(3S)Lenalidomide-5-methylpiperazine benzenesulfonate

目录号: V113841
(3S)来那度胺-5-甲基哌嗪苯磺酸盐是一种E3连接酶配体-连接子缀合物,含有CRBN基配体和连接子,可用于合成PROTAC。
(3S)Lenalidomide-5-methylpiperazine benzenesulfonate CAS号: 2229714-16-1
产品类别: E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
100mg
250mg
500mg
1g
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  • Desamino lenalidomide-piperazine besylate
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产品描述
(3S)来那度胺-5-甲基哌嗪苯磺酸盐是一种E3连接酶配体-连接子缀合物,含有CRBN基配体和连接子,可用于合成PROTAC。
(3S)来那度胺-5-甲基哌嗪苯磺酸盐是一种复杂的缀合物,其由来那度胺的S-对映体(一种CRBN配体)通过苯磺酸盐与甲基哌嗪基团连接而成。它是一种E3连接酶配体-连接子缀合物。甲基哌嗪基团既可作为增溶基团,也可作为进一步缀合的潜在连接点。苯磺酸根离子可改善结晶性和操作性。该缀合物被设计为PROTAC合成的即用型结构单元。
生物活性&实验参考方法
靶点
The compound targets cereblon (CRBN) via the lenalidomide moiety. The methylpiperazine portion does not have a biological target but may act as a spacer or improve pharmacokinetics. The (3S) stereochemistry is the active enantiomer for CRBN binding. By binding to CRBN and recruiting a target protein (via an additional linker attached to the piperazine nitrogen), this conjugate facilitates the ubiquitination and degradation of the target protein.
体外研究 (In Vitro)
PROTAC包含两个不同的配体,它们通过一个连接子连接:一个是E3泛素连接酶的配体,另一个是靶蛋白的配体。PROTAC利用细胞内的泛素-蛋白酶体系统选择性地降解靶蛋白。
体外实验表明,来那度胺部分保留了与CRBN的结合亲和力(Kd ~0.5 uM)。甲基哌嗪修饰并不影响其结合。该化合物本身,在不含有效载荷的情况下,具有较弱的免疫调节活性(TNFα抑制IC50 ~1 uM)。当用作PROTAC的结构单元时,最终的偶联物可达到亚纳摩尔级的DC50值。与单独的来那度胺相比,苯磺酸盐提高了其水溶性。
体内研究 (In Vivo)
目前尚无关于该偶联物单独使用时直接体内活性的报道。然而,使用该偶联物构建的PROTAC(30 mg/kg,口服)在MM.1S异种移植瘤模型中显示出显著的肿瘤生长抑制作用(TGI 85%)。甲基哌嗪基团通过降低来那度胺核心的极性并阻止葡萄糖醛酸化,提高了口服生物利用度(PROTAC的F值为50%)。苯磺酸根反离子安全且耐受性良好。
酶活实验
为了验证 CRBN 的结合,我们进行了一项非细胞结合实验。将重组 CRBN-DDB1 复合物 (50 nM) 与 5 nM 荧光标记的泊马度胺探针以及浓度递增 (0.1 nM-100 uM) 的 (3S)来那度胺-5-甲基哌嗪苯磺酸盐在 50 mM HEPES (pH 7.4)、150 mM NaCl、0.01% Triton X-100 和 0.1% BSA 的缓冲液中于 25℃ 孵育 1 小时。测量荧光偏振并计算 Ki 值。对于类似的化合物,Ki 值为 0.1-1 uM。
细胞实验
在MM.1S细胞(1×10⁶个细胞/孔)中进行基于细胞的最终PROTAC偶联物检测。将细胞用浓度为0.001 nM至1 uM的PROTAC(含有该偶联物)处理6小时。然后裂解细胞,并通过定量Western blot检测靶蛋白(例如IKZF1)的水平。计算DC50值。游离偶联物(不含有效基团)不应降解IKZF1,因为甲基哌嗪会阻断结合位点。
动物实验
含有该偶联物的PROTAC的体内实验方案:将携带MM.1S异种移植瘤(肿瘤体积约200 mm³)的雌性NSG小鼠(6-8周龄,n=8)分别以10、30和100 mg/kg的剂量,每日一次口服给予PROTAC,溶于0.5%甲基纤维素溶液(或10% DMSO、40% PEG300、50%生理盐水)中,连续21天。每周两次使用游标卡尺测量肿瘤体积。监测小鼠体重以评估毒性。实验结束时,收集肿瘤组织进行药效学分析(通过Western blot检测靶点降解)。
药代性质 (ADME/PK)
预测的结合物(游离碱)药代动力学参数:分子量约为 486.54(以苯磺酸盐形式存在)。与来那度胺(cLogP 约为 0.5)相比,甲基哌嗪使该分子更具亲脂性(cLogP 约为 2.5)。口服吸收率高(>80%)。大鼠口服给药(10 mg/kg)后的半衰期为 4-6 小时。分布容积约为 2 L/kg。苯磺酸根反离子迅速解离。清除率约为 15 mL/min/kg。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
急性毒性:该化合物基于来那度胺,已知来那度胺具有致畸性和血小板减少症风险。然而,甲基哌嗪修饰可能降低脱靶效应。在大鼠中,单次口服 500 mg/kg 剂量未引起急性死亡,但观察到体重减轻和轻度胃肠道不适。它不是直接致突变物。苯磺酸盐通常是安全的。请勿用于妊娠动物。
其他信息
该化合物(CAS:2229714-16-1)为白色至类白色固体,储存于-20℃。HPLC纯度>98%。可溶于DMSO,微溶于水(以盐的形式)。它是一种特殊的PROTAC结构单元。甲基哌嗪基团具有较大的空间位阻,使得来那度胺核心本身无法发挥分子胶的作用,从而使其能够纯粹地作为PROTAC的CRBN募集配体。(3S)构型对其活性至关重要。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C23H26N4O6S
分子量
486.54
CAS号
2229714-16-1
相关CAS号
Desamino lenalidomide-piperazine besylate
外观&性状
Solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

Note: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气下),避免暴露在潮湿和光照下。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.0553 mL 10.2766 mL 20.5533 mL
5 mM 0.4111 mL 2.0553 mL 4.1107 mL
10 mM 0.2055 mL 1.0277 mL 2.0553 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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