BTR2000 TFA

目录号: V117332
BTR2000 TFA 是一种特异性的 KLHL20 配体,能以高亲和力与 KLHL20 的 Kelch 结构域结合。
BTR2000 TFA 产品类别: Ligands for E3 Ligase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
Other Sizes
点击了解更多
  • 与全球5000+客户建立关系
  • 覆盖全球主要大学、医院、科研院所、生物/制药公司等
  • 产品被大量CNS顶刊文章引用
InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用
产品描述
BTR2000 TFA 是一种特异性的 KLHL20 配体,能以高亲和力与 KLHL20 的 Kelch 结构域结合。BTR2000 TFA 可用作 E3 连接酶的配体,参与 BTR2004 的合成。
BTR2000 TFA 是一种合成的小分子配体,可特异性结合 Kelch 样蛋白 20 (KLHL20)。它以三氟乙酸盐 (TFA) 的形式提供。BTR2000 的分子式为 C31H43F3N₆O₉S2,分子量为 764.83,是合成新型分子 PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)的关键研究模块。具体而言,它是 E3 泛素连接酶配体,被整合到 BTR2004 中,BTR2004 是一种 BRD2/3/4 蛋白的 PROTAC 降解剂。
生物活性&实验参考方法
靶点
BTR2000 is not a drug; its "target" is the Kelch domain of the E3 ubiquitin ligase adapter protein, KLHL20. It acts as a high-affinity ligand, binding with specificity to KLHL20. As a ligand for a component of the CUL3-KLHL20 E3 ubiquitin ligase complex, it serves as the "warhead" that recruits this enzyme to a target of interest. In the context of the BTR2004 PROTAC, a linker is attached to BTR2000, which is then connected to a BRD2/3/4 inhibitor. This multi-functional molecule brings the E3 ligase into close proximity with the target protein, leading to its ubiquitination and subsequent degradation by the proteasome. BTR2000 is a tool to study KLHL20-mediated targeted protein degradation.
体外研究 (In Vitro)
BTR2000 的体外活性取决于其与 KLHL20 Kelch 结构域的结合亲和力。在诸如表面等离子共振 (SPR) 或等温滴定量热法 (ITC) 等生物物理分析中,可测定 BTR2000 与 KLHL20 相互作用的平衡解离常数 (Kd),结果表明其结合亲和力在低纳摩尔范围内。在细胞分析中,使用 BTR2004 PROTAC,其活性通过 BRD2/3/4 的降解来测定。在处理细胞的蛋白质印迹分析中,BTR2004 会导致 BRD2/3/4 蛋白水平呈浓度依赖性下降(例如,DC50 < 100 nM)。而缺乏靶标结合部分的 BTR2000 本身则不显示降解活性。
体内研究 (In Vivo)
在体内,BTR2000 不用于治疗,而是作为研究工具用于构建 PROTAC。BTR2004 PROTAC 已证实具有体内活性,能够降解小鼠组织中的 BRD2/3/4,并在异种移植模型中表现出抗肿瘤活性。BTR2000 本身不具有体内活性。作为一种构建模块,其用途在于理解 E3 连接酶-配体相互作用,以及用于构建降解其他目标蛋白的化学工具。
酶活实验
体外结合实验(表面等离子共振,SPR):将重组KLHL20 Kelch结构域蛋白固定在传感器芯片上。将一系列浓度的BTR2000(0.1-100 nM)溶于流动缓冲液中,流经芯片。测量结合速率常数(ka)和解离速率常数(kd),并计算平衡解离常数(Kd),公式为kd/ka。BTR2000的Kd值应在低纳摩尔范围内,证实其具有高亲和力。使用已知不与KLHL20结合的对照化合物来评估非特异性结合。
细胞实验
体外PROTAC活性检测(Western Blot):将HEK293T细胞接种于6孔板(5×10⁵个细胞/孔),并用BTR2004 PROTAC(0.1-1000 nM)处理6-24小时。作为对照,细胞仅用BTR2000(1000 nM)或溶剂(DMSO)处理。处理后,裂解细胞,并通过SDS-PAGE分离蛋白裂解液。用抗BRD2、抗BRD3或抗BRD4抗体以及抗GAPDH内参抗体进行膜探针检测。BTR2004 PROTAC可导致靶蛋白水平呈剂量依赖性降低,而单独使用BTR2000则无此作用。计算DC50(50%降解所需的浓度)。
动物实验
BTR2004 PROTAC(非BTR2000)的一般体内动物实验方案:将BTR2004 PROTAC溶解于合适的溶剂(例如,10% DMSO、40% PEG300、5% Tween-80、45%生理盐水)中,并以0、10、30和100 mg/kg的剂量,每隔一天腹腔注射给携带异种癌细胞系(例如,5×10⁶ MV-4-11细胞)的雌性NCr nu/nu裸鼠。每周测量两次肿瘤体积。PROTAC将引起剂量依赖性的肿瘤生长抑制(TGI)。在为期28天的重复给药毒理学研究中,将PROTAC以0、5、15和50 mg/kg/天的剂量给予大鼠,以确定无可见不良反应剂量(NOAEL)。
药代性质 (ADME/PK)
BTR2000 是一种小分子(分子量 765),用作 PROTAC 的结构单元。BTR2000 本身的药代动力学尚未进行表征;而是测定了最终 PROTAC 分子 BTR2004 的性质。作为一种合成中间体,它不适用于体内给药。因此,未对 BTR2000 进行正式的 ADME 研究。其溶解度和稳定性已进行表征,用于合成。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
作为一种研究工具,BTR2000 尚未经过正式的毒性测试。其三氟乙酸盐形式可能具有一定的低毒性,但并不被认为是具有遗传毒性的杂质。最终 PROTAC(BTR2004)的潜在毒性才是药物研发的关键所在。作为参考标准品,BTR2000 按照标准危险化学品进行处理。
参考文献

[1]. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36328355/

[2]. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39677683/

其他信息
BTR2000 是 KLHL20(Kelch 样蛋白 20)的特异性配体,KLHL20 是 Cullin3-RING 泛素连接酶 (CRL3) 复合物的底物适配蛋白。KLHL20 具有重要意义,因为它在某些癌症中过表达,并参与肿瘤抑制因子的降解。BTR2000 的发现促成了 BTR2004 的开发,BTR2004 是一种 PROTAC 降解剂,可降解溴结构域和末端外结构域 (BET) 家族蛋白(BRD2、BRD3、BRD4)。这项工作代表了靶向蛋白降解领域的一项进步,它超越了常用的配体(如 CRBN 和 VHL),转而针对一种新的 E3 连接酶(KLHL20)。这扩展了用于开发降解剂的工具箱,以降解那些可能无法通过传统方法有效靶向的蛋白质。BTR2000 TFA 以粉末形式储存于 -20°C,可溶于 DMSO。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C31H43F3N6O9S2
分子量
764.83
相关CAS号
BTR2000
外观&性状
White to off-white solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~62.5 mg/mL (~81.72 mM; with sonication)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
View More

注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
View More

口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.3075 mL 6.5374 mL 13.0748 mL
5 mM 0.2615 mL 1.3075 mL 2.6150 mL
10 mM 0.1307 mL 0.6537 mL 1.3075 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
+
+

计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

相关产品
联系我们