Azido-PEG3-amine

别名: 1-氨基-11-叠氮-3,6,9-三氧杂十一烷;11-叠氮-3,6,9-三氧杂十一烷-1-胺;11-叠氮-3,6,9-三氧杂十一烷-1-氨基;11-Azido-3,6,9-trioxaundecan-1-amine 11-叠氮-3,6,9-三氧杂十一烷-1-氨基;1-氨基-11-叠氮基-3,6,9-三噁十一烷;氨基-三聚乙二醇-叠氮;叠氮三聚乙二醇氨基;2-{2-[2-(2-叠氮乙氧基)乙氧基]乙氧基}乙胺;O-(2-氨乙基)-O′-(2-叠氮乙基)二乙二醇;叠氮-PEG3-胺;氨基-PEG3-叠氮;11-氨基-3,6,9-三氧杂十一烷基叠氮
目录号: V12184 纯度: ≥98%
Azido-PEG3-amine 是一种含有氨基和叠氮基的 PEG 类似物。
Azido-PEG3-amine CAS号: 134179-38-7
产品类别: PROTAC Linkers
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
100mg
250mg
500mg
1g
2g
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

产品描述
叠氮基-PEG3-胺是一种含有氨基和叠氮基的 PEG 类似物。氨基可与羧酸、活化的NHS酯、羰基(酮、醛)等反应。叠氮基可通过Click Chemistry与炔、BCN、DBCO反应,产生稳定的三唑键。 PEG 连接体可用于开发抗体药物缀合物和药物递送方法。
生物活性&实验参考方法
体外研究 (In Vitro)
使用三(乙二醇)(PEG3)连接体,泊马度胺(CRBN 配体和众所周知的免疫调节酰亚胺药物(IMiD))连接到 Rucaparib 上,产生我们称为 iRucaparib-TP3 的分子(带有三唑-PEG3 的 IMiD-Rucaparib)链接器)。 PARP1 降解是由 iRucaparib-TP3 诱导的[1]。
参考文献

[1]. Uncoupling of PARP1 trapping and inhibition using selective PARP1 degradation. Nat Chem Biol. 2019 Dec;15(12):1223-1231.

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C8H18N4O3
分子量
218.2535
精确质量
218.138
CAS号
134179-38-7
相关CAS号
134179-38-7;
PubChem CID
2735280
外观&性状
Colorless to light yellow liquid
密度
1.1
沸点
198-202ºC
折射率
1.47
LogP
0.458
tPSA
103.46
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
11
重原子数目
15
分子复杂度/Complexity
173
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O(C([H])([H])C([H])([H])OC([H])([H])C([H])([H])N=[N+]=[N-])C([H])([H])C([H])([H])OC([H])([H])C([H])([H])N([H])[H]
InChi Key
FPVCVHVTMPCZTH-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C8H18N4O3/c9-1-3-13-5-7-15-8-6-14-4-2-11-12-10/h1-9H2
化学名
2-[2-[2-(2-azidoethoxy)ethoxy]ethoxy]ethanamine
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: (1). 本产品在运输和储存过程中需避光。  (2). 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 4.5819 mL 22.9095 mL 45.8190 mL
5 mM 0.9164 mL 4.5819 mL 9.1638 mL
10 mM 0.4582 mL 2.2910 mL 4.5819 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • iRucaparib induces PARP1 degradation. (A-D) Degradation of PARP1 by iRucaparib in primary rat neonatal cardiomyocytes. (A) Cells were treated with increasing concentrations of iRucaparib for 24 hrs. iRucap, iRucaparib-AP6. The result is a representative of two biologically independent experiments. (B) Cells were treated with Rucaparib (1 μM), pomalidomide (1 μM), Rucaparib (1 μM) plus pomalidomide (1 μM), iRucaparib (1 μM), or iRucaparib (1 μM) plus Rucaparib (1 μM) or Pomalidomide (10 μM) or MG132 (1 μM) for 24 hrs. Rucap/Ru, Rucaparib; Poma/Po, Pomalidomide; MG, MG-132. The result is a representative of three biologically independent experiments. (C) Cells were pre-treated with iRucaparib (1 μM) for 3 hrs followed by cycloheximide (10 μg/ml) treatment for the indicated times. CHX, Cycloheximide. The result is a representative of two biologically independent experiments. (D) Degradation curves of PARP1 for iRucaparib-AP5 and iRucaparib-AP6 (iRucaparib). Values represent mean ± SEM (n = 3 biological independent samples). In these experiments, whole cell lysates were analyzed by immunoblotting assays using the indicated antibodies, with the molecular weight standards shown (kDa). Uncropped blots are shown in Supplementary Figure 14.[1]. Uncoupling of PARP1 trapping and inhibition using selective PARP1 degradation. Nat Chem Biol. 2019 Dec;15(12):1223-1231.
  • iRucaparib selectively targets PARP1 for degradation. (A-C) Reproducibility of the TMT experiments in primary cardiomyocytes. The S/N values (signal-to-noise ratios) of the corresponding TMT channels for each protein were extracted and were Log10-transformed for the (A) control group (DMSO), (B) iRucaparib-AP5 treatment group and (C) iRucaparib treatment group (n = 2 biological independent samples). (D) Log-Log plot comparing protein expression in iRucaparib-AP5 (AP5) treatment vs. iRucaparib (AP6) treatment in primary cardiomyocytes (n = 2 biological independent samples). The corresponding ratio (compared to DMSO) was log2-transformed. PARP1 and PARP3 are indicated by the corresponding arrows. (E) Heatmap presentation of the protein expression changes in the primary cardiomyocyte TMT experiment. All data were normalized to the first control sample, which were then log2-transformed.[1]. Uncoupling of PARP1 trapping and inhibition using selective PARP1 degradation. Nat Chem Biol. 2019 Dec;15(12):1223-1231.
  • iRucaparib inhibits Poly-ADP-ribosylation (PARylation)-mediated signaling events downstream of PARP1. (A) Immunoblotting analysis of PARylation levels in HeLa cells treated with either Rucaparib or iRucaparib. HeLa cells were pretreated with a PARG inhibitor (PDD 00017273, 2 μM) for one hour and then treated with Rucaparib or iRucaparib (10 μM) for another hour. Cells were then challenged with H2O2 (2 mM) for 5 min, and whole cell lysates were analyzed by immunoblotting assays using the indicated antibodies, with the molecular weight standards shown (kDa). The result is a representative of two biologically independent experiments. Uncropped blots are shown in Supplementary Figure 14. (B) Identification of a Rucaparib-sensitive (upper panel) and iRucaparib-sensitive (lower panel) PARP1 auto-modified peptide (AEPVE*VVAPR). The site of modification is indicated by an asterisk. The inset shows a ~1:1 ratio (heavy/light) of a non-PARylated peptide (RGVACTQPR) from DHX15. The upper panel shows the peptides extracted from the Rucaparib SILAC experiment, and the lower panel shows the peptides extracted from the iRucaparib SILAC experiment. [1]. Uncoupling of PARP1 trapping and inhibition using selective PARP1 degradation. Nat Chem Biol. 2019 Dec;15(12):1223-1231.
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