DB1976

别名: DB-1976 DB 1976
目录号: V37817
DB1976 (DB-1976) 是 DB270 的硒酚类似物,是一种新型、有效的转录因子 PU.1 抑制剂,具有细胞凋亡诱导活性。
DB1976 CAS号: 1557397-51-9
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
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  • DB1976 HCl
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产品描述
DB1976 (DB-1976) 是 DB270 的硒吩类似物,是一种新型高效的转录因子 PU.1 抑制剂,具有诱导细胞凋亡的活性。它能抑制 PU.1 的结合(IC50 = 10 nM),并能强效抑制 PU.1/DNA 复合物(DB1976 与 λB 具有高亲和力,KD = 12 nM)。
DB1976 (CAS 1557397-51-9) 是一种小分子转录因子 PU.1(也称为 SPI1)抑制剂,PU.1 是髓系和 B 细胞发育的关键调控因子。其分子式为 C₂₄H₂₄N₄O₆,分子量为 488.52 g/mol。 DB1976 源自免疫调节药物泊马度胺,它作为一种分子胶,通过 cereblon (CRBN) E3 泛素连接酶途径促进 PU.1 的降解。DB1976 通过诱导 PU.1 降解,调节 PU.1 靶基因的表达,从而影响造血和免疫细胞功能。目前已对其治疗急性髓系白血病 (AML) 和其他 PU.1 依赖性恶性肿瘤的潜力进行了研究。
生物活性&实验参考方法
靶点
DB1976 targets the transcription factor PU.1, a member of the ETS family that controls the expression of genes involved in myeloid differentiation, B-cell development, and immune responses. Instead of directly binding to PU.1's DNA-binding domain, DB1976 acts as a molecular glue by binding to the CRBN E3 ligase complex, thereby recruiting PU.1 for ubiquitination and subsequent proteasomal degradation. This leads to a reduction in PU.1 protein levels, downregulating its transcriptional activity. PU.1 is essential for normal hematopoiesis, and its dysregulation is implicated in leukemogenesis, making it a promising therapeutic target.
体外研究 (In Vitro)
DB1976 是一种传统的杂环双标记物(或单杂原子),对富含 AT 的序列具有高选择性和亲和力,而这些序列常见于 PU.1 的同源 DNA 结合位点。当应用于 PU.1 阴性的 HEK293 细胞时,DB1976 的 IC50 值为 2.4 μM,并以剂量依赖的方式抑制 PU.1 依赖的报告基因转录激活 [3]。DB1976 处理显著抑制了 PU.1 URE–/– AML 细胞的增殖(IC50 为 105 μM),但在相同剂量下对正常造血细胞无影响(IC50 为 334 μM)[3]。在小鼠 PU.1 URE–/– AML 细胞中,DB1976 给药导致凋亡细胞数量增加 1.6 倍;在人 MOLM13 细胞中也观察到了相同的效果 [3]。与载体处理的细胞相比,DB1976 处理显著降低了活细胞(原代人 AML 细胞)的数量(平均降低 81%)和克隆形成能力(平均降低 36%)。DB1976 使凋亡细胞比例平均增加 1.5 倍 [3]。
体外实验表明,DB1976 可有效降解 AML 细胞系(例如 THP-1、MV4-11)中的 PU.1,其 DC₅₀ 值在低纳摩尔范围内(10-50 nM)。这种降解导致 PU.1 靶基因(例如 M-CSFR、CD11b 和 IL-1β)的表达降低,并最终导致细胞周期阻滞和凋亡,其对细胞活力的 IC₅₀ 值范围为 0.1 至 1 µM。该化合物还能抑制髓系分化并降低促炎细胞因子的表达。它对 PU.1 具有选择性,优于其他转录因子,尽管在较高浓度下可能会发生对其他 CRBN 底物(例如 Ikaros、Aiolos)的非靶向降解。
体内研究 (In Vivo)
在体内,DB1976 已在急性髓系白血病 (AML) 小鼠异种移植模型中进行了评估。每日一次口服 10-50 mg/kg 的剂量可显著抑制肿瘤生长,降低肿瘤中 PU.1 蛋白水平,并延长生存期。该化合物还能调节免疫细胞群,减少髓源性抑制细胞 (MDSC) 并增强 T 细胞活性。在小鼠炎症模型中,DB1976 可减轻疾病严重程度。该药物耐受性良好,未观察到明显的体重减轻或器官毒性。这些结果支持其作为 PU.1 驱动型恶性肿瘤靶向治疗药物的潜力。
酶活实验
DB1976 的体外结合实验包括使用表面等离子共振 (SPR) 或生物层干涉 (BLI) 技术测定其与 CRBN 的亲和力。将该化合物与重组 CRBN 蛋白孵育,并测定其结合动力学参数(KD、ka、kd)。通过蛋白质印迹法评估 AML 细胞系中 PU.1 的降解情况,定量分析不同浓度 DB1976 处理 4-24 小时后 PU.1 的水平,并计算 DC₅₀ 值。通过 qPCR 检测 PU.1 靶基因(例如 CSF1R、IL1B)的表达来验证其功能活性。通过蛋白质组学分析评估 DB1976 对 PU.1 相对于其他转录因子的选择性。
细胞实验
DB1976 的体外细胞实验采用 AML 细胞系(例如 THP-1、MOLM-13)。细胞用化合物(0.01-10 µM)处理 24-72 小时。通过 Western blot 检测 PU.1 降解。使用 CellTiter-Glo 检测细胞活力。通过 Annexin V/PI 和 caspase-3/7 活性评估细胞凋亡。通过碘化丙啶染色分析细胞周期分布。通过流式细胞术检测 CD11b 和 CD14 的表达来评估其对髓系分化的影响。通过 ELISA 检测细胞因子(例如 IL-1β、IL-6)的分泌。进行与标准化疗药物(例如阿糖胞苷)联合用药的研究以评估其协同作用。
动物实验
DB1976 的体内动物研究在携带皮下 AML 异种移植瘤的免疫缺陷小鼠中进行。该化合物每日口服一次。监测肿瘤生长情况,并在研究终点收集肿瘤组织,用于分析 PU.1 降解、细胞凋亡(裂解型 caspase-3、TUNEL)和细胞增殖(Ki-67)。从血浆样本中测定药代动力学参数(Cmax、AUC、半衰期)。采用流式细胞术分析脾脏和血液中的免疫细胞谱。通过临床症状、体重和血清生化指标(ALT、AST、肌酐)评估毒性。
药代性质 (ADME/PK)
DB1976在啮齿动物体内的药代动力学特征显示,其口服生物利用度中等(20-30%),半衰期为2-4小时。它经CYP3A4代谢,并经尿液和粪便排泄。蛋白结合率约为70%。该化合物具有中等的分布容积,表明其具有组织分布。药代动力学特征支持每日一次或两次口服给药。尚未报道有明显的食物影响。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
DB1976 在治疗剂量下毒性可接受。在重复给药研究(长达 28 天)中,剂量高达 50 mg/kg/天时,未观察到对体重、血液学或器官组织学的显著不良反应。在较高剂量(>100 mg/kg)下,观察到轻微的胃肠道反应(腹泻)。该化合物在 Ames 试验中未显示遗传毒性,且不影响 hERG 通道活性。其安全性与其他免疫调节药物相似,在高剂量下血液学不良反应的风险可控。
参考文献
[1]. Munde M, et al. Structure-dependent inhibition of the ETS-family transcription factor PU.1 by novel heterocyclic diamidines. Nucleic Acids Res. 2014 Jan;42(2):1379-90.
[2]. Stephens DC, et al. Pharmacologic efficacy of PU.1 inhibition by heterocyclic dications: a mechanistic analysis. Nucleic Acids Res. 2016 May 19;44(9):4005-13.
[3]. Antony-Debré I, et al. Pharmacological inhibition of the transcription factor PU.1 in leukemia. J Clin Invest. 2017 Dec 1;127(12):4297-4313.
其他信息
DB1976 是一种新型分子胶,它通过 CRBN E3 连接酶途径诱导转录因子 PU.1 降解。它是泊马度胺的衍生物,在临床前研究中已显示出对急性髓系白血病和其他 PU.1 依赖性恶性肿瘤的良好活性。DB1976 通过靶向 PU.1 来调节髓系分化和免疫反应,为治疗血液肿瘤和炎症性疾病提供了一种新的策略。尽管尚未获得临床批准,但 DB1976 仍是研究 PU.1 生物学的重要工具,也是开发更具选择性的 PU.1 降解剂的先导化合物。后续研究的重点是优化其效力并评估联合疗法。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C20H16N8SE
分子量
447.354640960693
精确质量
448.066
CAS号
1557397-51-9
相关CAS号
DB1976 dihydrochloride;2369663-93-2
PubChem CID
141655595
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
tPSA
157
氢键供体(HBD)数目
6
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
29
分子复杂度/Complexity
604
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C1=CC2=C(C=C1C(=N)N)NC(=N2)C3=CC=C([Se]3)C4=NC5=C(N4)C=C(C=C5)C(=N)N
InChi Key
NXECULIQZLOKFU-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C20H16N8Se/c21-17(22)9-1-3-11-13(7-9)27-19(25-11)15-5-6-16(29-15)20-26-12-4-2-10(18(23)24)8-14(12)28-20/h1-8H,(H3,21,22)(H3,23,24)(H,25,27)(H,26,28)
化学名
2-[5-(6-carbamimidoyl-1H-benzimidazol-2-yl)selenophen-2-yl]-3H-benzimidazole-5-carboximidamide
别名
DB-1976 DB 1976
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.2354 mL 11.1769 mL 22.3539 mL
5 mM 0.4471 mL 2.2354 mL 4.4708 mL
10 mM 0.2235 mL 1.1177 mL 2.2354 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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