Ac-Glu-Asp(EDANS)-Lys-Pro-Ile-Leu-Phe-Phe-Arg-Leu-Gly-Lys(DABCYL)-Glu-NH2 acetate

目录号: V109007
Ac-Glu-Asp(EDANS)-Lys-Pro-Ile-Leu-Phe-Phe-Arg-Leu-Gly-Lys(DABCYL)-Glu-NH2 乙酸盐是一种组织蛋白酶 D 底物,可用于组织蛋白酶 D FRET 检测。
Ac-Glu-Asp(EDANS)-Lys-Pro-Ile-Leu-Phe-Phe-Arg-Leu-Gly-Lys(DABCYL)-Glu-NH2 acetate 产品类别: Cathepsin
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
Ac-Glu-Asp(EDANS)-Lys-Pro-Ile-Leu-Phe-Phe-Arg-Leu-Gly-Lys(DABCYL)-Glu-NH2 乙酸盐是一种组织蛋白酶 D 底物,可用于组织蛋白酶 D FRET 检测。
Ac-Glu-Asp(EDANS)-Lys-Pro-Ile-Leu-Phe-Phe-Arg-Leu-Gly-Lys(DABCYL)-Glu-NH2 乙酸酯(CAS# 400716-78-1;C104H146N24O23S;MW 2132.52;又称组织蛋白酶 D FRET 底物)是一种灵敏的、内部猝灭的荧光(FRET)肽底物,专门设计用于天冬氨酸蛋白酶组织蛋白酶 D。其序列为 Ac-ED(edans)KPILFFRLGK(dabcyl)E-NH2。它包含荧光团 EDANS(5-[(2-氨基乙基)氨基]萘-1-磺酸)和猝灭剂 DABCYL(4-(4-(二甲氨基)苯基)偶氮)苯甲酸)。这种双标记肽用于生化测定中测量组织蛋白酶 D 的活性。
生物活性&实验参考方法
靶点
The molecular target of this peptide is cathepsin D (CTSD), a lysosomal aspartic protease that belongs to the pepsin family. Cathepsin D plays a critical role in protein degradation, antigen processing, and apoptosis. It is also implicated in tumor progression and metastasis, as it degrades extracellular matrix components. This FRET peptide is specifically cleaved by cathepsin D between the P1-P1' residues (the phenylalanine-phenylalanine bond in the -Phe-Phe- sequence). When cathepsin D cleaves the peptide, the physical separation of EDANS from DABCYL relieves fluorescence quenching, resulting in a proportional increase in fluorescence intensity, allowing real-time measurement of enzyme activity. The substrate is highly selective for cathepsin D over other proteases such as cathepsin B, L, or pepsin.
体外研究 (In Vitro)
在体外,这种FRET肽并非药物,而是组织蛋白酶D活性测定的敏感底物。在1-20 uM的浓度范围内,该肽能被重组人组织蛋白酶D(0.1-10 nM)高效切割,且切割过程呈时间和浓度依赖性。该底物与组织蛋白酶D的米氏常数(Km)通常在低微摩尔范围内(例如1-5 uM)。该肽的自水解可忽略不计,且在测定缓冲液中具有优异的稳定性,因此适用于组织蛋白酶D抑制剂的高通量筛选(HTS)。在最佳条件下,荧光信号稳定且呈线性关系,可持续长达60分钟。在测定所用浓度下,该底物不会抑制组织蛋白酶D的活性。
体内研究 (In Vivo)
该FRET肽底物并非设计用于体内实验;它是一种用于酶活性测定的体外试剂。在阿尔茨海默病患者的脑组织(老年斑)以及多种癌症(乳腺癌、结直肠癌、胃癌)中均检测到了组织蛋白酶D活性升高。利用该FRET肽,可以定量分析组织裂解液、血浆或细胞培养上清液中的组织蛋白酶D活性。然而,由于FRET信号在体内会被淬灭,因此不会将完整的肽直接用于动物实验。该肽在研究中被用作诊断工具,用于关联酶活性与疾病进展,而非作为治疗药物。目前尚未对该肽本身进行体内疗效研究。
酶活实验
体外组织蛋白酶D活性测定中,FRET肽被重悬于测定缓冲液(100 mM乙酸钠,pH 4.0-5.5,含0.05% Brij-35或0.01% Triton X-100)中。组织蛋白酶D的最适pH值为4.5-5.0。典型的反应混合物(总体积100 uL)包含1-10 uM FRET肽底物和0.1-10 nM重组人组织蛋白酶D,溶于测定缓冲液中。加入酶启动反应,于37℃孵育10-60分钟,并在激发波长λex = 336 nm或340 nm和发射波长λem = 490 nm(EDANS)下测量荧光强度。以动力学模式记录荧光强度随时间的变化。初始速率(V0)以每分钟相对荧光单位(RFU/min)表示。抑制剂筛选中,待测化合物与酶预孵育10-30分钟后再加入底物。IC₅0值由剂量-反应曲线计算得出。胃蛋白酶抑制剂A(10-100 nM)用作阳性对照。
细胞实验
对于细胞组织蛋白酶D活性测定,将细胞(例如HeLa细胞、MCF-7乳腺癌细胞或原代神经元)接种于96孔板中(1-2×10⁴个细胞/孔),培养24-48小时。然后用含有蛋白酶抑制剂(不含胃蛋白酶抑制剂A)的裂解缓冲液(50 mM pH 5.0的乙酸钠、0.1% Triton X-100、150 mM NaCl)裂解细胞。裂解液经离心(10,000 × g,10分钟)澄清。将等量的蛋白质(10-50 ug)加入含有10 uM FRET肽底物的测定缓冲液中。反应在37℃下孵育30-60分钟,并测量荧光强度。荧光强度的增加与组织蛋白酶D活性成正比。在抑制实验中,细胞在裂解前先用测试化合物(1-100 uM)预处理24-48小时,或者直接将抑制剂加入裂解液中。同时采用MTT法检测细胞活力。
动物实验
不适用。FRET肽是一种体外生化试剂,而非体内治疗剂。该肽未用于动物实验。相反,该化合物用于测量从疾病动物模型中采集的组织匀浆中的组织蛋白酶D活性。例如,在阿尔茨海默病小鼠模型(APP/PS1转基因小鼠)中,用裂解缓冲液制备脑组织匀浆(海马、皮层),并使用上述FRET肽定量组织蛋白酶D活性。与野生型对照组相比,阿尔茨海默病小鼠脑组织中组织蛋白酶D活性升高。该数据用于将酶活性与淀粉样斑块负荷关联起来。在癌症研究中,收集肿瘤异种移植瘤,并测量组织蛋白酶D活性以评估该酶在肿瘤进展中的作用。该研究不涉及肽的给药。
药代性质 (ADME/PK)
不适用。该FRET肽并非药物,不用于体内给药。其在生物缓冲液中稳定性高;应避光保存以防止EDANS荧光团发生光漂白。长期保存时,该肽应以冻干粉末形式储存于-20℃。储备液(1-10 mM)可溶于DMSO或50%乙腈/水溶液中,并储存于-20℃或-80℃。避免反复冻融。该肽可溶于DMSO和水。HPLC纯度通常≥95%。该肽对光敏感;储存时请用铝箔包裹试管。由于该化合物不用于全身给药,因此暂无药代动力学数据。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
对于FRET肽,GHS危险说明:H315(造成皮肤刺激)、H319(造成严重眼刺激)、H335(可能造成呼吸道刺激)。信号词:警告。预防措施:P261(避免吸入粉尘/烟雾/气体/喷雾)、P280(佩戴防护手套/防护服/护目镜/面罩)、P305+P351+P338(如不慎入眼:立即用清水小心冲洗几分钟)。该肽不可用于人类食用。处理肽类时,应遵循标准安全预防措施:佩戴个人防护装备(手套、实验服、护目镜),在通风橱内操作,避免吸入和皮肤接触。储存:粉末在-20℃下可保存3年;溶剂(DMSO)在-80℃下可保存6个月,在-20℃下可保存1个月。避光保存。
其他信息
Ac-Glu-Asp(EDANS)-Lys-Pro-Ile-Leu-Phe-Phe-Arg-Leu-Gly-Lys(DABCYL)-Glu-NH2 乙酸酯(组织蛋白酶 D FRET 底物;CAS 编号:400716-78-1)是一种研究级荧光肽底物。它并非 FDA 批准的药物。该底物用于生化分析中组织蛋白酶 D 活性的测定、组织蛋白酶 D 抑制剂的高通量筛选 (HTS),以及研究组织蛋白酶 D 在癌症、神经退行性疾病(阿尔茨海默病)和其他疾病中的作用。仅供研究使用,不得用于诊断或治疗用途。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C104H146N24O23S.XC2HF3O2
分子量
2132.48 (free base)
相关CAS号
Ac-Glu-Asp(EDANS)-Lys-Pro-Ile-Leu-Phe-Phe-Arg-Leu-Gly-Lys(DABCYL)-Glu-NH2; 400716-78-1
序列
Ac-Glu-{Asp(EDANS)}-Lys-Pro-Ile-Leu-Phe-Phe-Arg-Leu-Gly-{Lys(DABCYL)}-Glu-NH2Ac-E-{Asp(EDANS)}-KPILFFRLG-{Lys(DABCYL)}-E-NH2
外观&性状
Solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

Note: 请将本产品存放在密封保护的环境中,避免受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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