大效应。在Jurkat细胞中观察到轻微且不显著的效应。 [1] ZINC69391 在 HL-60、U937 和 KG1A 细胞中诱导 caspase 9(内源性途径的起始 caspase)的时间依赖性激活,并在处理后约 6 小时显著增加。Caspase 8 的激活在更晚的时间点观察到。[1] 在 HL-60 细胞中,ZINC69391(50 μM,12 小时)显著降低了 IL-8 mRNA 水平,而在 Jurkat 细胞中,IL-8 mRNA 水平升高。[1] 在 HL-60 细胞中,ZINC69391(50 μM,24 小时)通过 pull-down 实验评估,降低了 Rac1-GTP 水平。 [1]
ZINC69391(50 μM 和 100 μM,24 小时)未诱导正常外周血单核细胞发生显著凋亡,包括未刺激的和植物血凝素 A 激活的(增殖性)淋巴细胞。[1]
体内研究 (In Vivo)
在同基因动物模型中,ZINC69391(25 mg/kg;腹腔注射;每日一次,持续 21 天)可抑制转移性肺肿瘤的定植[3]。
酶活实验
Rac1激活实验(下拉实验):将HL-60细胞用50 μM ZINC69391处理24小时。提取细胞裂解液进行下拉实验,以检测Rac1-GTP水平(Rac1的激活形式)。[1]
细胞实验
细胞增殖实验[2]
细胞类型: U-87 MG、LN229 细胞
测试浓度: 0-125μM
孵育时间: 72 小时
实验结果: 细胞增殖呈浓度依赖性降低。

细胞周期分析[2]
细胞类型: LN229 细胞
测试浓度: 50、100 μM
孵育时间: 48 小时
实验结果: 亚 G0/G1 期细胞比例呈浓度依赖性显著增加。

细胞凋亡分析[1]
细胞类型:HL-60、U937 和 KG1A 细胞系
测试浓度:50 μM
孵育时间:24 小时
实验结果:导致凋亡细胞数量显著增加。
细胞增殖实验 (MTS):将细胞接种于 96 孔板中,并用系列稀释的 ZINC69391 处理 48 小时。加入 MTS 试剂,孵育 2 小时后,在 490 nm 处测量吸光度以确定细胞活力。IC50 值采用 S 型剂量反应函数计算。 [1]
细胞周期分析(PI染色):将同步化的细胞用50 μM ZINC69391处理24小时。细胞用70%乙醇固定,用含RNase A的碘化丙啶(PI)染色,并通过流式细胞术分析细胞周期分布。[1]
细胞凋亡检测(Annexin V/PI):将细胞用ZINC69391处理24小时。细胞用Annexin V-FITC和碘化丙啶(PI)染色,并通过流式细胞术检测早期和晚期凋亡细胞。[1]
Caspase 3活性检测(比色法):将细胞用ZINC69391(50和100 μM)处理12和24小时。将细胞裂解液与 caspase 3 底物 Ac-DEVD-pNA 孵育。通过测量 405 nm 处的吸光度来确定 caspase 3 的活性。[1]
caspase 9 活性测定(比色法):将细胞用 ZINC69391 (50 μM) 处理 0、2、4、6、8 和 12 小时。将细胞裂解液与 caspase 9 底物孵育,并在 405 nm 处测量活性。[1]
Western 印迹:将细胞用 ZINC69391 处理,裂解,并进行 SDS-PAGE 电泳。将蛋白质转移至硝酸纤维素膜,并用针对裂解型 caspase 3、caspase 8、Bcl-2 和 α-微管蛋白的抗体进行检测。 [1]
线粒体膜电位检测 (DiOC6):将细胞用 50 μM ZINC69391 处理 0 至 7 小时。用亲脂性阳离子探针 DiOC6 (10 mM) 对细胞进行染色 20 分钟,并通过流式细胞术分析荧光以评估线粒体膜的完整性。[1]
定量实时 PCR (qPCR):从用 50 μM ZINC69391 处理 12 小时的 HL-60 和 Jurkat 细胞中提取总 RNA。合成 cDNA,并使用 Bcl-2、Bcl-xL、Mcl-1、IL-8 和 β-actin(管家基因)的引物进行 qPCR。使用比较 ΔΔCt 法计算相对 mRNA 表达量。 [1]
原代细胞培养:采用Ficoll-Hypaque密度梯度离心法分离健康供体的外周血单核细胞(PBMC)。将细胞培养于含10%胎牛血清(FBS)的RPMI-1640培养基中。为激活T细胞,在用ZINC69391处理前48小时,将细胞与1.0 μg/mL植物血凝素A孵育。[1]
动物实验
动物/疾病模型: 特定病原体清除(SPF)雌性BALB/c近交系小鼠(携带F3II细胞)[3]
剂量: 25 mg/kg体重
给药途径: 腹腔注射(ip);每日一次,持续21天
实验结果: 肺转移灶总数显著减少约60%。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
ZINC69391(50 μM 和 100 μM,24 小时)未诱导健康供体正常外周血单核细胞 (PBMC) 发生显著凋亡,包括未刺激的和植物血凝素 A 激活的(增殖性)淋巴细胞。[1]
参考文献

[1]. Pharmacological Rac1 inhibitors with selective apoptotic activity in human acute leukemic cell lines. Oncotarget. 2017;8(58):98509‐98523. Published 2017 Oct 4.

[2]. Proapoptotic and antiinvasive activity of Rac1 small molecule inhibitors on malignant glioma cells. Onco Targets Ther. 2014;7:2021‐2033. Published 2014 Oct 30.

[3]. Preclinical development of novel Rac1-GEF signaling inhibitors using a rational design approach in highly aggressive breast cancer cell lines. Anticancer Agents Med Chem. 2014;14(6):840‐851.

其他信息
ZINC69391是一种小分子,通过基于分子对接的虚拟库筛选方法鉴定为Rac1-GEF相互作用抑制剂。它是第一代Rac1抑制剂。[1]
ZINC69391此前已被证明在乳腺癌模型中能够抑制细胞增殖、细胞周期进程、迁移和肺转移,并在胶质母细胞瘤细胞系中诱导细胞凋亡并降低细胞迁移和侵袭能力。 [1] ZINC69391 在急性白血病细胞中的促凋亡活性涉及线粒体(内源性)凋亡途径的激活,其特征是线粒体膜电位丧失、caspase 9 激活以及随后 caspase 3 和 caspase 8 的激活。[1] ZINC69391 处理可诱导 HL-60 和 KG1A 细胞发生 G2/M 期细胞周期阻滞。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C14H14F3N5
分子量
309.289672374725
精确质量
309.12
CAS号
303094-67-9
PubChem CID
5728890
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
2.7
tPSA
76.2
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
22
分子复杂度/Complexity
388
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CC1=CC(=NC(=N1)/N=C(\N)/NC2=CC=CC=C2C(F)(F)F)C
InChi Key
BEZGMANANMSUSQ-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C14H14F3N5/c1-8-7-9(2)20-13(19-8)22-12(18)21-11-6-4-3-5-10(11)14(15,16)17/h3-7H,1-2H3,(H3,18,19,20,21,22)
化学名
2-(4,6-dimethylpyrimidin-2-yl)-1-[2-(trifluoromethyl)phenyl]guanidine
别名
ZINC69391 ZINC-69391 ZINC 69391
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~25 mg/mL (~80.83 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.2332 mL 16.1661 mL 32.3321 mL
5 mM 0.6466 mL 3.2332 mL 6.4664 mL
10 mM 0.3233 mL 1.6166 mL 3.2332 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • Cell cycle distribution after ZINC69391 treatment in human acute leukemia cell lines Synchronized G0/G1 cells were exposed to ZINC69391 50 μM or to 0.05% (v/v) DMSO, vehicle control group for 24h. Cell cycle distribution was calculated as described in Material and Methods. Data represent the mean ± SD (n > 3). *p< 0.05.[1].Cabrera M, et al. Pharmacological Rac1 inhibitors with selective apoptotic activity in human acute leukemic cell lines. Oncotarget. 2017;8(58):98509‐98523. Published 2017 Oct 4.
  • Caspase 3 activation in apoptosis induced by ZINC69391 (A) The cleavage of caspase 3 was evaluated by western blot. Equal amounts of protein were subjected to SDS–PAGE and western blot with anti-caspase 3. Data are representative of at least three independent experiments. (B) Cells were treated with ZINC69391 in the indicated concentrations and time, and caspase 3 protease activity was measured using a colorimetric kit as described in Materials and Methods and expressed as OD405nm values. Data are presented as mean ± SD from four independent experiments. *p<0.05; **p<0.01; ***p<0.005.[1].Cabrera M, et al. Pharmacological Rac1 inhibitors with selective apoptotic activity in human acute leukemic cell lines. Oncotarget. 2017;8(58):98509‐98523. Published 2017 Oct 4.
  • ZINC69391 effect on anti-apoptotic Bcl-2 family proteins and mitochondrial membrane permeability (MMP) (A) HL-60 and Jurkat cells were incubated with 50 μM of ZINC69391 or 0.05% (v/v) DMSO vehicle control group for 12h. Bcl-2, Bcl-xL and Mcl-1 mRNA levels were quantified by qPCR as described in the methods section. Results are mean ± SD of at least three independent experiments performed in triplicates. **p<0.01; ***p<0.005 (B) Analysis of MMP alteration at indicated times for U937 (left panel) and HL-60, KG1a and Jurkat (right panel) cell lines. Cells treated with 50 μM of ZINC69391 or 0.05% (v/v) DMSO vehicle control group, were evaluated for changes in fluorescence intensity of DiOC6 probe by flow cytometry. The bar graph shows differences among treatment times (n=4) *p<0.05; **p<0.01; ***p<0.005. (C). Representative graphic shows Bcl-2 protein assessment by Western blot. Equal amounts of protein were subjected to SDS–PAGE and western blot using anti-Bcl-2 protein antibody. *p<0.05; **p<0.01; ***p<0.005.[1].Cabrera M, et al. Pharmacological Rac1 inhibitors with selective apoptotic activity in human acute leukemic cell lines. Oncotarget. 2017;8(58):98509‐98523. Published 2017 Oct 4.
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