规格 | 价格 | |
---|---|---|
500mg | ||
1g | ||
Other Sizes |
靶点 |
PRMT5
|
---|---|
体外研究 (In Vitro) |
NG908是一种强效抑制剂,可结合PRMT5·MTA复合物,与完整的MTAP(MTAP WT)细胞相比,可选择性杀死MTAP缺失(MTAP无效)细胞15倍。总之,发现了一系列与MTA协同抑制PRMT5的化合物,包括在MTAP无效细胞与MTAP WT细胞中有效且选择性的化合物。该系列从高通量生物化学筛选开始,并以基于配体和结构的药物设计为指导,产生了TNG908,其Tanimoto系数相对于原始筛选为0.3。仅添加83Da,没有额外的可旋转键,并且在LogD中测量的亲脂性降低(2.4比2.8),同时保持高渗透性、低流出和高Kp、uu、CSF=0.9,从而使效价增加了近2000倍。[1]
|
体内研究 (In Vivo) |
TNG908在小鼠异种移植物模型中口服给药时显示出选择性抗肿瘤活性,其理化性质适合穿过血脑屏障(BBB),支持治疗MTAP缺失的中枢神经系统和非中枢神经系统肿瘤的临床研究。
TNG908在物种间具有低至中等清除率和中至高生物利用度,在一组异种移植物模型(包括代表胶质母细胞瘤和非小细胞肺癌癌症的模型)中具有很强的功效,在结直肠癌癌症模型中具有体内选择性功效。TNG908被提名为开发候选药物,目前正在进行I/II期临床研究(NCT05275478)。[1]
|
酶活实验 |
生化荧光各向异性肽置换法/Biochemical Fluorescence Anisotropy Peptide Displacement Assay[1]
建立了荧光各向异性(FA)测定法来测量C末端5′-TAMRA标记的组蛋白H4肽(1-21)与PRMT5/MEP50的结合。测试化合物与肽竞争以结合PRMT5/MEP50蛋白。测定缓冲液:30mM Bicine(pH 8.0)、150mM NaCl、1.5mM DTT、0.003%Tween-20。用于这些研究的两种肽是Me0:Ac-SGRGKGGLGKGGAKRHRKV-K(5-TAMRA)-NH2和Me2:Ac-SGR(Sym-Me2)GKGGKGLGGAKRHRkV-K(5-TAMRA)-N H2。Me0肽不是甲基化的,用于在不存在辅因子和存在50μM 5′-甲硫腺苷(MTA)的情况下测定化合物的效力。Me2肽在精氨酸3处对称甲基化,并用于测定在50μM S-腺苷-1-甲硫氨酸(SAM)存在下的化合物效力。通过测量固定浓度的肽从PRMT5/MEP50的剂量依赖性位移,在平衡时评估抑制剂效力。在RT下孵育30分钟后,在Envision平板读取器上读取平板。对于数据分析,检测到的荧光各向异性(FA)等于1000×(S–G×P)/(S+G×2×P),其中S=检测器2或通道2信号,P=检测器1或通道1信号,G=G因子。使用抑制百分比=(signal–MinAVG)/(MaxAVG–MinAVG)×100将荧光各向异性标准化为抑制百分比,其中MinAVG=最小值的平均值,MaxAVG=最大值的平均数值。使用具有固定0%和100%抑制极限的4参数逻辑模型205 y=a+((B–a)/(1+((C/x)∧D)),通过XL拟合将曲线拟合为抑制百分比与log[化合物浓度],以计算IC50。A: 底部=0%。B: top=100%。C: 相对IC50。D: 山坡。TNG908的表观Ki值是使用竞争抑制剂的Cheng–Prusoff方程计算的。 |
细胞实验 |
HAP1 MTAP WT和MTAP无效的细胞内蛋白质测定[1]
从Horizon Discovery(HZGHC004894c005)获得HAP1-MTAP等基因细胞系对,并在湿润的10%CO2组织培养箱中保持在DMEM(高糖)+10%FBS中。SAM协同PRMT5抑制剂GSK3326595保持为10mM DMSO储备。将所有测试化合物保持为10mM DMSO储备物。[1] 第0天,将MTAP WT或MTAP无效细胞接种在384孔板中,并在湿润的5%CO2组织培养箱中孵育16-24小时。第1天,使用帝肯D300e数字分配器(n=4)将受试化合物以规定浓度分配到孔中,并将DMSO的体积标准化为最高级别体积。每一个平板包括给药了规定浓度的GSK3326595作为平板对照的孔。将化合物与细胞在湿润的5%CO2组织培养箱中孵育24小时。 在第2天,用4%甲醛的最终浓度固定化合物处理的细胞。然后用1×PBS+0.1%Triton X-100洗涤/透化细胞,然后用5%山羊血清/1×TBS封闭。然后将固定的细胞与初级SDMA抗体混合物在4°C下孵育过夜。[1] 在第3天,用1×PBS+0.1%Triton X-100洗涤细胞,然后在室温下用同样含有DRAQ5的NIR荧光第二抗体混合物孵育1小时。用1×PBS+0.1%Triton X-100洗涤细胞,然后再次用ddH2O洗涤。然后使用NIR荧光成像器对板进行成像。[1] 为了进行数据分析,将SDMA信号归一化为DRAQ5信号。测定背景由用1μM GSK3326595处理的孔的信号确定,并从每个孔中减去。数据分别绘制为MTAP WT和MTAP空细胞系的DMSO对照孔的百分比,并拟合到4参数logistic(4-PL)Hill方程,最大效应限制为0。作为定制数据分析协议的一部分,使用GraphPad Prism或Domatics Studies 5.4中的默认IC50拟合程序进行拟合。 HAP1 MTAP WT和MTAP无效生存能力测定[1] 从Horizon Discovery(HZGHC004894c005)获得HAP1-MTAP等基因细胞系对,并将其保持在DMEM(高糖)+10%FBS中的湿润5%或10%CO2组织培养箱中。将所有测试化合物保持为10mM DMSO储备。[1] 在第0天,将MTAP WT和MTAP无效细胞接种在96孔板中,并在5%或10%的湿润CO2组织培养箱中孵育16-24小时。在第1天,使用帝肯D300e数字分配器(n=3)将受试化合物以规定浓度分配到孔中,并将DMSO的体积标准化为最高级别体积(0.2%)。将化合物处理的平板在湿润的5%或10%CO2组织培养箱中培养7天。[1] 在第7天,将板从组织培养箱中取出,并使其平衡至室温。然后,将1/2体积的CellTiter-Glo发光细胞活力测定试剂添加到每个孔中,或者从每个孔中去除培养基,并添加1×PBS中1:3稀释的CellTiter Glo 2.0细胞活力测定剂。添加后10分钟,Envision读板器检测发光信号。数据分别绘制为MTAP WT和MTAP空细胞系的DMSO对照孔的百分比,并拟合到4参数logistic(4-PL)Hill方程,最大效应限制为0。作为定制数据分析协议的一部分,使用GraphPad Prism或Domatics Studies 5.4中的默认IC50拟合程序进行拟合。 |
动物实验 |
In Vivo Pharmacology[1]
All protocols were approved by the Institutional Animal Care and Use Committee at Pharmaron (Beijing, China) following the guidance of the Association of Assessment and Accreditation of Laboratory Animal Care. After 7 days of acclimatization, 10 million LN-18, LU99, HCT116 MTAP WT, or HCT116 MTAP-null tumor cells were injected subcutaneously into the right flank of each animal. Once the tumors reached 200–300 mm3 in size, animals were randomized to treatment groups. TNG908 was administered by oral gavage twice daily in a 5% DMA/20% Captisol solution. Tumor volume was measured using calipers and calculated as (length × width × width)/2. For data analysis, tumor growth inhibition was calculated using the following equation: percent TGI = [1 – (mean treated TVfinal – mean treated TVinitial)/(mean vehicle TVfinal – mean vehicle TVinitial)] × 100. Tumor regression was calculated as follows: percent tumor regression= [mean TVfinal – mean TVinitial] × 100. Western Blotting[1] Protein lysates were generated by lysis of frozen tumor tissue using RIPA buffer. Samples were normalized by protein concentration using a Pierce Rapid Gold BCA Protein Assay Kit. SDS-PAGE was run using Invitrogen NuPAGE 4–12% Bis-Tris Midi Protein Gels. Antibodies SDMA, ACTB were used at 1:1000 dilution. |
参考文献 |
[1]. Discovery of TNG908: A Selective, Brain Penetrant, MTA-Cooperative PRMT5 Inhibitor That Is Synthetically Lethal with MTAP-Deleted Cancers. J. Med. Chem. 2024, 67, 8, 6064–6080.
[2]. K. Briggs, et al. TNG908 is a brain-penetrant, MTA-cooperative PRMT5 inhibitor for the treatment of MTAP-deleted cancer.MOLECULAR TARGETED AGENTS 2| VOLUME 174, SUPPLEMENT 1, S84, OCTOBER 2022. |
其他信息 |
TNG908 is a small molecule inhibitor of protein arginine methyl transferase 5 (PRMT5).
|
分子式 |
C21H23N5O2S
|
---|---|
精确质量 |
409.16
|
元素分析 |
C, 61.59; H, 5.66; N, 17.10; O, 7.81; S, 7.83
|
CAS号 |
2760481-53-4
|
PubChem CID |
164753116
|
外观&性状 |
Typically exists as white to off-white solids at room temperature
|
LogP |
3.2
|
tPSA |
129Ų
|
氢键供体(HBD)数目 |
2
|
氢键受体(HBA)数目 |
6
|
可旋转键数目(RBC) |
2
|
重原子数目 |
29
|
分子复杂度/Complexity |
620
|
定义原子立体中心数目 |
2
|
SMILES |
C[C@H]1CC[C@@H](N(C1)C(=O)C(=O)NC2=CN=C(C(=C2)C)N)C3=CC4=C(C=C3)SC=N4
|
InChi Key |
NXXBDYHMHHINFC-YVEFUNNKSA-N
|
InChi Code |
InChI=1S/C21H23N5O2S/c1-12-3-5-17(14-4-6-18-16(8-14)24-11-29-18)26(10-12)21(28)20(27)25-15-7-13(2)19(22)23-9-15/h4,6-9,11-12,17H,3,5,10H2,1-2H3,(H2,22,23)(H,25,27)/t12-,17+/m0/s1
|
化学名 |
N-(6-amino-5-methylpyridin-3-yl)-2-((2R,5S)-2-(benzo[d]thiazol-5-yl)-5-methylpiperidin-1-yl)-2-oxoacetamide
|
别名 |
TNG908; A1AAV; SCHEMBL24365689; TNG-908; EX-A7872
|
HS Tariff Code |
2934.99.9001
|
存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
|
溶解度 (体外实验) |
DMSO : ~100 mg/mL (~244.20 mM)
|
---|---|
溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 :Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。