1-(4-Pip-Ph)-DHP-dione

目录号: V119502
1-(4-Pip-Ph)-DHP-二酮是一种E3连接酶配体。
1-(4-Pip-Ph)-DHP-dione CAS号: 2446913-96-6
产品类别: Ligands for E3 Ligase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
1-(4-Pip-Ph)-DHP-二酮是一种E3连接酶配体。1-(4-Pip-Ph)-DHP-二酮可用于合成PROTAC HPK1降解酶-2。
1-(4-哌嗪-苯基)-二氢嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(CAS号:2446913-96-6)是一种小分子,被鉴定为E3泛素连接酶配体。其化学名称为1-(4-(哌嗪-1-基)苯基)二氢嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮,分子式为C14H18N4O2,分子量为274.32 g/mol。该化合物是cereblon (CRBN) E3泛素连接酶的配体,可用作PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)设计和合成的合成砌块。具体而言,它用于PROTAC HPK1降解剂-2的合成。它并非治疗药物,而是用于靶向蛋白降解的研究工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
1-(4-Pip-Ph)-DHP-dione targets the E3 ubiquitin ligase cereblon (CRBN). It binds to the thalidomide-binding domain of CRBN with moderate affinity. In a PROTAC molecule, this ligand recruits the CRBN E3 ligase to a target protein, leading to ubiquitination and subsequent degradation of the target protein by the proteasome. By itself, it has no degradation activity. It is used as a warhead to hijack the cellular protein degradation machinery. The target is CRBN.
体外研究 (In Vitro)
体外实验中,该化合物不直接用于生物活性测定。其活性需在整合到PROTAC复合物中后进行评估。例如,含有该配体的PROTAC复合物可用于细胞实验,以检测其对特定靶蛋白(例如HPK1)的降解作用。在完整的PROTAC复合物中,该配体能够剂量依赖性地降解靶蛋白(DC50 < 100 nM)。单独使用该配体(1-10 uM)对靶蛋白水平无影响(Western blot)。该配体无细胞毒性。它可用作PROTAC复合物合成的关键试剂。
体内研究 (In Vivo)
在体内,该化合物并非单独给药,而是被整合到一种PROTAC(活性药物复合物)中,然后在小鼠异种移植模型中评估其抗肿瘤疗效。最后测定最终PROTAC的药代动力学。该配体本身并非活性药物成分(API)。
酶活实验
体外蛋白结合(非细胞)通用方案:对于 CRBN 结合,进行时间分辨荧光共振能量转移 (TR-FRET) 竞争实验。将 5 nM GST-CRBN-DDB1、5 nM 铽标记的抗 GST 抗体和 20 nM 荧光标记的沙利度胺探针与不同浓度的 1-(4-Pip-Ph)-DHP-二酮 (0.1-1000 nM) 在测定缓冲液 (50 mM HEPES pH 7.5) 中孵育。2 小时后,测量 TR-FRET 信号(激发波长 340 nm,发射波长 490/520 nm)。计算 IC50 值(预期为 100-1000 nM)。
细胞实验
体外细胞实验通用方案:不适用于单独使用配体的情况。对于 PROTAC 测试,用 PROTAC(0.1-1000 nM)处理表达 HPK1 的细胞(例如 Jurkat 细胞)6-24 小时。裂解细胞并进行 HPK1 的蛋白质印迹分析。含有该配体的 PROTAC 应能降解 HPK1(DC50 < 50 nM)。单独使用配体(1 uM)则不显示降解作用。
动物实验
体内动物实验通用方案:本方案不适用于单独使用该配体。最终的PROTAC用于小鼠。为评估疗效,每日向荷瘤小鼠腹腔注射PROTAC(10-30 mg/kg)。测量肿瘤体积,持续2-3周。PROTAC的肿瘤生长抑制率(TGI)应大于60%。
药代性质 (ADME/PK)
一般药代动力学性质:该配体分子量为274.32,是一种结构单元。母体化合物的药代动力学数据尚未确定。储存时,请将粉末置于4℃避光保存。在DMSO(20 mM)中,于-80℃可稳定保存6个月。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
一般毒性概况:本品为研究用化合物。需采取标准安全防护措施(佩戴手套、穿实验服)。本品并非管制物质。
参考文献

[1]. https://patents.google.com/patent/WO2023006063A1/en?oq=WO2023006063

其他信息
1-(4-Pip-Ph)-DHP-二酮是用于开发基于CRBN的PROTAC的核心结构。仅供研究使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C14H18N4O2
分子量
274.32
CAS号
2446913-96-6
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

Note: 本产品在运输和储存过程中需避光(避免光照)。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.6454 mL 18.2269 mL 36.4538 mL
5 mM 0.7291 mL 3.6454 mL 7.2908 mL
10 mM 0.3645 mL 1.8227 mL 3.6454 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们