HaloPROTAC3

别名: HaloPROTAC-3; HaloPROTAC 3; Halo PROTAC-3; HaloPROTAC3
目录号: V56746 纯度: ≥98%
HaloPROTAC3 是 HaloTag 融合蛋白的降解剂。
HaloPROTAC3 CAS号: 1799506-07-2
产品类别: Others 11
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
50mg
100mg
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产品描述
HaloPROTAC3 是一种 HaloTag 融合蛋白降解剂。
HaloPROTAC3(CAS 1799506-07-2)是一种异双功能蛋白水解靶向嵌合体(PROTAC),它通过氯代烷烃部分与 HaloTag7 融合蛋白共价结合,同时募集 von Hippel-Lindau (VHL) E3 泛素连接酶复合物。这会诱导标记靶蛋白的泛素化和蛋白酶体降解。HaloPROTAC3 是一种经过广泛验证的靶向蛋白降解研究工具,由 Crews 实验室开发。
生物活性&实验参考方法
靶点
HaloPROTAC3 targets HaloTag7 fusion proteins for degradation via the proteasomal pathway. It binds to VHL with an IC50 of 0.54 μM. The compound is a conjugate of ligands for E3 ligase (VHL) and a 16-atom-length linker. By forming a ternary complex between the HaloTag fusion protein, HaloPROTAC3, and VHL E3 ligase, it facilitates ubiquitination and subsequent degradation of the HaloTagged protein of interest.
体外研究 (In Vitro)
HaloPROTAC3 是一种高效的 GFP-HaloTag7 融合蛋白降解剂,其半数降解浓度 (DC50) 为 19 nM。在 625 nM 的浓度下,它可诱导 90% 的 GFP-HaloTag7 降解。它与 VHL 结合的 IC50 为 0.54 μM。该化合物在细胞模型中表现出优异的降解效率,并已被用于研究多种 HaloTag 融合蛋白的降解动力学。
体内研究 (In Vivo)
在体内,HaloPROTAC3已被用于在细胞模型以及潜在的动物模型中实现HaloTag融合蛋白的靶向降解。降解动力学已被广泛研究,结果表明,治疗后数小时内即可发生显著降解。HaloPROTAC3已被应用于抗病毒研究,其中利用HaloPROTAC3靶向降解HaloG3BP1显示出对MNV1感染的抗病毒作用。该化合物的体内疗效取决于HaloTag融合蛋白靶标的表达水平。
酶活实验
采用荧光偏振或表面等离子共振 (SPR) 法测定 HaloPROTAC3 与 VHL 的结合亲和力。将重组 VHL 蛋白与荧光标记的 VHL 配体探针孵育,并测定不同浓度 HaloPROTAC3 对 VHL 配体的置换作用。IC50 值由竞争曲线计算得出。该测定证实 HaloPROTAC3 能够与 VHL E3 连接酶结合,IC50 值为 0.54 μM。
细胞实验
在表达 GFP-HaloTag7 融合蛋白的 HEK293 细胞中评估降解活性。将细胞用浓度递增的 HaloPROTAC3(通常为 0.1 nM 至 10 μM)处理 4-24 小时。通过流式细胞术或荧光显微镜测量 GFP 荧光,以定量剩余的 HaloTag7 蛋白。根据剂量反应曲线计算 DC50 值。使用抗 HaloTag 或抗 GFP 抗体进行 Western blot 分析以确认降解。在不同时间点评估降解动力学。
动物实验
HaloPROTAC3 的体内研究通常包括将其给药于表达目标 HaloTag 融合蛋白的小鼠模型。该化合物可通过腹腔注射或其他途径给药。在给药后不同时间点采集组织样本,并通过蛋白质印迹法或免疫组织化学法定量分析 HaloTag 融合蛋白的水平。药效学终点包括评估靶标降解效率和作用持续时间。
药代性质 (ADME/PK)
HaloPROTAC3 的药代动力学性质具有 PROTAC 分子的特征。其分子式为 C41H55ClN4O8S,分子量为 799.42。该化合物可溶于 DMSO。为长期稳定保存,应将其以固体粉末形式储存于 -20°C;短期使用时,应储存于 0-4°C。作为一种 PROTAC,它具有一个连接 HaloTag 配体和 VHL 配体的 16 原子连接基团。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
HaloPROTAC3的毒理学数据仅限于研究应用。该化合物仅供研究使用,不用于治疗用途。作为一种靶向蛋白降解的工具化合物,其毒性主要在所研究的特定细胞系或动物模型中进行评估。在体外降解研究中使用的浓度下,该化合物通常具有良好的耐受性。临床开发需要进行全面的毒理学分析。
参考文献

[1]. HaloPROTACS: Use of Small Molecule PROTACs to Induce Degradation of HaloTag Fusion Proteins. ACS Chem Biol. 2015 Aug 21;10(8):1831-7.

其他信息
HaloPROTAC3 是一种典型的小分子 VHL 募集型 HaloTag 降解剂,也是目前应用最广泛的 HaloTag 融合蛋白降解工具。它也被称为 VH285-PEG4-C4-Cl。该化合物能够诱导特定 HaloTag 蛋白的降解,从而用于研究蛋白质功能。它已被应用于多种领域,包括受体药理学、抗病毒研究以及蛋白质降解动力学研究。HaloPROTAC3 提供了一种化学生物学方法,可以对蛋白质功能进行时间控制的研究。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C41H55CLN4O8S
分子量
799.4154
精确质量
798.34
元素分析
C, 61.60; H, 6.94; Cl, 4.43; N, 7.01; O, 16.01; S, 4.01
CAS号
1799506-07-2
PubChem CID
156597126
外观&性状
Colorless to off-white liquid
LogP
4.9
tPSA
168
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
10
可旋转键数目(RBC)
23
重原子数目
55
分子复杂度/Complexity
1190
定义原子立体中心数目
3
SMILES
CC1=C(SC=N1)C2=CC(=C(C=C2)CNC(=O)[C@@H]3C[C@H](CN3C(=O)[C@H](C(C)C)N4CC5=CC=CC=C5C4=O)O)OCCOCCOCCOCCCCCCCl
InChi Key
UABTZMQNIWDHGQ-JGNAJVFASA-N
InChi Code
InChI=1S/C41H55ClN4O8S/c1-28(2)37(46-25-32-10-6-7-11-34(32)40(46)49)41(50)45-26-33(47)23-35(45)39(48)43-24-31-13-12-30(38-29(3)44-27-55-38)22-36(31)54-21-20-53-19-18-52-17-16-51-15-9-5-4-8-14-42/h6-7,10-13,22,27-28,33,35,37,47H,4-5,8-9,14-21,23-26H2,1-3H3,(H,43,48)/t33-,35+,37+/m1/s1
化学名
(2S,4R)-N-(2-(2-(2-(2-((6-Chlorohexyl)oxy)ethoxy)ethoxy)ethoxy)-4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)-4-hydroxy-1-((S)-3-methyl-2-(1-oxoisoindolin-2-yl)butanoyl)pyrrolidine-2-carboxamide
别名
HaloPROTAC-3; HaloPROTAC 3; Halo PROTAC-3; HaloPROTAC3
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.2509 mL 6.2545 mL 12.5091 mL
5 mM 0.2502 mL 1.2509 mL 2.5018 mL
10 mM 0.1251 mL 0.6255 mL 1.2509 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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