TNIK-IN-3

别名: 4-[(4-氟苯基)甲基]-3,4-二氢-8-(1H-吡咯[2,3-b]吡啶-5-基)-1,4-苯并恶唑平-5(2H)-酮
目录号: V35186 纯度: ≥98%
TNIK-IN-3(化合物 21k)是一种特异性口服生物活性 TNIK 抑制剂(拮抗剂),IC50 为 0.026 μM。
TNIK-IN-3 CAS号: 2754265-25-1
产品类别: Apoptosis
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
TNIK-IN-3(化合物 21k)是一种特异性强、口服有效的 TNIK 抑制剂(拮抗剂),IC50 为 0.026 μM。TNIK-IN-3 还能抑制 Flt4(IC50=0.030 μM)、Flt1(IC50=0.191 μM)和 DRAK1(IC50=0.411 μM)。TNIK-IN-3 可用于结直肠癌研究。
TNIK-IN-3(CAS 编号:2754265-25-1)是一种高效、选择性强、口服有效的 Traf2 和 Nck 相互作用蛋白激酶 (TNIK) 抑制剂,TNIK 是一种参与 Wnt/β-catenin 信号通路的丝氨酸/苏氨酸激酶。该化合物对TNIK具有很强的选择性,IC50值为0.026 μM,并且在高浓度下也能抑制Flt4、Flt1和DRAK1。该化合物在结直肠癌(CRC)研究中具有潜在应用价值,是研究TNIK驱动的致癌通路的一种很有前景的工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
IC50: 0.026 μM (TNIK)[1], 0.030 μM (Flt4)[1], 0.191 μM (Flt1)[1], 0.411 μM (DRAK1)[1]
TNIK (Traf2- and Nck-interacting protein kinase) is the primary target of TNIK-IN-3, with an IC50 of 0.026 μM. The compound also shows inhibitory activity against Flt4 (IC50 = 0.030 μM), Flt1 (IC50 = 0.191 μM), and DRAK1 (IC50 = 0.411 μM). Additionally, it exhibits activity against Aurora-A, GCK, and MLK3 with IC50 values of 0.517 μM, 3.657 μM, and 4.552 μM, respectively.
体外研究 (In Vitro)
化合物 21k,即 TNIK-IN-3,分别以 3.657 μM、4.552 μM 和 0.517 μM 的 IC50 值抑制 GCK、MLK3 和 Aurora-A[1]。TNIK-IN-3(0.1–100 μM;3 天)可抑制 HCT116 和 DLD-1 细胞的活力,其 IC50 值分别为 4.26 μM 和 8.00 μM[1]。TNIK-IN-3(2.5–40 μM;10 天)可剂量依赖性地抑制 HCT116 和 DLD-1 细胞的克隆形成[1]。TNIK-IN-3(5–20 μM;48 小时)可抑制 DLD-1 和 HCT116 细胞的迁移[1]。在HCT116细胞中,TNIK-IN-3(5–40 μM;48 h)呈剂量依赖性地抑制Wnt靶基因AXIN2和c-Myc以及LRP5和LRP6蛋白的表达[1]。在Hela细胞中,TNIK-IN-3(5–20 μM;48 h)显著降低JNK1/2的磷酸化水平[1]。体外实验表明,TNIK-IN-3(化合物21k)呈剂量依赖性地降低HCT116和DLD-1细胞的活力,在0.1至100 μM浓度范围内,三天内的IC50值分别为4.26 μM和8.00 μM。它抑制集落形成达10天(2.5至40 μM),并抑制细胞迁移达48小时(5至20 μM)。该化合物还能以剂量依赖的方式降低 HCT116 细胞中 LRP5 和 LRP6 蛋白的表达,以及 Wnt 靶基因 AXIN2 和 c-Myc 的表达(5 至 40 μM,48 小时)。
体内研究 (In Vivo)
TNIK-IN-3(化合物 21k)以剂量依赖的方式抑制肿瘤发展(100–150 mg/kg;口服,每日两次,持续 18 天)[1]。
TNIK-IN-3 的体内数据有限。作为一种口服有效的 TNIK 抑制剂,预计其适用于动物模型的口服给药。基于其靶向 Wnt/β-catenin 信号通路的机制以及其在结直肠癌细胞系中的体外疗效,预计该化合物在异种移植模型中能够抑制肿瘤生长。需要进一步的体内研究来全面表征其药代动力学和药效学特征。
酶活实验
体外酶/受体结合(非细胞)测定通常涉及使用重组TNIK蛋白的激酶活性测定。将化合物与激酶、ATP和肽底物孵育,并通过定量磷酸化水平来测量抑制活性。IC50值通过拟合剂量反应曲线确定。对于TNIK-IN-3,使用这种生化测定方法确定其IC50值为0.026 μM。类似的测定方法也用于针对一系列激酶的脱靶效应分析,以评估选择性。
细胞实验
细胞活力测定[1]
细胞类型: HCT116 和 DLD-1 细胞
测试浓度: 0.1-100 μM
孵育时间: 3 天
实验结果: 以剂量依赖的方式抑制细胞活力。
细胞活力检测[1]
细胞类型: HCT116 细胞
测试浓度: 5、10、20、40 μM
孵育时间: 48 小时
实验结果: 抑制 Wnt 靶基因 AXIN2 和 c-Myc 以及 LRP5 和 LRP6 蛋白的表达。
TNIK-IN-3 的细胞活性检测采用 HCT116 和 DLD-1 等结直肠癌细胞系进行。将细胞用不同浓度的化合物(0.1–100 μM)处理 72 小时,并使用 MTT 或 CellTiter-Glo 等标准检测方法测定细胞活力,以确定 IC50 值。菌落形成试验在 10 天内进行,浓度为 2.5–40 μM,细胞迁移通过伤口愈合或 Transwell 试验在 48 小时内进行评估。
动物实验
动物/疾病模型:将6周龄雌性NOD-SCID(重症联合免疫缺陷)小鼠注射HCT116细胞[1]
剂量:100、150 mg/kg
给药途径:口服,每日两次,持续18天
实验结果:150 mg/kg剂量下,肿瘤生长显著受到抑制。未观察到明显的体重减轻和其他副作用。
TNIK-IN-3的体内动物研究预计将采用结直肠癌小鼠异种移植模型。荷瘤小鼠将接受不同剂量的口服给药。定期监测肿瘤体积和体重,以评估疗效和耐受性。还将分析肿瘤组织中AXIN2和c-Myc表达等药效学标志物。然而,现有文献中尚未详细介绍该化合物的具体体内实验方案。
药代性质 (ADME/PK)
现有文献尚未对TNIK-IN-3的详细药代动力学(PK)特性进行全面表征。然而,作为一种口服活性化合物,预计其口服给药后具有足够的生物利用度和全身暴露量。需要进一步研究以确定其半衰期、清除率、分布容积和代谢稳定性。该化合物可能被配制成用于体内研究的标准载体,例如DMSO、PEG300和Tween 80。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚无TNIK-IN-3的全面毒性数据。作为一种用于临床前研究的试验化合物,在进行临床开发之前,需要进行标准的安全性药理学和毒理学评估。该化合物尚未获准用于人体,仅供研究用途。鉴于其激酶抑制特性,未来的研究应仔细评估潜在的脱靶效应,以评估其毒性风险。
参考文献

[1]. Discovery of 3,4-Dihydrobenzo[ f][1,4]oxazepin-5(2 H)-one Derivatives as a New Class of Selective TNIK Inhibitors and Evaluation of Their Anti-Colorectal Cancer Effects. J Med Chem. 2022 Jan 5.

其他信息
TNIK-IN-3 又名化合物 21k,是一种特异性的口服生物活性 TNIK 拮抗剂。它通过调节 Wnt/β-catenin 信号通路,展现出在结直肠癌 (CRC) 研究中的应用潜力。该化合物尚未进入临床试验阶段,目前仍处于临床前研究阶段。其高效性和选择性使其成为研究 TNIK 生物学和验证 TNIK 作为治疗靶点的宝贵化学探针。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C23H18FN3O2
分子量
387.41
精确质量
387.138
CAS号
2754265-25-1
PubChem CID
162641720
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
LogP
3.7
tPSA
58.2
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
29
分子复杂度/Complexity
583
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O1C2=CC(C3=CN=C4NC=CC4=C3)=CC=C2C(=O)N(CC2=CC=C(F)C=C2)CC1
InChi Key
UVLOISNMRLZTPF-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C23H18FN3O2/c24-19-4-1-15(2-5-19)14-27-9-10-29-21-12-16(3-6-20(21)23(27)28)18-11-17-7-8-25-22(17)26-13-18/h1-8,11-13H,9-10,14H2,(H,25,26)
化学名
4-[(4-fluorophenyl)methyl]-8-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)-2,3-dihydro-1,4-benzoxazepin-5-one
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 83.33 mg/mL (215.10 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.5812 mL 12.9062 mL 25.8124 mL
5 mM 0.5162 mL 2.5812 mL 5.1625 mL
10 mM 0.2581 mL 1.2906 mL 2.5812 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们