| 规格 | 价格 | |
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| 500mg | ||
| 1g | ||
| Other Sizes |
| 靶点 |
WDR5 (WD repeat domain 5 protein) – MLL (Mixed Lineage Leukemia) protein-protein interaction. [1]
Binding affinity to WDR5: IC50 = 0.90 ± 0.20 nM, Ki < 1 nM (determined by a fluorescence polarization-based competitive binding assay). [1] The primary target of MM-589 is WDR5, functioning by blocking the interaction between WDR5 and MLL proteins. WDR5 is a core component of the H3K4 histone methyltransferase complex, interacting with MLL1-MLL4 family members and playing key roles in histone H3K4 trimethylation, chromatin remodeling, and transcriptional activation of target genes. MM-589 binds to WDR5 with extremely high affinity, with an IC50 of 0.90 nM (Ki < 1 nM), competitively occupying the MLL binding interface on WDR5 to specifically inhibit MLL1 methyltransferase activity. |
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| 体外研究 (In Vitro) |
- MLL HMT活性抑制: 在一项无细胞AlphaLISA功能测定中,MM-589能有效抑制MLL核心复合物的组蛋白H3赖氨酸4甲基转移酶活性,IC50值为12.7 ± 1.5 nM。 [1]
- 酶选择性: 在先前发表的HMT测定中,化合物MM-589有效抑制MLL HMT活性(IC50 = 12.7 nM),但对其他SET1家族成员(包括MLL2, MLL3, MLL4, SET1a和SET1b)的HMT活性,在高达100 μM的浓度下,没有或仅有极小的影响。 [1] - 对MLL易位白血病细胞的生长抑制: MM-589能有效且选择性地抑制携带MLL易位的人急性白血病细胞系的细胞生长。 [1] - 在MOLM-13细胞(携带MLL-AF9融合蛋白)中,4天处理后的细胞生长抑制IC50值为0.21 ± 0.02 μM(96孔板,10,000细胞/孔)。 [1] - 在MV4-11细胞(携带MLL-AF4融合蛋白)中,4天处理后的细胞生长抑制IC50值为0.25 ± 0.01 μM(96孔板,10,000细胞/孔)。 [1] - 该化合物对这些携带MLL易位的细胞系显示出超过30倍的选择性,相比之下,对不携带MLL易位的HL-60白血病细胞系的IC50值为8.56 ± 1.14 μM。 [1] - 长期处理效果: 在7天处理中(起始密度50,000细胞/mL于24孔板,第4天重新加药),MM-589在MOLM-13和MV4-11细胞系中均能达到>95%的最大细胞生长抑制率,而4天处理的最大抑制率约为75%。随着处理时间延长,IC50值提高了2-3倍。 [1] - 立体特异性: MM-589的对映异构体(化合物19,苯甘氨酸残基的手性中心由D-构型变为L-构型)在MOLM-13和MV4-11细胞中的IC50值分别为14.3 μM和35.0 μM,其效力比MM-589低50-100倍以上。 [1] |
| 体内研究 (In Vivo) |
MM-589 TFA盐在动物模型中显示出体内抗白血病活性。作为WDR5-MLL相互作用的强效抑制剂,MM-589可有效抑制MLL重排白血病细胞在小鼠体内的扩增。研究表明,具有改善药代动力学特性的MM-589优化衍生物有望进入临床研究。与MM-401相比,MM-589因其改进的细胞通透性和代谢稳定性,在体内研究中表现出更优的药效学特征。据报道,MM-589代表了迄今为止报道的最强效WDR5-MLL相互作用抑制剂,进一步优化可能产生新型急性白血病治疗方法。
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| 酶活实验 |
- 基于荧光偏振的WDR5竞争性结合测定: 为测定化合物与WDR5的结合亲和力,使用了基于荧光偏振的竞争性结合测定。将5 μL溶于DMSO的待测化合物溶液加入120 μL预孵育的复合物溶液中,该复合物溶液含有N端带His标签的WDR5蛋白(残基24-334)和S-FAM标记的示踪剂,溶于测定缓冲液(0.1 M磷酸盐,25 mM KCl,0.01% Triton,pH 6.5)中。WDR5和示踪剂的终浓度分别为4 nM和0.6 nM。将板在室温下于摇床上孵育3小时,然后使用酶标仪测量mP值。使用先前描述的公式计算Ki值。 [1]
- 无细胞AlphaLISA MLL HMT功能测定: 使用均相AlphaLISA测定法评估对MLL HMT活性的抑制。使用重组MLL核心复合物(包含MLL, WDR5, ASH2L, RbBP5, DPY30)和重组核小体。将2.5 μL溶于含4% DMSO的测定缓冲液中的系列稀释化合物和5 μL MLL复合物溶液加入384孔板中,轻轻摇晃孵育30分钟。然后加入2.5 μL SAM/核小体混合物,使MLL复合物、SAM和核小体的终浓度分别为5 nM、200 nM和3 nM,DMSO终浓度为1%。甲基化反应在避光条件下进行120分钟。加入5 μL高盐终止缓冲液终止反应,持续15分钟。随后,加入5 μL含有抗-H3K4me1/2 AlphaLISA受体珠和生物素化抗-H3(C端)抗体的检测缓冲液混合物,孵育1小时。最后,加入5 μL链霉亲和素标记的供体珠,孵育30分钟。使用酶标仪在激发波长680 nm和发射波长615 nm处读取信号。使用Graphpad Prism软件,通过将荧光强度对化合物浓度进行非线性回归拟合(S形剂量反应曲线)来确定IC50值。[1] |
| 细胞实验 |
- 细胞活力测定(4天处理): 为评估细胞生长抑制,将MOLM-13、MV4-11或HL-60白血病细胞以1 x 10⁴细胞/孔的密度接种于96孔板中。细胞用不同浓度的待测化合物处理4天。培养液中DMSO的终浓度为0.2%。使用WST-8细胞增殖检测试剂盒,按照制造商说明书测定细胞活力。使用Prism软件,与DMSO对照相比,计算50%细胞生长抑制的IC50值。实验进行三次独立重复,每次三个复孔。 [1]
- 长期细胞活力测定(7天处理): 将MOLM-13和MV4-11细胞系以5 x 10⁴细胞/mL的密度接种于24孔板中(2 mL/孔),并用相关浓度的MM-589处理。在第4天,使用WST-8测定法测量细胞活力。然后,将每个孔中10%的活细胞转移到含有相应浓度化合物的新鲜制备培养基中,再培养3天。在第7天,确定每个处理组的细胞活力。[1] |
| 动物实验 |
动物模型:使用免疫缺陷小鼠(NSG或NOD/SCID小鼠),通过尾静脉注射MLL重排白血病细胞(如MLL-AF9细胞)构建播散性白血病模型。
给药方案:MM-589 TFA通过静脉注射给药。配制方法参考:可配制于10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween-80 + 45%生理盐水的混合溶剂中。
药效评估:通过生物发光成像监测肿瘤负荷,记录生存期(Kaplan-Meier分析),通过流式细胞术检测外周血和骨髓中白血病细胞(hCD45⁺)比例。
毒性评估:监测动物体重变化、行为表现及外周血细胞计数,评估对正常造血功能的影响。
数据分析:比较治疗组与对照组的生存期差异和肿瘤负荷变化。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
MM-589 TFA盐作为大环肽模拟物的三氟乙酸盐形式,具有良好的理化性质。其分子式为C₃₀H₄₅F₃N₈O₇,分子量为686.72。溶解性方面,该化合物在DMSO中可溶解(25 mg/mL,需超声和加热至60°C助溶),在水相缓冲液中溶解度有限。储存条件:粉末在-20°C避光条件下可稳定保存3年;溶液在-80°C避光条件下可稳定保存6个月,在-20°C条件下可保存1个月。与线性肽MM-101相比,MM-589通过环化策略显著提高了代谢稳定性和细胞通透性。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
根据安全数据表(MSDS),MM-589 TFA盐未被归类为危险物质或混合物,GHS标签不适用。在致癌性方面:NTP未将其列为致癌物;IARC未将其列为致癌物;OSHA未将其列为监管物质;ACGIH未将其列入。该产品的毒理学效应尚未被系统研究。在细胞水平,MM-589对正常骨髓细胞无明显毒性作用,仅特异性抑制MLL重排白血病细胞的增殖。操作时应遵守标准实验室安全规范,避免释放到环境中。MM-589 TFA盐纯度≥98%,仅供科学研究使用,不适用于人体或兽医用途。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
- MM-589 对应研究中的化合物18。其合成方法涉及固相肽合成、烯烃复分解环化、催化氢化和保护基团的脱除。详细的合成路线见论文中的方案4和方案5。[1]
- MM-589与WDR5复合物的共晶结构被解析,分辨率为1.64 Å(PDB代码5VFC)。该结构显示,MM-589通过保守的氢键网络和疏水相互作用结合到WDR5的WD40螺旋桨的中心通道。与早期类似物(化合物2的n=4,化合物16的n=6)相比,MM-589(n=2)更小的环尺寸形成了更紧凑的结构,促进了最佳的分子内氢键形成并降低了构象灵活性,这有助于其高结合亲和力。[1] - 研究发现,在MV4-11和MOLM-13细胞系中,化合物抑制MLL HMT活性的效力与其抑制细胞生长的效力之间存在良好的相关性。[1] - 该化合物在细胞培养基中可稳定存在至少7天。[1] |
| 分子式 |
C30H45F3N8O7
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|---|---|
| 分子量 |
686.722917318344
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| 精确质量 |
686.336
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| 元素分析 |
C, 52.47; H, 6.61; F, 8.30; N, 16.32; O, 16.31
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| CAS号 |
2097887-21-1
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| 相关CAS号 |
2097887-20-0;2097887-21-1 (TFA salt);
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| PubChem CID |
132585206
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| 外观&性状 |
White to off-white solid at room temperature
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| tPSA |
233
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| 氢键供体(HBD)数目 |
8
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| 氢键受体(HBA)数目 |
11
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| 可旋转键数目(RBC) |
9
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| 重原子数目 |
48
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| 分子复杂度/Complexity |
1050
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| 定义原子立体中心数目 |
4
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| SMILES |
CC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C(=O)NCC[C@@](C(=O)N[C@H](C(=O)N1)CCCNC(=NC)N)(C)NC(=O)C(C)C)C2=CC=CC=C2.C(=O)(C(F)(F)F)O
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| InChi Key |
NARXNZHWAWPJIY-HTCBAMNXSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C28H44N8O5.C2HF3O2/c1-6-19-23(38)35-21(18-11-8-7-9-12-18)25(40)31-16-14-28(4,36-22(37)17(2)3)26(41)34-20(24(39)33-19)13-10-15-32-27(29)30-5;3-2(4,5)1(6)7/h7-9,11-12,17,19-21H,6,10,13-16H2,1-5H3,(H,31,40)(H,33,39)(H,34,41)(H,35,38)(H,36,37)(H3,29,30,32);(H,6,7)/t19-,20-,21+,28+;/m0./s1
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| 化学名 |
N-[(3R,6S,9S,12R)-6-ethyl-12-methyl-9-[3-[(N'-methylcarbamimidoyl)amino]propyl]-2,5,8,11-tetraoxo-3-phenyl-1,4,7,10-tetrazacyclotetradec-12-yl]-2-methylpropanamide;2,2,2-trifluoroacetic acid
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| 别名 |
MM589 (racemic mixture ) (TFA); MM-589 (racemic mixture ) (TFA)
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
H2O: 40 mg/mL (58.3 mM)
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| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 :Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.4562 mL | 7.2810 mL | 14.5620 mL | |
| 5 mM | 0.2912 mL | 1.4562 mL | 2.9124 mL | |
| 10 mM | 0.1456 mL | 0.7281 mL | 1.4562 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。