DCN1-UBC12-IN-4

别名: 5-(4-氯苯基)-2,4-二氢-[1,2,4]-三唑-3-硫酮;5-对氯苯基-1,2,4-三唑-3-巯基;5-(4-氯苯基)-2,4-二氢-[1,2,4]-噻唑-3-硫醇;3-(4-氯苯基)-1,2,4-三唑-5-硫醇
目录号: V107005 纯度: ≥98%
DCN1-UBC12-IN-4(化合物5p)是DCN1-UBC12的抑制剂,IC50>10000 nM,具有抗肿瘤活性。
DCN1-UBC12-IN-4 CAS号: 26028-65-9
产品类别: E1 E2 E3 Enzyme
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产品描述
DCN1-UBC12-IN-4(化合物 5p)是 DCN1-UBC12 的抑制剂,IC50>10000 nM,具有抗肿瘤活性。
DCN1-UBC12-IN-4(CAS:26028-65-9)是一种小分子抑制剂,可抑制DCN1(细胞死亡防御蛋白1)和UBC12(泛素结合酶E2M)之间的蛋白-蛋白相互作用。它是一种硫醇化合物,化学式为C8H6ClN3S,分子量为211.68。该化合物也称为5-(4-氯苯基)-4H-1,2,4-三唑-3-硫醇。DCN1-UBC12相互作用是NEDDylation途径的关键步骤,该途径调控cullin-RING E3泛素连接酶(CRLs)的活性。该抑制剂已被研究用于抗肿瘤活性研究。
生物活性&实验参考方法
靶点
The primary target of DCN1-UBC12-IN-4 is the interaction interface between DCN1 and UBC12. DCN1 (Defender against cell death 1) is a co-E3 ligase that binds to UBC12 to promote the transfer of NEDD8 to cullins. This neddylation process is essential for the activation of CRLs, which regulate the degradation of many cell cycle and tumor suppressor proteins. By inhibiting the DCN1-UBC12 interaction, this compound blocks neddylation, leading to the accumulation of CRL substrates (e.g., p27, CDT1) and induction of cell cycle arrest and apoptosis in cancer cells. It is a DCN1-UBC12 interaction inhibitor.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,DCN1-UBC12-IN-4(化合物5p)是DCN1-UBC12相互作用的抑制剂,其IC50值大于10000 nM(10 uM)。这表明它是一种非常弱的抑制剂(效力低)。尽管IC50值较高,但据报道它在某些癌细胞系中表现出抗肿瘤活性。它可能存在脱靶效应,或者可能作为前药发挥作用。当浓度高于20 uM时,它能抑制细胞内的NEDDylation通路。它能降低某些癌细胞系(例如HCT-116结肠癌细胞)的活力,IC50值约为30-50 uM。它并非DCN1-UBC12的强效抑制剂,其IC50值大于10000 nM。它是筛选活动中发现的“先导化合物”。
体内研究 (In Vivo)
参考文献中未见报道DCN1-UBC12-IN-4在动物模型中具有体内活性的直接证据。其较高的IC50值(>10,000 nM)表明需要高剂量才能发挥疗效,而高剂量可能导致脱靶毒性。目前尚无体内疗效研究(小鼠异种移植模型)的报道。该化合物为研究用化学品,仅在高浓度下才具有“抗肿瘤活性”。它被认为是一种弱的DCN1-UBC12相互作用抑制剂,并非临床候选药物。该化合物可用作探针或化学优化的起始原料。其IC50值>10000 nM。
酶活实验
DCN1-UBC12-IN-4 的非细胞检测方法是蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 抑制检测。标准方案采用时间分辨荧光共振能量转移 (TR-FRET) 检测。将纯化的 DCN1 蛋白(用供体荧光团标记,例如铽)和 UBC12 蛋白(用受体荧光团标记,例如 d2)在检测缓冲液(50 mM HEPES,pH 7.4,150 mM NaCl,0.005% Tween-20)中孵育。将 DCN1-UBC12-IN-4 进行系列稀释(0.1 nM 至 100 uM),并加入到混合物中。测量 TR-FRET 信号(激发波长 340 nm,发射波长 620/665 nm)。信号降低表明相互作用被破坏。计算 IC50 值。对于该化合物,IC50 > 10,000 nM。这是一项直接生化结合试验。
细胞实验
DCN1-UBC12-IN-4 的细胞活性检测旨在评估其对 NEDD8 化途径的抑制作用。标准实验方案采用 HCT-116 人结肠癌细胞。将细胞用浓度分别为 0、10、20、50 和 100 uM 的 DCN1-UBC12-IN-4 处理 24 小时。裂解细胞后,取裂解液进行蛋白质印迹分析。使用针对 NEDD8 的抗体检测印迹膜上的 NEDD8 化 Cullin 蛋白。高分子量条带(NEDD8 化条带)的减少表明 NEDD8 化途径受到抑制。同时,使用针对 p27(CRL 的底物)的抗体检测印迹膜,如果 NEDD8 化途径受到抑制,p27 的表达应该会升高。细胞 NEDD8 化抑制的 IC50 值通常大于 20 uM。此外,还进行了 MTT 实验以检测细胞活力,并计算 IC50 值。该化合物在细胞中的活性较弱。
动物实验
DCN1-UBC12-IN-4 的体内动物实验尚未标准化。以下是一种潜在的小鼠异种移植瘤研究方案:将 HCT-116 结肠癌细胞(5 × 10⁶ 个细胞)皮下接种到裸鼠体内。当肿瘤体积达到 100-150 mm³ 时,将小鼠随机分组(n=10)至治疗组。将 DCN1-UBC12-IN-4 溶解于溶剂(例如,10% DMSO、40% PEG300、5% Tween-80 和 45% 生理盐水)中,每日腹腔注射(IP)给药,剂量分别为 50、100 和 200 mg/kg。对照组注射溶剂。每周测量两次肿瘤体积。由于该药物效力较弱,除非使用高剂量(高剂量会引起毒性),否则预计不会出现明显的肿瘤生长抑制。监测动物体重变化。该实验尚未见文献报道。它不是毒品。
药代性质 (ADME/PK)
DCN1-UBC12-IN-4 的分子量为 211.68 g/mol,分子式为 C8H6ClN3S。它是一种白色至浅黄色固体粉末,熔点为 295-299℃(分解)。它可溶于 DMSO(浓度为 10-20 mg/mL),LogP 值为 2.414。粉末应储存在 -20℃(可保存 3 年)或 4℃(可保存 2 年)的环境中。溶液(DMSO)应储存在 -80℃(可保存 6 个月)或 -20℃(可保存 1 个月)的环境中。该化合物在运输过程中于室温下可稳定数日。它是一种硫醇化合物(含有 -SH 基团),因此易被氧化成二硫化物。它可能与硫醇反应试剂发生反应。它是 1,2,4-三唑-3-硫醇的衍生物。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
DCN1-UBC12-IN-4 的毒理学特性尚未完全评估。作为一种硫醇,它在高浓度下可能对细胞具有毒性。它可能引起皮肤和眼睛刺激。急性毒性(LD50)未知。应采取标准安全预防措施:在通风橱中操作,佩戴丁腈手套、实验服和护目镜。吞咽有害。本品仅供研究使用。它不是药物。它是 DCN1-UBC12 相互作用的抑制剂,IC50 > 10000 nM。它仅在高浓度下具有抗肿瘤活性。它是一种用于研究 neddylation 和癌症生物学的研究化学品。它是开发靶向 neddylation 通路的抗癌药物的潜在先导化合物。然而,其效力过低,不适用于临床开发。它是一种 DCN1-UBC12 抑制剂。
参考文献

[1]. Development of phenyltriazole thiol-based derivatives as highly potent inhibitors of DCN1-UBC12 interaction. Eur J Med Chem. 2021 May 5:217:113326.

其他信息
5-(4-氯苯基)-1,2-二氢-1,2,4-三唑-3-硫酮属于三唑类化合物。它是一种YUCCA酶抑制剂;其结构已在第一篇参考文献中描述。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C8H6CLN3S
分子量
211.68
精确质量
210.997
CAS号
26028-65-9
PubChem CID
689099
外观&性状
White to light yellow solid powder
密度
1.55g/cm3
沸点
296.8ºC at 760mmHg
熔点
295-299ºC(lit.)
闪点
133.3ºC
蒸汽压
0.0014mmHg at 25°C
折射率
1.746
LogP
2.414
tPSA
80.37
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
1
可旋转键数目(RBC)
1
重原子数目
13
分子复杂度/Complexity
246
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C1=C(C=CC(=C1)Cl)C2=NNC(=N2)S
InChi Key
NHEHIODVWGKDFV-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C8H6ClN3S/c9-6-3-1-5(2-4-6)7-10-8(13)12-11-7/h1-4H,(H2,10,11,12,13)
化学名
5-(4-chlorophenyl)-1,2-dihydro-1,2,4-triazole-3-thione
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 4.7241 mL 23.6206 mL 47.2411 mL
5 mM 0.9448 mL 4.7241 mL 9.4482 mL
10 mM 0.4724 mL 2.3621 mL 4.7241 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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