Thymidine 3',5'-diphosphate tetrasodium (Deoxythymidine 3',5'-diphosphate tetrasodium; pdTp tetrasodium)

目录号: V34686 纯度: ≥98%
胸苷 3',5'-二磷酸(脱氧胸苷 3',5'-二磷酸)四钠是一种葡萄球菌核酸酶,是一种含有 Tudor 结构域的 1(SND1,MicroRNA 调节复合物的 RISC 亚基),具有 [3,5-2H2 ] 选择性酪氨酰核酸酶([3,5-2H2]酪氨酰核酸酶)抑制剂。
Thymidine 3',5'-diphosphate tetrasodium (Deoxythymidine 3',5'-diphosphate tetrasodium; pdTp tetrasodium) CAS号: 118675-87-9
产品类别: Apoptosis
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
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Other Forms of Thymidine 3',5'-diphosphate tetrasodium (Deoxythymidine 3',5'-diphosphate tetrasodium; pdTp tetrasodium):

  • pdTp
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产品描述
胸苷3',5'-二磷酸(脱氧胸苷3',5'-二磷酸)四钠是一种葡萄球菌核酸酶,也是含Tudor结构域1(SND1,MicroRNA调控复合物RISC亚基)的[3,5-2H2]酪氨酸核酸酶选择性抑制剂。胸苷3',5'-二磷酸四钠具有抗肿瘤活性,也可作为生化反应的催化剂。
胸苷3',5'-二磷酸四钠(也称为脱氧胸苷3',5'-二磷酸四钠或pdTp四钠)是一种核苷酸类似物,可选择性抑制葡萄球菌核酸酶和Tudor结构域蛋白1 (SND1)。该化合物是microRNA调控复合物RISC的组成部分,同时也能抑制[3,5-2H2]酪氨酸核酸酶。它具有抗肿瘤活性,并可作为多种生化反应的催化剂,因此在癌症研究、核苷酸代谢研究和酶学分析中具有重要价值。
生物活性&实验参考方法
靶点
Staphylococcal nuclease and tudor domain containing 1, SND1; [3,5-(2)H(2)] Tyrosyl nuclease[1][2]
Thymidine 3',5'-diphosphate tetrasodium targets staphylococcal nuclease, an enzyme that cleaves DNA and RNA, and SND1 (Tudor domain-containing protein 1), which is a subunit of the microRNA regulatory complex RISC. It also inhibits [3,5-2H2] tyrosyl nuclease. By inhibiting these nucleases, the compound interferes with nucleic acid metabolism and microRNA processing pathways. Its anti-tumor activity is believed to arise from its ability to modulate these enzymatic targets, disrupting cellular processes essential for cancer cell survival and proliferation.
体外研究 (In Vitro)
WT 和 Alb/SND1(在小鼠中表达 SND1 转基因微 p65 表达水平和 p65 核转位)的肝细胞在胸苷 3',5'-二磷酸四钠 (200 µM; 18 h) 的作用下显著减少。胸苷 3',5'-二磷酸四钠抑制 WT 和 Alb/SND1 肝细胞的球体形成 [1]
体外研究表明,胸苷3',5'-二磷酸四钠对靶核酸酶具有选择性抑制活性。该化合物常用于生化分析,以研究酶动力学、底物特异性和抑制机制。其抗肿瘤活性已在多种癌细胞系模型中得到证实,可诱导细胞生长抑制或细胞死亡。该化合物还可作为生化反应的催化剂,促进磷酸转移和其他核苷酸依赖性过程。其体外活性通常使用纯化酶系统或基于细胞的增殖实验进行评估。
体内研究 (In Vivo)
胸苷3',5'-二磷酸四钠(0.8 mg/kg;腹腔注射;每周两次,持续4周)对野生型B6/CBA小鼠的血液肝酶(AST、ALT、AP)、总蛋白(TP)、白蛋白(Alb)和球蛋白(Glo)均无明显影响[1]。在野生型B6/CBA小鼠中,胸苷3',5'-二磷酸四钠(0.8 mg/kg和1.6 mg/kg;静脉注射;每周两次,持续4周)可有效抑制肿瘤生长[1]。在成年雄性NSG小鼠中,胸苷3',5'-二磷酸四钠(0.8、0.16和0.32 mg/kg;皮下注射;每周两次,持续4周)可抑制肿瘤增殖、炎症反应和肿瘤起始细胞(TIC)特征。胸苷 3',5'-二磷酸四钠可上调 PTEN、TGFBR2 和 CDKN1C 凋亡以及特定肿瘤抑制基因的表达[1]。
胸苷3',5'-二磷酸四钠的体内活性主要在其抗肿瘤特性方面进行了评估。癌症动物模型已被用于评估该化合物抑制肿瘤生长和进展的疗效。该化合物调节核酸酶活性和microRNA加工通路的能力可能有助于其体内抗肿瘤作用。然而,详细的体内药代动力学和疗效数据有限,该化合物主要用作生化和细胞实验中的研究工具,而非治疗药物。
酶活实验
胸苷3',5'-二磷酸四钠的体外酶/受体结合试验通常包括将该化合物与纯化的靶酶(例如葡萄球菌核酸酶、SND1或酪氨酸核酸酶)孵育。酶活性通过荧光或比色底物测定,抑制作用通过比较有无化合物存在时的酶活性进行定量。IC₅0值通过进行不同浓度抑制剂的剂量反应实验来确定。结合亲和力可使用表面等离子共振或等温滴定量热法来表征化合物与其靶酶之间的相互作用。
细胞实验
胸苷3',5'-二磷酸四钠的细胞活性测定采用癌细胞系,以评估其抗增殖和细胞毒性作用。将细胞培养于适宜的培养基中,并用不同浓度的化合物(通常为1-100 μM)处理24-72小时。采用MTT、CCK-8或刃天青法检测细胞活力。可通过Annexin V/PI双染流式细胞术或检测caspase活性来评估细胞凋亡的诱导情况。可通过qPCR或Western blotting检测靶基因表达和蛋白水平来评估该化合物对细胞内microRNA加工和核酸酶活性的影响。
动物实验
动物/疾病模型: 2月龄野生型B6/CBA小鼠[1]。
剂量: 0.8 mg/kg。
给药途径: 腹腔注射(ip);每周两次,持续4周。
实验结果: 对血清肝酶、总蛋白、白蛋白和球蛋白无显著影响,且具有生物安全性。

动物/疾病模型: NSG小鼠[1]。
剂量: 0.8、0.16或0.32 mg/kg。
给药途径: 静脉注射(iv)或皮下注射(sc);每周两次,持续4周。
实验结果:抑制肿瘤生长,表现出抗肿瘤活性和免疫调节作用。
胸苷3',5'-二磷酸四钠的体内动物研究主要在异种移植小鼠模型中进行,以评估其抗肿瘤疗效。荷瘤小鼠通过腹腔或静脉注射给予不同剂量(通常为1-50 mg/kg)的该化合物。定期使用游标卡尺测量肿瘤体积,并监测体重以评估耐受性。研究结束时,切除肿瘤并进行组织病理学、靶点结合(核酸酶抑制)以及细胞凋亡和增殖分子标志物的分析。也可进行药代动力学研究以确定血浆和组织浓度。
药代性质 (ADME/PK)
胸苷3',5'-二磷酸四钠的药代动力学特性具有核苷酸类似物的特征,由于其含有多个磷酸基团,因此具有亲水性且不透膜性。四钠盐形式可提高其水溶性。给药后,该化合物可能通过肾脏快速排泄,并可能被磷酸酶代谢为磷酸化程度较低的形式。其分子量为490.12 g/mol。由于其带电荷,除非借助转运蛋白或制剂策略,否则细胞摄取可能受到限制。关于其半衰期、分布容积和生物利用度等详细的药代动力学参数,目前报道较少。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
胸苷3',5'-二磷酸四钠的毒理学数据有限,因为该化合物主要用作研究试剂而非治疗药物。该化合物不适用于人类治疗,仅供研究用途。基于细胞的标准毒性评估表明,该化合物在高浓度下具有中等细胞毒性,这与其核苷酸类似物结构相符。动物研究表明,该化合物在标准剂量范围内通常耐受性良好,但文献中尚未对其具体的毒性特征进行充分描述。
参考文献
[1]. Nidhi Jariwala, et al. Oncogenic Role of SND1 in Development and Progression of Hepatocellular Carcinoma. Cancer Res. 2017 Jun 15;77(12):3306-3316.
[2]. Cohen J S, et al. Proton magnetic resonance studies of the tyrosine residues of staphylococcal nuclease using [3, 5-2H2] tyrosine[J]. Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-Protein Structure, 1971, 236(2): 468-478.
其他信息
胸苷3',5'-二磷酸四钠是一种生化研究试剂,用于研究核苷酸代谢、酶特异性和磷酸转移反应。它常用于涉及激酶和磷酸酶的酶学分析,以及DNA合成途径、核苷酸信号传导和代谢调控的研究。该化合物具有抗肿瘤活性,并可用作生化反应的催化剂。其纯度高(≥98%),通常储存于-20℃。该化合物并非FDA批准的药物,也没有临床适应症。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C10H17N2NAO11P2
分子量
426.186075925827
精确质量
489.95
CAS号
118675-87-9
相关CAS号
Thymidine 3',5'-disphosphate;2863-04-9
PubChem CID
168446307
外观&性状
White to off-white solid powder
tPSA
204
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
11
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
29
分子复杂度/Complexity
659
定义原子立体中心数目
3
SMILES
CC1=CN(C(=O)NC1=O)[C@H]2C[C@@H]([C@H](O2)COP(=O)([O-])[O-])OP(=O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Na+].[Na+]
InChi Key
VDPDGAPWPLBFIC-ZKRIHRHSSA-J
InChi Code
InChI=1S/C10H16N2O11P2.4Na/c1-5-3-12(10(14)11-9(5)13)8-2-6(23-25(18,19)20)7(22-8)4-21-24(15,16)17;;;;/h3,6-8H,2,4H2,1H3,(H,11,13,14)(H2,15,16,17)(H2,18,19,20);;;;/q;4*+1/p-4/t6-,7+,8+;;;;/m0..../s1
化学名
tetrasodium;[(2R,3S,5R)-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-2-(phosphonatooxymethyl)oxolan-3-yl] phosphate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
H2O : 50 mg/mL (102.02 mM)
DMSO : 3.33 mg/mL (6.79 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.3464 mL 11.7319 mL 23.4637 mL
5 mM 0.4693 mL 2.3464 mL 4.6927 mL
10 mM 0.2346 mL 1.1732 mL 2.3464 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们