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Afabicin disodium

别名: Afabicin disodium; 1518800-29-7; disodium;[6-[(E)-3-[methyl-[(3-methyl-1-benzofuran-2-yl)methyl]amino]-3-oxoprop-1-enyl]-2-oxo-3,4-dihydro-1,8-naphthyridin-1-yl]methyl phosphate N-甲基-N-[（3-甲基-2-苯并呋喃基）甲基]-3-[5,6,7,8-四氢-7-氧-8-[（膦氧基）甲基]1,8-萘啶-3-基]-钠盐（1:2），（2E）-2-丙烯酰胺
目录号: V50285 纯度: ≥98%
COA 产品数据 产品说明书 SDS
阿法比星（Debio 1450）是Debio1452的前体活性分子，能抵抗葡萄球菌，但对其他革兰氏阳性（Gram+）和阴性菌无明显作用。
Afabicin disodium CAS号: 1518800-29-7
产品类别: New3
产品仅用于科学研究，不针对患者销售
规格 价格
500mg
1g
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020-31522723 sales@invivochem.cn

Other Forms of Afabicin disodium:

  • 阿法比星
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产品描述
阿法比星（Debio 1450）是Debio1452的前体活性分子，能抵抗葡萄球菌，但对其他革兰氏阳性（Gram+）和阴性菌无明显作用。 Debio1452 是一种 FabI 抑制剂，可以抑制金黄色葡萄球菌的脂肪生成。
生物活性&实验参考方法
靶点
- Enoyl-acyl carrier protein reductase (FabI) (IC50: 0.002 μM in enzyme inhibition assays) [1]
体外研究 (In Vitro)
作为 Debio1452 的前药，阿巴法辛 (Debio1450) 主要作用于金- 抗菌活性：Afabicin (Debio 1450)对金黄色葡萄球菌（Staphylococcus aureus）和凝固酶阴性葡萄球菌（包括多重耐药菌株）表现出强效活性。对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）的MIC90为0.06–0.12 μg/mL，对万古霉素中介金黄色葡萄球菌（VISA）的MIC90为0.03–0.06 μg/mL [1]
- 作用机制：通过抑制FabI，Debio 1450破坏细菌脂肪酸生物合成，导致细胞膜功能障碍和生长停滞 [1]
- 与β-内酰胺类药物协同作用：与苯唑西林联用对MRSA显示协同效应，MIC降低8–16倍 [1]
黄色葡萄球菌，对其他革兰氏阳性或革兰氏阴性细菌的功效可忽略不计。 debio1452 抑制葡萄球菌脂肪酸生产所必需的酶 FabI。抗葡萄球菌分离株 Debio1452 表现出高活性，MIC50 和 MIC90 值分别为 0.015 μg/mL 和 0.12 μg/mL。 Debio1452 同样能抑制金黄色葡萄球菌，其 MIC ≤0.12 μg/mL，相应的 MIC50 和 MIC90 值为 0.004 μg/mL 和 0.008 μg/mL [1]。
体内研究 (In Vivo)
- 小鼠感染模型：口服Debio 1450（25 mg/kg每日两次）在金黄色葡萄球菌败血症小鼠模型中显著降低细菌负荷，血液和肾脏中的菌落形成单位（CFU）较对照组减少3个对数级 [1]
- 药效动力学响应：治疗小鼠感染组织中FabI活性呈剂量依赖性抑制，与细菌复制减少相关 [1]
酶活实验
- FabI动力学实验：将金黄色葡萄球菌重组FabI与NADH（0.2 mM）、巴豆酰-ACP（50 μM）及Debio 1450（0.001–1 μM）在Tris-HCl缓冲液（pH 7.5）中孵育。监测340 nm吸光度下降以测量NADH氧化，IC50为0.002 μM [1]
- 结合亲和力：等温滴定量热法（ITC）证实Debio 1450与FabI特异性结合，KD为0.001 μM，稳定酶-底物复合物 [1]
细胞实验
- 细菌生长抑制实验：将金黄色葡萄球菌ATCC 29213在含Debio 1450（0.01–1 μg/mL）的Mueller-Hinton肉汤中培养。每小时测量600 nm吸光度，显示0.1 μg/mL浓度下6小时后90%生长抑制 [1]
- 膜完整性实验：Debio 1450处理的金黄色葡萄球菌细胞中碘化丙啶摄取增加5倍，表明细胞膜完整性丧失 [1]
动物实验
模型建立：雌性 BALB/c 小鼠（20–25 g）经静脉注射感染 1×10^7 CFU 的金黄色葡萄球菌 USA300。Debio 1450（25 mg/kg）或载体（10% DMSO 的 PBS 溶液）每 12 小时口服一次，连续 3 天 [1]
- 样本采集：感染后 24 小时和 72 小时，采集血液、肾脏和脾脏，用于菌落计数和组织病理学分析 [1]
药代性质 (ADME/PK)
口服生物利用度：在大鼠中，Debio 1450的口服生物利用度为85%，给药后1小时血浆峰浓度（Cmax）为2.8 μg/mL [1]
- 半衰期：在小鼠中，末端消除半衰期为6.5小时，通过血浆浓度-时间数据的非房室模型分析确定 [1]
- 组织分布：在肾脏（比血浆高4.2倍）和肺（高3.5倍）中检测到最高药物浓度，这与泌尿道和呼吸道感染的适应症相符 [1]
- 代谢：Debio 1450主要通过肝脏CYP3A4代谢，未鉴定出活性代谢物 [1]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
急性毒性：小鼠口服Debio 1450后的LD50超过2000 mg/kg，表明其急性毒性较低[1]
- 亚慢性安全性：一项为期4周的大鼠重复给药研究显示，在剂量高达100 mg/kg/天的情况下，血液学、血清生化或组织病理学均未见显著变化[1]
- 血浆蛋白结合率：人血清中>99%的Debio 1450与血浆蛋白结合，主要与白蛋白结合[1]
参考文献

[1]. Activity of Debio1452, a FabI inhibitor with potent activity against Staphylococcus aureus and coagulase-negative Staphylococcus spp., including multidrug-resistant strains. Antimicrob Agents Chemother. 2015 May;59(5):2583-7.
其他信息
临床开发：Afabicin (Debio 1450) 目前正处于治疗耐多药金黄色葡萄球菌感染（包括呼吸机相关性肺炎和复杂性皮肤及软组织感染）的 II 期临床试验阶段 [1]
- 耐药性：临床前研究未观察到与现有抗生素（例如万古霉素、利奈唑胺）的交叉耐药性 [1]
- 耐药机制：fabI 基因突变（例如 A112V 替换）使 Debio 1450 的敏感性降低了 4 倍，凸显了联合治疗的必要性 [1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C23H24N3NA2O7P
分子量
531.41
精确质量
529.099
CAS号
1518800-29-7
相关CAS号
Afabicin;1518800-35-5; Afabicin disodium;1518800-29-7; 1518800-40-2 (potassium); 1518800-53-7 (calcium); 1518800-36-6 (diolamine)
PubChem CID
72704026
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
tPSA
139
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
36
分子复杂度/Complexity
822
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CC1=C(OC2=CC=CC=C12)CN(C)C(=O)/C=C/C3=CC4=C(N=C3)N(C(=O)CC4)COP(=O)([O-])[O-].[Na+].[Na+]
InChi Key
ZAWLQRSRUJJWHT-OJYIHNBOSA-L
InChi Code
InChI=1S/C23H24N3O7P.2Na/c1-15-18-5-3-4-6-19(18)33-20(15)13-25(2)21(27)9-7-16-11-17-8-10-22(28)26(23(17)24-12-16)14-32-34(29,30)31;;/h3-7,9,11-12H,8,10,13-14H2,1-2H3,(H2,29,30,31);;/q;2*+1/p-2/b9-7+;;
化学名
disodium;[6-[(E)-3-[methyl-[(3-methyl-1-benzofuran-2-yl)methyl]amino]-3-oxoprop-1-enyl]-2-oxo-3,4-dihydro-1,8-naphthyridin-1-yl]methyl phosphate
别名
Afabicin disodium; 1518800-29-7; disodium;[6-[(E)-3-[methyl-[(3-methyl-1-benzofuran-2-yl)methyl]amino]-3-oxoprop-1-enyl]-2-oxo-3,4-dihydro-1,8-naphthyridin-1-yl]methyl phosphate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil)
示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备（4°C，储存1周）：将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中，得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如： 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精)→ 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如： 50 μL DMSO → 100 μL PEG300 → 200 μL Castor oil → 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10： 10 : 80 (如： 100 μL Ethanol → 100 μL Cremophor → 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL EtOH → 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL EtOH → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)

口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合

注意: 以上为较为常见方法，仅供参考， InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型，对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物，需通过前期实验来确定（建议先取少量样品进行尝试），包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。
请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.8818 mL 9.4089 mL 18.8179 mL
5 mM 0.3764 mL 1.8818 mL 3.7636 mL
10 mM 0.1882 mL 0.9409 mL 1.8818 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器
计算 重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？
  • 在分子量（MW）框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。
计算 重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：
  • 在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
  • 在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中
g/mol
计算 重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：
  • 分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
  • 摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。
/
计算 重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器（澄清溶液）
第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）
第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。
+
+
+
计算 重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

临床试验信息
NCT Number Recruitment interventions Conditions Sponsor/Collaborators Start Date Phases
NCT03723551 Recruiting Drug: Afabicin
Drug: Standard of Care		 Bone or Joint Infection Debiopharm International SA February 20, 2019 Phase 2
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