N-Me-Thalidomide 4-fluoride

目录号: V107155 纯度: ≥98%
N-Me-沙利度胺 4-氟化物 I 是 E3 连接酶的配体,可用于合成抗炎剂 70。
N-Me-Thalidomide 4-fluoride CAS号: 2244520-92-9
产品类别: Ligands for E3 Ligase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
N-甲基沙利度胺 4-氟化物 I 是 E3 连接酶的配体,可用于合成抗炎剂 70。
N-甲基沙利度胺4-氟化物(CAS:2244520-92-9)是一种用于合成蛋白水解靶向嵌合体(PROTACs)的化学结构单元。具体而言,它是E3泛素连接酶的配体,特别是Cereblon (CRBN) E3连接酶复合物的配体,该复合物与药物沙利度胺的作用靶点相同。该化合物具有类似沙利度胺的核心结构,并在4位引入了甲基(N-Me)基团和氟原子。它是一种固体粉末,仅用于研究目的,旨在开发针对炎症和癌症的靶向蛋白降解疗法。
生物活性&实验参考方法
靶点
Cereblon
The primary molecular target of N-Me-Thalidomide 4-fluoride is the E3 ubiquitin ligase complex, specifically the Cereblon (CRBN) protein. By binding to CRBN, this compound induces a conformational change that allows the recruitment of neo-substrates (target proteins). In the context of a PROTAC, one end of the molecule (the thalidomide portion) binds to CRBN, while the other end is designed to bind to a specific protein of interest (POI). This brings the POI into close proximity with the E3 ligase, leading to its ubiquitination and subsequent degradation by the proteasome. The fluorine substitution is often introduced to modulate potency, selectivity, and metabolic stability. The molecular formula is C14H11FN2O4, and it has a molecular weight of 290.25.
体外研究 (In Vitro)
N-甲基沙利度胺4-氟化物的体外活性是通过其掺入PROTAC后诱导靶蛋白降解的能力来测定的。该分子本身对特定疾病靶点没有固有的IC50值;相反,它是一种配体。在体外泛素化实验中,使用含有CRBN、E1和E2泛素酶以及靶蛋白(新底物)的纯化体系。加入N-甲基沙利度胺4-氟化物(或含有该化合物的PROTAC)可增强靶蛋白的泛素化,这可以通过使用抗泛素抗体的Western印迹法检测。其效力通常用导致50%降解的浓度(DC50)来描述。该化合物专门用于合成抗炎药70。
体内研究 (In Vivo)
N-甲基沙利度胺4-氟化物本身不具有直接的体内治疗活性。它是一种合成中间体,也是cereblon的配体。只有当它与靶向结合的活性基团偶联形成PROTAC分子后,才能发挥活性。在体内,含有该配体的PROTAC已被用于小鼠异种移植模型中,以降解致病蛋白。例如,含有该配体的抗炎PROTAC可通过腹腔注射或口服给药。终点指标是组织匀浆中靶向炎症蛋白(例如BRD4或IRAK4)水平的降低(通过Western blot检测),以及随后炎症细胞因子的减少。该化合物还可用于合成抗炎药70。
酶活实验
用于测定 N-甲基沙利度胺 4-氟化物与 CRBN 亲和力的标准非细胞结合分析方法是时间分辨荧光共振能量转移 (TR-FRET) 结合分析。该分析使用重组人 CRBN 蛋白(通常与 GST 标签融合)和铽标记的抗 GST 抗体(供体)。受体染料(例如 HiLyte Fluor 647)与已知的高亲和力沙利度胺衍生物(探针)偶联。将待测化合物(N-甲基沙利度胺 4-氟化物)在 384 孔板中进行系列稀释。加入 CRBN 蛋白和荧光探针。平衡 1-2 小时后测量 TR-FRET 信号。信号降低表明探针被待测化合物置换。计算 IC50 值,并由此得出结合亲和力 (Ki)。这证实了该化合物在用于制造 PROTAC 之前作为 CRBN 粘合剂的功能。
细胞实验
为验证N-甲基沙利度胺4-氟化物的活性,可通过检测最终的PROTAC分子进行间接的细胞实验。典型的基于细胞的降解实验使用表达靶标的细胞系(例如,针对IRAK4靶向PROTAC的MDA-MB-231乳腺癌细胞)。将细胞接种于6孔板中,并用浓度递增(0.1 nM至1 uM)的PROTAC(包含该配体)处理6-24小时。裂解细胞,并将裂解液进行Western blotting分析。用针对靶蛋白(POI)的抗体进行探针检测。使用上样对照(例如GAPDH)进行标准化。通过密度分析计算DC50(降解50%靶标所需的浓度)。使用含有非活性 CRBN 配体的 PROTAC(阴性对照)时未观察到降解现象,证实了 N-Me-沙利度胺 4-氟化物的特异性活性。
动物实验
体内实验是评估以N-甲基沙利度胺4-氟化物构建的PROTAC的疗效的标准药物研发流程。该实验方案使用携带靶向阳性癌细胞系(例如MM.1S多发性骨髓瘤)皮下异种移植瘤的雌性BALB/c裸鼠。当肿瘤体积达到150-200 mm³时,将小鼠随机分组(n=8-10)至治疗组。PROTAC以1-30 mg/kg的剂量,每日或隔日静脉或口服给药,持续2-4周。每周两次使用游标卡尺测量肿瘤大小。实验结束时,收集肿瘤组织,并通过Western blot或免疫组织化学(IHC)检测靶蛋白水平。与载体对照组相比,肿瘤生长和靶蛋白水平的降低表明PROTAC具有体内疗效,验证了基于沙利度胺的配体的实用性。该化合物还可用于合成抗炎剂 70。
药代性质 (ADME/PK)
N-甲基沙利度胺4-氟化物的分子量为290.25,分子式为C14H11FN2O4。室温下为固体粉末。应以粉末形式储存于-20℃(可稳定保存3年)或4℃(可稳定保存2年)。溶于DMSO后,应储存于-80℃(可稳定保存6个月)或-20℃(可稳定保存1个月)。该化合物仅供研究用途,其在水中的溶解度较差,但可溶于DMSO等有机溶剂以及甲醇和乙醇。典型的DMSO储备液浓度为10-50 mM。该化合物具有哌啶二酮环,这是免疫调节酰亚胺类药物(IMiDs)的特征结构。CAS号为2244520-92-9。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
N-甲基沙利度胺4-氟化物的毒理学特性尚未完全明确,但预计与其他沙利度胺衍生物相似。沙利度胺以其致畸性(导致出生缺陷)而闻名。因此,在实验室中处理该化合物时必须极其谨慎。研究人员应佩戴双层手套、实验服和护目镜。该化合物被归类为研究用化学品,禁止人类食用。应避免吸入和皮肤接触。虽然甲基和氟的取代可能会改变其毒理学特性,但该化合物的作用机制(与cereblon结合)仍然存在免疫调节和发育影响的潜在风险。此类化合物的安全数据表通常包含生殖毒性的危害说明。必须防止在实验室工作的孕妇接触该化合物。
参考文献

[1]. Novel CRBN-Recruiting Proteolysis-Targeting Chimeras as Degraders of Stimulator of Interferon Genes with In Vivo Anti-Inflammatory Efficacy. J Med Chem. 2022 May 12;65(9):6593-6611.

其他信息
N-甲基沙利度胺4-氟化物是靶向蛋白降解(TPD)这一快速发展领域中的关键组分。与阻断蛋白活性位点的传统抑制剂不同,降解剂(PROTAC)能够彻底去除蛋白。这为靶向“不可成药”蛋白并克服耐药性提供了可能。由于其体积小、结合亲和力高,沙利度胺核心目前是PROTAC设计中最常用的CRBN配体。特定的修饰(N-甲基和4-氟)是药物化学优化的实例,旨在改善配体的类药特性,例如提高其代谢稳定性或微调其与CRBN的结合。该化合物是抗炎药70合成的中间体。它本身并非药物,而是一种用于开发下一代炎症和癌症疗法的精密工具。它仅供研究使用,尚未获准用于临床。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C14H11FN2O4
分子量
290.25
CAS号
2244520-92-9
外观&性状
Solid powder
SMILES
FC1=CC=CC2=C1C(N(C2=O)C1C(N(C)C(CC1)=O)=O)=O
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.4453 mL 17.2265 mL 34.4531 mL
5 mM 0.6891 mL 3.4453 mL 6.8906 mL
10 mM 0.3445 mL 1.7227 mL 3.4453 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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