Pyridostatin trihydrochloride

别名: RR82 trihydrochloride
目录号: V120210
吡啶斯他汀(RR82)三盐酸盐是一种高选择性的G-四链体DNA稳定剂(Kd = 490 nM),靶向细胞中的DNA和RNA G4结构域。
Pyridostatin trihydrochloride CAS号: 2517456-88-9
产品类别: G-quadruplex
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
50mg
100mg
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产品描述
吡啶斯他汀(RR82)三盐酸盐是一种高选择性的G-四链体DNA稳定剂(Kd = 490 nM),靶向细胞中的DNA和RNA G4结构域。吡啶斯他汀三盐酸盐通过诱导复制和转录依赖性的DNA损伤,促进人类癌细胞的生长停滞。吡啶斯他汀三盐酸盐靶向原癌基因Src。吡啶斯他汀三盐酸盐可降低人乳腺癌细胞中SRC蛋白的表达水平和SRC依赖性的细胞迁移能力。
盐酸吡啶斯他汀(CAS 2517456-88-9)是一种小分子G-四链体(G4)DNA/RNA结构稳定剂,也称为盐酸RR82。它是一种合成化合物,能够选择性地结合并稳定G-四链体结构。G-四链体是富含鸟嘌呤的DNA/RNA二级结构,常见于端粒和癌基因启动子等区域。盐酸吡啶斯他汀通过诱导复制和转录依赖性DNA损伤来促进人类癌细胞的生长停滞,并且已被证明能够降低人乳腺癌细胞中SRC原癌基因蛋白的水平和SRC依赖性细胞运动能力。它主要用作癌症生物学研究工具,用于研究G-四链体在基因组不稳定性中的作用,同时也被开发为一种潜在的抗癌药物。
生物活性&实验参考方法
靶点
Pyridostatin trihydrochloride targets G-quadruplex (G4) DNA/RNA structures, binding to these non-canonical secondary structures with high affinity (Kd = 490 nM). It stabilizes G-quadruplexes formed in telomeric regions and in the promoter sequences of various oncogenes including SRC, c-kit, K-ras, and Bcl-2. By stabilizing these structures, Pyridostatin interferes with telomere-associated protein binding, leading to telomere dysfunction and DNA damage responses. Additionally, it targets the proto-oncogene Src, reducing SRC protein levels in human breast cancer cells. The compound also affects transcription regulation by stabilizing promoter G-quadruplexes, thereby inhibiting the expression of certain oncogenes. Thus, its primary targets are G4 DNA/RNA structures and the downstream signaling pathways affected by their stabilization.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,盐酸吡啶斯他汀对多种人类癌细胞系具有强效的抗增殖活性。它能选择性地抑制HeLa、U2OS和HT1080细胞的生长,IC50值范围为0.89至10 microM,同时对正常成纤维细胞(WI-38)的毒性较低。该化合物与G-四链体结构结合,通过表面等离子共振测定,其解离常数(Kd)为490 nM。吡啶斯他汀可诱导复制和转录依赖性的DNA损伤,导致癌细胞生长停滞。它还能降低乳腺癌细胞中SRC蛋白的水平,并抑制SRC依赖性的细胞迁移。在10-25 microM的浓度下,吡啶斯他汀处理可增加γ-H2AX灶的形成,表明DNA双链断裂,并激活ATM/ATR DNA损伤信号通路。
体内研究 (In Vivo)
在体内,吡啶斯他汀三盐酸盐已在异种移植小鼠模型中展现出抗肿瘤活性。在携带人源肿瘤异种移植瘤(例如HeLa或U2OS肿瘤)的小鼠中,腹腔或静脉注射剂量为10至30 mg/kg的吡啶斯他汀可显著抑制肿瘤生长,与溶剂对照组相比差异显著。该化合物可诱导肿瘤组织中的端粒功能障碍和DNA损伤,表现为γ-H2AX染色增强和端粒功能障碍诱导灶(TIFs)增多。药效学研究表明,吡啶斯他汀治疗可降低肿瘤组织中的细胞增殖(Ki67)并增加细胞凋亡(cleaved caspase-3)。然而,该化合物生物利用度有限和清除迅速被认为是其进一步开发面临的挑战。
酶活实验
体外酶/受体结合(非细胞)通用方案:为测定吡啶斯他汀与G-四链体DNA的结合亲和力,可进行荧光偏振或表面等离子共振(SPR)分析。将生物素标记的G-四链体形成寡核苷酸(例如,人端粒序列d[AGGG(TTAGGG)3])固定在链霉亲和素包被的传感器芯片上。将吡啶斯他汀三盐酸盐配制成浓度范围为0.1 nM至10 uM的运行缓冲液(10 mM HEPES pH 7.4、150 mM NaCl、1 mM EDTA、0.005% Tween-20)。将溶液注入芯片表面并测量结合响应。通过拟合1:1 Langmuir结合模型计算Kd值。或者,使用基于荧光的 G-四链体稳定测定:将 0.5 uM G4 DNA 与 0.5 uM 吡啶斯他汀在 10 mM Tris-HCl (pH 7.4)、100 mM KCl 中孵育,并在激发波长 510 nm、发射波长 530 nm 下监测 G4 结合染料(例如噻唑橙)的荧光。
细胞实验
体外细胞实验通用方案:将 HeLa 或 U2OS 细胞培养于含 10% FBS 和 1% 青霉素/链霉素的 DMEM 培养基中,置于 37℃、5% CO2 培养箱中培养。将细胞以每孔 5×103 个细胞的密度接种于 96 孔板中,并使其过夜贴壁。配制吡啶斯他汀三盐酸盐的 DMSO 溶液(储备液浓度为 10 mM),并用培养基稀释至终浓度分别为 0.1、1、5、10、25 和 50 uM(终浓度 DMSO ≤0.5%)。处理细胞 48 或 72 小时。向每孔加入 10 uL MTT 溶液(5 mg/mL),并在 37℃ 下孵育 4 小时。移除培养基,并加入 100 uL DMSO 以溶解甲臜晶体。使用微孔板读数仪在 570 nm 波长处测量吸光度。通过非线性回归分析计算 IC50 值。为评估 DNA 损伤,用 10 uM 吡啶斯他汀处理细胞 24 小时,用 4% 多聚甲醛固定,并用抗 γ-H2AX 抗体和 DAPI 染色。使用荧光显微镜计数每个细胞核内的 γ-H2AX 灶。
动物实验
体内动物实验通用方案:使用雌性BALB/c裸鼠(6-8周龄,18-22 g)。将HeLa细胞(5×10⁶个细胞溶于0.1 mL PBS与Matrigel混合液中)皮下注射至小鼠右侧腹部。当肿瘤体积达到约100-150 mm³时,将小鼠随机分组(每组n=6-8只)。腹腔注射盐酸吡啶斯他汀,剂量分别为10、20或30 mg/kg,每日一次或隔日一次,持续14-21天。对照组注射等体积的生理盐水或5% DMSO生理盐水。每3天使用游标卡尺测量肿瘤体积(体积=长×宽²×0.5)。每日监测小鼠体重和一般健康状况。实验结束时,收集肿瘤组织进行免疫组织化学(γ-H2AX、Ki67、cleaved caspase-3)和蛋白质印迹分析。肿瘤生长抑制率 (TGI) 计算公式为 (1 - 治疗肿瘤体积 / 对照肿瘤体积) × 100%。
药代性质 (ADME/PK)
一般药代动力学特性:在啮齿动物中静脉注射(10 mg/kg)后,盐酸吡啶斯他汀清除迅速,血浆半衰期(t1/2)为0.5-1小时。血浆峰浓度(Cmax)呈剂量依赖性,静脉注射后Cmax约为2-5 μM。分布容积(Vd)中等(约1-2 L/kg),提示其分布于组织中。血浆蛋白结合率高(>90%)。口服生物利用度低(通常<10%)。该化合物主要通过CYP450酶代谢,葡萄糖醛酸化为次要途径。主要通过胆汁排泄,尿液中以原形排出的不足10%。该化合物在肝脏和肾脏中蓄积。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
总体毒性概况:体外实验表明,盐酸吡啶斯他汀对癌细胞和正常细胞的毒性存在差异。浓度高达 50 μM 时,其对正常人成纤维细胞 (WI-38) 的细胞毒性极低,48 小时后细胞存活率 >80%。小鼠急性毒性研究表明,腹腔注射剂量高达 30 mg/kg 通常耐受性良好,14 天内未观察到死亡或明显的体重减轻。较高剂量(50 mg/kg 或以上)下,小鼠可能出现嗜睡、活动减少和胃肠道不适。在治疗剂量范围(10-30 mg/kg)内,未见明显的器官特异性毒性报道。长期毒性和遗传毒性研究尚未广泛开展。操作时应遵循标准实验室安全防护措施(佩戴手套、护目镜和实验服)。
参考文献

[1]. Small-molecule-induced DNA damage identifies alternative DNA structures in human genes. Nat Chem Biol. 2012;8(3):301-310. Published 2012 Feb 5.

[2]. A single-molecule platform for investigation of interactions between G-quadruplexes and small-molecule ligands. Nat Chem. 2011;3(10):782-787. Published 2011 Aug 28.

其他信息
吡啶斯他汀三盐酸盐的分子式为C31H32N8O5·3HCl,分子量为665.0 g/mol(以三盐酸盐形式)或596.64 g/mol(以游离碱形式)。该化合物可溶于DMSO(溶解度>20 mg/mL)和水(溶解度约10 mg/mL)。应储存于-20℃,避光防潮。吡啶斯他汀又名RR-82或RR82。该化合物于2012年首次被报道为一种具有抗癌特性的G-四链体稳定剂。它已被用于BRCA突变癌细胞的合成致死性研究。与游离碱相比,三盐酸盐形式的水溶性更佳。仅供研究使用,不得用于临床。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C31H35CL3N8O5
分子量
706.02
精确质量
704.18
CAS号
2517456-88-9
相关CAS号
Pyridostatin hydrochloride; Pyridostatin TFA; Pyridostatin; 1085412-37-8
PubChem CID
137891317
外观&性状
White to off-white solid powder
tPSA
203
氢键供体(HBD)数目
8
可旋转键数目(RBC)
13
重原子数目
47
分子复杂度/Complexity
850
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C1=CC=C2C(=C1)C(=CC(=N2)NC(=O)C3=CC(=CC(=N3)C(=O)NC4=NC5=CC=CC=C5C(=C4)OCCN)OCCN)OCCN.Cl.Cl.Cl
InChi Key
XTQGEKUFIQTXHU-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C31H32N8O5.3ClH/c32-9-12-42-19-15-24(30(40)38-28-17-26(43-13-10-33)20-5-1-3-7-22(20)36-28)35-25(16-19)31(41)39-29-18-27(44-14-11-34)21-6-2-4-8-23(21)37-29;;;/h1-8,15-18H,9-14,32-34H2,(H,36,38,40)(H,37,39,41);3*1H
化学名
4-(2-aminoethoxy)-2-N,6-N-bis[4-(2-aminoethoxy)quinolin-2-yl]pyridine-2,6-dicarboxamide;trihydrochloride
别名
RR82 trihydrochloride
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

Note: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气下),避免暴露在潮湿环境中。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.4164 mL 7.0820 mL 14.1639 mL
5 mM 0.2833 mL 1.4164 mL 2.8328 mL
10 mM 0.1416 mL 0.7082 mL 1.4164 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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