PF-06446846

别名: PF‑06446846; PF-6446846; PF6446846; PF 06446846; PF06446846; N-(3-氯吡啶-2-基)-N-[(3R)-哌啶-3-基]-4-(三唑并[4,5-b]吡啶-3-基)苯甲酰胺
目录号: V4983 纯度: ≥98%
PF-06446846 (PF06446846; PF-6446846) 是一种新型有效的 PCSK9(前蛋白转化酶枯草杆菌蛋白酶/kexin 9 型)抑制剂,通过诱导核糖体在密码子周围停滞来抑制 PCSK9 的翻译,这是由内部新生链序列介导的出口隧道。
PF-06446846 CAS号: 1632250-49-7
产品类别: New7
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
25mg
50mg
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  • PF-06446846 hydrochloride
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

产品描述
PF-06446846 (PF06446846; PF-6446846) 是一种新型有效的 PCSK9(前蛋白转化酶枯草杆菌蛋白酶/kexin 9 型)抑制剂,通过诱导核糖体在密码子周围停滞(由新生核糖体序列介导)来抑制 PCSK9 的翻译出口隧道内的链条。 PF-06446846 口服给药后可降低大鼠血浆 PCSK9 和总胆固醇水平。 PF-06446846 对 PCSK9 翻译的抑制具有高度选择性。抑制 PCSK9 可以通过促进 LDLR 介导的 TCR 回收和信号传导来增强 CD8 + T 细胞的抗肿瘤活性。因此,PCSK9/LDLR 也可能作为癌症免疫治疗的潜在靶点。
生物活性&实验参考方法
靶点
Human 80S ribosome (Kd = 7.0 μM in saturation binding assay). [1]
体外研究 (In Vitro)
PF-06446846 抑制 Huh7 细胞分泌 PCSK9,IC50 为 0.3 μM[1]。 PF-06446846 抑制 PCSK9(1-35)-荧光素酶表达,IC50 为 2 μM[1]。 PF-06446846(化合物 7f)证明了大鼠骨髓和人类 CD34+ 毒性 [2]。
PF-06446846 抑制Huh7人肝癌细胞分泌PCSK9,IC50为0.3 μM。[1]
在HeLa细胞衍生的无细胞翻译系统中,PF-06446846 抑制PCSK9(1-35)-荧光素酶融合蛋白的翻译,IC50为2 μM,而在250 μM的最高测试浓度下,对单独荧光素酶的翻译仅抑制20%。[1]
在Huh7细胞中进行的核糖体分析表明,用PF-06446846 (1.5 μM,处理1小时)处理后,能高度选择性地抑制PCSK9的翻译,核糖体停滞在PCSK9转录本第34号密码子附近。在此时间点,仅有22个其他细胞转录本对PF-06446846表现出显著敏感性。[1]
用细胞培养中氨基酸稳定同位素标记技术对经PF-06446846 (0.25 μM和1.25 μM处理4或16小时)处理的Huh7细胞分泌组和裂解物进行的蛋白质组学分析证实了其高选择性,除了PCSK9和少数其他靶点外,对分泌组或细胞内蛋白质组没有普遍影响。[1]
用³⁵S-Met/Cys对Huh7细胞进行代谢标记表明,与放线菌酮不同,PF-06446846 不会导致全局性蛋白质合成抑制。[1]
其活性依赖于新生PCSK9肽(残基1-35)的氨基酸序列,而非mRNA密码子序列。关键敏感区域包括Leu15-Leu20、含Trp的残基9-11以及残基31-33。[1]
PF-06446846 在来源于兔网织红细胞、小麦胚芽和酵母的无细胞翻译系统中抑制翻译,但在大肠杆菌系统中无此作用。[1]
核糖体toeprinting实验证实,PF-06446846 在PCSK9翻译过程中诱导核糖体停滞,逆转录酶终止产物的位置与在第35号密码子及之后发生停滞的情况一致。[1]
对使用PCSK9 mRNA编程的无细胞翻译反应进行蔗糖密度梯度分析表明,PF-06446846 处理导致出现与多核糖体相关的放射性小肽段,这与一个停滞的核糖体后面排队的核糖体情况相符。[1]
体内研究 (In Vivo)
在体内,PF-06446846 可以降低血浆总胆固醇和循环 PCSK9 水平,但似乎无害 [1]。
给雄性大鼠口服PF-06446846,剂量为5、15和50 mg/kg/天,连续14天,在单次和重复给药后均能剂量依赖性地降低血浆PCSK9水平。[1]
在50 mg/kg剂量下,治疗14天后观察到总血浆胆固醇(降低30%)和低密度脂蛋白胆固醇(降低58%)有统计学意义的显著减少,而高密度脂蛋白胆固醇没有显著变化。[1]
血浆PCSK9和胆固醇的降低是在未改变肝功能血浆标志物(ALT、AST、白蛋白)且肝脏未出现组织病理学发现的情况下实现的。[1]
酶活实验
进行了饱和结合实验以测量[³H]-PF-06446846与纯化的人80S核糖体的结合。将不同浓度的放射性配体单独(用于总结合)或与200倍过量的未标记PF-06446846(用于非特异性结合)一起,与0.6 μM的核糖体在测定缓冲液中孵育。孵育后,过滤反应混合物,并计数结合的放射性。通过相减计算特异性结合,并通过将数据拟合到单位点特异性结合模型来确定Kd和Bmax值。[1]
细胞实验
细胞毒性测定[2]
细胞类型:大鼠骨髓谱系(−)细胞和 CD34+ 细胞
测试浓度: 0-20 µM
孵育持续时间:72 小时
实验结果:证明对大鼠 Lin(−) 和人 CD34+ 具有细胞毒性,IC50 值为 2.9 µM 和 2.7 µM , 分别。
PCSK9分泌抑制实验:将Huh7细胞接种于96孔板,贴壁后,用含有PF-06446846或溶媒的新鲜培养基处理过夜。收集条件培养基,使用商业人PCSK9 ELISA试剂盒测量PCSK9水平。[1]
代谢标记实验:洗涤Huh7细胞,在无甲硫氨酸/半胱氨酸培养基中孵育30分钟。加入PF-06446846、放线菌酮或溶媒,然后加入³⁵S-Met/Cys标记混合物孵育30分钟。裂解细胞,通过SDS-PAGE和磷屏成像分析裂解物以定量³⁵S掺入。[1]
SILAC蛋白质组学实验:Huh7细胞在含有轻、中、重同位素形式的赖氨酸和精氨酸的SILAC培养基中生长数代。同步化细胞后,分别用溶媒(轻)、0.25 μM PF-06446846(中)或1.25 μM PF-06446846(重)处理4或16小时。分别收集条件培养基(分泌组)和细胞裂解物。蛋白质用胰蛋白酶消化,肽段通过LC-MS/MS进行分析以进行鉴定和相对定量。[1]
动物实验
Animal/Disease Models: Male SD (SD (Sprague-Dawley)) (Crl:CD [SD] rats, 5 per group; 6-8 weeks old at start of dosing) [1]
Doses: 5, 15, and 50 mg/kg
Route of Administration: Every Daily oral administration for 14 days.
Experimental Results: Reduce plasma PCSK9, plasma total cholesterol and LDL-C (low-density lipoprotein cholesterol) in a dose-dependent manner without obvious toxicity.
Male Sprague-Dawley rats (5 per group) were administered PF-06446846 orally at doses of 5, 15, or 50 mg/kg/day for 14 consecutive days. The compound was formulated in a vehicle of 200 mM citrate buffer in 0.5% methylcellulose (w/v). The control group received vehicle only. The dose volume was 5 mL/kg based on individual body weight. [1]
Blood samples were collected on days 1 and 12 at approximately 1, 3, 6, and 24 hours post-dose for measurement of plasma PF-06446846 and PCSK9 concentrations. [1]
On day 15 (24 hours after the last dose), fasted animals were humanely killed and necropsied. Terminal blood samples were collected for clinical chemistry (including cholesterol panels) and hematology. The liver was weighed, and a selected set of tissues was collected for histopathological examination. [1]
药代性质 (ADME/PK)
Plasma concentrations of PF-06446846 were measured in rats following oral administration at 5, 15, and 50 mg/kg. Data are provided in a supplementary table (S11 Table) showing concentrations at 1, 3, 6, and 24 hours post-dose on days 1 and 12. Specific pharmacokinetic parameters (e.g., half-life, clearance, oral bioavailability) are not reported in the main text. [1]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
In the 14-day rat study, PF-06446846 was tolerated at 5 and 15 mg/kg/day with no dose-limiting changes observed in histology or clinical chemistry compared to vehicle. [1]
At 50 mg/kg/day, the following adverse effects were observed: a small decrease (11-13%) in food consumption, a minimal decrease in bone marrow cellularity (primarily erythroid) correlating with a 9% decrease in red cell mass, mild reductions in white blood cells (52%), lymphocytes (54%), T cell and B cell populations, and minimal necrosis of the crypt cells of the ileum in one of five animals. [1]
No histopathological findings were observed in the liver at any dose. No significant changes were observed in liver transaminases (ALT, AST) or albumin levels. [1]
参考文献

[1]. Selective stalling of human translation through small-molecule engagement of the ribosome nascent chain. PLoS Biol. 2018 Apr 17;16(4):e1002628.

[2]. Small Molecule Proprotein Convertase Subtilisin/Kexin Type 9 (PCSK9) Inhibitors: Hit to Lead Optimization of Systemic Agents. J Med Chem. 2018 Jul 12;61(13):5704-5718.

其他信息
PF-06446846 is a triazolopyridine that is 3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridine substituted by a 4-{(3-chloropyridin-2-yl)[(3R)-piperidin-3-yl]carbamoyl}phenyl group at position 3. It is a potent inhibitor of PCSK9. It has a role as an antilipemic drug and an EC 3.4.21.61 (kexin) inhibitor. It is a monochloropyridine, a member of piperidines, a tertiary carboxamide, a member of benzamides and a triazolopyridine.
PF-06446846 is an orally active small molecule that inhibits the synthesis of PCSK9 by directly targeting the translating human ribosome. It induces ribosome stalling during the elongation phase of PCSK9 translation, specifically around codon 34, shortly after the signal peptide. This mechanism is dependent on the amino acid sequence of the nascent chain within the ribosome exit tunnel. [1]
Ribosome profiling demonstrated that despite acting on the core translation machinery, PF-06446846 exhibits exceptional selectivity for PCSK9 and only a very small number of other transcripts. [1]
The work presents the first demonstration of a selective small-molecule inhibitor of eukaryotic mRNA translation for therapeutic purposes. However, the narrow margin between PCSK9-lowering efficacy and hematopoietic/intestinal toxicity observed at the highest dose in rats likely precludes the clinical development of PF-06446846 itself. [1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C22H20CLN7O
分子量
433.893502235413
精确质量
433.141
CAS号
1632250-49-7
相关CAS号
PF-06446846 hydrochloride;1632250-50-0
PubChem CID
86271238
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
LogP
3.1
tPSA
88.8
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
31
分子复杂度/Complexity
617
定义原子立体中心数目
1
SMILES
C1C[C@H](CNC1)N(C2=C(C=CC=N2)Cl)C(=O)C3=CC=C(C=C3)N4C5=C(C=CC=N5)N=N4
InChi Key
FDTXHWQFIXYHCL-QGZVFWFLSA-N
InChi Code
InChI=1S/C22H20ClN7O/c23-18-5-2-12-25-20(18)29(17-4-1-11-24-14-17)22(31)15-7-9-16(10-8-15)30-21-19(27-28-30)6-3-13-26-21/h2-3,5-10,12-13,17,24H,1,4,11,14H2/t17-/m1/s1
化学名
(R)-4-(3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-3-yl)-N-(3-chloropyridin-2-yl)-N-(piperidin-3-yl)benzamide
别名
PF‑06446846; PF-6446846; PF6446846; PF 06446846; PF06446846;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.3047 mL 11.5237 mL 23.0473 mL
5 mM 0.4609 mL 2.3047 mL 4.6095 mL
10 mM 0.2305 mL 1.1524 mL 2.3047 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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