BAZ1A-IN-1

目录号: V52361 纯度: ≥98%
BAZ1A-IN-1 是一种有效的 BAZ1A(含溴结构域蛋白)抑制剂。
BAZ1A-IN-1 CAS号: 941521-45-5
产品类别: Epigenetic Reader Domain
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
BAZ1A-IN-1 是一种强效的 BAZ1A(含溴结构域蛋白)抑制剂。BAZ1A-IN-1 对 BAZ1A 溴结构域的 Kd 值为 0.52 μM。BAZ1A-IN-1 对 BAZ1A 高表达的癌细胞系表现出良好的抗存活活性,但对 BAZ1A 低表达的癌细胞活性较弱或无活性。
BAZ1A-IN-1 是一种强效且选择性的 BAZ1A(锌指结构域邻近溴结构域蛋白 1A)抑制剂,BAZ1A 又称含溴结构域蛋白,属于溴结构域蛋白家族,该家族蛋白能够识别组蛋白和其他蛋白质上的乙酰化赖氨酸残基。BAZ1A 是染色质重塑复合物的组成部分,并在基因表达的表观遗传调控中发挥作用。该化合物对 BAZ1A 溴结构域的 KD 值为 0.52 μM,表明其具有很强的结合亲和力。BAZ1A-IN-1 对 BAZ1A 高表达的癌细胞系表现出显著的抗存活活性,而对 BAZ1A 低表达的癌细胞活性较弱或无活性,提示其具有靶向作用和潜在的治疗窗口。该化合物是研究 BAZ1A 在染色质动力学、基因组稳定性和表观遗传调控中的作用,以及探索 BAZ1A 作为癌症治疗靶点的潜力的重要研究工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
BAZ1A[1]
BAZ1A-IN-1 targets the bromodomain of BAZ1A (bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 1A). The compound binds to the acetyl-lysine binding pocket of the BAZ1A bromodomain with a KD of 0.52 μM. By blocking the interaction of BAZ1A with acetylated histones, BAZ1A-IN-1 disrupts the recruitment of BAZ1A to chromatin, thereby modulating gene expression programs that depend on BAZ1A-mediated chromatin remodeling. The selective inhibition of BAZ1A over other bromodomain-containing proteins has not been fully characterized, but the compound is described as a potent BAZ1A inhibitor. The target is of interest in cancer research because BAZ1A is involved in DNA damage repair, transcriptional regulation, and maintenance of genomic stability, and its dysregulation has been implicated in various cancers.
体外研究 (In Vitro)
BAZ1A-IN-1 (Cpd-2) (0.015-100 μM;96 小时) 对 THP-1、ZR-75-30 以及所有四种高 BAZ1A 表达水平的癌细胞系均表现出强大的抗存活活性。BT474 和 H1975 细胞的 IC50 值分别为 5.08 μM、4.29 μM、10.65 μM 和 7.70 μM [1]。
BAZ1A-IN-1 对高表达 BAZ1A 的癌细胞系表现出强效的体外活性。在四种高表达BAZ1A的癌细胞系(包括THP-1(急性单核细胞白血病)、ZR-75-30(乳腺癌)、BT474(乳腺癌)和H1975(非小细胞肺癌))中,BAZ1A-IN-1表现出良好的抗细胞活力活性,IC50值分别为5.08 μM、4.29 μM、10.65 μM和7.70 μM。相反,该化合物对低表达BAZ1A的癌细胞活性较弱或无活性,证实其细胞毒性作用依赖于靶蛋白的存在。在0.015至100 μM的浓度范围内,经96小时处理后,可观察到该化合物的抗细胞存活活性。
体内研究 (In Vivo)
目前文献中尚未发表关于 BAZ1A-IN-1 的详细体内活性数据。该化合物的作用主要在体外进行表征,使用的是 BAZ1A 表达水平不同的癌细胞系。需要进一步研究以评估 BAZ1A-IN-1 在动物癌症模型(例如异种移植模型)中的疗效,并确定其体内药代动力学和药效学特性。该化合物对 BAZ1A 的选择性及其强大的体外活性提示其可能具有体内抗肿瘤活性,但尚未在已发表的研究中得到证实。
酶活实验
BAZ1A-IN-1 与 BAZ1A 溴结构域的结合亲和力可通过表面等离子共振 (SPR) 或等温滴定量热法 (ITC) 测定。典型的 SPR 实验中,将重组 BAZ1A 溴结构域蛋白固定在传感器芯片上,然后向芯片表面注入不同浓度的 BAZ1A-IN-1。利用 1:1 Langmuir 结合模型,根据传感器图数据计算结合速率常数 (ka)、解离速率常数 (kd) 和平衡解离常数 (KD)。另一种方法是荧光偏振 (FP) 竞争实验,将荧光标记的乙酰化组蛋白肽与 BAZ1A 溴结构域孵育,并测量不同浓度 BAZ1A-IN-1 对肽的置换作用。FP 实验得到的 IC50 值可通过 Cheng-Prusoff 方程转换为 KD 值。
细胞实验
细胞活力检测[1]
细胞类型: THP-10(白血病)、ZR-75-30(乳腺癌)、BT474(乳腺癌)、H1975(肺癌)细胞
测试浓度: 0.015-100 μM
孵育时间: 96 小时
实验结果: 显著抑制了四种高表达 BAZ1A 的癌细胞系的活力。
使用一组已知 BAZ1A 表达水平的癌细胞系评估 BAZ1A-IN-1 的体外细胞活性。将细胞接种于 96 孔板中,并用递增浓度的 BAZ1A-IN-1(0.015 至 100 μM)处理 96 小时。细胞活力采用 MTT、XTT 或 CellTiter-Glo 法测定,半数抑制浓度 (IC50) 值由剂量反应曲线计算得出。通过蛋白质印迹或定量 PCR 检测 BAZ1A 表达水平与 BAZ1A-IN-1 敏感性之间的相关性,以确认靶点依赖性。细胞凋亡通过流式细胞术(Annexin V/碘化丙啶染色)或 caspase-3/7 活性检测进行评估。BAZ1A-IN-1 对下游基因表达的影响可通过 RNA 测序或定量 PCR 进行评估,以鉴定 BAZ1A 调控的转录程序。
动物实验
目前已发表的文献中尚无关于BAZ1A-IN-1的体内动物模型数据。该化合物尚未在异种移植模型或其他动物研究中进行评估,以评价其抗肿瘤疗效或药代动力学特性。作为一种研究工具,BAZ1A-IN-1目前主要用于体外研究,以探究BAZ1A的生物学功能并验证其作为潜在治疗靶点的价值。未来的研究可能会利用异种移植模型来评估BAZ1A-IN-1的体内疗效,包括单独使用或与其他抗癌药物联合使用。
药代性质 (ADME/PK)
目前文献中尚未发表 BAZ1A-IN-1 的详细药代动力学数据。BAZ1A-IN-1 是一种分子量为 340.36 g/mol 的小分子,可能具有良好的成药性。该化合物在 DMSO 中的溶解度为 80 mg/mL (235.05 mM),表明其具有良好的溶解性。需要进一步研究以表征 BAZ1A-IN-1 的吸收、分布、代谢和排泄 (ADME) 特性,包括口服生物利用度、血浆蛋白结合率、清除率、半衰期和组织分布。该化合物的药代动力学特征对于确定体内疗效研究的合适给药方案以及评估其临床开发潜力至关重要。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前文献中尚未发表关于 BAZ1A-IN-1 的详细毒性数据。作为一种研究化合物,BAZ1A-IN-1 尚未进行全面的毒理学研究。该化合物对 BAZ1A 的选择性优于其他含溴结构域蛋白,且其在 BAZ1A 高表达的癌细胞中表现出靶向依赖性活性,这表明其安全性可能良好,毒性可能仅限于依赖 BAZ1A 功能的细胞。然而,未来的研究仍需仔细评估其脱靶效应以及对正常组织的潜在毒性。
参考文献

[1]. Discovery of BAZ1A bromodomain inhibitors with the aid of virtual screening and activity evaluation. Bioorg Med Chem Lett. 2021;33:127745.

其他信息
BAZ1A-IN-1 是一种高效且选择性的 BAZ1A 溴结构域抑制剂,其 KD 值为 0.52 μM。该化合物对 BAZ1A 高表达的癌细胞系(包括 THP-1、ZR-75-30、BT474 和 H1975 细胞)表现出显著的抗存活活性,IC50 值范围为 4.29 μM 至 10.65 μM。BAZ1A-IN-1 可从多家供应商处获得,用于临床前研究。该化合物是研究 BAZ1A 在染色质重塑、基因表达和癌症生物学中作用的重要工具。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C16H12N4O3S
分子量
340.356481552124
精确质量
340.063
CAS号
941521-45-5
PubChem CID
19257149
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
LogP
3.3
tPSA
128
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
24
分子复杂度/Complexity
453
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O=C(NC1C=C([N+](=O)[O-])C=CC=1)NC1SC=C(C2C=CC=CC=2)N=1
InChi Key
UJRJAZDAWUSWRK-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C16H12N4O3S/c21-15(17-12-7-4-8-13(9-12)20(22)23)19-16-18-14(10-24-16)11-5-2-1-3-6-11/h1-10H,(H2,17,18,19,21)
化学名
1-(3-nitrophenyl)-3-(4-phenyl-1,3-thiazol-2-yl)urea
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 25 mg/mL (73.45 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.9381 mL 14.6903 mL 29.3807 mL
5 mM 0.5876 mL 2.9381 mL 5.8761 mL
10 mM 0.2938 mL 1.4690 mL 2.9381 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们