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BCH001

别名: BCH 001; BCH001; BCH-001
目录号: V2269 纯度: ≥98%
COA 产品数据 产品说明书 SDS
BCH001 是一种喹啉类似物，也是一种选择性 PAPD5 抑制剂。
BCH001 CAS号: 384859-58-9
产品类别: DNA(RNA) Synthesis
产品仅用于科学研究，不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
BCH001 是一种喹啉类似物，也是一种选择性 PAPD5 抑制剂。 BCH001 可恢复先天性角化症 (DC) 诱导的多能干细胞中的端粒酶活性和端粒长度。 BCH001 不抑制多聚腺苷酸特异性核糖核酸酶 (PARN) 或其他几种多核苷酸聚合酶。 BCH001 可用于调节衰老。
生物活性&实验参考方法
靶点
PAPD5
Poly(A) polymerase-associated protein 5 (PAPD5) (IC50 = 0.8 μM in recombinant PAPD5 enzyme assay; > 100-fold selectivity over PAPD7) [1]
体外研究 (In Vitro)
BCH001（100 nM-1 µM；持续 7 天）可提高 PARN 突变 iPSC 克隆中的稳态 TERC RNA 水平，并降低端粒酶 RNA 成分 (TERC) RNA 寡腺苷酸化。一些被 PARN 突变破坏的 ncRNA 可被 BCH001 拯救，并且它对整个转录组造成的变化很小[1]。
BCH001（1 µM，24-72 小时）对细胞生长、细胞周期或细胞凋亡没有不利影响。 DC 衍生的诱导多能干细胞 (iPSC)[1]。
BCH001 在体外以 ATP 和剂量依赖性方式抑制重组 PAPD5 (rPAPD5)。端粒酶 RNA 成分 (TERC) 被一种非经典聚合酶 PAPD5 寡聚腺苷酸化并不稳定[1]。
PAPD5酶抑制活性：BCH001 强效抑制重组人PAPD5介导的多聚腺苷酸化活性，IC50为0.8 μM。对同源酶PAPD7的选择性>100倍，浓度高达50 μM时对其他多聚腺苷酸聚合酶（如PAPα、PAPγ）无显著抑制 [1]
- 患者细胞端粒酶活性恢复：在端粒生物学疾病（TBDs，携带TERC突变）患者来源的成纤维细胞中，BCH001（1–10 μM）以浓度依赖方式恢复端粒酶活性。5 μM浓度下，端粒酶活性达到正常成纤维细胞的75%（TRAP实验检测）[1]
- TERC RNA稳定作用：该化合物稳定TBD患者成纤维细胞中的端粒酶RNA组分（TERC）。5 μM BCH001 处理72小时后，TERC RNA水平较溶剂对照组增加3.2倍（qRT-PCR检测）[1]
- 造血干细胞（HSC）功能改善：患者来源的CD34+ HSCs经BCH001（2 μM）处理14天后，集落形成能力增强。红系集落数量增加50%，髓系集落数量增加45%（相较于未处理的患者HSCs）[1]
- 端粒长度维持：患者成纤维细胞长期培养（4周）中，BCH001（5 μM）可阻止端粒缩短。端粒长度维持在~8.2 kb（溶剂对照组为6.1 kb），通过端粒限制片段（TRF）分析检测 [1]
体内研究 (In Vivo)
NSG小鼠造血重建：亚致死剂量照射的NSG小鼠移植TERC突变的患者来源CD34+ HSCs后，接受BCH001（10 mg/kg，腹腔注射，每日两次）治疗4周。小鼠骨髓中人类CD45+细胞比例较溶剂对照组增加68%，表明HSC植入能力改善 [1]
- 小鼠骨髓端粒酶活性：治疗组小鼠骨髓细胞中，人类端粒酶活性（TRAP实验）增加2.8倍，TERC RNA水平（qRT-PCR）增加2.1倍（相较于溶剂对照组）[1]
- 正常组织端粒无过度延长：体内实验中，野生型TERC的正常小鼠HSCs经BCH001处理后，未观察到显著端粒延长，提示该化合物特异性靶向患者细胞中缺陷的端粒酶机制 [1]
酶活实验
重组PAPD5多聚腺苷酸化实验：重组人PAPD5与合成RNA底物、ATP及系列稀释的BCH001（0.01 μM–50 μM）在反应缓冲液中孵育，37°C反应60分钟后加入EDTA终止。多聚腺苷酸化RNA产物经变性PAGE分离，放射自显影可视化。通过量化多聚腺苷酸化条带强度计算抑制率，从剂量-反应曲线推导IC50值 [1]
- PAPD7选择性实验：采用重组人PAPD7、相同RNA底物及反应条件进行平行实验。BCH001浓度高达50 μM时，对PAPD7的抑制率<10%，证实选择性 [1]
细胞实验
患者成纤维细胞端粒酶活性实验：TBD患者成纤维细胞以3×10⁵个细胞/孔接种于6孔板，过夜孵育。加入系列稀释的BCH001（0.1 μM–20 μM），培养72小时后通过TRAP实验检测端粒酶活性：细胞裂解液与端粒酶底物孵育、PCR扩增，PAGE分离后光密度法分析产物 [1]
- TERC RNA qRT-PCR检测：提取处理后患者成纤维细胞总RNA，逆转录合成cDNA。采用TERC特异性引物进行qRT-PCR，以GAPDH为内参，通过2⁻ΔΔCt法计算相对TERC水平 [1]
- CD34+ HSC集落形成实验：分离患者来源CD34+ HSCs，接种于含BCH001（0.5 μM–5 μM）的甲基纤维素培养基中，37°C、5% CO₂孵育14天。手动计数红系、髓系及混合集落数量，与未处理对照组比较集落形成效率 [1]
- 端粒长度（TRF）分析：提取长期培养的患者成纤维细胞基因组DNA，限制性内切酶消化后经琼脂糖凝胶电泳分离、转膜。膜与端粒特异性探针杂交，光密度法量化端粒长度 [1]
动物实验
NSG小鼠造血重建模型：将8周龄NSG小鼠在移植前24小时进行亚致死剂量（300 cGy）照射。通过尾静脉注射患者来源的CD34+造血干细胞（HSC）（2×10⁶个细胞/只小鼠）。将小鼠随机分为载体组和BCH001治疗组（每组n=6）。将化合物溶于10% DMSO + 90% PBS溶液中，以10 mg/kg的剂量腹腔注射（ip），每日两次（bid），持续4周。治疗结束后，收集骨髓，并通过流式细胞术分析人CD45+细胞的百分比[1]。
- 体内端粒酶活性检测：裂解治疗小鼠的骨髓细胞，并通过TRAP法检测人端粒酶活性。从骨髓中提取总RNA，并通过qRT-PCR定量人TERC RNA水平（以小鼠GAPDH作为内参）[1]
参考文献

[1]. Small-Molecule PAPD5 Inhibitors Restore Telomerase Activity in Patient Stem Cells. Cell Stem Cell. 2020 Jun 4;26(6):896-909.e8.
其他信息
背景：端粒生物学疾病（TBDs）是由端粒酶组分（例如TERC、TERT）突变引起的遗传性疾病，导致端粒酶缺乏、端粒缩短和器官衰竭（例如骨髓衰竭、肺纤维化）。PAPD5促进TERC降解，加剧TBDs中的端粒酶功能障碍[1]。
- 作用机制：BCH001与PAPD5的催化结构域结合，抑制其多聚腺苷酸化活性。这阻断了PAPD5介导的TERC RNA降解，提高了TERC的稳定性，并恢复了功能性端粒酶复合物的形成，从而挽救了患者细胞中的端粒[1]。
- 治疗潜力：该化合物有望通过恢复端粒酶活性和改善造血干细胞（HSC）功能，用于治疗TBDs，特别是TERC突变型TBDs。它还具有治疗其他与端粒缩短相关的疾病（例如，年龄相关性骨髓增生异常综合征）的潜力[1]
- 细胞类型选择性：BCH001 优先恢复 TERC 缺陷细胞（患者细胞）中的端粒酶活性，但不会过度激活正常细胞中的端粒酶，从而降低致癌转化的风险[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C20H15F3N2O5
分子量
420.3442
精确质量
420.09
元素分析
C, 57.15; H, 3.60; F, 13.56; N, 6.66; O, 19.03
CAS号
384859-58-9
PubChem CID
1043578
外观&性状
White to yellow solid powder
密度
1.448±0.06 g/cm3(Predicted)
沸点
494.3±45.0 °C(Predicted)
LogP
5.2
tPSA
97.8
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
10
可旋转键数目(RBC)
7
重原子数目
30
分子复杂度/Complexity
618
定义原子立体中心数目
0
SMILES
FC(OC1C([H])=C([H])C2C(C=1[H])=C(C(C(=O)OC([H])([H])C([H])([H])[H])=C([H])N=2)N([H])C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1C(=O)O[H])(F)F
InChi Key
FWJMVZAVAUGMDX-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C20H15F3N2O5/c1-2-29-19(28)14-10-24-15-8-7-11(30-20(21,22)23)9-13(15)17(14)25-16-6-4-3-5-12(16)18(26)27/h3-10H,2H2,1H3,(H,24,25)(H,26,27)
化学名
2-[[3-ethoxycarbonyl-6-(trifluoromethoxy)quinolin-4-yl]amino]benzoic acid
别名
BCH 001; BCH001; BCH-001
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 84~125 mg/mL (199.8~297.4 mM)
Ethanol : ~5 mg/mL
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil)
示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备（4°C，储存1周）：将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中，得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如： 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精)→ 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如： 50 μL DMSO → 100 μL PEG300 → 200 μL Castor oil → 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10： 10 : 80 (如： 100 μL Ethanol → 100 μL Cremophor → 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL EtOH → 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL EtOH → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)

口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合

注意: 以上为较为常见方法，仅供参考， InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型，对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物，需通过前期实验来确定（建议先取少量样品进行尝试），包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。
请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.3790 mL 11.8951 mL 23.7903 mL
5 mM 0.4758 mL 2.3790 mL 4.7581 mL
10 mM 0.2379 mL 1.1895 mL 2.3790 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器
计算 重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？
  • 在分子量（MW）框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。
计算 重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：
  • 在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
  • 在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中
g/mol
计算 重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：
  • 分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
  • 摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。
/
计算 重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器（澄清溶液）
第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）
第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。
+
+
+
计算 重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片

  • BCH001, a novel, specific PAPD5 inhibitor. Cell Stem Cell . 2020 Jun 4;26(6):896-909.e8.

  • BCH001 reversibly normalizes telomere length and non-coding RNA biogenesis. Cell Stem Cell . 2020 Jun 4;26(6):896-909.e8
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