| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 1mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
(R)-CDK2 degrader 6 targets cyclin-dependent kinase 2 (CDK2), a serine/threonine protein kinase that controls the G1/S transition of the cell cycle. Unlike traditional inhibitors, it acts as a molecular glue degraders (PROTAC) that induces the selective degradation of CDK2 by recruiting an E3 ubiquitin ligase. The degrader forms a ternary complex with CDK2 and the E3 ligase, promoting ubiquitination and subsequent proteasomal degradation. This mechanism leads to the removal of the CDK2 protein and results in sustained cell cycle arrest in cancer cells. The compound is part of the PROTAC (proteolysis targeting chimeras) and molecular glues pathway (Cell Cycle/DNA Damage). CDK2 is frequently overexpressed in breast cancer and other malignancies.
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| 体外研究 (In Vitro) |
体外实验表明，(R)-CDK2降解剂6能够选择性且高效地降解CDK2蛋白。其在24小时内的DC50（半数降解浓度）为27.0 nM。该化合物对乳腺癌细胞系具有活性，可导致细胞周期阻滞和增殖抑制。尽管针对该特定对映体的详细体外实验结果有限，但其外消旋混合物（即CDK2降解剂6）具有口服活性，DC50为46.5 nM。(R)-对映体似乎活性更强，其DC50值低于外消旋混合物。该化合物以浓度依赖的方式诱导细胞凋亡并降低肿瘤细胞活力，这可以通过标准细胞活力检测方法（MTT、CellTiter-Glo）进行测量。
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| 体内研究 (In Vivo) |
目前尚无针对 (R)-CDK2 降解剂 6 的体内数据发表。然而，其母体化合物 CDK2 降解剂 6（外消旋混合物或相关化合物）已被证实对乳腺癌异种移植模型具有口服活性。对于 CDK2 降解剂 6，口服给药可抑制小鼠乳腺癌异种移植模型中的肿瘤生长，其半数致死浓度 (DC50) 为 46.5 nM。该化合物具有良好的安全性，在有效剂量下未观察到明显的体重减轻。由于 (R)-对映体在体外具有更高的活性，预计其体内活性将相似或更佳，但尚未公布具体的研究结果。此类研究的标准方案包括每日一次灌胃给药，持续 21 天，并每周测量两次肿瘤体积。
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| 酶活实验 |
对于体外酶活性测定，CDK2 是一种纯化的重组蛋白（全长，活性）。为了在非细胞系统中检测其降解，可以进行体外泛素化测定。将 100 nM (R)-CDK2 降解剂 6 与 1 uM CDK2 蛋白、1 uM E3 连接酶复合物（Cereblon）、50 nM E1、200 nM E2（UBCH5a）、1 uM 泛素、2 mM ATP 和 10 mM MgCl2 混合于 50 mM Tris-HCl 缓冲液（pH 7.5）中。于 30℃ 孵育 60 分钟。加入 SDS-PAGE 上样缓冲液终止反应。使用抗泛素抗体和抗 CDK2 抗体通过 Western blot 检测泛素化的 CDK2。为了测定DC50，将CDK2用浓度为1-1000 nM的化合物处理2小时，然后通过Western blot密度分析法测量剩余的CDK2。使用不含化合物的对照组和已知的降解剂（例如，来那度胺）作为对照。
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| 细胞实验 |
对于体外细胞实验，将乳腺癌细胞（例如 MCF-7 或 T-47D）以 3×10⁵ 个细胞/孔的密度接种于 6 孔板中，培养基为含 10% FBS 的 RPMI-1640。在 37℃ 培养 24 小时后，用浓度范围为 1 nM 至 1 uM 的 (R)-CDK2 降解剂 6 处理细胞 24-72 小时。为测定 DC50 值，处理细胞 24 小时后，用含有蛋白酶抑制剂的 RIPA 裂解缓冲液裂解细胞。使用抗 CDK2 抗体和密度分析法通过 Western blot 定量 CDK2 水平。采用 MTT 法测定细胞活力：加入 0.5 mg/mL MTT（孵育 4 小时），然后用 DMSO 溶解，在 570 nm 处读取吸光度。采用碘化丙啶染色和流式细胞术进行细胞周期分析。采用Annexin V/PI双染法检测细胞凋亡。所有实验均重复三次。DMSO（0.1%）作为阴性对照。
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| 动物实验 |
在采用母体 CDK2 降解剂 6（外消旋体）进行的体内动物研究中，使用皮下移植 MCF-7 乳腺癌异种移植瘤（肿瘤体积约 150 mm³）的雌性 BALB/c 裸鼠（6-8 周龄，每组 n=8-10 只）。该化合物配制于 10% DMSO、40% PEG300、5% Tween 80 和 45% 生理盐水中，工作浓度为 2 mg/mL。给药方式为每日灌胃（PO），剂量分别为 10、30 或 100 mg/kg，持续 21 天。每 3 天用游标卡尺测量肿瘤大小，肿瘤体积计算公式为（长 × 宽²）/ 2。监测体重作为毒性指标。在研究终点（第 21 天），切除肿瘤，称重，并通过 Western blot 分析 CDK2 水平以确认靶点降解。对于 PK 研究，在给药后不同时间点收集血浆样本，并通过 LC-MS/MS 分析，以确定 Cmax、AUC 和半衰期。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
目前尚未公布 (R)-CDK2 降解剂 6 的药代动力学数据。然而，基于被描述为“口服活性”的消旋 CDK2 降解剂 6（化合物 6），预计其具有良好的药代动力学特性。该消旋化合物可能具有中等的口服生物利用度（F% ~20-50%），血浆峰浓度 (Cmax) 在 1-2 小时内达到（Tmax），消除半衰期 (t½) 为数小时，足以满足每日一次给药的需求。(R)-对映体可能由于代谢清除率的差异而具有更长的半衰期，但具体数据（清除率、分布容积、蛋白结合率、代谢稳定性）尚不可用。其分子量为 511.44，处于口服小分子药物的典型分子量范围内。作为一种 PROTAC，其分子量高于传统抑制剂，但仍可能达到口服生物利用度。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
尚未有关于 (R)-CDK2 降解剂 6 的具体毒性数据报道。对于母体化合物 CDK2 降解剂 6（外消旋体），小鼠临床前毒性研究表明，在有效剂量下（例如，每日口服 100 mg/kg，持续 21 天）耐受性良好，未观察到明显的体重减轻或不良反应。未报道剂量限制性毒性 (DLT)。对于该降解剂，尚未详细说明 CDK 抑制剂常见的安全性问题（例如，中性粒细胞减少症、骨髓抑制）。尚未公开标准安全药理学研究（hERG 试验、Ames 试验、体内毒理学）。该化合物应作为潜在危险化学品处理：避免吸入、摄入和皮肤接触。在通风良好的区域使用个人防护装备（手套、实验服）。MSDS 建议采取研究化学品的标准预防措施。目前尚无慢性毒性或致癌性数据。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
(R)-CDK2降解剂6（化合物7）是CDK2降解剂6的R对映异构体。CAS号：3083777-50-5。分子式：C23H22F5N5O3。分子量：511.44。纯度：HPLC法测定≥95%。储存：粉末-20℃保存，溶剂-80℃保存1年。运输：蓝冰或常温运输。仅供研究使用，不可用于人体。靶点：CDK2。通路：细胞周期/DNA损伤，PROTAC。DC50：24小时内为27.0 nM。用于乳腺癌研究。专利号：WO2025090727A1。非FDA批准药物。该化合物属于一系列蛋白质降解剂，为靶向CDK2的癌症治疗提供了一种新的方法。外观：固体粉末。溶解度：DMSO 70 mg/mL，乙醇 5 mg/mL。不含 TFA 盐。
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| 分子式 |
C23H22F5N5O3
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|---|---|
| 分子量 |
511.44
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| 精确质量 |
511.164
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| CAS号 |
3083777-50-5
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| 相关CAS号 |
CDK2 degrader 6; (S)-CDK2 degrader 6
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| PubChem CID |
177805742
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| 外观&性状 |
Solid powder
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| tPSA |
100
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| 氢键供体(HBD)数目 |
2
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| 可旋转键数目(RBC) |
5
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| 重原子数目 |
36
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| 分子复杂度/Complexity |
905
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| 定义原子立体中心数目 |
3
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| SMILES |
C[C@@H]1[C@H](CN1C2=CC(=C(C(=C2)F)[C@H]3CCC(=O)NC3=O)F)NC4=NN=C(O4)C56CC(C5)(C6)C(F)(F)F
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| InChi Key |
DYUMYEGVQNMNAQ-HXDJBORHSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C23H22F5N5O3/c1-10-15(29-20-32-31-19(36-20)21-7-22(8-21,9-21)23(26,27)28)6-33(10)11-4-13(24)17(14(25)5-11)12-2-3-16(34)30-18(12)35/h4-5,10,12,15H,2-3,6-9H2,1H3,(H,29,32)(H,30,34,35)/t10-,12-,15+,21?,22?/m1/s1
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| 化学名 |
(3R)-3-[2,6-difluoro-4-[(2R,3S)-2-methyl-3-[[5-[3-(trifluoromethyl)-1-bicyclo[1.1.1]pentanyl]-1,3,4-oxadiazol-2-yl]amino]azetidin-1-yl]phenyl]piperidine-2,6-dione
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month Note: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中（例如氮气下），避免暴露在潮湿环境中。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.9553 mL | 9.7763 mL | 19.5526 mL | |
| 5 mM | 0.3911 mL | 1.9553 mL | 3.9105 mL | |
| 10 mM | 0.1955 mL | 0.9776 mL | 1.9553 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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