Thalidomide-NH-C5-NH2 TFA

目录号: V113401
沙利度胺-NH-C5-NH2 (TFA) 是一种 E3 连接酶配体-连接子缀合物,含有 CRBN 基配体和连接子,可用于合成 PROTAC。
Thalidomide-NH-C5-NH2 TFA CAS号: 2093386-40-2
产品类别: E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
100mg
250mg
500mg
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产品描述
沙利度胺-NH-C5-NH2 (TFA) 是一种 E3 连接酶配体-连接子缀合物,含有 CRBN 基配体和连接子,可用于合成 PROTAC。
沙利度胺-NH-C5-NH2 TFA(CAS# 2093386-40-2)是一种E3连接酶配体-连接子偶联物,包含一个基于cereblon (CRBN)的配体(沙利度胺类似物)和一个5碳氨基连接子,以三氟乙酸(TFA)盐的形式存在。该化合物也称为E3连接酶配体-连接子偶联物,其中基于沙利度胺的CRBN配体预先偶联到一个以伯胺为末端的C5烷基链上。其分子式为C19H22N4O5·C2HF3O2,分子量约为504.4 g/mol(含TFA反离子)。该偶联物设计用于PROTAC合成,无需单独的连接子偶联步骤。
生物活性&实验参考方法
靶点
Thalidomide-NH-C5-NH2 TFA targets the cereblon (CRBN) protein, which is a substrate receptor of the E3 ubiquitin ligase complex. The thalidomide-based pharmacophore binds to CRBN with high affinity, recruiting the E3 ubiquitin ligase machinery. The C5 alkyl linker provides a 5-carbon spacer, and the terminal primary amine serves as a conjugation handle for attachment to target protein ligands via amide bond formation using standard coupling chemistry. This conjugate is designed for one-step PROTAC assembly, where the amine reacts with a carboxylic acid-containing target protein ligand.
体外研究 (In Vitro)
PROTAC包含两个不同的配体,它们通过一个连接子连接:一个是E3泛素连接酶的配体,另一个是靶蛋白的配体。PROTAC利用细胞内的泛素-蛋白酶体系统选择性地降解靶蛋白。
沙利度胺-NH-C5-NH2 TFA 本身不具有体外活性,因为它是一种配体-连接子缀合物,而非完整的 PROTAC。其生物活性需在与靶蛋白配体偶联形成完整的 PROTAC 后进行评估。对于所得的 PROTAC,标准的细胞实验包括用 PROTAC 处理靶细胞,并通过蛋白质印迹法检测靶蛋白的降解情况。CRBN 结合的沙利度胺部分可确保 E3 泛素连接酶复合物的有效募集,从而导致靶蛋白的泛素化和蛋白酶体降解。
体内研究 (In Vivo)
目前尚未报道单独使用沙利度胺-NH-C5-NH2 TFA 具有直接的体内活性。当该化合物与靶蛋白配体偶联形成 PROTAC 时,可实现靶向蛋白的体内降解。含有该偶联物的 PROTAC 的标准体内实验方案包括向荷瘤小鼠给药(通常通过腹腔或静脉注射,剂量为 1-50 mg/kg)。CRBN 配体可确保募集内源性 CRBN E3 连接酶,从而导致靶蛋白的泛素化和蛋白酶体降解。C5 连接臂的长度为三元复合物的形成提供了最佳间距。
酶活实验
目前尚未针对该配体-连接子偶联物建立特定的酶/受体结合方案。基于沙利度胺的CRBN配体组分的标准结合分析方法包括表面等离子共振(SPR)或荧光偏振法,用于测定其与cereblon蛋白的直接结合亲和力(KD)。在PROTAC的合成中,沙利度胺-NH-C5-NH2 TFA的末端伯胺通过标准酰胺偶联条件与含羧酸的靶蛋白配体偶联。通常,将靶蛋白配体(1.0-1.5当量)溶于DMF或DMSO中,并加入HATU或HBTU(1.2-1.5当量)和DIPEA(2-3当量)。然后加入含胺偶联物,并在室温下搅拌12-24小时。所得PROTAC通过制备型HPLC纯化,并通过LC-MS进行表征。
细胞实验
沙利度胺-NH-C5-NH2 TFA 不能单独进行细胞实验评估。对于使用该缀合物合成的 PROTAC 的细胞评估,标准方案包括将癌细胞系(例如 HEK293、HeLa、MM.1S 多发性骨髓瘤细胞)在含有 10% FBS 的适宜培养基中,于 37°C、5% CO2 条件下培养。将细胞以每孔 1×10⁵ 个细胞的密度接种于 12 孔或 96 孔板中,并使其过夜贴壁。加入浓度范围为 0.1 nM 至 10 uM 的 PROTAC,孵育 4-72 小时。使用特异性抗体通过蛋白质印迹法检测细胞裂解液中的靶蛋白降解情况。使用过量的沙利度胺或来那度胺(1-10 uM)进行竞争实验,可以确认 CRBN 的结合情况。使用 CellTiter-Glo 试剂盒检测细胞活力。所有实验均重复三次。
动物实验
对于使用沙利度胺-NH-C5-NH2 TFA合成的PROTACs的体内研究,标准动物实验方案包括免疫缺陷小鼠(裸鼠或NSG小鼠,6-8周龄,18-22 g)的异种移植模型。皮下注射约5×10⁶个癌细胞。当肿瘤体积达到约150-200 mm³时,将小鼠随机分组(每组n=5-10)。PROTAC以1-50 mg/kg的剂量腹腔注射给药,制剂溶剂包括10% DMSO、40% PEG300、5% Tween 80和45%生理盐水。每2-3天使用数字游标卡尺测量肿瘤体积。监测体重作为毒性指标。研究结束时,切除肿瘤并进行Western blotting靶蛋白分析。可采集血液进行药代动力学分析。
药代性质 (ADME/PK)
目前尚未发表关于沙利度胺-NH-C5-NH2 TFA的直接药代动力学研究。计算得到的性质包括基于沙利度胺的CRBN配体,其预测的logP值约为1.0-1.5。C5烷基连接基提供5个碳原子的间隔,末端伯胺基团可用于偶联。对于使用该偶联物合成的PROTAC,其药代动力学参数(例如半衰期、清除率、分布容积和生物利用度)取决于完整PROTAC分子的整体分子性质。已知在某些情况下,基于沙利度胺的偶联物具有中等至良好的口服生物利用度,但这取决于完整的PROTAC结构。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
沙利度胺-NH-C5-NH2 TFA 的安全数据表明,该化合物仅供研究使用。沙利度胺及其衍生物是已知的致畸剂;处理该化合物时必须极其谨慎,以避免接触,尤其是有生育能力的妇女。应遵循标准的实验室安全预防措施:佩戴防护手套、护目镜和实验服。在通风良好的通风橱中操作。避免吸入、摄入以及与皮肤和眼睛接触。该化合物应储存在-20℃,避光防潮。必须严格遵守安全规程。本产品不适用于人类治疗。
其他信息
Thalidomide-NH-C5-NH2 TFA 是一种 E3 连接酶配体-连接子偶联物,专为 PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)合成而设计。该化合物包含一个基于沙利度胺的 cereblon (CRBN) 配体,该配体预先偶联到一个末端为伯胺的 C5 烷基连接子上(以 TFA 盐的形式存在)。这种预偶联设计简化了 PROTAC 的组装,无需单独的连接子偶联步骤。末端伯胺可作为连接点,利用标准偶联化学方法与含羧酸的靶蛋白配体直接形成酰胺键。沙利度胺是典型的 CRBN 结合免疫调节药物,其衍生物广泛用于 PROTAC 的开发,以在癌症研究中靶向降解蛋白质。本产品仅供研究使用,尚未获批用于临床。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C20H23F3N4O6
分子量
472.42
CAS号
2093386-40-2
相关CAS号
Thalidomide-NH-C5-NH2; 2093386-39-9
外观&性状
Solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

Note: 请将本产品存放在密封保护的环境中,避免受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.1168 mL 10.5838 mL 21.1676 mL
5 mM 0.4234 mL 2.1168 mL 4.2335 mL
10 mM 0.2117 mL 1.0584 mL 2.1168 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们