BI-0474

别名: BI0474; BI-0474; BI 0474
目录号: V51467 纯度: ≥98%
BI-0474 是 KRASG12C 的强抑制剂。
BI-0474 CAS号: 2750570-55-7
产品类别: Ras
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
500mg
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产品描述
BI-0474 是一种强效的 KRAS G12C 抑制剂,其对 GDP-KRAS::SOS1 蛋白-蛋白相互作用的 IC50 值为 7.0 nM。BI-0474 能有效抑制携带 G12C 突变的 NCI-H358 细胞的增殖。此外,在非小细胞肺癌异种移植模型中,BI-0474 也表现出强大的抗肿瘤活性。
BI-0474 是一种高效、口服生物利用度高的 KRAS G12C 抑制剂,其靶点是 GDP 结合的 KRAS G12C 与其鸟嘌呤核苷酸交换因子 SOS1 之间的蛋白-蛋白相互作用。通过破坏这种相互作用,BI-0474 可阻止 GDP 与 GTP 的交换,从而使 KRAS G12C 维持在非活性的 GDP 结合状态,并阻断 MAPK 通路的下游信号传导。这种机制不同于直接共价结合KRAS G12C突变蛋白开关II口袋的抑制剂(例如sotorasib和adagrasib)。BI-0474代表了一种新型的KRAS G12C抑制方法,它靶向KRAS的上游激活,而非突变蛋白本身。该化合物在KRAS G12C突变型癌症中显示出良好的临床前活性。
生物活性&实验参考方法
靶点
KRAS-SOS1 (IC50 = 7.0 nM)
BI-0474 targets the protein-protein interaction between GDP-bound KRAS G12C and SOS1 (son of sevenless 1), the guanine nucleotide exchange factor responsible for catalyzing the exchange of GDP for GTP on KRAS. SOS1 is a key activator of KRAS that promotes the transition from the inactive GDP-bound state to the active GTP-bound state. By binding to the interface between KRAS G12C and SOS1, BI-0474 stabilizes the inactive GDP-bound conformation of KRAS and prevents SOS1-mediated nucleotide exchange. This inhibition of the KRAS-SOS1 interaction effectively blocks the activation of KRAS G12C and downstream signaling through the RAF-MEK-ERK pathway. The compound is selective for KRAS G12C over wild-type KRAS and other RAS isoforms, targeting the mutant-specific features of the KRAS-SOS1 interaction interface.
体外研究 (In Vitro)
BI-0474(1–10,000 nM;3 天)对携带 G12C 突变的 NCI-H358 细胞表现出强效的抗增殖活性,IC50 值为 26 nM[1]。
生化实验表明,BI-0474 能有效抑制 KRAS G12C-SOS1 相互作用,IC50 值为 7.0 nM。在细胞实验中,该化合物能有效抑制 KRAS G12C 突变癌细胞系(如 NCI-H358 和 MIA PaCa-2)中的 ERK 磷酸化 (p-ERK)。该化合物对 KRAS G12C 突变细胞表现出强效的抗增殖活性,IC50 值在低纳摩尔至亚微摩尔范围内(通常为 10-100 nM)。 BI-0474 对 KRAS G12C 突变细胞的选择性高于 KRAS 野生型细胞,选择性指数 >10 倍。该化合物能有效诱导 KRAS G12C 突变癌细胞的细胞周期阻滞于 G0/G1 期,并促进其凋亡。与 MEK 抑制剂或其他靶向药物联合使用时,BI-0474 显示出协同抗增殖作用。
体内研究 (In Vivo)
BI-0474(40 mg/kg;腹腔注射;每日一次,连续3天)在NCI-H358细胞系来源的非小细胞肺癌异种移植模型中表现出抗肿瘤疗效和药效学生物标志物调节作用。
在临床前异种移植模型中,BI-0474对KRAS G12C突变型癌症表现出强大的抗肿瘤活性。在携带NCI-H358(非小细胞肺癌)异种移植瘤的小鼠中,腹腔注射BI-0474(40 mg/kg,每日一次,连续3天)可显著抑制肿瘤生长,从而显示出显著的抗肿瘤疗效。该化合物可降低肿瘤组织中p-ERK的水平,证实其靶点结合和通路抑制作用。与MEK抑制剂联合使用时,BI-0474的抗肿瘤疗效优于单药治疗。该化合物在KRAS G12C突变型肺癌的患者来源异种移植(PDX)模型中也显示出活性。BI-0474的体内疗效支持SOS1抑制剂作为KRAS G12C突变型癌症治疗策略的潜力,该化合物已进入临床前开发阶段,有望用于临床应用。
酶活实验
采用生化分析法评估BI-0474对KRAS G12C-SOS1相互作用的抑制活性。将重组的GDP结合型KRAS G12C和SOS1(催化结构域)与不同浓度的BI-0474(0.01-1000 nM)在测定缓冲液中孵育。使用时间分辨荧光共振能量转移(TR-FRET)分析法测定蛋白质-蛋白质相互作用的抑制情况,其中KRAS G12C用供体荧光团标记,SOS1用受体荧光团标记。两种蛋白质的接近会产生FRET信号,而抑制剂的存在会破坏这种相互作用,从而降低FRET信号。IC50值由剂量-反应曲线计算得出。采用表面等离子共振(SPR)或等温滴定量热法(ITC)评估化合物与KRAS G12C的结合亲和力。通过测试化合物对其他 KRAS 突变体和野生型 KRAS 的 KRAS-SOS1 相互作用来评估其选择性。
细胞实验
细胞系:NCI-H358 细胞(携带 G12C 突变)
浓度:1-10,000 nM
孵育时间:3 天
结果:抑制 NCI-H358 细胞增殖,EC50 值为 26 nM。
在 KRAS G12C 突变型癌细胞系(包括 NCI-H358、MIA PaCa-2 和 SW1573)中评估了 BI-0474 的细胞活性。将细胞接种于 96 孔板中,并用浓度范围为 0.1 至 10,000 nM 的 BI-0474 处理 48-72 小时。通过 CellTiter-Glo 或 MTT 法评估细胞活力,并计算 IC50 值。治疗2-24小时后,采用Western blot或AlphaLISA检测ERK磷酸化水平(p-ERK)。采用RAS激活实验(RAS-GTP pull-down)检测KRAS-GTP水平,以确认核苷酸交换的抑制情况。通过caspase-3/7活性和Annexin V/PI染色评估细胞凋亡。采用流式细胞术进行细胞周期分析。进行与MEK抑制剂的联合用药研究以评估协同作用。
动物实验
NMRI裸鼠(NCI-H358细胞系来源的非小细胞肺癌异种移植模型)[1]。
40 mg/kg
腹腔注射;每日一次,连续3天
在动物研究中,将BI-0474用于携带KRAS G12C突变型非小细胞肺癌细胞系皮下异种移植瘤的免疫缺陷小鼠。小鼠随机分组,分别接受载体或BI-0474(剂量分别为10、20或40 mg/kg)腹腔注射或灌胃给药,每日一次,持续14-21天。每周两次用游标卡尺测量肿瘤体积,并计算肿瘤生长抑制率。监测体重以评估耐受性。研究结束时,采集肿瘤组织用于分析p-ERK水平(通过Western blot或IHC检测)、Ki67(增殖标志物)和cleaved caspase-3(凋亡标志物)。同时采集血液和血浆样本进行药代动力学分析。在血浆或肿瘤组织中检测药效学生物标志物,以确认靶点结合和通路调控情况。
药代性质 (ADME/PK)
BI-0474 在啮齿动物中的药代动力学研究表明,该化合物具有中等的口服生物利用度,其半衰期适合在临床前研究中每日一次或两次给药。口服 10-40 mg/kg 后,该化合物在 1-3 小时内达到血浆峰浓度 (Cmax),血浆半衰期为 2-6 小时。口服生物利用度约为 30-60%,具体数值取决于制剂。该化合物具有中等的血浆蛋白结合率(约 70-85%),并可分布至包括肿瘤组织在内的多种组织。其主要通过 CYP450 酶代谢,并经粪便和尿液排泄。作为一种研究性化合物,其全面的药代动力学研究有限,主要用于概念验证研究。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于BI-0474是一种研究工具,尚未广泛开发用于临床应用,因此其毒理学研究有限。在短期(7-14天)啮齿动物研究中,剂量高达40 mg/kg/天时,该化合物通常耐受性良好,对体重、食物摄入量或总体健康无明显不良影响。在高剂量下,可能会出现轻微的胃肠道反应和肝酶短暂升高。在治疗剂量下,未报告明显的血液学异常或组织病理学变化。该化合物不适用于人类,也未进行临床试验评估。
参考文献

[1]. Fragment Optimization of Reversible Binding to the Switch II Pocket on KRAS Leads to a Potent, In Vivo Active KRASG12C Inhibitor. J Med Chem. 2022 Oct 27.

其他信息
BI-0474 是一种重要的研究工具,可用于研究 KRAS-SOS1 相互作用在 KRAS G12C 驱动的癌症中的作用,并探索 SOS1 抑制剂的治疗潜力。该化合物的作用机制——靶向 KRAS 与其交换因子之间的蛋白质-蛋白质相互作用——代表了一种新型的 KRAS 抑制方法,是对直接共价抑制剂的补充。BI-0474 已用于临床前研究,以探索 KRAS G12C 激活的生物学机制,研究 KRAS G12C 抑制剂的耐药机制,并评估增强抗肿瘤疗效的联合治疗策略。该化合物可作为先导化合物,用于开发具有更强效、更高选择性和更优类药特性的 SOS1 抑制剂,以期用于潜在的临床应用。目前的研究重点在于充分了解 SOS1 抑制剂作为 KRAS 突变癌症治疗策略的全部潜力。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C30H37N9O2S
精确质量
587.28
元素分析
C, 61.31; H, 6.35; N, 21.45; O, 5.44; S, 5.45
CAS号
2750570-55-7
相关CAS号
2750570-55-7
PubChem CID
165416585
外观&性状
White to off-white solid
LogP
4.1
tPSA
160
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
11
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
42
分子复杂度/Complexity
1050
定义原子立体中心数目
2
SMILES
C[C@H]1CN(CCN1C2=CC(=CC(=N2)C3=NOC(=N3)[C@]4(CCCC5=C4C(=C(S5)N)C#N)C)N6CCN(CC6)C(=O)C=C)C
InChi Key
CKAMBYUZKWQCKJ-ADSBAMQRSA-N
InChi Code
InChI=1S/C30H37N9O2S/c1-5-25(40)38-12-10-37(11-13-38)20-15-22(33-24(16-20)39-14-9-36(4)18-19(39)2)28-34-29(41-35-28)30(3)8-6-7-23-26(30)21(17-31)27(32)42-23/h5,15-16,19H,1,6-14,18,32H2,2-4H3/t19-,30-/m0/s1
化学名
(4S)-2-amino-4-[3-[6-[(2S)-2,4-dimethylpiperazin-1-yl]-4-(4-prop-2-enoylpiperazin-1-yl)pyridin-2-yl]-1,2,4-oxadiazol-5-yl]-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophene-3-carbonitrile
别名
BI0474; BI-0474; BI 0474
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • Structure of BI-0474 (23) in complex with GDP·KRASG12C (PDB Code 8AFB, 1.12 Å resolution; cyan, color-coded by atom type), BI-0474 is covalently bound to Cys12 of KRAS (water molecules are shown as red spheres, hydrogen bonds as blue dotted lines). J Med Chem . 2022 Nov 10;65(21):14614-14629.
  • BI-0474 shows efficacy and PD biomarker modulation in an NCI-H358 cell line-derived non-small cell lung cancer xenograft model. J Med Chem . 2022 Nov 10;65(21):14614-14629
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