5'-Ethynyl-2'-deoxycytidine

别名: 5-乙炔基-2'-脱氧胞苷;5-Ethynyl-2'-deoxycytidine 5-乙炔基-2'-脱氧胞苷;5-乙炔-2-脱氧胞苷;5-乙炔基-2 -脱氧胞苷;5-乙炔基-2‘-脱氧胞苷;5-乙炔基-2''-脱氧胞苷;5-乙炔基-2'-去氧胞苷;2'-脱氧-5-乙炔基胞苷
目录号: V102932
5'-Ethynyl-2'-deoxycytidine 是一种 HSV 抑制剂,可抑制 HSV-1 在原代兔肾细胞中的细胞病变作用,MIC 为 0.2 μg/mL。
5'-Ethynyl-2'-deoxycytidine CAS号: 69075-47-4
产品类别: HSV
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
25mg
50mg
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产品描述
5'-乙炔基-2'-脱氧胞苷是一种HSV抑制剂,能以0.2 μg/mL的MIC值抑制HSV-1在原代兔肾细胞中的细胞病变效应。5'-乙炔基-2'-脱氧胞苷还能以64.5 μg/mL的IC50值抑制白血病L1210细胞的增殖。
5'-乙炔基-2'-脱氧胞苷(CAS号:69075-47-4)是一种合成核苷类似物,因其在抗病毒治疗(尤其是抗单纯疱疹病毒(HSV)治疗)方面的潜力而备受关注。它也被称为5-EdC,是一种胞苷衍生物,其核碱基的5位连接有一个乙炔基。该化合物能抑制HSV-1复制,并且对白血病细胞也具有抗增殖活性。
生物活性&实验参考方法
靶点
5'-Ethynyl-2'-deoxycytidine targets herpes simplex virus (HSV) by inhibiting viral replication. Its primary antiviral target is the HSV-1 KOS strain. Additionally, the compound inhibits the proliferation of leukemia L1210 cells, indicating activity against cellular targets involved in DNA synthesis and cell division.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,5'-乙炔基-2'-脱氧胞苷能以0.2 μg/mL的最低抑菌浓度(MIC)抑制HSV-1在原代兔肾细胞中的细胞病变效应。它还能以64.5 μg/mL的IC50抑制白血病L1210细胞的增殖。这些活性表明其在细胞模型中具有抗病毒和抗增殖的双重特性。
体内研究 (In Vivo)
现有文献中关于5'-乙炔基-2'-脱氧胞苷体内活性的数据并不多见。大多数已报道的研究集中于其体外抗病毒和抗增殖作用。作为一种核苷类似物,它预计需要磷酸化成活性三磷酸形式才能发挥作用,这与其他核苷类抗病毒药物类似。
酶活实验
5'-乙炔基-2'-脱氧胞苷的非细胞酶活性测定通常涉及评估其与病毒DNA聚合酶或细胞DNA聚合酶的相互作用。该化合物磷酸化为三磷酸形式后,可使用纯化的酶、放射性标记的核苷酸和模板-引物DNA底物,在无细胞体系中评估其抑制聚合酶活性的能力。抑制作用通过测量标记核苷酸掺入新生DNA链的量来量化。
细胞实验
5'-乙炔基-2'-脱氧胞苷的体外细胞活性测定包括培养感染HSV-1的兔原代肾细胞。监测细胞病变效应,并将完全抑制病毒诱导的细胞损伤的最低浓度确定为最小抑菌浓度(MIC)。对于抗增殖活性,将白血病L1210细胞培养于生长培养基中,用不同浓度的化合物处理,并在48-72小时后测量细胞活力以确定IC50值。
动物实验
5'-乙炔基-2'-脱氧胞苷的具体体内动物研究方案尚不完善。基于其作为核苷类似物的作用机制,潜在的体内研究可采用HSV感染动物模型(例如,HSV感染的小鼠或豚鼠模型)来评估其抗病毒疗效,或采用荷瘤小鼠模型来评估其抗肿瘤活性。给药途径和剂量方案均可采用标准方法。
药代性质 (ADME/PK)
现有文献对5'-乙炔基-2'-脱氧胞苷的药代动力学性质描述尚不充分。作为一种分子量为251.24的核苷类似物,其水溶性预计中等。与其他核苷类似物一样,它可能受到核苷磷酸化酶和脱氨酶的代谢降解,并且其细胞摄取可能通过核苷转运蛋白进行。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
关于5'-乙炔基-2'-脱氧胞苷的毒理学数据报道不多。该化合物仅供研究使用,尚未获准用于人体治疗。操作过程中应遵守标准安全预防措施。其对L1210白血病细胞的抗增殖活性提示其可能对快速分裂的细胞具有细胞毒性,这在任何治疗开发中都应予以考虑。
参考文献

[1]. Antiviral, antimetabolic, and cytotoxic activities of 5-substituted 2'-deoxycytidines. Mol Pharmacol. 1982 Jan;21(1):217-23.

其他信息
细胞复制活性的标志;原始结构
5'-乙炔基-2'-脱氧胞苷(5-EdC)主要是一种用于抗病毒和抗癌研究的工具化合物。其乙炔基允许潜在的点击化学应用。该化合物还被用于监测DNA合成和细胞增殖,当其被纳入DNA中时,可以可视化细胞周期进程并识别增殖细胞。它不是FDA批准的药物,且没有市场授权。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C11H13N3O4
分子量
251.24
精确质量
251.091
CAS号
69075-47-4
PubChem CID
15036533
外观&性状
Solid powder
熔点
190 °C(dec.)
LogP
0
tPSA
111.59
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
18
分子复杂度/Complexity
476
定义原子立体中心数目
3
SMILES
O1[C@]([H])(C([H])([H])O[H])[C@@]([H])(C([H])([H])[C@]1([H])N1C(N=C(C(C#C[H])=C1[H])N([H])[H])=O)O[H]
InChi Key
HMJSYXIPNSASJY-DJLDLDEBSA-N
InChi Code
InChI=1S/C11H13N3O4/c1-2-6-4-14(11(17)13-10(6)12)9-3-7(16)8(5-15)18-9/h1,4,7-9,15-16H,3,5H2,(H2,12,13,17)/t7-,8+,9+/m0/s1
化学名
4-amino-5-ethynyl-1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidin-2-one
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

Note: (1). 本产品在运输和储存过程中需避光(避免光照)。  (2). 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气下),避免暴露在潮湿环境中。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.9803 mL 19.9013 mL 39.8026 mL
5 mM 0.7961 mL 3.9803 mL 7.9605 mL
10 mM 0.3980 mL 1.9901 mL 3.9803 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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