IA107

目录号: V116496
IA107 是一种强效、选择性的 IRE1α RNase 变构抑制剂(IC50 = 16 nM(非磷酸化),IC50 = 9 nM(磷酸化))。
IA107 产品类别: IRE1
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产品描述
IA107 是一种强效、选择性的 IRE1α RNase 变构抑制剂(IC50 = 16 nM(非磷酸化),IC50 = 9 nM(磷酸化))。IA107 可抑制内质网应激诱导的 XBP1 mRNA 剪接和蛋白表达,且无细胞毒性。
IA107 是一种强效、选择性的变构抑制剂,可抑制肌醇需求酶 1alpha (IRE1alpha) 的核糖核酸酶活性。IRE1alpha 是位于内质网 (ER) 膜上的三种未折叠蛋白反应 (UPR) 传感器之一。IA107 与 IRE1alpha 的激酶结构域结合,但不抑制其激酶活性或二聚化;相反,它通过变构作用阻断核糖核酸酶活性位点。这种独特的结合模式导致选择性抑制 XBP1 mRNA 剪接,而不影响 IRE1alpha 的磷酸化。IA107 是研究 IRE1alpha 在内质网应激相关疾病(包括癌症、神经退行性疾病和代谢性疾病)中作用的重要研究工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
IA107 specifically targets the inositol-requiring enzyme 1 alpha (IRE1alpha), a dual-function kinase/RNase. It is an allosteric inhibitor of the IRE1alpha RNase domain, with IC50 values of 16 nM for the non-phosphorylated form and 9 nM for the phosphorylated form. X-ray crystallography reveals that IA107 binds to the IRE1alpha kinase domain (ATP-binding pocket) without inhibiting kinase activity or IRE1alpha dimerization. This binding induces a conformational change that allosterically blocks the RNase active site. Consequently, IA107 concentration-dependently inhibits ER stress-induced XBP1 mRNA splicing and protein expression, without affecting the phosphorylation status of IRE1alpha. Enzyme kinetic studies indicate a non-competitive inhibition mode towards the XBP1 RNA substrate.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,IA107 能有效抑制无细胞酶活性测定中的 IRE1α RNase 活性。细胞实验评估显示其无细胞毒性,使其成为研究 IRE1α 生物学特性的安全工具。该化合物以浓度依赖的方式抑制细胞内质网应激诱导的 XBP1 mRNA 剪接。与母体化合物相比,IA107 的酯化前药的细胞活性提高了约 50 倍,表明酯化作用提高了细胞渗透性和效力,且不改变 RNase 抑制的基本机制。IA107 不抑制 IRE1α 的二聚化,这与其他通过阻止二聚体形成来同时阻断激酶和 RNase 功能的 IRE1α 抑制剂的关键区别。
体内研究 (In Vivo)
由于IA107主要是一种细胞和生化工具,因此其体内研究较为有限。IA107的高选择性和低细胞毒性表明,它有望成为开发体内探针的理想起点。IA107的酯类前药(在一些文献中被称为IAPD1)具有更高的细胞渗透性,并且在A549细胞中抑制内质网应激诱导的XBP1剪接的IC50值为180 nM。这种前药策略可能使药物在血浆中达到足够的浓度,从而在动物模型中实现靶点结合。这种双重抑制剂系统(IA107用于生化研究,其酯类前药用于细胞/动物研究)能够对IRE1α在疾病模型中的作用进行全面的靶点验证。目前,IA107已被用于研究IRE1α的RNase功能在未折叠蛋白反应(UPR)中的具体作用。
酶活实验
体外IRE1α RNase活性测定采用重组IRE1α蛋白和基于XBP1茎环结构的荧光RNA底物。反应混合物(20 uL)包含50 mM HEPES(pH 7.5)、150 mM NaCl、2 mM DTT、0.01% Brij-35、10 mM MgCl2、50 nM IRE1α激酶/RNase结构域、5 nM FRET底物(5'端FAM和3'端BHQ标记的RNA)以及不同浓度的IA107(0.001-1000 nM)。加入RNA底物启动反应,并在37℃孵育1-2小时。使用酶标仪连续或在反应终点测量荧光强度(激发波长485 nm,发射波长520 nm)。荧光强度的增加对应于核糖核酸酶(RNase)活性(酶切将荧光团与淬灭剂分离)。IC50值通过拟合抑制曲线确定。对于磷酸化的IRE1α,在加入底物之前,先用ATP预孵育酶以诱导其自身磷酸化。IA107的IC50值分别为16 nM(非磷酸化)和9 nM(磷酸化)。
细胞实验
对于细胞活性检测,将A549人肺腺癌细胞或其他细胞系接种于96孔板(20,000个细胞/孔),培养基为含10%胎牛血清的DMEM/F12培养基。过夜贴壁后,加入毒胡萝卜素(300 nM)或衣霉素(2 ug/mL)诱导内质网应激,持续6-8小时。同时加入IA107或其酯类前药(0.001-10 uM)。孵育后,裂解细胞并提取总RNA。使用覆盖XBP1剪接区域的引物,通过RT-PCR(逆转录聚合酶链式反应)定量XBP1 mRNA的剪接情况。剪接和未剪接的扩增子可通过琼脂糖凝胶电泳(未剪接条带位于~410 bp,剪接条带位于~440 bp)或毛细管电泳进行分离。剪接百分比的计算公式为:(剪接条带强度)/(剪接条带强度 + 未剪接条带强度)× 100。IA117(IA107 的酯类前药)在该细胞 XBP1 剪接实验中 IC50 值为 180 nM。同时,使用 CellTiter-Glo 试剂盒在平行孔中检测细胞毒性,以确保观察到的效应并非由细胞死亡引起。
动物实验
IA107 主要用于内质网应激的细胞模型;基础文献中鲜有体内动物研究报道。然而,对于前药 IA107(IAPD1 或 IA117),可以提出一种典型的鼠异种移植模型方案。将 5 × 10⁶ 个 A549 或其他癌细胞皮下接种到 6-8 周龄的雌性 BALB/c 裸鼠体内。当肿瘤体积达到 150-200 mm³ 时,将小鼠随机分组(n=6-8)。将前药配制成溶剂(例如,10% DMSO、10% Cremophor EL、80% 生理盐水),并以 10-50 mg/kg/天的剂量,通过灌胃 (po) 或腹腔注射 (ip) 给药,持续 14-21 天。每周测量两次肿瘤体积和体重。研究结束时,切除肿瘤,并通过RT-PCR检测肿瘤组织中XBP1剪接水平以确认靶点结合情况。采集血液样本进行血浆药代动力学分析,并对器官(肝脏、肾脏)进行组织病理学检查。体外实验未观察到细胞毒性,提示IA107衍生药物可能具有良好的治疗窗口,但仍需体内验证。
药代性质 (ADME/PK)
IA107(分子量约为500-600 Da,文献中未明确具体分子量)的药代动力学性质尚未完全阐明。该化合物被描述为一种强效抑制剂,其细胞活性可通过酯类前药的形成而增强。这表明IA107本身可能细胞渗透性较差(可能与其极性或负电荷有关),但其酯类衍生物(IA117)的渗透性更高。预计酯类前药会被细胞内酯酶水解,从而释放活性IA107。在啮齿动物中,由于快速水解,酯类前药的半衰期可能较短(t1/2 < 1小时)。活性IA107一旦在细胞内形成,由于其与IRE1α的高亲和力结合(IC50在纳摩尔范围内),可能在细胞内停留较长时间。血浆蛋白结合情况尚不清楚,但由于其吲哚骨架,可能为中等程度。 IA107 仅供研究使用,不属于临床候选药物。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
根据现有文献(Nature Communications 2025),IA107 在细胞实验中未显示出细胞毒性。该化合物经过专门筛选和验证,证实其不具有普遍的细胞毒性作用,同时能有效抑制 IRE1α 核糖核酸酶。这是它区别于许多其他应激通路抑制剂的关键特征,后者通常会导致脱靶细胞死亡。由于 IA107 是一种研究工具而非临床药物,因此目前尚无动物急性或慢性毒性数据。该化合物不抑制 IRE1α 的二聚化,表明其不太可能引起 UPR 信号通路的整体紊乱,从而可能降低靶向毒性。应遵循研究化学品的标准安全操作规程(佩戴手套、实验服和护目镜)。该化合物应储存在 -20℃ 的干燥避光环境中。
参考文献

[1]. Harnessing indole scaffolds to identify small-molecule IRE1α inhibitors modulating XBP1 mRNA splicing. Nat Commun. 2025 Sep 26;16(1):8531.

其他信息
IA107 也被称为 IRE1α 核糖核酸酶变构抑制剂,是文献中报道的一系列取代吲哚类化合物之一(Nat. Commun. 2025, 16, 8531)。该化合物与 IRE1α 激酶结构域结合,该结构域不同于核糖核酸酶活性位点,但能抑制核糖核酸酶活性。IA107 的酯类前药(例如 IA117 或 IAPD1)显示出约 50 倍的细胞活性增强。IA107 是一种有价值的化学探针,可用于研究 IRE1α 核糖核酸酶活性在未折叠蛋白反应 (UPR) 信号通路中的具体作用,而无需考虑其激酶功能。它对癌症(多发性骨髓瘤、三阴性乳腺癌)、神经退行性疾病(阿尔茨海默病、帕金森病)和代谢性疾病(肥胖症、脂肪肝)的研究具有重要意义。IA107 仅供研究使用,不得用于临床应用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C19H16BRNO3
分子量
386.24
外观&性状
White to off-white solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.5891 mL 12.9453 mL 25.8906 mL
5 mM 0.5178 mL 2.5891 mL 5.1781 mL
10 mM 0.2589 mL 1.2945 mL 2.5891 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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