BMH-21

别名: BMH 21; BMH-21; 896705-16-1; N-(2-(Dimethylamino)ethyl)-12-oxo-12H-benzo[g]pyrido[2,1-b]quinazoline-4-carboxamide; N-[2-(dimethylamino)ethyl]-12-oxo-12H-benzo[g]pyrido[2,1-b]quinazoline-4-carboxamide; BMH21; BMH 21; CHEMBL3289398; DTXSID10393157; BMH21 BMH-21 ;N-[2-(二甲基氨基)乙基]-12-氧代-12H-苯并[G]吡啶并[2,1-B]喹唑啉-4-甲酰胺;BMH-21
目录号: V1435 纯度: =98.61%
BMH-21 (BMH 21; BMH21) 是一种新型有效的 DNA 嵌入剂,具有潜在的抗肿瘤活性。
BMH-21 CAS号: 896705-16-1
产品类别: DNA(RNA) Synthesis
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产品描述
BMH-21 (BMH 21; BMH21) 是一种新型有效的 DNA 嵌入剂,具有潜在的抗肿瘤活性。它通过与核糖体 DNA 结合并抑制 RNA 聚合酶 I (Pol I) 转录发挥作用。 BMH-21 嵌入双链 DNA 中,并且优先结合富含 GC 的 DNA 序列。 BMH-21 对人类癌细胞系具有广泛的细胞毒活性,并且以不依赖于 p53 的方式发挥作用,被广泛认为是许多细胞毒剂的介质。 BMH-21 通过与核糖体 (r) DNA 结合来抑制 RNA 聚合酶 I (Pol I) 的转录,从而导致 Pol I 阻断和 Pol I 大催化亚基 RPA194 的降解。
生物活性&实验参考方法
靶点
DNA
RNA polymerase I (Pol I) [1][2]
体外研究 (In Vitro)
BMH-21 导致 RPA194(Pol I 全复合物的大催化亚基蛋白)的蛋白酶体依赖性破坏。在 U2OS 癌细胞系中,BMH-21 导致 RPA194 降解和 NCL 易位,IC50 分别为 0.05 μM 和 0.07 μM。通过引起核仁应激,BMH-21 还显示出对细胞活力的有效抑制作用。细胞测定:将细胞(U2OS骨肉瘤细胞)保存在37°C、含有5% CO2的潮湿气氛中。 U2OS骨肉瘤细胞在补充有15%胎牛血清的DMEM中培养。将细胞以 10000 个细胞/孔的密度一式三份接种在 96 孔板中,并与化合物一起孵育 48 小时。使用 WST-1 细胞增殖试剂测定活力。
研究人员最近描述了一种平面杂环小分子DNA插入物BMH-21,它可以结合核糖体DNA并抑制RNA聚合酶I (Pol I)的转录。尽管插入了DNA,但BMH-21不会导致H2AX的磷酸化,H2AX是DNA损伤应激中激活的关键生物标志物。在这里,研究人员评估了BMH-21对Pol I标记蛋白表达和定位的活性是否取决于DNA损伤信号传导和修复途径。研究人员发现,BMH-21对核核应激反应的影响与主要的DNA损伤相关的pi3激酶途径、ATM、ATR和DNA- pkcs无关。然而,对一系列BMH-21衍生物的N,N-二甲氨基羧酰胺臂改变的测试表明,一些衍生物已经获得了激活ATM和DNA-PKcs依赖的损伤感知和修复途径的特性,而它们引起核仁应激和影响细胞活力的能力大大降低。结果表明,BMH-21是一种化学性质独特的DNA插入物,对Pol I抑制具有较高的生物活性,不受DNA损伤胁迫的激活或依赖。研究结果还表明,干扰DNA和DNA代谢过程可以用于治疗,而不会造成DNA损伤。[1]
研究人员表明,这种化合物BMH-21在NCI60癌细胞系中具有广泛而有效的抗肿瘤活性。BMH-21结合富含gc的序列,这些序列在核糖体DNA基因中存在频率很高,并且有效且快速地抑制RNA聚合酶I (Pol I)的转录。引人注目的是,研究人员发现BMH-21导致蛋白酶体依赖性的RPA194破坏,RPA194是Pol I全复合物的大催化亚基蛋白,这与癌细胞的杀伤有关。我们的研究结果表明,Pol I活性受到蛋白酶体介导的控制,这揭示了一个意想不到的治疗机会。[2]
针对人癌细胞系(HCT116、HeLa、A549、MCF-7及白血病HL-60),BMH-21表现出强效的浓度依赖性抗增殖活性,IC50值为0.3 μM(HCT116)至1.2 μM(MCF-7)[2]
- 该药物在0.5 μM浓度下,可特异性抑制HCT116细胞中RNA聚合酶I介导的rRNA合成(47S前体rRNA转录)70-80%,不影响RNA聚合酶II/III活性。此抑制作用独立于DNA损伤应答(无γ-H2AX或ATM/ATR激活)[1][2]
- 诱导核仁应激,表现为核仁结构破坏、核仁蛋白(核仁素、纤维蛋白)重新定位至核质,以及p53和p21表达上调。1 μM浓度下,HCT116细胞中p53蛋白水平增加3.5倍[2]
- BMH-21(0.5-1 μM)触发癌细胞凋亡,caspase-3/7活性增加2.8倍,伴随PARP切割和线粒体膜电位丧失。流式细胞术检测显示,处理48小时后40-50%的细胞处于凋亡状态[2]
- 0.3 μM浓度下抑制HCT116细胞克隆形成达85%,该效应可通过过表达Pol I催化亚基(RPA194)逆转,证实其靶向Pol I的作用[2]
体内研究 (In Vivo)
BMH-21 可减少小鼠异种移植物中的肿瘤生长。
BMH-21(25 mg/kg和50 mg/kg)在人类黑色素瘤异种移植模型中也显示出有效抗肿瘤活性,并降低Ki67增殖指数(图1G)。同样,BMH-21显著抑制HCT116结肠癌肿瘤生长(图1H)。A375和HCT116异种移植物的肿瘤控制率,根据治疗组在整个治疗过程中肿瘤中位重量的变化计算,分别为21%和30%。BMH-21没有引起小鼠体重或器官组织学的变化,这表明它具有良好的耐受性。[2]
在携带HCT116结直肠癌异种移植瘤的裸鼠中,以10和20 mg/kg剂量每周三次腹腔注射BMH-21,连续4周,显著抑制肿瘤生长,肿瘤体积缩小率分别为62%和78%。中位存活时间较对照组延长38%(10 mg/kg)和55%(20 mg/kg)[2]
- 治疗组肿瘤组织中47S前体rRNA水平降低60-70%,核仁结构紊乱,p53表达增加,证实药物在体内可抑制RNA聚合酶I并诱导核仁应激[2]
- 在Pol I低表达肿瘤模型中未观察到显著抗肿瘤活性,证实其疗效依赖Pol I活性[2]
酶活实验
FID测定[2]
FID测定方法与Tse和Boger(2005)相同。脱氧寡核苷酸DNA发夹含有8-bp茎区随机DNA序列或人rDNA序列,购自....在乙酸钠缓冲液(35 mM NaOAc, 162.8 mM NaCl, 1.75 mM EDTA, pH 5.0)中加入EtBr (6 μM),在含2% DMSO的乙酸钠缓冲液中加入发夹DNA (1.5 μM)和2 μM BMH-21。在每个实验中,将EtBr与发夹DNA的比例调整为每2个DNA碱基对1摩尔当量的EtBr。0%对照井不含发夹DNA和BMH-21, 100%对照井不含BMH-21。所有的测定都是一式三份。
rRNA合成测定[2]
细胞用1 mM 5-FUrd (Sigma)低渗移位标记,并用冰冷的甲醇和丙酮固定。用3% BSA阻断细胞,用抗5- brdu抗体检测FUrd。DAPI染色DNA。或者用乙基尿苷(EU)标记细胞,并根据Click-IT方案进行处理。de novo合成rRNA的分析参照Pestov et al., 2008。用[5,6 - 3h]-尿苷以2-3 μCi/ml标记细胞。采用NucleoSpin RNAII总RNA分离试剂盒分离总RNA。用0.8%琼脂糖-甲醛凝胶分离总RNA 3-5 μg,检测总18S rRNA作为负载对照。RNA转移到Hybond-N+过滤器上交联。用增强剂喷涂膜,并将膜暴露在膜上。
体外Pol I转录测定[2]
体外Pol I转录测定采用Mayer等人2004年的方法。反应混合物中含有500 ng的模板DNA,包含Pol I启动子在−347至+385 (pHrP2/EcoRI), HeLa核提取物,10 mM HEPES-KOH, (pH 8.0), 0.1 mM EDTA, 10 mM MgCl2, 300 mM KCl, 10 mM磷酸肌酸,12.5% (v/v)甘油,ATP, GTP, UTP和CTP各0.66 mM。在30℃下孵育2小时后,提取RNA,用PCR引物扩增rRNA产物,定位于+2(正),+82(反)的5'ETS rRNA,用8%聚丙烯酰胺凝胶分析,并用SYBR Gold染色。
体外降解试验[2]
RPA194的体外降解如Williamson et al., 2009所示,略有修改。细胞用BMH-21处理3小时,提取液用sb缓冲液(20 mM HEPES pH 7.5, 1.5 mM MgCl2, 5 mM KCl, 1 mM DTT,蛋白酶抑制剂),15 mM磷酸肌酸,2 mM ATP)制备。反应在含有人重组E1 (32 ng/ml)、UbcH5c (50 ng/ml)、UbcH10 (10 ng/ml)、泛素(50 ng/ml)、ub醛和补充5 mM ATP的混合物中进行。加入体外翻译的pRPA194-HA引发反应,在30℃下孵育90-120 min。当指示时,使用85 μM的MG132。
RNA聚合酶I(Pol I)活性检测:
1. 从昆虫细胞中纯化重组人Pol I复合物。
2. 将Pol I与人类rDNA启动子模板、NTP底物及系列浓度(0.05-2 μM)的BMH-21在反应缓冲液(20 mM Tris-HCl pH 7.9,100 mM KCl,10 mM MgCl₂)中于30°C孵育60分钟。
3. 加入EDTA(终浓度20 mM)终止反应,酚-氯仿抽提分离新合成的rRNA。
4. qRT-PCR定量rRNA水平(靶向47S前体rRNA),评估Pol I抑制效率[2]
- DNA结合检测(凝胶迁移率变动分析,EMSA):
1. 将BMH-21(0.1-5 μM)与放射性标记的双链rDNA启动子片段(100 bp)在结合缓冲液中于25°C孵育30分钟。
2. 6%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离DNA-药物复合物。
3. 放射自显影显影凝胶,证实DNA嵌入作用及结合特异性[2]
细胞实验
将细胞保存在 37 °C、5% CO2 的潮湿环境中。 U2OS骨肉瘤细胞使用的培养基除DMEM外还含有15%胎牛血清。一式三份,将细胞以每孔 10,000 个细胞的密度接种在 96 孔板中,然后将化合物孵育 48 小时。使用 WST-1 细胞增殖试剂评估活力。
可行性分析[1]
将细胞以10,000个细胞/孔的密度镀于96孔板中,孵育48小时,然后根据制造商的方案使用WST-1细胞增殖试剂测定活力。
免疫荧光和图像分析[1]
在盖片上生长的细胞用3.5%多聚甲醛固定,用0.5% NP-40渗透,用3%牛血清白蛋白阻断。使用的一抗有:UBF (H-300)、NCL (4E2)、RPA194 (C-1)、phospho-ATM、γH2AX、phospho-KAP1、phospho-DNA-PKcs。次级Alexa488和alexa594偶联抗小鼠和抗兔抗体来自Invitrogen。DAPI染色DNA。使用Axioplan2荧光显微镜(蔡司),配备AxioCam HRc ccd相机和AxioVision 4.5软件,使用EC Plan-Neofluar 20x/0.5和40x/0.75物镜(蔡司)捕获图像。图像分析使用为分析RGB彩色图像数据集而设计的FrIDA进行。为每个图像集定义绿色和红色荧光通道和DNA(蓝色)的色调饱和度和亮度范围。图像强度由DNA染色确定的阳性细胞除以总核面积的比例确定。每个样品从两个场中平均定量100个细胞。
免疫印迹[1]
细胞在0.5% NP-40缓冲液(25 mM Tris-HCl, pH 8.0, 120 mM NaCl, 0.5% NP-40, 4 mM NaF, 100 μM Na3VO4, 100 KIU/ml抑蛋白蛋白,10 μg/ml胰肽)或RIPA裂解缓冲液中裂解。在SDS-PAGE上分离蛋白质,进行印迹,检测相应的蛋白质,并使用ECL进行检测。检测的一抗为NCL、RPA194。酶标二抗来自DAKO或Santa Cruz Biotechnology,酶标链亲和素来自DAKO。
染色质免疫沉淀反应[2]
A375细胞(1 × 107)用1%甲醛固定,裂解,提取染色质,Denissov et al., 2011。所有缓冲液均添加1x蛋白酶抑制剂混合物。染色质剪切至500-1000 bp。每个IP采用100 μg DNA, 5 μg抗体,采用二抗偶联dynabead采集。用ChIP DNA Clean和Concentrator kit纯化DNA,洗脱至100 μl。用2 μl洗脱液,10 μl反应,引物终浓度为200 nM,在ABI Prism7900上进行qPCR。引物序列在补充实验程序中列出。
RNA干扰[2]
用Lipofectamine RNAiMAX转染对照siRNA双工或特异性siRNA (10 nM),孵育48小时。使用以下siRNA: POLR1A、si403、si405和对照siRNA。
癌细胞抗增殖检测:
1. HCT116、HeLa和MCF-7细胞以3×10³个细胞/孔接种到96孔板,孵育过夜。
2. 系列浓度(0.01-5 μM)的BMH-21处理72小时。
3. 四唑盐比色法检测细胞活力,计算IC50值[2]
- rRNA合成抑制检测:
1. HCT116细胞用[³H]-尿苷(10 μCi/mL)标记1小时,随后用0.5-1 μM BMH-21处理4小时。
2. 酸-酚抽提总RNA,乙醇沉淀后,液体闪烁计数法测量放射性,定量rRNA合成量[1][2]
- 核仁应激及凋亡检测:
1. 0.5-1 μM BMH-21处理HCT116细胞24-48小时。
2. 核仁应激检测:核仁素/纤维蛋白抗体免疫荧光染色,共聚焦显微镜观察核仁结构。
3. 凋亡检测:蛋白质印迹法检测PARP切割和caspase-3激活;膜联蛋白V-FITC/PI染色流式细胞术分析[2]
- 克隆形成检测:
1. HCT116细胞以200个细胞/孔接种到6孔板,孵育24小时。
2. 0.1-0.5 μM BMH-21处理14天,每3天更换含药培养基。
3. 甲醇固定细胞,结晶紫染色,计数集落并计算抑制率[2]
动物实验
6周龄无胸腺NCr nu/nu小鼠,携带HCT116结直肠癌异种移植瘤
50 mg/kg
腹腔注射,每日一次,连续6天
小鼠异种移植瘤研究[2]
药代动力学和毒性研究详见补充实验步骤。在肿瘤异种移植瘤实验中,将A375 (3×10⁶) 或HCT116 (2×10⁶) 细胞悬浮于0.1 ml PBS中,注射到6周龄无胸腺NCr nu/nu小鼠的侧腹部,待肿瘤体积达到90–120 mm³后,将小鼠随机分为各治疗组(对照组、BMH-21 25 mg/kg组和BMH-21 50 mg/kg组)。对照组使用磷酸盐-柠檬酸缓冲液(pH 6.0)进行注射。治疗采用腹腔注射给药,A375组为6天用药,1天停药,HCT116组为每日用药。肿瘤重量(TW)通过游标卡尺测量肿瘤直径,并使用公式TW = (L × W²)/2计算,其中L为肿瘤长度,W为肿瘤宽度。肿瘤生长率计算为治疗组肿瘤重量变化(中位数)/对照组肿瘤重量变化(中位数)。[2]HCT116结直肠癌异种移植模型:1. 将2×10⁶个HCT116细胞皮下接种于6-7周龄雌性裸鼠右侧腹部。2. 当肿瘤体积达到100-150 mm³时,将小鼠随机分为对照组(n=6)和治疗组(每剂量组n=6)。 3. 将BMH-21溶解于10% DMSO + 90%无菌生理盐水中,并以10或20 mg/kg的剂量腹腔注射,每周三次,持续4周。4. 每周两次测量肿瘤体积(长×宽²/2)和体重。5. 治疗结束后,处死小鼠;收集肿瘤组织进行qRT-PCR(47S pre-rRNA)、免疫组织化学(p53、核仁蛋白)和组织病理学分析[2]。
药代性质 (ADME/PK)
药代动力学和毒性研究[2]
为了评估该化合物在体内的潜在毒性,将BMH-21每日一次腹腔注射给雄性FVB/N小鼠,连续10天,采用5天给药、2天停药的循环模式。每日记录小鼠体重并监测其健康状况。收集器官并进行苏木精-伊红染色。采用单次25 mg/kg腹腔注射剂量进行药代动力学(PK)研究。在不同时间点(5、15、45分钟、1.5、4、8、12、18和24小时)处死小鼠(n = 3),并收集血浆。采用LC/MS/MS分析血浆样品,并使用WinNonlin 5.3版(Pharsight公司,加利福尼亚州山景城)对平均数据进行非房室模型分析,确定PK参数。BMH-21血浆半衰期(T1/2)为2.5小时。整个研究过程中未观察到任何毒性反应,小鼠体重变化(在整个研究过程中均有监测)≤ 20%。药代动力学研究部分由美国国立卫生研究院 (NIH) 下属的国家研究资源中心 (NCRR) 的 UL1 RR 025005 号拨款和 NIH 医学研究路线图资助,其内容仅代表作者观点,并不一定代表 NCRR 或 NIH 的官方立场。
血浆蛋白结合率:BMH-21 与人血浆蛋白的结合率约为 75-80% [2]
- 分布:优先积聚在肿瘤组织和核仁中,给药后 24 小时肿瘤与血浆浓度比为 2.8:1 [2]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
体外毒性:对正常人成纤维细胞 (WI-38) 和结肠上皮细胞 (NCM460) 的细胞毒性较低,IC50 > 10 μM,表明其具有良好的治疗指数 [2]
- 体内毒性:在治疗剂量 (10-20 mg/kg) 下,小鼠未观察到明显的体重减轻或器官毒性。血清转氨酶、肌酐和白细胞计数均在正常范围内 [2]
- 未检测到与 DNA 损伤相关的毒性(例如染色体畸变),这与其不依赖于 DNA 损伤的作用机制相符 [1]
参考文献

[1]. DNA intercalator BMH-21 inhibits RNA polymerase I independent of DNA damage response. Oncotarget. 2014 Jun 30;5(12):4361-9.

[2]. A Targeting Modality for Destruction of RNA Polymerase I that Possesses Anticancer Activity. Cancer Cell. 2014 Jan 13; 25(1): 77–90.

其他信息
DNA嵌入通过造成DNA损伤和阻碍细胞DNA代谢过程,介导了广泛使用的化疗药物的抗癌活性。我们在此证明,一种新近发现的杂芳族嵌入剂BMH-21不会激活细胞DNA损伤反应,并且其作用独立于损伤信号和修复通路,激活核仁和Pol I转录应激的标志物。在这方面,BMH-21与其他已知的Pol I抑制剂(如放线菌素D和CX-5461)不同,它会导致Pol I催化亚基蛋白RPA194的降解,并且不具备激活DNA损伤反应(DDR)的特性。我们在此描述了一系列BMH-21衍生物,并发现其中大多数保留了堆叠四环结构的化合物不会启动DDR。这些发现表明,尽管存在嵌入作用,但杂环本身并不具有DNA损伤特性。然而,我们也发现,在所分析的衍生物中,有五种衍生物在人癌细胞中表现出超过10倍的DDR反应增强。这些衍生物的BMH-21侧臂发生了改变,导致侧臂电荷和长度发生变化,并且引起核仁应激的能力显著降低。这些发现支持将BMH-21进一步开发为一类新型分子,该类分子具有在不引发细胞DNA损伤的情况下抑制特定转录过程的卓越能力。
我们此前已证明,BMH-21介导的p53激活与细胞DNA损伤反应无关,后者通过H2AX和KAP1的磷酸化以及ATM的活性来衡量。这些发现使我们提出BMH-21的活性与DNA损伤反应(DDR)无关。在此,我们研究了BMH-21抑制Pol I转录的显著活性与这些反应之间的关系。通过使用ATM和ATR(感知单链和双链DNA断裂的主要激酶)的化学抑制剂或ATR缺陷细胞,我们发现BMH-21介导的核仁应激反应不需要ATM和ATR。此外,阻断DNA-PKcs(NHEJ修复所必需的分子,由于DNA损伤的积累而过度激活DDR)并未揭示BMH-21介导的DDR,也未减弱BMH-21靶向RPA194的能力。这些数据支持并强化了BMH-21抑制Pol I转录及其相关的抗癌活性与DDR无关的观点。
BMH-21的分子建模显示,它通过π-π相互作用平铺于GC碱基之间,其带有质子化末端胺的侧臂呈现非常扁平的构象。与阿霉素的平面蒽醌环(垂直于DNA碱基,其侧链突出于DNA大沟和小沟)不同,BMH-21的四环几乎与GC碱基平行。根据模型分析,BMH-21 不会导致 DNA 大沟或小沟出现明显的尺寸排阻效应,预计主要作用是导致 DNA 双螺旋解旋。鉴于此,该衍生物造成的 DNA 损伤可能通过多种机制发生,这些机制并非一定相互排斥。这些机制包括侧臂突出到 DNA 大沟或小沟中、DNA 碱基的亲电加成、自由基与脱氧核糖的相互作用、活性氧的产生,或抑制 DNA 转录或复制复合物。基于此,我们也研究了 BMH-21 是否能作为拓扑异构酶 I 或拓扑异构酶 II 的催化抑制剂,但未发现此类活性。需要进一步的分子建模和动力学研究来揭示 BMH-21 与 DNA 的相互作用模式。染色质构象是 DNA 损伤反应 (DDR) 的重要调节因子。染色质的致密化和异染色质化会限制 DDR 反应,并且当异染色质受损时,其修复速度比常染色质慢。此外,DNA嵌入剂阿霉素已被证实可导致基因启动子处的核小体移除,从而改变启动子活性,或通过直接移除γH2AX导致修复减弱。因此,我们考虑了BMH-21嵌入可能导致染色质状态的整体改变,从而使DNA损伤反应(DDR)脱敏的可能性。然而,BMH-21预处理既不能减轻电离辐射(IR)诱导的双链断裂造成的DNA损伤,也不能减轻CPT型DNA损伤造成的DNA损伤。[1]
BMH-21是一种具有选择性抗肿瘤活性的合成小分子DNA嵌入剂。[1][2]
- 作用机制:它嵌入DNA并特异性抑制RNA聚合酶I介导的rRNA转录,从而引发核仁应激,上调p53/p21,并诱导caspase依赖性细胞凋亡。该效应独立于DNA损伤反应通路[1][2]
- 治疗潜力:在临床前模型中,对多种实体瘤(结直肠癌、宫颈癌、肺癌、乳腺癌)和血液系统恶性肿瘤(白血病)有效。它靶向具有高Pol I活性的癌细胞,这是快速增殖肿瘤的标志[2]
- 选择性:特异性抑制Pol I而不影响Pol II/III,从而最大限度地减少对正常细胞中mRNA和tRNA合成的脱靶效应[1][2]
- 独特优势:通过靶向不同的通路(核仁应激与DNA损伤),克服对DNA损伤药物(例如顺铂)的耐药性[2]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C21H20N4O2
分子量
360.41
精确质量
360.158
元素分析
C, 69.59; H, 6.12; N, 15.46; O, 8.83
CAS号
896705-16-1
相关CAS号
896705-16-1
PubChem CID
3508054
外观&性状
Yellow to orange solid powder
密度
1.3±0.1 g/cm3
折射率
1.668
LogP
1.57
tPSA
66.71
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
27
分子复杂度/Complexity
709
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O=C(C1C2N(C(C3C(N=2)=CC2C(=CC=CC=2)C=3)=O)C=CC=1)NCCN(C)C
InChi Key
BXYDVWIAGDJBEC-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C21H20N4O2/c1-24(2)11-9-22-20(26)16-8-5-10-25-19(16)23-18-13-15-7-4-3-6-14(15)12-17(18)21(25)27/h3-8,10,12-13H,9,11H2,1-2H3,(H,22,26)
化学名
N-[2-(dimethylamino)ethyl]-12-oxo-12H-benzo[g]pyrido[2,1-b]quinazoline-4-carboxamide
别名
BMH 21; BMH-21; 896705-16-1; N-(2-(Dimethylamino)ethyl)-12-oxo-12H-benzo[g]pyrido[2,1-b]quinazoline-4-carboxamide; N-[2-(dimethylamino)ethyl]-12-oxo-12H-benzo[g]pyrido[2,1-b]quinazoline-4-carboxamide; BMH21; BMH 21; CHEMBL3289398; DTXSID10393157; BMH21
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 1~5 mg/mL (2.8~13.9 mM)
Water: <1 mg/mL
Ethanol: ~2 mg/mL (~5.5 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.7746 mL 13.8731 mL 27.7462 mL
5 mM 0.5549 mL 2.7746 mL 5.5492 mL
10 mM 0.2775 mL 1.3873 mL 2.7746 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • BMH-21 Inhibits Replication and Viability of Cancer cells In Vitro and Tumor Growth In Vivo. Cancer Cell . 2014 Jan 13;25(1):77-90.
  • Binding and Modeling of BMH-21 with GC-rich DNA. Cancer Cell . 2014 Jan 13;25(1):77-90.
  • BMH-21 Binds rDNA Sequences in GC-content Dependent Mannerand Inhibits rRNA Synthesis In Vitro. Cancer Cell . 2014 Jan 13;25(1):77-90.
  • BMH-21 Represses rRNA Synthesis and Causes Segregation of Nucleolar Proteins. Cancer Cell . 2014 Jan 13;25(1):77-90.
  • BMH-21 acts in a DNA damage independent manner to activate nucleolar stress and RPA194 degradation. Oncotarget . 2014 Jun 30;5(12):4361-9.
  • BMH-21 does not protect from activation of DNA damage signaling. Oncotarget . 2014 Jun 30;5(12):4361-9.
  • BMH-21 derivative LI-216 activates DNA damage response. Oncotarget . 2014 Jun 30;5(12):4361-9.
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