(R,R)-BAY-Y 3118

别名: (R,R)-BAY-Y-3118
目录号: V52834 纯度: ≥98%
(R,R)-BAY-Y 3118 是 BAY-Y 3118 的 R 对映体。
(R,R)-BAY-Y 3118 CAS号: 151213-22-8
产品类别: Bacterial
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
50mg
Other Sizes

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产品描述
(R,R)-BAY-Y 3118 是 BAY-Y 3118 的 R 对映体。(R,R)-BAY-Y 3118 具有杀菌活性。
(R,R)-BAY-Y 3118 (CAS#: 151213-22-8) 是氟喹诺酮类抗生素 BAY-Y 3118 的 R-对映体。它对多种革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌表现出较弱的杀菌活性,并被用作研究喹诺酮类对映选择性抗菌活性和细菌 DNA 损伤机制的研究工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
Like other fluoroquinolones, (R,R)‑BAY‑Y 3118 targets bacterial type II topoisomerases, specifically DNA gyrase (GyrA/GyrB) and topoisomerase IV (ParC/ParE). It is believed to bind to the enzyme‑DNA complex, stabilizing DNA double‑strand breaks and leading to bacterial cell death. However, the R‑enantiomer binds with lower affinity and/or altered orientation compared to the active S‑enantiomer.
体外研究 (In Vitro)
对于大肠杆菌、铜绿假单胞菌、金黄色葡萄球菌和粪肠球菌,(R,R)-BAY-Y 3118 表现出杀菌活性,log 1/C 范围为 5.65-7.47[1]。
体外实验表明,(R,R)-BAY-Y 3118 对大肠杆菌、铜绿假单胞菌、金黄色葡萄球菌和粪肠球菌均表现出杀菌活性,log 1/C 值介于 5.65 至 7.47 之间。该化合物还能损伤真核细胞的线粒体 DNA (mtDNA),这与喹诺酮类药物对真核生物拓扑异构酶 II 的已知脱靶活性相符。然而,其活性显著弱于母体化合物 BAY-Y 3118 或其 S-对映体。
体内研究 (In Vivo)
(R,R)-BAY-Y 3118 的体内动物活性尚未进行正式评估。基于氟喹诺酮类药物的药代动力学和药效学特征,由于其杀菌活性较弱,预计 R-对映异构体的体内疗效有限。外消旋体 BAY-Y 3118 或 S-对映异构体将是任何体内感染模型的首选候选药物。
酶活实验
非细胞酶抑制实验采用纯化的DNA促旋酶(大肠杆菌)或拓扑异构酶IV。将酶与松弛的pBR322 DNA在ATP和不同浓度的(R,R)-BAY-Y 3118(0.01-100 uM)存在下于37℃孵育30分钟。反应用SDS/蛋白酶K终止,DNA产物通过琼脂糖凝胶电泳分离。超螺旋抑制(促旋酶)或解链(拓扑异构酶IV)的IC50值通过密度分析法测定。
细胞实验
根据CLSI指南,采用肉汤微量稀释法测定(R,R)-BAY-Y 3118的最低抑菌浓度(MIC)。将细菌菌株过夜培养,稀释至5 × 10⁵ CFU/mL,溶于阳离子调整的Mueller-Hinton肉汤中,并与化合物的倍比稀释液(0.125-64 ug/mL)在37℃下孵育18-20小时。MIC定义为抑制可见生长的最低浓度。对于真核细胞毒性,用(R,R)-BAY-Y 3118(0.1-100 uM)处理HepG2或Vero细胞,并通过Southern印迹或qPCR评估线粒体DNA的完整性。
动物实验
(R,R)-BAY-Y 3118 的体内疗效研究尚未发表。对于 BAY-Y 3118 的外消旋混合物或 S-对映体,可采用小鼠败血症模型(例如,腹腔注射 5 × 10⁷ CFU 的大肠杆菌)。感染后 1 小时,皮下或口服给予受试化合物(1-30 mg/kg)。监测小鼠存活 7 天,并测定血液中的细菌计数。对于 R-对映体,可能需要高剂量才能达到疗效。
药代性质 (ADME/PK)
目前尚未有专门针对 (R,R)-BAY-Y 3118 的正式药代动力学研究报道。作为一种氟喹诺酮类药物,预计其在啮齿动物体内具有较高的口服生物利用度(70-90%)和中等的血浆半衰期(3-6 小时),且组织穿透性良好。R-对映体可能具有相似的药代动力学特性,但靶点亲和力降低,因此总体抗菌疗效也较低。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚无针对 (R,R)-BAY-Y 3118 的毒理学数据。然而,据报道,外消旋体 BAY-Y 3118 会损伤火鸡胚胎肝细胞中的线粒体 DNA,这是喹诺酮类药物已知的非靶向效应,并可能具有肝毒性。对于 R-对映体,预计其毒性与外消旋体相似,但可能需要更高的剂量才会显现。
参考文献
[1]. Cianchetta G, et al. Chemometric studies on the bactericidal activity of quinolones via an extended VolSurf approach. J Med Chem. 2004;47(12):3193-3201.
其他信息
(R,R)-BAY-Y 3118 是一种研究级化学工具,用于研究氟喹诺酮类抗菌活性的立体选择性以及手性、靶点结合和毒性之间的关系。它尚未被开发为治疗药物,也未进入临床试验,更未获准用于人类或兽医用途。其母体化合物 BAY-Y 3118(外消旋体)是一种研究性氟喹诺酮类药物,但最终未能上市。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C20H21CLFN3O3
分子量
405.85
精确质量
405.125
CAS号
151213-22-8
相关CAS号
BAY-Y 3118;151213-16-0
PubChem CID
44338422
外观&性状
White to light yellow solid powder
LogP
1.3
tPSA
72.9
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
28
分子复杂度/Complexity
715
定义原子立体中心数目
2
SMILES
C1C[C@@H]2CN(C[C@@H]2NC1)C3=C(C=C4C(=C3Cl)N(C=C(C4=O)C(=O)O)C5CC5)F
InChi Key
VRXORHRXNRJZCQ-BMIGLBTASA-N
InChi Code
InChI=1S/C20H21ClFN3O3/c21-16-17-12(19(26)13(20(27)28)8-25(17)11-3-4-11)6-14(22)18(16)24-7-10-2-1-5-23-15(10)9-24/h6,8,10-11,15,23H,1-5,7,9H2,(H,27,28)/t10-,15+/m1/s1
化学名
7-[(4aR,7aR)-1,2,3,4,4a,5,7,7a-octahydropyrrolo[3,4-b]pyridin-6-yl]-8-chloro-1-cyclopropyl-6-fluoro-4-oxoquinoline-3-carboxylic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.4640 mL 12.3198 mL 24.6396 mL
5 mM 0.4928 mL 2.4640 mL 4.9279 mL
10 mM 0.2464 mL 1.2320 mL 2.4640 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们