3-Deazaneplanocin A (DZNep)

别名: (1S,2R,5R)-5-(4-氨基-1H-咪唑并[4,5-C]吡啶-1-基)-3-羟甲基-3-环戊烯-1,2-二醇; 3-deazaneplanocin(DzNep) ; 3-去氮腺嘌呤; 3-去氮腺嘌呤A
目录号: V40934 纯度: ≥98%
3-Deazaneplanocin A (C-c3Ado, DZNep; NSC617989) 是一种腺苷类似物,作为 S-腺苷高半胱氨酸水解酶和 EZH2(组蛋白甲基转移酶)的竞争性抑制剂。
3-Deazaneplanocin A (DZNep) CAS号: 102052-95-9
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg

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  • 3-去氮腺嘌呤A
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产品描述
3-脱氮腺苷A(C-c3Ado,DZNep;NSC617989)是一种腺苷类似物,可作为S-腺苷高半胱氨酸水解酶和EZH2(组蛋白甲基转移酶)的竞争性抑制剂。在无细胞实验中,它通过抑制S-腺苷高半胱氨酸水解酶发挥抗癌活性,Ki值为50 pM。3-脱氮腺苷A具有优异的抗增殖活性和较高的体内抗肿瘤疗效。它能破坏多梳抑制复合物2(PRC2),诱导癌细胞凋亡,同时抑制癌细胞的增殖和转移,这些癌细胞包括急性髓系白血病、乳腺癌和胶质母细胞瘤。DZNep是一种有前景的卵巢癌细胞治疗药物,具有抑制增殖、诱导凋亡和减少细胞迁移的潜力。此外,3-脱氮腺苷甲硫氨酸(3-Deazaneplanocin A)也被发现对治疗埃博拉病毒病有效,其作用机制似乎是干扰埃博拉病毒阻断干扰素产生的能力,从而恢复免疫系统清除体内埃博拉病毒的能力。
3-脱氮腺苷甲硫氨酸(DZNep)是一种强效的组蛋白甲基转移酶EZH2抑制剂,也是一种强效的S-腺苷高半胱氨酸水解酶(AHCY)抑制剂。DZNep可降低整体组蛋白甲基化水平,尤其在体外可抑制H3K27和H4K20的三甲基化。该化合物在血液系统恶性肿瘤和实体瘤的临床前模型中显示出抗癌活性。其分子式为C12H14N4O3,分子量为262.26 g/mol。
生物活性&实验参考方法
靶点
DZNep targets EZH2 (enhancer of zeste homolog 2), a histone methyltransferase that catalyzes trimethylation of histone H3 at lysine 27 (H3K27me3), and AHCY (S-adenosylhomocysteine hydrolase). By inhibiting EZH2, DZNep reduces H3K27me3 levels and reactivates developmentally silenced genes. Inhibition of AHCY leads to accumulation of S-adenosylhomocysteine, which in turn inhibits methyltransferases, contributing to global histone methylation reduction. This dual mechanism results in epigenetic reprogramming and altered gene expression.
体外研究 (In Vitro)
3-脱氮腺苷A是一种有效的组蛋白甲基转移酶EZH2抑制剂。用3-脱氮腺苷A(1.0 μM)处理OCI-AML3细胞可显著降低细胞周期中S期(35.2%)和G2/M期(6.3%)的细胞数量(P<0.05),同时增加G0/G1期细胞的积累(58.5%)。用3-脱氮腺苷A(200 nM至2.0 μM)处理48小时后,OCI-AML3和HL-60细胞的克隆形成受到抑制,且呈剂量依赖性[1]。 3-地塞米松A抑制EZH2的表达,尤其是在72小时后(PANC-1、MIA-PaCa-2和LPc006细胞中EZH2的表达分别降低了48%、32%和36%)[2]。3. 在PANC-1细胞中,地塞米松A的生长抑制作用可以忽略不计。即使暴露于最高剂量(20 μM),仍有近50%的细胞继续生长。MIA-PaCa-2和LPc006细胞的IC0值显著更高,分别为1±0.3 μM和0.1±0.03 μM[2]。 3-脱氮腺苷甲硫氨酸 (3-Deazaneplanocin A) 的 IC50 值范围为 0.08 至 0.24 μM,并以剂量依赖的方式抑制非小细胞肺癌 (NSCLC) 细胞系的增殖[3]。体外实验表明,DZNep 可降低 EZH2 的表达,72 小时后,PANC-1、MIA-PaCa-2 和 LPc006 细胞中 EZH2 的表达分别降低了 48%、32% 和 36%。用 1.0 μM 的 DZNep 处理 OCI-AML3 细胞可显著增加 G0/G1 期细胞的比例 (58.5%),同时减少 S 期细胞 (35.2%) 和 G2/M 期细胞 (6.3%)。该化合物在 200 nM 至 2.0 μM 的浓度范围内可抑制 OCI-AML3 和 HL-60 细胞的克隆形成。在 NSCLC 细胞系中,IC50 值范围为 0.08 至 0.24 μM。
体内研究 (In Vivo)
当同时给予3-脱氮腺苷甲硫氨酸(3-Deazaneplanocin A)和帕比司他(Panobinostat,PS)治疗由HL-60细胞引起的急性髓系白血病(AML)的NOD/SCID小鼠时,其生存率显著高于单独使用PS、3-脱氮腺苷甲硫氨酸或载体治疗的小鼠(P<0.05)。各组的中位生存时间分别为:对照组36天,PS组42天,3-脱氮腺苷甲硫氨酸组43天,3-脱氮腺苷甲硫氨酸联合PS组52天[1]。给予生理盐水的实验大鼠体重随时间逐渐增加(平均日增长率为3.19%)。当给大鼠注射 20 mg/kg 的 3-脱氮腺苷甲氨蝶呤 (3-Deazaneplanocin A) 后,不仅在治疗后的前三天显著降低了其相对体重(分别降低了 2.0%、4.9% 和 1.2%),而且还减缓了其体重增长率,在给药后的第四天降至每天 2.6%[4]。
在体内,DZNep 已在临床前模型中显示出抗癌功效。在患有急性髓系白血病 (AML,HL-60 细胞) 的 NOD/SCID 小鼠中,与单药治疗或单独使用载体相比,DZNep 联合帕比司他治疗显著提高了生存率(中位生存期:对照组 36 天;帕比司他组 42 天;DZNep 组 43 天;联合治疗组 52 天)。在大鼠中,给予 20 mg/kg 的 DZNep 后,在治疗后的前三天,其相对体重显著降低。
酶活实验
DZNep的体外酶抑制试验采用纯化的EZH2复合物和组蛋白底物来测定EZH2组蛋白甲基转移酶活性。该反应在含有S-腺苷甲硫氨酸(SAM)作为甲基供体的优化缓冲液中进行,并通过ELISA、Western blot或质谱法定量H3K27me3水平。AHCY抑制作用通过监测S-腺苷高半胱氨酸水解为腺苷和高半胱氨酸的反应来测定,该反应采用偶联酶法或高效液相色谱法(HPLC)进行。IC50值由剂量-反应曲线计算得出。
细胞实验
体外细胞实验采用多种癌细胞系,包括血液系统恶性肿瘤细胞系(OCI-AML3、HL-60)和实体瘤细胞系(PANC-1、MIA-PaCa-2、LPc006、非小细胞肺癌细胞系)。细胞用不同浓度(通常为纳摩尔至微摩尔级)的DZNep处理48-72小时。采用MTT或CellTiter-Glo法评估细胞活力。通过流式细胞术进行细胞周期分析。采用Western blot法检测H3K27me3和EZH2的表达水平。克隆形成实验用于评估细胞的长期增殖能力。
动物实验
小鼠:将 500 万个 HL-60 细胞注射到雌性非肥胖糖尿病/重症联合免疫缺陷 (NOD/SCID) 小鼠的尾静脉中,并对小鼠进行 7 天的观察。每组 7 只小鼠分别接受以下治疗:仅注射载体、1 mg/kg 3-脱氮腺苷甲硫氨酸 (3-Deazaneplanocin A)、10 mg/kg PS 以及 3-脱氮腺苷甲硫氨酸联合 PS。治疗从第 7 天开始。3-脱氮腺苷甲硫氨酸每周两次(周二至周四)腹腔注射,持续 2 周,然后停药。PS 每周三次(周一、周三和周五)注射,持续 4 周。尾静脉注射模型小鼠的存活率用 Kaplan-Meier 生存曲线表示。
大鼠:使用雄性 Wistar 大鼠。本急性毒性研究旨在确定3-脱氮腺苷甲硫氨酸(3-Deazaneplanocin A)在大鼠中的无观察到不良反应剂量(NOAEL)。共20只大鼠随机分为4组,每组5只。其中3组分别经尾静脉注射20、15和10 mg/kg体重(BW)的DZNep溶液。剩余1组作为对照组,注射生理盐水(0.9%氯化钠溶液)。然后,根据以下终点参数确定游离DZNep的NOAEL。
NOD/SCID小鼠
采用免疫缺陷小鼠的异种移植模型进行体内动物实验。对荷瘤小鼠腹腔注射1-20 mg/kg剂量的DZNep。测量肿瘤体积随时间的变化,终点包括肿瘤生长抑制率和生存率。药效学研究评估肿瘤组织中 H3K27me3 水平、EZH2 表达和细胞凋亡标志物。与其他药物(例如帕比司他)联合用药研究旨在评估潜在的协同作用。
药代性质 (ADME/PK)
DZNep的药代动力学特性包括其在水中的溶解度(超声处理后为100 mg/mL)。该化合物的分子量为262.26 g/mol,LogP值为1.48,外观为白色至类白色固体粉末。沸点为541.7±60.0°C(760 mmHg)。建议粉末储存于-20°C,溶液储存于-80°C。该化合物应避光防潮保存。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
DZNep的毒理学数据来源于临床前研究。该化合物在20 mg/kg剂量下可导致大鼠体重减轻。作为一种表观遗传修饰剂,它可能具有脱靶效应和潜在毒性。该化合物仅供研究使用,不适用于人类治疗。由于其具有强效的生物活性,处理该化合物时应遵循标准安全预防措施。
参考文献

[1]. Combined epigenetic therapy with the histone methyltransferase EZH2 inhibitor 3-deazaneplanocin A and the histone deacetylase inhibitor panobinostat against human AML cells. Blood, 2009, 114(13), 2733-2743.

[2]. Molecular mechanisms involved in the synergistic interaction of the EZH2 inhibitor 3-deazaneplanocin A with gemcitabine in pancreatic cancer cells. Mol Cancer Ther. 2012 Aug;11(8):1735-46.

[3]. Epigenetic therapy with 3-deazaneplanocin A, an inhibitor of the histone methyltransferase EZH2, inhibits growth of non-small cell lung cancer cells. Lung Cancer. 2012 Nov;78(2):138-43.

[4]. Preclinical pharmacokinetic studies of 3-deazaneplanocin A, a potent epigenetic anticancer agent, and its human pharmacokinetic prediction using GastroPlus?. Eur J Pharm Sci. 2015 Sep 18;77:290-302.

[5]. The Histone Methyltransferase Enzyme Enhancer of Zeste Homolog 2 Protects against Podocyte Oxidative Stress and Renal Injury in Diabetes. J Am Soc Nephrol. 2016 Jul;27(7):2021-34.

[6]. Aristeromycin and DZNeP cause growth inhibition of prostate cancer via induction of mir-26a. Eur J Pharmacol. 2017 Oct 5;812:138-146.

[7]. A review of compounds exhibiting anti-orthopoxvirus activity in animal models. Antiviral Res. 2003 Jan;57(1-2):41-52.

其他信息
3-去硝基异戊二酸A是一种咪唑并吡啶类化合物。
DZNep也称为3-脱氮异戊二酸A、NSC 617989,以纯度≥98%的粉末形式供应。它是一种强效的组蛋白甲基转移酶EZH2抑制剂和AHCY抑制剂。DZNep在血液系统恶性肿瘤和实体瘤的临床前模型中显示出抗癌活性。它能降低整体组蛋白甲基化水平并重新激活发育过程中沉默的基因。目前的研究正在探索联合用药策略以提高治疗效果。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C12H14N4O3
分子量
262.26456
精确质量
262.106
CAS号
102052-95-9
相关CAS号
3-Deazaneplanocin A hydrochloride;120964-45-6
PubChem CID
73087
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.6±0.1 g/cm3
沸点
541.7±60.0 °C at 760 mmHg
闪点
281.4±32.9 °C
蒸汽压
0.0±1.5 mmHg at 25°C
折射率
1.753
LogP
1.48
tPSA
97.19
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
2
重原子数目
19
分子复杂度/Complexity
378
定义原子立体中心数目
3
SMILES
C1=CN=C(C2=C1N(C=N2)[C@@H]3C=C([C@H]([C@H]3O)O)CO)N
InChi Key
OMKHWTRUYNAGFG-IEBDPFPHSA-N
InChi Code
InChI=1S/C12H14N4O3/c13-12-9-7(1-2-14-12)16(5-15-9)8-3-6(4-17)10(18)11(8)19/h1-3,5,8,10-11,17-19H,4H2,(H2,13,14)/t8-,10-,11+/m1/s1
化学名
(1S,2R,5R)-5-(4-aminoimidazo[4,5-c]pyridin-1-yl)-3-(hydroxymethyl)cyclopent-3-ene-1,2-diol
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.8130 mL 19.0650 mL 38.1301 mL
5 mM 0.7626 mL 3.8130 mL 7.6260 mL
10 mM 0.3813 mL 1.9065 mL 3.8130 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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