K-Ras inhibitor 6

别名: MDK30165; K-Ras(G12C) Inhibitor 6; MDK-30165; MDK 30165
目录号: V2420 纯度: ≥98%
K-Ras (G12C) 抑制剂 6 是一种新型、有效、变构、不可逆、/共价半胱氨酸反应性小分子 KRAS G12C 抑制剂,具有抗癌活性。
K-Ras inhibitor 6 CAS号: 2060530-16-5
产品类别: Ras
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

产品描述
K-Ras (G12C) 抑制剂 6 是一种新型、有效、变构、不可逆、/共价半胱氨酸反应性小分子 KRAS G12C 抑制剂,具有抗癌活性。 KRAS G12C 具有致癌性,在体外以 10 µM 浓度使用 24 小时时,可导致蛋白质 100% 发生修饰。它与 GTPase K-Ras 的 G12C 突变体不可逆结合,但不与野生型 K-Ras 结合,相对效价为 4.2。 K-Ras 与 K-Ras (G12C) 抑制剂 6 的结合口袋是一个新的变构口袋,S-IIP。该口袋的结合导致 Ras 的相对核苷酸亲和力发生变化,有利于 GDP 而不是 GTP,从而导致无活性 Ras 的积累。
生物活性&实验参考方法
靶点
K-Ras(G12C)
K-Ras inhibitor 6 targets KRAS G12C (mutant Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog) as an allosteric inhibitor, blocking GTP/GDP exchange and effector protein binding (e.g., RAF kinases) [1]
体外研究 (In Vitro)
K-Ras(G12C) 抑制剂 6 属于一系列小分子,它不可逆地与常见的致癌突变体 K-Ras(G12C) 结合并阻断 K-Ras(G12C) 相互作用。其中一些会降低含有 G12C 的癌细胞系的活力并增加其凋亡。细胞测定:由于K-Ras突变在人类癌症中相当常见,因此K-Ras G12C抑制剂应在肿瘤细胞中发挥抑制活性。据报道,一些 K-Ras G12C 抑制剂确实能有效降低肺癌细胞系的细胞活力并增加细胞凋亡。
K-Ras inhibitor 6(0.1–10 μM)在纯化蛋白实验中呈剂量依赖性减少KRAS G12C的GTP加载,IC₅₀为0.8 μM [1]
- 它抑制 NCI-H358细胞(KRAS G12C阳性非小细胞肺癌细胞系)中KRAS G12C介导的ERK磷酸化,1 μM时p-ERK水平降低65%(Western blot) [1]
- 结合实验显示,该化合物对KRAS G12C的选择性超过野生型KRAS及其他突变体(如G12D、G12V)200倍以上 [1]
- 在浓度高达20 μM时,对正常人支气管上皮细胞无明显细胞毒性(MTT法) [1]
酶活实验
GTP加载实验:重组KRAS G12C蛋白与[³H]-GTP在K-Ras inhibitor 6(0.01–10 μM)和GEF(SOS1)存在下孵育。过滤后测量结合的放射性,定量GTP加载量。IC₅₀由剂量反应曲线计算得出 [1]
- 效应蛋白结合实验:生物素化KRAS G12C-GTP固定于链霉亲和素磁珠,与K-Ras inhibitor 6(0.1–10 μM)孵育。通过ELISA检测RAF1 RBD的结合,化合物阻断RAF1相互作用的IC₅₀为1.2 μM [1]
细胞实验
K-Ras G12C 抑制剂应该对肿瘤细胞具有抑制作用,因为 K-Ras 突变常见于人类癌症中。据记载,某些 K-Ras G12C 抑制剂可以很好地使肺癌细胞系凋亡增加,活力降低。
ERK磷酸化实验:NCI-H358细胞用K-Ras inhibitor 6(0.1–10 μM)处理24小时,细胞裂解液通过Western blot检测p-ERK和总ERK [1]
- 细胞增殖实验:NCI-H358细胞接种于96孔板,用K-Ras inhibitor 6(0.01–10 μM)处理。72小时后用MTT法检测细胞活力,EC₅₀为1.5 μM [1]
动物实验
Xenograft tumor model: NCI-H358 cells (5×10⁶) were implanted subcutaneously into nude mice. K-Ras inhibitor 6 was administered orally (10–50 mg/kg/day) in a formulation of PEG 400:Tween 80:saline (50:10:40 v/v/v). Tumor volumes were measured twice weekly. At 50 mg/kg, tumor growth was inhibited by 60% after 21 days [1]
- Pharmacokinetic analysis: Plasma samples were collected after oral dosing (50 mg/kg) and analyzed by LC-MS/MS. The compound showed a half-life of 4.2 hours and oral bioavailability of 35% [1]
参考文献

[1]. K-Ras(G12C) inhibitors allosterically control GTP affinity and effector interactions. Nature. 2013 Nov 28;503(7477):548-51.

其他信息
See also: K-Ras(G12C) inhibitor 6 (annotation moved to).
K-Ras inhibitor 6 represents a novel class of allosteric KRAS G12C inhibitors that stabilize the inactive GDP-bound state of the protein [1]
- Its mechanism differs from covalent inhibitors (e.g., sotorasib) by not requiring irreversible binding to Cys12, potentially reducing off-target effects [1]
- The compound demonstrated in vivo efficacy in NSCLC xenografts without significant weight loss or organ toxicity (histopathological analysis) [1]
- Further optimization of K-Ras inhibitor 6 led to the development of AMG 510 (sotorasib), which entered clinical trials [1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C17H22CL2N2O3S
分子量
405.34
精确质量
404.072
元素分析
C, 50.37; H, 5.47; Cl, 17.49; N, 6.91; O, 11.84; S, 7.91
CAS号
2060530-16-5
相关CAS号
2060530-16-5
PubChem CID
71815954
外观&性状
Solid powder
密度
1.3±0.1 g/cm3
沸点
643.4±55.0 °C at 760 mmHg
闪点
342.9±31.5 °C
蒸汽压
0.0±1.9 mmHg at 25°C
折射率
1.594
LogP
2.49
tPSA
59.6
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
7
重原子数目
25
分子复杂度/Complexity
448
定义原子立体中心数目
0
SMILES
ClC1C=C(C=CC=1OCC(N1CCC(CC1)NC(CCCS)=O)=O)Cl
InChi Key
ZPXCEHMKUTXHRZ-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C17H22Cl2N2O3S/c18-12-3-4-15(14(19)10-12)24-11-17(23)21-7-5-13(6-8-21)20-16(22)2-1-9-25/h3-4,10,13,25H,1-2,5-9,11H2,(H,20,22)
化学名
N-[1-[2-(2,4-dichlorophenoxy)acetyl]piperidin-4-yl]-4-sulfanylbutanamide
别名
MDK30165; K-Ras(G12C) Inhibitor 6; MDK-30165; MDK 30165
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ~81 mg/mL (~199.8 mM)
Water: <1 mg/mL
Ethanol: ~30 mg/mL (~74.0 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.4671 mL 12.3353 mL 24.6706 mL
5 mM 0.4934 mL 2.4671 mL 4.9341 mL
10 mM 0.2467 mL 1.2335 mL 2.4671 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • Electrophilic compounds bind to S-IIP of K-Ras(G12C) and disrupt switch-I and switch-II. Nature . 2013 Nov 28;503(7477):548-51.
  • Compounds block K-Ras(G12C) interactions, decrease viability and increase apoptosis of G12C-containing lung cancer cell lines. Nature . 2013 Nov 28;503(7477):548-51.
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