| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
|---|---|---|---|
| 1mg |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| 25mg |
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| 100mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
SF3B splicing
SF3b complex (spliceosome) [1] The compound competes with pladienolide for binding to SF3b complexes containing either wild-type or mutant SF3B1. [1] |
|---|---|
| 体外研究 (In Vitro) |
H3B-8800有效且优先杀死剪接体突变的上皮和血液肿瘤细胞。H3B-8800的这些杀伤作用是由于其与SF3b复合物的直接相互作用,如在编码SF3b成分的基因突变的耐药细胞中H3B-8800的活性损失所证明的。
H3B-8800 在竞争性结合实验中能有效结合并抑制含有野生型或突变型SF3B1的剪接体的剪接活性。[1] 在生化剪接实验中,它可剂量依赖性地抑制典型剪接和异常剪接。[1] 在一组胰腺癌细胞系中,用 H3B-8800 处理72小时仅导致SF3B1突变细胞系Panc05.04发生细胞死亡和caspase-3/7切割,而野生型细胞系不受影响。[1] 与同基因野生型细胞相比,它对携带SF3B1-K700E突变的K562细胞显示出优先的杀伤作用。[1] 在Panc05.04细胞中,H3B-8800 处理可调节典型和异常剪接,表现为成熟MBD4 mRNA水平降低、MBD4前mRNA积累以及突变SF3B1诱导的MAP3K7异常剪接减少。[1] 它在核提取物中抑制ATP依赖性的17S U2 snRNP复合物形成,表明其通过干扰SF3b复合物与分支点区域的相互作用来破坏剪接体组装前催化复合物的形成。[1] SF3B1 (R1074H) 或 PHF5A (Y36C) 的耐药突变会赋予对 H3B-8800 的耐药性,证实了其对SF3b复合物的选择性。[1] RNA-seq分析显示,H3B-8800 处理优先诱导短而富含GC的内含子滞留,特别是在编码剪接体组分(如U2AF2和RBM10)的基因中。[1] 它在K562细胞中剂量依赖性地降低U2AF2和SRPK1蛋白表达。[1] |
| 体内研究 (In Vivo) |
每天口服2或4 mg H3B-8800/kg体重(mg/kg)可减缓SF3B1K700E异种移植物的生长(P<0.003,双向方差分析,然后进行Dunnett多重比较试验),但对SF3B1WT异种移植物没有影响。尽管8 mg/kg的剂量确实减缓了SF3B1WT肿瘤的生长,但它完全消除了SF3b1K000E肿瘤的生长(P<0.003)。b)。H3B-8800同样对携带编码SF3B1-K700E的内源性突变的人HNT-34急性髓系白血病(AML)细胞的异种移植物显示出显著的抗肿瘤活性。H3B-8800在携带SF3B1WT或SF3B1K700E异种移植物的小鼠的血浆和肿瘤中达到相似的浓度,并且H3B-8800以剂量依赖的方式调节规范剪接和异常剪接。根据H3B-8800的药代动力学特征,早在治疗后1小时就观察到剪接调节,并且在治疗后24小时内剪接恢复到预处理水平。
在携带同基因K562细胞异种移植瘤的NSG小鼠中,每日口服 H3B-8800(2或4 mg/kg)能显著减缓SF3B1-K700E突变瘤的生长,但对野生型瘤无影响。8 mg/kg的剂量可完全抑制SF3B1-K700E突变瘤的生长,并减缓野生型瘤的生长。[1] H3B-8800 对携带内源性SF3B1-K700E突变的人HNT-34 AML细胞异种移植瘤显示出显著的抗肿瘤活性。[1] 在携带SF3B1突变的AML患者来源异种移植瘤(PDX)小鼠中,用 H3B-8800(8 mg/kg)治疗10天可显著降低白血病负荷,而在野生型PDX受体中效果甚微。[1] 在携带SRSF2突变的CMML PDX模型中观察到类似的优先活性,H3B-8800 治疗仅在SRSF2突变模型中降低外周血和器官中的人源白血病负荷,并缩小脾脏和肝脏。[1] 剪接调节(成熟mRNA减少和前mRNA积累)在给药后1小时即可在肿瘤中观察到,并在24小时内恢复到基线水平。[1] |
| 酶活实验 |
从过表达Flag标记的SF3B1的293F细胞制备的核提取物中免疫沉淀SF3B复合物。首先,通过孵育80μg抗SF3B1抗体(MBL International D221-3,anti-Sap155单克隆抗体)和24 mg抗小鼠PVT闪烁邻近测定(SPA)珠(PerkinElmer)30分钟,将抗体批量固定在珠上。离心(14000 r.p.m.,在4°C下5分钟)后,将抗体-珠混合物重悬于补充有PhosSTOP磷酸酶抑制剂混合物(Roche)和cOmplete ULTRA蛋白酶抑制剂混合物(罗氏)的PBS中。通过用磷酸酶和蛋白酶抑制剂将40 mg稀释到总体积为16 ml的PBS中制备核提取物,并将混合物离心(14000 r.p.m.,在4°C下离心10分钟)。将上清液转移到干净的管中,加入抗体-珠混合物并孵育2小时。通过离心收集珠,用PBS+0.1%Triton X-100洗涤两次,并用4.8ml PBS重悬。使用浆液和不同浓度的H3B-8800制备100μl结合反应。在室温下预培养15分钟后,加入Kotake等人20中使用的1nM 3H探针。将混合物在室温下孵育15分钟,并使用MicroBeta2平板计数器(PerkinElmer)读取发光信号。
竞争性结合实验使用从过表达Flag标记SF3B1的细胞的核提取物中免疫沉淀得到的SF3b复合物进行。将抗SF3B1抗体固定在珠子上,并与核提取物孵育。设置含有珠悬液和不同浓度 H3B-8800 的结合反应,然后加入放射性标记探针。通过测量发光信号来确定与Pladienolide结合的竞争情况。[1] 体外剪接反应实验使用核提取物和前mRNA底物(Ad2衍生或Ad2-ZDHHC16杂交体)进行。反应体系包含核提取物、前mRNA、对照RNA以及不同浓度的 H3B-8800 或DMSO,进行预孵育后加入剪接激活缓冲液(含ATP和MgCl2)。孵育后,淬灭反应并通过RT-qPCR分析以定量典型和异常剪接连接点。[1] U2 snRNP复合物组装实验使用耗尽ATP的核提取物进行。将提取物与或不与 H3B-8800 预孵育,然后与ATP、MgCl2、磷酸肌酸以及放射性标记的、与U2 snRNA分支点结合区互补的2′-O-甲基寡核苷酸孵育。纯化样品并在非变性琼脂糖凝胶上电泳以分离17S和12S U2 snRNP复合物。[1] |
| 细胞实验 |
胰腺癌症细胞以每孔750个细胞接种在384孔板中,并在第2天用化合物处理。将K562等基因细胞(K562-SF3B1K700E和K562-SF3 B1K700K)以每孔10000个细胞接种在96孔板中,4小时后用化合物处理。在指示的时间点使用CellTiter-Glo或Caspase-Glo 3/7(Promega)通过发光测量活细胞和凋亡细胞的相对数量。
使用胰腺癌细胞或K562同基因细胞,将其接种于多孔板中进行细胞活力和凋亡实验。用 H3B-8800 或载体处理细胞,并在指定时间点使用基于发光的检测试剂(CellTiter-Glo 或 Caspase-Glo 3/7)测量活力/凋亡。[1] 对于剪接分析,用 H3B-8800 处理细胞6小时,然后提取RNA并进行反转录。使用TaqMan低密度阵列(TLDA)或针对特定靶点(如MBD4、MAP3K7、U2AF2及异常连接点)的RT-qPCR引物-探针组来定量剪接事件。[1] 对处理过的K562同基因细胞的裂解物进行蛋白质印迹分析。蛋白质通过SDS-PAGE分离,转膜后使用针对U2AF2、SRPK1、MCL1以及内参(β-肌动蛋白或GAPDH)的抗体进行检测。[1] RNA-seq样本制备涉及用 H3B-8800 处理NALM-6或K562同基因细胞6小时,随后进行RNA分离、cDNA文库制备和测序。数据分析包括差异剪接事件、内含子滞留和基因表达变化。[1] |
| 动物实验 |
K562同源细胞系、HNT-34和K052异种移植模型疗效及药代动力学/药效学建模。
将1 × 10⁷个K562同源细胞、HNT-34细胞或K052细胞皮下植入6-8周龄雌性NSG或CB17-SCID小鼠的侧腹部。小鼠接受H3B-8800(10%乙醇、5% Tween-80、85%生理盐水)或载体对照治疗。在疗效研究中,小鼠每日口服给药,并监测直至达到以下任一终点:(i)肿瘤体积过大(最长径≥20 mm),每周测量三次(肿瘤体积采用椭球体公式计算:(长×宽²)/ 2);或(ii)出现任何健康问题,例如瘫痪或体重过度下降。采用双因素方差分析 (ANOVA) 和 Dunnett 多重比较检验分析研究期间载体组和 H3B-8800 治疗组肿瘤体积的差异。在药代动力学/药效学建模 (PK/PD) 研究中,小鼠接受单次给药,并在治疗后指定时间点(图 2 和图 3)收集肿瘤进行进一步分析。使用 RiboPure RNA 纯化试剂盒 (Ambion) 分离 RNA,并用于 TLDA 分析。所有小鼠实验均按照 H3 Biomedicine 机构动物护理和使用委员会批准的方案进行。在异种移植疗效研究中,将肿瘤细胞(例如,K562 同源细胞、HNT-34 细胞或 K052 细胞)皮下植入 6-8 周龄的雌性 NSG 或 CB17-SCID 小鼠体内。小鼠每日口服H3B-8800(配制于10%乙醇、5% Tween-80和85%生理盐水中)或载体对照。定期测量肿瘤体积,并监测小鼠直至达到终点标准(肿瘤体积过大或出现健康问题)。[1] 在药代动力学/药效学(PK/PD)研究中,小鼠单次口服H3B-8800,并在特定时间点收集肿瘤进行RNA分析(例如,TLDA),以评估剪接调控。[1] 通过将患者来源的造血细胞移植到亚致死剂量照射的NSGS小鼠体内,建立患者来源的异种移植(PDX)模型。一旦确认移植成功(外周血中人CD45+细胞>3%或血红蛋白≤11 g/dL),小鼠被随机分为两组,分别接受载体或H3B-8800(8 mg/kg,每日口服,连续10天)。末次给药2小时后处死小鼠,用于分析白血病负荷和器官浸润情况。[1] |
| 药代性质 (ADME/PK) |
口服给药后,携带SF3B1野生型或突变型异种移植瘤的小鼠血浆和肿瘤中H3B-8800的浓度相似。[1] 给药后1小时即可观察到肿瘤中剪接调控,并在24小时内恢复至治疗前水平,这与其药代动力学特征一致。[1]
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
H3B-8800 是由 H3 Biomedicine 公司开发的一种新型剪接体抑制剂。它具有优先杀伤剪接体突变癌细胞的优势,而其他剪接体抑制剂,例如普拉地诺内酯类似物 E7107,则不具备这种优先靶向性。H3B-8800 于 2017 年 8 月获得美国食品药品监督管理局 (FDA) 的孤儿药资格认定,目前正在进行治疗急性髓系白血病和慢性粒单核细胞白血病的临床试验。
剪接抑制剂 H3B-8800 是一种口服生物利用度高的剪接因子 3B 亚基 1 (SF3B1) 抑制剂,具有潜在的抗肿瘤活性。给药后,H3B-8800 可与 SF3B1 结合并阻断其活性。SF3B1 是一种核心剪接体蛋白,在多种癌细胞中发生突变。该物质通过阻止剪接体对mRNA的异常剪接来调节RNA剪接,阻断RNA错误剪接,增强正确的RNA剪接,并抑制某些肿瘤相关基因的表达。这导致细胞凋亡的诱导,并抑制肿瘤细胞增殖。在许多癌细胞中,核心剪接体蛋白,包括SF3B1、U2小核核糖核蛋白辅助因子1 (U2AF1)、富含丝氨酸/精氨酸的剪接因子2 (SRSF2) 和U2小核核糖核蛋白辅助因子亚基相关蛋白2 (ZRSR2),发生突变并异常激活,导致mRNA剪接失调。 作用机制 H3B-8800被认为与剪接体中SF3B复合物上类似于普拉地诺内酯的位点结合。一旦结合,H3B-8800 便会通过调节前体 mRNA 的加工过程,诱导短(<300 个核苷酸)富含 GC 的内含子保留增加。这些被内含子保留的 mRNA 序列随后被认为会通过无义介导的 mRNA 降解途径被降解。有研究表明,H3B-8800 的调节作用是通过破坏 SF3B 复合物对分支点序列的识别来实现的,因为 H3B-8800 保留的内含子中,分支点核苷酸对腺苷的偏好性总体降低,且与 SFB3 结合较弱的序列数量更多。研究发现,在 404 个编码剪接体蛋白的基因中,有 41 个基因含有富含 GC 的序列,这些序列的保留是由 H3B-8800 诱导的。这被认为是 H3B-8800 致死性特异性的关键,因为携带剪接体突变的细胞依赖于野生型剪接体组分的表达才能存活。由于癌细胞(例如骨髓增生异常综合征中的癌细胞)比宿主细胞更容易发生SF3B1突变,因此H3B-8800可用于优先靶向这些细胞,其作用机制是通过诱导关键剪接体组分前体mRNA中的内含子保留,导致无义成熟RNA的降解,最终因缺乏这些关键蛋白而导致细胞死亡。 药效学 H3B-8800优先靶向含有突变剪接因子3B1 (SF3B1)蛋白的剪接体复合物的细胞,通过调节内含子剪接增加癌细胞的死亡,而对含有野生型SF3B1的细胞的存活率影响甚微。在突变型和野生型细胞中,正常和异常的成熟mRNA均受到抑制。这种致死效应的选择性被认为是由突变型SF3B1的存在及其影响所致,而非突变蛋白相对于野生型蛋白的作用机制或效力改变所致[A32749]。由于SF3B1在癌症中经常发生突变,这使得药物能够优先靶向癌细胞而非宿主细胞。 H3B-8800是一种口服小分子剪接调节剂,可选择性靶向剪接体的SF3b复合物。[1] 它能优先杀死携带剪接体基因(例如SF3B1、SRSF2)突变的癌细胞,这些突变常见于骨髓增生异常综合征、白血病和某些实体瘤中。 [1] 其作用机制涉及优先保留短的、富含GC的内含子,尤其是在编码剪接体组分的基因中,从而加剧突变细胞中已存在的剪接缺陷,并导致选择性细胞死亡。[1] 与其他剪接调节剂(如E7107)相比,它表现出独特的序列特异性剪接调节特性。[1] 该研究支持H3B-8800在治疗具有RNA剪接因子突变的基因明确癌症方面的临床潜力。[1] |
| 分子式 |
C31H45N3O6
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|---|---|
| 分子量 |
555.705508947372
|
| 精确质量 |
555.33
|
| 元素分析 |
C, 67.00; H, 8.16; N, 7.56; O, 17.27
|
| CAS号 |
1825302-42-8
|
| 相关CAS号 |
1825302-42-8;
|
| PubChem CID |
92135969
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| 外观&性状 |
Yellow to orange solid
|
| 密度 |
1.2±0.1 g/cm3
|
| 沸点 |
710.6±60.0 °C at 760 mmHg
|
| 闪点 |
383.6±32.9 °C
|
| 蒸汽压 |
0.0±2.4 mmHg at 25°C
|
| 折射率 |
1.581
|
| LogP |
2.22
|
| tPSA |
112Ų
|
| 氢键供体(HBD)数目 |
2
|
| 氢键受体(HBA)数目 |
8
|
| 可旋转键数目(RBC) |
6
|
| 重原子数目 |
40
|
| 分子复杂度/Complexity |
928
|
| 定义原子立体中心数目 |
6
|
| SMILES |
O(C(N1CCN(C)CC1)=O)[C@H]1C=C[C@H](C)[C@@H](/C(=C/C=C/[C@@H](C)C2C=CC=CN=2)/C)OC(C[C@@H](CC[C@@]1(C)O)O)=O |t:12|
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| InChi Key |
YOIQWBAHJZGRFW-WVRLKXNASA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C31H45N3O6/c1-22(26-11-6-7-16-32-26)9-8-10-23(2)29-24(3)12-13-27(39-30(37)34-19-17-33(5)18-20-34)31(4,38)15-14-25(35)21-28(36)40-29/h6-13,16,22,24-25,27,29,35,38H,14-15,17-21H2,1-5H3/b9-8+,13-12+,23-10+/t22-,24+,25-,27+,29-,31-/m1/s1
|
| 化学名 |
(2S,3S,6S,7R,10R,E)-7,10-Dihydroxy-3,7-dimethyl-12-oxo-2-((R,2E,4E)-6-(pyridin-2-yl)hepta-2,4-dien-2-yl)oxacyclododec-4-en-6-yl 4-methylpiperazine-1-carboxylate
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| 别名 |
H3B-8800; H3B8800; RVT-2001; UNII-90YLS47BRX; RVT2001; 1825302-42-8; 90YLS47BRX; 1-Piperazinecarboxylic acid, 4-methyl-, (2S,3S,4E,6S,7R,10R)-7,10-dihydroxy-3,7-dimethyl-2-((1E,3E,5R)-1-methyl-5-(2-pyridinyl)-1,3-hexadien-1-yl)-12-oxooxacyclododec-4-en-6-yl ester; SCHEMBL17255784; EX-A8015; H3B 8800 [WHO-DD]; H3B 8800
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO: ≥ 100 mg/mL (~180 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 :Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.7995 mL | 8.9975 mL | 17.9950 mL | |
| 5 mM | 0.3599 mL | 1.7995 mL | 3.5990 mL | |
| 10 mM | 0.1800 mL | 0.8997 mL | 1.7995 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
![]() H3B-8800 modulates splicing of WT and mutant SF3B1 spliceosomesin vitroand preferentially kills SF3B1-mutant cells.Nat Med.2018May;24(4):497-504. th> |
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![]() H3B-8800 modulates splicing and selectively kills SF3B1-mutant leukemia cellsin vivo.Nat Med.2018May;24(4):497-504. td> |
![]() H3B-8800 demonstrates preferential activity on SRSF2-mutant leukemia in PDX mice.Nat Med.2018May;24(4):497-504. td> |