4-Chloro-N-methylpicolinamide

目录号: V110400
4-氯-N-甲基吡啶甲酰胺(化合物3)是一种BAZ2A溴结构域抑制剂,其Kd值大于500 μM。
4-Chloro-N-methylpicolinamide CAS号: 220000-87-3
产品类别: Epigenetic Reader Domain
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
4-氯-N-甲基吡啶甲酰胺(化合物3)是一种BAZ2A溴结构域抑制剂,其Kd值大于500 μM。4-氯-N-甲基吡啶甲酰胺与Pro1817的羰基氧形成弱氢键。4-氯-N-甲基吡啶甲酰胺可用于侵袭性前列腺癌的研究。
4-氯-N-甲基吡啶甲酰胺(CAS号:220000-87-3;C7H7ClN2O;分子量:170.60)是一种极性有机化合物,可通过氢键相互作用。它是一种BAZ2A溴结构域抑制剂,Kd值>500 uM,可与Pro1817的羰基氧形成弱氢键。该化合物已被证实可通过抑制蛋白质合成来抑制癌细胞生长,是一种潜在的癌症治疗药物。此外,它还被用于研究其在侵袭性前列腺癌中的应用。
生物活性&实验参考方法
靶点
4-Chloro-N-methylpicolinamide targets the BAZ2A bromodomain, an epigenetic reader protein that recognizes acetylated lysine residues on histones. The BAZ2A bromodomain is involved in the regulation of gene transcription, chromatin remodeling, and DNA replication. The compound forms a weak hydrogen bond with the carbonyl oxygen of Pro1817, with a Kd >500 uM, indicating low affinity. The compound also inhibits protein synthesis in cancer cells, leading to growth inhibition. It may also inhibit bcr/abl kinase. The primary mechanism of action for its anti-proliferative effects is not fully elucidated.
体外研究 (In Vitro)
4-氯-N-甲基吡啶甲酰胺已被证实可通过抑制蛋白质合成来抑制人肝癌细胞、bcr/abl激酶和HCT116细胞的生长。它还能通过阻断生长因子信号传导来抑制MDA-MB231乳腺癌细胞的增殖。该化合物是一种BAZ2A溴结构域抑制剂,其Kd值大于500 uM,表明其亲和力较弱。该化合物在多种癌细胞系中均显示出抑制活性,使其成为一种潜在的癌症治疗药物。虽然搜索结果中未提供针对特定癌细胞系的IC₅0值,但该化合物仍被认为是一种潜在的癌症治疗药物。
体内研究 (In Vivo)
搜索结果中未找到4-氯-N-甲基吡啶甲酰胺的具体体内活性数据。作为一种BAZ2A溴结构域抑制剂和潜在的抗癌药物,该化合物可在癌症异种移植小鼠模型(例如肝细胞癌、乳腺癌、白血病)中进行评估。该化合物有望用于癌症治疗,并已在侵袭性前列腺癌的研究中得到应用。它可能通过抑制蛋白质合成来抑制癌细胞的生长。需要进行体内研究来评估其疗效和毒性。
酶活实验
体外 BAZ2A 溴结构域结合实验(ITC 或 SPR):采用等温滴定量热法 (ITC) 或表面等离子共振 (SPR) 测定 4-氯-N-甲基吡啶甲酰胺与 BAZ2A 溴结构域的结合亲和力。ITC 实验中,用化合物(浓度最高达 500 uM)滴定纯化的 BAZ2A 溴结构域,并计算解离常数 (Kd)。SPR 实验中,将 BAZ2A 溴结构域固定在传感器芯片上,并注入不同浓度的化合物(1-1000 uM)。通过 X 射线晶体衍射或突变分析证实其与 Pro1817 之间存在弱氢键。Kd > 500 uM 表明结合力较弱。
细胞实验
细胞增殖和蛋白质合成抑制试验:将癌细胞(例如,肝细胞癌的HepG2细胞、结肠癌的HCT116细胞、乳腺癌的MDA-MB-231细胞、白血病的K562细胞)接种于96孔板中(5,000-10,000个细胞/孔),并用4-氯-N-甲基吡啶甲酰胺(0.1-1000 uM)处理48-72小时。采用MTT或CellTiter-Glo法检测细胞活力。蛋白质合成抑制可通过[3⁵S]-蛋氨酸/半胱氨酸代谢标记或非放射性嘌呤霉素掺入试验(SUnSET)进行评估。为评估选择性,可对该化合物进行针对一系列溴结构域的测试,以确定其选择性谱。未提供针对特定癌细胞系的IC₅0值。
动物实验
目前尚无针对4-氯-N-甲基吡啶甲酰胺的特定体内动物实验方案。对于侵袭性前列腺癌的异种移植模型,将5×10⁶个PC-3或DU145细胞(雄激素非依赖性侵袭性前列腺癌细胞)皮下接种于6-8周龄的雄性无胸腺裸鼠体内,细胞悬浮于0.1 mL PBS/Matrigel(1:1)混合液中。当肿瘤体积达到约100-150 mm³时,将小鼠随机分组(每组n=6-8)。将化合物配制成10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween 80 + 45%生理盐水溶液,并以10-100 mg/kg的剂量腹腔注射,每日一次,持续3-4周。每3天用游标卡尺测量一次肿瘤体积。在实验终点,切除肿瘤并进行组织学(H&E染色)和免疫组织化学(Ki-67增殖指数、cleaved caspase-3凋亡)分析。该方案适用于侵袭性前列腺癌的研究;目前尚无该化合物的具体数据。
药代性质 (ADME/PK)
目前尚无4-氯-N-甲基吡啶甲酰胺的具体药代动力学数据。该化合物为小型极性分子(分子量170.60,LogP值约为1.0-2.0),预计具有中等水溶性,并可能具有口服生物利用度。该化合物含有酰胺基团,可通过酰胺酶或CYP450酶代谢。预计其在啮齿动物体内的半衰期为2-6小时。用于研究时,该化合物可配制成10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween 80 + 45%生理盐水溶液,用于体内给药。用于体外实验时,该化合物可溶于DMSO。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
4-氯-N-甲基吡啶甲酰胺的危险说明:H302(吞咽有害),H315(造成皮肤刺激),H319(造成严重眼刺激),H335(可能造成呼吸道刺激)。信号词:警告。预防措施:P261(避免吸入粉尘/烟雾/气体/喷雾),P280(佩戴防护手套/防护服/护目镜/面罩),P305+P351+P338(如不慎入眼:立即用清水小心冲洗几分钟)。储存:室温下,置于密封容器中,避光防潮。仅供研究使用。
参考文献

[1]. Discovery of BAZ2A bromodomain ligands. Eur J Med Chem. 2017 Oct 20;139:564-572.

其他信息
4-氯-N-甲基吡啶甲酰胺(CAS# 220000-87-3)是一种研究级极性有机化合物,具有较弱的BAZ2A溴结构域抑制活性(Kd >500 μM)。它对多种癌细胞系具有抗增殖活性,并被用于癌症(包括侵袭性前列腺癌)和表观遗传学的研究。该化合物尚未获得FDA批准。仅供研究使用,不得用于诊断或治疗用途。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C7H7CLN2O
分子量
170.60
精确质量
170.025
CAS号
220000-87-3
PubChem CID
1476814
外观&性状
White to light yellow solid powder
tPSA
42
氢键供体(HBD)数目
1
可旋转键数目(RBC)
1
重原子数目
11
分子复杂度/Complexity
151
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CNC(=O)C1=NC=CC(=C1)Cl
InChi Key
BGVBBMZMEKXUTR-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C7H7ClN2O/c1-9-7(11)6-4-5(8)2-3-10-6/h2-4H,1H3,(H,9,11)
化学名
4-chloro-N-methylpyridine-2-carboxamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 5.8617 mL 29.3083 mL 58.6166 mL
5 mM 1.1723 mL 5.8617 mL 11.7233 mL
10 mM 0.5862 mL 2.9308 mL 5.8617 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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