Afabicin

别名: Afabicin; Debio 1450; Debio-1450; Afabicin; 1518800-35-5; Debio1450; afabicina; afabicine; DMM8663H2R; [6-[(E)-3-[methyl-[(3-methyl-1-benzofuran-2-yl)methyl]amino]-3-oxoprop-1-enyl]-2-oxo-3,4-dihydro-1,8-naphthyridin-1-yl]methyl dihydrogen phosphate; Debio1450; AFN-1720; AFN 1720; AFN1720;
目录号: V10423 纯度: ≥98%
Afabicin (Debio-1450; AFN-1720) 是 Debio1452 (afabicin desphono) 的前药,作为烯酰基载体蛋白还原酶 (FabI) 抑制剂。
Afabicin CAS号: 1518800-35-5
产品类别: Bacterial
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
Other Sizes

Other Forms of Afabicin:

  • 阿法比星二钠盐
点击了解更多
InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用
产品描述
Afabicin (Debio-1450; AFN-1720) 是 Debio1452 (afabicin desphosno) 的前药,作为烯酰基载体蛋白还原酶 (FabI) 抑制剂。它是一种一流的抗生素,具有新颖的作用模式,专门针对葡萄球菌属中的脂肪酸合成。阿法比星专门针对葡萄球菌,对其他革兰氏阳性或革兰氏阴性菌种没有显着活性。
生物活性&实验参考方法
靶点
FabI, Bacterial[1]; Enoyl-acyl carrier protein reductase (FabI) (IC50: 0.002 μM in enzyme inhibition assays) [1]
体外研究 (In Vitro)
Debio1452 的前药称为 Afabicin (Debio1450),它主要针对葡萄球菌,对其他革兰氏阳性或革兰氏阴性物种没有显示出任何明显的作用。 debio1452 会抑制葡萄球菌脂肪酸生物合成所必需的酶 FabI。 Debio1452 对葡萄球菌分离株的 MIC50 和 MIC90 值分别为 0.015 μg/mL 和 0.12 μg/mL,表明其高活性水平。 Debio1452 的 MIC ≤0.12 μg/mL,MIC50 和 MIC90 值分别为 0.004 μg/mL 和 0.008 μg/mL,还可以抑制金黄色葡萄球菌[1]。
- 抗菌活性:Afabicin (Debio 1450)对金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)和凝固酶阴性葡萄球菌(包括多重耐药菌株)表现出强效活性。对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的MIC90为0.06–0.12 μg/mL,对万古霉素中介金黄色葡萄球菌(VISA)的MIC90为0.03–0.06 μg/mL [1]
- 作用机制:通过抑制FabI,Debio 1450破坏细菌脂肪酸生物合成,导致细胞膜功能障碍和生长停滞 [1]
- 与β-内酰胺类药物协同作用:与苯唑西林联用对MRSA显示协同效应,MIC降低8–16倍 [1]
体内研究 (In Vivo)
- 小鼠感染模型:口服Debio 1450(25 mg/kg每日两次)在金黄色葡萄球菌败血症小鼠模型中显著降低细菌负荷,血液和肾脏中的菌落形成单位(CFU)较对照组减少3个对数级 [1]
- 药效动力学响应:治疗小鼠感染组织中FabI活性呈剂量依赖性抑制,与细菌复制减少相关 [1]
酶活实验
- FabI动力学实验:将金黄色葡萄球菌重组FabI与NADH(0.2 mM)、巴豆酰-ACP(50 μM)及Debio 1450(0.001–1 μM)在Tris-HCl缓冲液(pH 7.5)中孵育。监测340 nm吸光度下降以测量NADH氧化,IC50为0.002 μM [1]
- 结合亲和力:等温滴定量热法(ITC)证实Debio 1450与FabI特异性结合,KD为0.001 μM,稳定酶-底物复合物 [1]
细胞实验
- 细菌生长抑制实验:将金黄色葡萄球菌ATCC 29213在含Debio 1450(0.01–1 μg/mL)的Mueller-Hinton肉汤中培养。每小时测量600 nm吸光度,显示0.1 μg/mL浓度下6小时后90%生长抑制 [1]
- 膜完整性实验:Debio 1450处理的金黄色葡萄球菌细胞中碘化丙啶摄取增加5倍,表明细胞膜完整性丧失 [1]
动物实验
模型建立:雌性 BALB/c 小鼠(20–25 g)经静脉注射感染 1×10^7 CFU 的金黄色葡萄球菌 USA300。Debio 1450(25 mg/kg)或载体(10% DMSO 的 PBS 溶液)每 12 小时口服一次,连续 3 天 [1]
- 样本采集:感染后 24 小时和 72 小时,采集血液、肾脏和脾脏,用于菌落计数和组织病理学分析 [1]
药代性质 (ADME/PK)
口服生物利用度:在大鼠中,Debio 1450的口服生物利用度为85%,给药后1小时血浆峰浓度(Cmax)为2.8 μg/mL [1]
- 半衰期:在小鼠中,末端消除半衰期为6.5小时,通过血浆浓度-时间数据的非房室模型分析确定 [1]
- 组织分布:在肾脏(比血浆高4.2倍)和肺(高3.5倍)中检测到最高药物浓度,这与泌尿道和呼吸道感染的适应症相符 [1]
- 代谢:Debio 1450主要通过肝脏CYP3A4代谢,未鉴定出活性代谢物 [1]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
急性毒性:小鼠口服Debio 1450后的LD50超过2000 mg/kg,表明其急性毒性较低[1]
- 亚慢性安全性:一项为期4周的大鼠重复给药研究显示,在剂量高达100 mg/kg/天的情况下,血液学、血清生化或组织病理学均未见显著变化[1]
- 血浆蛋白结合率:人血清中>99%的Debio 1450与血浆蛋白结合,主要与白蛋白结合[1]
参考文献

[1]. Activity of Debio1452, a FabI inhibitor with potent activity against Staphylococcus aureus and coagulase-negative Staphylococcus spp., including multidrug-resistant strains. Antimicrob Agents Chemother. 2015 May;59(5):2583-7.

其他信息
Afabicin 正在临床试验 NCT03723551(评估 Afabicin 治疗葡萄球菌引起的骨或关节感染患者的安全性、耐受性和有效性的研究)中进行研究。
- 临床开发:Afabicin(Debio 1450) 目前正处于 II 期临床试验阶段,用于治疗耐多药金黄色葡萄球菌感染,包括呼吸机相关性肺炎和复杂性皮肤及软组织感染 [1]
- 耐药性:临床前研究未观察到与现有抗生素(例如万古霉素、利奈唑胺)的交叉耐药性 [1]
- 耐药机制:fabI 基因突变(例如 A112V 替换)使 Debio 1450 的敏感性降低了 4 倍,凸显了联合治疗的必要性 [1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C23H24N3O7P
分子量
485.4328
精确质量
485.135
元素分析
C, 56.91; H, 4.98; N, 8.66; O, 23.07; P, 6.38
CAS号
1518800-35-5
相关CAS号
Afabicin disodium;1518800-29-7; 1518800-35-5 (free acid); 1518800-40-2 (potassium); 1518800-53-7 (calcium); 1518800-36-6 (diolamine)
PubChem CID
72696796
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.4±0.1 g/cm3
沸点
876.6±75.0 °C at 760 mmHg
闪点
483.9±37.1 °C
蒸汽压
0.0±0.3 mmHg at 25°C
折射率
1.667
LogP
0.87
tPSA
133
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
7
重原子数目
34
分子复杂度/Complexity
833
定义原子立体中心数目
0
SMILES
P(=O)(O)(O)OCN1C(CCC2C=C(/C=C/C(N(C)CC3=C(C)C4C=CC=CC=4O3)=O)C=NC1=2)=O
InChi Key
HFYMDQMXVPJNTH-VQHVLOKHSA-N
InChi Code
InChI=1S/C23H24N3O7P/c1-15-18-5-3-4-6-19(18)33-20(15)13-25(2)21(27)9-7-16-11-17-8-10-22(28)26(23(17)24-12-16)14-32-34(29,30)31/h3-7,9,11-12H,8,10,13-14H2,1-2H3,(H2,29,30,31)/b9-7+
化学名
(E)-(6-(3-(methyl((3-methylbenzofuran-2-yl)methyl)amino)-3-oxoprop-1-en-1-yl)-2-oxo-3,4-dihydro-1,8-naphthyridin-1(2H)-yl)methyl dihydrogen phosphate
别名
Afabicin; Debio 1450; Debio-1450; Afabicin; 1518800-35-5; Debio1450; afabicina; afabicine; DMM8663H2R; [6-[(E)-3-[methyl-[(3-methyl-1-benzofuran-2-yl)methyl]amino]-3-oxoprop-1-enyl]-2-oxo-3,4-dihydro-1,8-naphthyridin-1-yl]methyl dihydrogen phosphate; Debio1450; AFN-1720; AFN 1720; AFN1720;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
H2O : ~3.85 mg/mL (~7.93 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
View More

注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
View More

口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.0600 mL 10.3001 mL 20.6003 mL
5 mM 0.4120 mL 2.0600 mL 4.1201 mL
10 mM 0.2060 mL 1.0300 mL 2.0600 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
+
+

计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

临床试验信息
NCT Number Recruitment interventions Conditions Sponsor/Collaborators Start Date Phases
NCT03723551 Recruiting Drug: Afabicin
Drug: Standard of Care
Bone or Joint Infection Debiopharm International SA February 20, 2019 Phase 2
相关产品
联系我们