Bafilomycin C1 (Bafilomycin C1)

别名: 巴佛罗霉素C1; 巴佛洛霉素C 1; 巴伐洛霉素 C1; 巴菲霉素C1
目录号: V52367 纯度: ≥98%
Bafilomycin C1 是一种从链霉菌属中提取的大环内酯类抗生素(抗生素)。
Bafilomycin C1 (Bafilomycin C1) CAS号: 88979-61-7
产品类别: Apoptosis
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
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产品描述
巴弗洛霉素C1是一种从链霉菌属(Streptomyces sp.)中提取的大环内酯类抗生素。巴弗洛霉素C1是一种强效、特异性且可逆的液泡型H+-ATP酶抑制剂。巴弗洛霉素C1可抑制革兰氏阳性菌(Gram+)和真菌的生长。巴弗洛霉素C1可诱导细胞凋亡,并可用于肝细胞癌(HCC)的研究。
巴弗洛霉素C1是一种从链霉菌属中分离得到的大环内酯类抗生素,它是一种强效、特异性且可逆的液泡型H+-ATP酶(V-ATP酶)抑制剂。V-ATP酶是多亚基质子泵,可酸化细胞内区室,包括溶酶体、内体和高尔基体,并且对蛋白质降解、受体循环和自噬等多种细胞过程至关重要。巴弗洛霉素C1通过与V0亚基结合抑制V-ATPase,阻止质子跨膜转运。这种抑制作用导致酸性细胞器中和,阻断自噬降解,并诱导癌细胞凋亡。巴弗洛霉素C1还具有抗革兰氏阳性菌的抗菌活性和抗真菌活性。该化合物已被用作研究工具,用于研究V-ATPase在各种生理和病理过程中的作用,包括癌症、传染病和神经退行性疾病。
生物活性&实验参考方法
靶点
Macrolide
Bafilomycin C1 targets vacuolar-type H+-ATPases (V-ATPases), which are proton pumps responsible for acidifying intracellular organelles. The compound binds to the V0 subunit of the V-ATPase, specifically inhibiting proton translocation across membranes. By blocking V-ATPase activity, Bafilomycin C1 prevents the acidification of lysosomes and endosomes, leading to the inhibition of autophagic degradation and the accumulation of autophagosomes. The inhibition of V-ATPase also disrupts various cellular processes that depend on acidic pH, including receptor-mediated endocytosis, protein trafficking, and the activation of lysosomal enzymes. Bafilomycin C1 is a reversible inhibitor, meaning its effects can be reversed by removing the compound.
体外研究 (In Vitro)
巴弗洛霉素C1(0.33-10 μM;6天)以时间和剂量依赖的方式抑制HepG2和SMMC7721细胞的生长和增殖[2]。在mRNA和蛋白质表达方面,巴弗洛霉素C1(0.33-3.3 μM;24小时)可降低SMMC7721细胞中细胞周期蛋白D3、细胞周期蛋白E1、CDK2、CDK4和CDK6的表达[2]。与溶剂对照组相比,巴弗洛霉素C1(3.3-10 μM;24小时)可导致细胞形态改变,并且在Hoechst 33258(HY-15558)染色后,凋亡细胞数量增加[2]。巴弗洛霉素C1已显示出对多种癌细胞系的强效体外活性。在肝细胞癌细胞系HepG2和SMMC7721中,巴弗洛霉素C1(0.33-10 μM;6天)以时间和剂量依赖的方式抑制细胞生长和增殖。该化合物可降低细胞周期关键调控因子——细胞周期蛋白D3、细胞周期蛋白E1、CDK2、CDK4和CDK6的表达。巴弗洛霉素C1可诱导肝细胞癌细胞凋亡。此外,该化合物还具有抗革兰氏阳性菌的抗菌活性和抗真菌活性。现有文献尚未详细报道其对V-ATPase活性的半数抑制浓度(IC50),但该化合物被描述为一种强效抑制剂。
体内研究 (In Vivo)
在裸鼠模型中,巴弗洛霉素C1(皮下注射;0.2 mg/kg;20天)可减缓肿瘤生长,且未引起任何明显的副作用或不良反应[1]。
巴弗洛霉素C1在异种移植小鼠模型中也展现出体内抗肿瘤活性。在携带SMMC7721肝细胞癌肿瘤异种移植的BALB/c裸鼠模型中,皮下注射巴弗洛霉素C1(剂量为0.2 mg/kg,持续20天)可显著抑制肿瘤生长,且未引起明显的不良反应或副作用。该结果表明,巴弗洛霉素C1在所测试的剂量下具有良好的安全性,具有成为潜在抗癌药物的潜力。该化合物的体内活性归因于其对V-ATPase的抑制作用,从而导致自噬降解受阻并诱导癌细胞凋亡。
酶活实验
巴弗洛霉素C1对V-ATPase的抑制活性可通过体外酶活性测定进行评估。典型的测定方法是将纯化的V-ATPase酶(来自牛脑或其他来源)重组到脂质体或膜囊泡中。将该酶与不同浓度的ATP和巴弗洛霉素C1孵育,并使用吖啶橙或其他pH敏感染料进行荧光测定,以测量质子泵活性。荧光信号的降低表明质子转运受到抑制,并可用于计算半数抑制浓度(IC50)。此外,也可通过比色法定量无机磷酸盐的释放来测定V-ATPase的ATPase活性。抑制作用的可逆性可通过透析或稀释实验来验证。
细胞实验
细胞活力检测[2]
细胞类型: SMMC7721 细胞和 HepG2 细胞
测试浓度: SMMC7721 细胞:0.33 μM、1.1 μM 和 3.3 μM;HepG2 细胞:1.1 μM、3.3 μM 和 10.0 μM
孵育时间: 6 天
实验结果: 抑制细胞生长。
蛋白质印迹分析[2]
细胞类型: SMMC7721 细胞
测试浓度: 3.3 μM
孵育时间: 24 小时
实验结果: 细胞周期蛋白 D3/E1、CDK2/4/6 蛋白表达降低,p21 蛋白表达升高。
细胞凋亡分析[2]
细胞类型: SMMC7721 和 HepG2 细胞
测试浓度: 3.3 μM; 10 μM
孵育时间: 24 小时
实验结果: 诱导 SMMC7721 和 HepG2 细胞凋亡。
使用肝癌细胞系(如 HepG2 和 SMMC7721)评估巴弗洛霉素 C1 的细胞活性。将细胞接种于 96 孔板中,并用递增浓度的巴弗洛霉素 C1 (0.33-10 μM) 处理 24 至 144 小时。使用 MTT 或 CellTiter-Glo 检测法测定细胞活力,并根据剂量反应曲线计算半数抑制浓度 (IC50) 值。使用 Annexin V/碘化丙啶染色或通过测量 caspase-3/7 活性,通过流式细胞术评估细胞凋亡。通过蛋白质印迹法评估巴弗洛霉素C1对细胞周期调节因子(如细胞周期蛋白D3、细胞周期蛋白E1、CDK2、CDK4和CDK6)的影响。通过蛋白质印迹法监测LC3-II(自噬体标志物)的积累来评估自噬。
动物实验
动物/疾病模型: BALB/c裸鼠(体重18-20 g)皮下注射SMMC7721细胞悬液(5×10⁶个细胞/100 μL)[2]
剂量: 0.2 mg/kg
给药途径: 皮下注射;20天
实验结果: 抑制SMMC7721肿瘤异种移植瘤的生长。
巴弗洛霉素C1已在肝细胞癌异种移植小鼠模型中进行了评估。雌性BALB/c裸鼠皮下接种SMMC7721肝细胞癌细胞。当肿瘤达到可触及的大小时,将动物随机分为治疗组和对照组。巴弗洛霉素C1以0.2 mg/kg的剂量皮下注射给药,疗程为20天。每周使用游标卡尺测量两次肿瘤体积,并计算肿瘤生长抑制率(TGI)。监测体重作为毒性反应的总体指标。研究结束时,切除肿瘤,称重,并进行组织病理学分析和免疫组织化学染色,以评估V-ATPase表达、细胞凋亡(TUNEL检测)和细胞增殖(Ki-67染色)。
药代性质 (ADME/PK)
目前文献中尚未发表巴弗洛霉素C1的详细药代动力学数据。巴弗洛霉素C1是一种分子量为720.89 g/mol的大环内酯类抗生素,其口服生物利用度可能较低,因此在体内研究中可能需要肠外给药。该化合物可溶于二甲基亚砜(DMSO)。需要开展进一步研究,以阐明巴弗洛霉素C1的吸收、分布、代谢和排泄(ADME)特性,包括血浆蛋白结合率、清除率、半衰期和组织分布。该化合物的药代动力学特征对于确定体内疗效研究的合适给药方案以及评估其临床开发潜力至关重要。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
现有文献中尚未发表关于巴弗洛霉素C1的详细毒性数据。在异种移植小鼠模型中,据报道,巴弗洛霉素C1在0.2 mg/kg剂量下耐受性良好,未观察到明显的不良反应或副作用。然而,仍需进行全面的毒理学研究以评估巴弗洛霉素C1的安全性,从而评估其潜在的临床开发。其作用机制涉及V-ATPase的抑制和溶酶体功能的破坏,这可能导致对依赖V-ATPase活性的正常组织产生脱靶效应。该化合物的抗菌和抗真菌活性也表明其可能影响微生物群。
参考文献

[1]. Bafilomycins: A Class of Inhibitors of Membrane ATPases From Microorganisms, Animal Cells, and Plant Cells. Proc Natl Acad Sci U S A. 1988 Nov;85(21):7972-6.

[2]. Bafilomycin C1 Induces G0/G1 Cell-Cycle Arrest and Mitochondrial-Mediated Apoptosis in Human Hepatocellular Cancer SMMC7721 Cells. J Antibiot (Tokyo). 2018 Sep;71(9):808-817.

其他信息
巴弗洛霉素C1是一种从链霉菌属(Streptomyces sp.)中分离得到的大环内酯类抗生素,它是一种强效、特异性且可逆的液泡型H+-ATP酶(V-ATPases)抑制剂。它被用作研究工具,用于研究V-ATPases在自噬、内吞作用和其他细胞过程中的作用。该化合物能够抑制革兰氏阳性菌和真菌的生长。巴弗洛霉素C1可诱导细胞凋亡,并已被用于肝细胞癌的研究。在异种移植小鼠模型中,皮下注射0.2 mg/kg的巴弗洛霉素C1,持续20天,可抑制肿瘤生长,且未观察到明显的副作用。巴弗洛霉素C1可从多家供应商处获得,作为研究用化合物。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C39H60O12
分子量
720.89
精确质量
720.408
CAS号
88979-61-7
PubChem CID
129396804
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.18 g/cm3
沸点
844.4ºC at 760 mmHg
闪点
248.9ºC
折射率
1.544
LogP
4.884
tPSA
178.28
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
12
可旋转键数目(RBC)
11
重原子数目
51
分子复杂度/Complexity
1350
定义原子立体中心数目
12
SMILES
C[C@H]1C/C(=C/C=C/[C@@H]([C@H](OC(=O)/C(=C/C(=C/[C@H]([C@H]1O)C)/C)/OC)[C@@H](C)[C@H]([C@H](C)[C@]2(C[C@H]([C@@H]([C@H](O2)C(C)C)C)OC(=O)/C=C/C(=O)O)O)O)OC)/C
InChi Key
WUDBXVQNMOTFEE-ZXXPJKRZSA-N
InChi Code
InChI=1S/C39H60O12/c1-21(2)36-26(7)31(49-33(42)16-15-32(40)41)20-39(46,51-36)28(9)35(44)27(8)37-29(47-10)14-12-13-22(3)17-24(5)34(43)25(6)18-23(4)19-30(48-11)38(45)50-37/h12-16,18-19,21,24-29,31,34-37,43-44,46H,17,20H2,1-11H3,(H,40,41)/b14-12+,16-15+,22-13+,23-18+,30-19-/t24-,25+,26-,27-,28-,29-,31+,34-,35+,36+,37+,39+/m0/s1
化学名
(E)-4-[(2R,4R,5S,6R)-2-hydroxy-2-[(2S,3R,4S)-3-hydroxy-4-[(2R,3S,4E,6E,9S,10S,11R,12E,14Z)-10-hydroxy-3,15-dimethoxy-7,9,11,13-tetramethyl-16-oxo-1-oxacyclohexadeca-4,6,12,14-tetraen-2-yl]pentan-2-yl]-5-methyl-6-propan-2-yloxan-4-yl]oxy-4-oxobut-2-enoic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.3872 mL 6.9359 mL 13.8717 mL
5 mM 0.2774 mL 1.3872 mL 2.7743 mL
10 mM 0.1387 mL 0.6936 mL 1.3872 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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