PARP-1-IN-3

目录号: V41045 纯度: ≥98%
PARP-1-IN-3 是一种苯甲酰胺类似物和一种有效的 PARP-1 抑制剂(拮抗剂),对 PARP-1 和 PARP-2 的 IC50 值分别为 0.25 nM 和 2.34 nM。
PARP-1-IN-3 CAS号: 2976342-33-1
产品类别: Apoptosis
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
PARP-1-IN-3 是一种苯甲酰胺类似物,也是一种强效的 PARP-1 抑制剂(拮抗剂),对 PARP-1 和 PARP-2 的 IC50 值分别为 0.25 nM 和 2.34 nM。PARP-1-IN-3 可诱导细胞凋亡并将细胞周期阻滞在 G2/M 期。PARP-1-IN-3 可用于癌症研究。
PARP-1-IN-3(CAS 编号:2976342-33-1)是一种强效的苯甲酰胺衍生的 PARP-1 抑制剂,对 PARP-1 和 PARP-2 的 IC50 值分别为 0.25 nM 和 2.34 nM。它通过诱导细胞凋亡和将细胞周期阻滞在 G2/M 期而表现出显著的抗癌活性。该化合物显示出潜在的抗炎活性,目前正在探索其在癌症治疗中的应用,尤其是在 BRCA 突变肿瘤的治疗中。
生物活性&实验参考方法
靶点
PARP-1 0.25 nM (IC50) PARP-2 2.34 nM (IC50)
PARP-1 (Poly(ADP-ribose) polymerase 1) and PARP-2. The compound inhibits PARP-1 with an IC50 of 0.25 nM and PARP-2 with an IC50 of 2.34 nM, demonstrating potent activity against both targets. It also shows antiproliferative activity against various cancer cell lines with IC50 values ranging from 0.30 μM (HCT116) to 33.69 μM (SW480).
体外研究 (In Vitro)
化合物 13f,即 PARP-1-IN-3,对 HCT116、DLD-1、SW480 和 NCM460 细胞均表现出强效的抗癌活性,其 IC50 值分别为 0.30、2.83、33.69 和 486.87 μM[1]。PARP-1-IN-3(0.3-3 μM;24-48 小时)可抑制 HCT116 细胞的迁移和克隆形成[1]。HCT116 细胞暴露于 PARP-1-IN-3(0.3-3 μM;48 小时)后,DNA 双链断裂发生积累[1]。 PARP-1-IN-3(0.3-7.5 μM;48-72 小时)可导致 HCT116 细胞线粒体膜电位降低,最终诱导细胞凋亡,并引起细胞周期阻滞[1]。体外实验表明,PARP-1-IN-3(化合物 13f;48 小时)对 HCT116、DLD-1、SW480 和 NCM460 细胞系均表现出显著的抗癌活性,IC50 值分别为 0.30、2.83、33.69 和 486.87 μM。在 0.3-3 μM 浓度下,PARP-1-IN-3 处理 24-48 小时可抑制 HCT116 细胞的克隆形成和迁移。在 0.3-7.5 μM 浓度下作用 48-72 小时,可诱导 G2/M 细胞周期停滞,降低线粒体膜电位,并触发 HCT116 细胞凋亡。
体内研究 (In Vivo)
由于PARP-1-IN-3是一种研究级抑制剂,其体内活性数据有限。基于其强大的体外活性和作用机制(PARP抑制、DNA损伤积累、诱导细胞凋亡),预计其在异种移植模型中具有抗肿瘤疗效,尤其是在携带BRCA突变或其他DNA修复缺陷的肿瘤中。需要开展进一步的体内研究。
酶活实验
采用化学发光或放射性测定法,以重组PARP-1/PARP-2蛋白和NAD+底物为底物,测定化合物对PARP-1和PARP-2的酶抑制作用。将化合物与酶孵育,通过测定聚(ADP-核糖)聚合物的形成来确定IC50值(PARP-1为0.25 nM,PARP-2为2.34 nM)。也可进行针对其他PARP家族成员的选择性分析。
细胞实验
细胞凋亡分析[1]
细胞类型: HCT116 细胞
测试浓度: 0.3、1.5、7.5 μM
孵育时间: 48 和 72 小时
实验结果: 总凋亡细胞百分比从 1.05%(对照组)增加到 79.49%(7.5 μM)。
细胞周期分析[1]
细胞类型: HCT116 细胞
测试浓度: 0.3、1.5、7.5 μM
孵育时间: 48 和 72 小时
实验结果: 阻滞细胞周期于 G2/M 期。
蛋白质印迹分析[1]
细胞类型: HCT116 细胞
测试浓度: 0.3、1、3 μM
孵育时间: 48 小时
实验结果: γH2AX 的表达水平呈浓度依赖性增加。
蛋白质印迹分析[1]
细胞类型: HCT116 细胞
测试浓度: 0.3、1、3 μM
孵育时间: 48 小时
实验结果: Bax、cleaved Caspase-3 和 cleaved-PARP 的表达水平升高,Bcl-2 的表达水平降低。
将 HCT116、DLD-1、SW480(结直肠癌)和 NCM460(正常结肠上皮)细胞培养,并用不同浓度的 PARP-1-IN-3 处理 48 小时。采用 CCK-8 或 MTT 法评估细胞活力。在 0.3-3 µM 浓度下进行 24-48 小时的克隆形成和迁移实验。采用流式细胞术进行细胞周期分析,通过 Annexin V/PI 染色和线粒体膜电位测量检测细胞凋亡。
动物实验
目前文献中尚未建立针对PARP-1-IN-3的具体体内实验方案。PARP抑制剂评估的标准方案包括在异种移植小鼠模型(例如,BRCA缺陷型肿瘤)中,根据药代动力学研究确定的剂量,进行口服或腹腔注射给药。评估指标包括肿瘤生长抑制、肿瘤内PARP活性以及生物标志物分析(γ-H2AX、细胞凋亡标志物)。
药代性质 (ADME/PK)
PARP-1-IN-3 的详细药代动力学参数尚未完全明确。该化合物的分子式为 C21H17BrN2O3,分子量为 425.28。它是一种苯甲酰胺衍生物,具有良好的溶解性。需要进一步研究以确定其在临床前模型中的口服生物利用度、半衰期和组织分布。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚无关于PARP-1-IN-3的全面毒性数据。作为一种强效PARP抑制剂,其安全性需要通过正式的毒理学研究进行评估。标准评估包括急性毒性和重复给药毒性、血液学参数以及主要器官的组织病理学检查。该化合物对PARP-1/2相对于其他靶点的选择性可能有助于其获得良好的安全性。
参考文献

[1]. Discovery of novel benzamide derivatives bearing benzamidophenyl and phenylacetamidophenyl scaffolds as potential antitumor agents via targeting PARP-1. Eur J Med Chem. 2023 May 5;251:115243.

其他信息
PARP-1-IN-3 (T78157) 是一种苯甲酰胺类似物,也是一种强效的 PARP-1 抑制剂,可用于癌症研究。其作用机制包括抑制 PARP 活性,导致 DNA 损伤积累、BRCA 缺陷细胞的合成致死以及诱导细胞凋亡。该化合物对癌细胞的选择性高于正常细胞(NCM460 IC50=486.87 μM vs HCT116 IC50=0.30 μM)。目前尚无临床试验或 FDA 批准信息。纯度通常 >99%。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C21H17BRN2O3
分子量
425.275284528732
精确质量
424.042
CAS号
2976342-33-1
PubChem CID
168355539
外观&性状
White to light yellow solid powder
LogP
3.8
tPSA
81.4
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
3
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
27
分子复杂度/Complexity
508
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C1=CC=C(C(=C1)C(=O)N)OCC2=CC(=CC=C2)NC(=O)C3=CC=C(C=C3)Br
InChi Key
VYGPONYCLGMRIN-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C21H17BrN2O3/c22-16-10-8-15(9-11-16)21(26)24-17-5-3-4-14(12-17)13-27-19-7-2-1-6-18(19)20(23)25/h1-12H,13H2,(H2,23,25)(H,24,26)
化学名
2-[[3-[(4-bromobenzoyl)amino]phenyl]methoxy]benzamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 125 mg/mL (293.92 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.3514 mL 11.7570 mL 23.5139 mL
5 mM 0.4703 mL 2.3514 mL 4.7028 mL
10 mM 0.2351 mL 1.1757 mL 2.3514 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们