Pyridostatin

别名: Pyridostatin; 1085412-37-8; Pyridostain; 4-(2-Aminoethoxy)-N2,N6-bis(4-(2-aminoethoxy)quinolin-2-yl)pyridine-2,6-dicarboxamide; RR-82; RR 82; 4-(2-aminoethoxy)-2-N,6-N-bis[4-(2-aminoethoxy)quinolin-2-yl]pyridine-2,6-dicarboxamide; RR82 hydrochloride; 4-(2-氨基乙氧基)-N2,N6-二[4-(2-氨基乙氧基)-2-喹啉基]-2,6-吡啶二甲酰胺
目录号: V8257 纯度: ≥98%
Pyridostatin (RR82) 是一种 G-四链体 (G4) 稳定剂,在无细胞测定中 Kd 为 490 nM,其靶向一系列原癌基因,包括 c-kit、K-ras 和 Bcl-2。
Pyridostatin CAS号: 1085412-37-8
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
50mg
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  • Pyridostatin hydrochloride
  • Pyridostatin 三氟乙酸盐
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纯度: ≥98%

产品描述
Pyridostatin (RR82) 是一种 G-四链体 (G4) 稳定剂,在无细胞测定中 Kd 为 490 nM,其靶向一系列原癌基因,包括 c-kit、K-ras 和 Bcl-2。吡啶抑素可降低 MRC-5–SV40 细胞和各种癌细胞系的增殖,并通过 DNA 损伤检查点激活诱导细胞周期停滞。 Pyridostatin 还通过与 SRC 中的 G-四联体基序相互作用,降低 MDA-MB-231 细胞中 SRC 依赖性细胞运动。
生物活性&实验参考方法
靶点
G-quadruplexe ( Kd = 490 nM )
体外研究 (In Vitro)
吡格菌素 (RR82)(10 μM;48 小时)可诱导细胞周期停滞 [1]。一种名为吡啶球蛋白的微小化学物质选择性地与 DNA 中的 G-四链体结构结合,与其形成复合物以稳定 DNA。哌啶他汀会引起剂量依赖性神经元死亡、神经突回缩和突触丧失。在培养的原代神经元中,吡格菌素会导致 DNA 双链断裂。值得注意的是,BRCA1 蛋白(保护和修复神经元基因组)会被吡啶球蛋白(1-5 μM,过夜)转录下调 [3]。
体内研究 (In Vivo)
Pyridostatin对BRCA2缺陷异种移植物具有抗肿瘤活性[4]
结合和稳定G4s的化合物已被证明对小鼠建立的BRCA1/2缺失异种移植物肿瘤有活性(RHPS4和CX‐5461)。然而,这些尚未被证明对BRCA突变患者有益。此外,BRCA突变的肿瘤很难治疗,因为它们对靶向治疗(例如PARP抑制剂;PARPi)。因此,必须找到新的G4配体,不仅可以消除BRCA缺陷肿瘤,还可以抵抗耐药疾病。我们之前发表的结果(Zimmer et al, 2016)表明,G4配体pyridostatin对体外BRCA2缺陷细胞具有特异性毒性。在这项研究中,研究人员评估了pyridostatin在体内消除BRCA2缺陷异种移植物肿瘤中的潜力。为了解决这个问题,我们使用等基因BRCA2 +/+ (BRCA2‐精通)和BRCA2−/−(BRCA2‐缺乏)人结直肠癌DLD1细胞在CB17‐SCID小鼠中产生异种移植物(图1A和B)。研究人员广泛优化了pyridostatin在体内使用的条件,并确定了7.5 mg/kg/天的剂量计划静脉注射连续5天,然后休息2天,第二个5天的治疗耐受性良好。没有明显的体重减轻,没有不良的临床症状(附录表S1)。在这些条件下,研究人员发现pyridostatin有效且特异性地抑制BRCA2‐缺陷DLD1细胞建立的异种移植物肿瘤的生长(图1B)。作为对照,研究人员使用了PARPi talazoparib,该药物以其根除小鼠BRCA1/2缺失肿瘤的能力而闻名(Shen et al ., 2013),最近被许可用于携带BRCA1/2种系突变的转移性乳腺癌患者(Litton et al ., 2018)。pyridostatin对BRCA2 -缺陷肿瘤的抗肿瘤作用与talazoparib相似,两种药物都不会损害BRCA2 -精通肿瘤的生长。
此外,研究人员使用第二种肿瘤模型研究了pyridostatin在体内的反应,该模型是由等基因BRCA2 +/+和BRCA2 - / -结直肠癌HCT116细胞建立的(Xu et al ., 2014)。Pyridostatin显示出对BRCA2缺失HCT116细胞源性肿瘤的选择性毒性(附录图S1A和B;附录表S2),其作用与DLD1细胞来源的异种移植物相似[4]
研究人员之前的研究表明,pyridostatin治疗会导致HR修复受损的细胞(包括BRCA2缺陷细胞)中DNA损伤的积累(Zimmer等,2016)。一致地,免疫组织化学(IHC)分析显示,BRCA2‐缺乏,但不是BRCA2‐完全,肿瘤在暴露于pyridostatin或talazoparib时显示出DNA损伤标记γH2AX水平增加(附录图S1C-F)。这些结果表明,pyridostatin不仅可以特异性抑制细胞的生长(Zimmer等,2016),还可以特异性抑制缺乏BRCA2的肿瘤,并通过造成DNA损伤在体内起作用[4]。
细胞实验
细胞活力测定 [1]
细胞类型:超过 60 种不同的癌细胞系
测试浓度: 10 μM
孵育时间: 48小时
实验结果:主要在60多种不同癌细胞系的细胞周期G2期积累。
动物实验
CB17-SCID 小鼠
\n7.5 mg/kg
\ni.v.
\n\n体内异种移植实验[4]
\nCB17-SCID 小鼠(CB17/Icr-Prkdcscid/IcrIcoCrl,雄性或雌性)和 FVB 雌性小鼠购自 Charles River Laboratories。小鼠饲养于高效空气微粒过滤器 (HEPA) 过滤的笼架中,并喂以高压灭菌的实验室啮齿动物饲料。[4]
\n\n为了构建源自 DLD1 和 HCT116 BRCA2 功能正常或缺陷细胞的异种移植模型,将 5 × 10⁶ 个细胞/只注射到 6 周龄 CB17-SCID 雄性小鼠的后腿肌肉中。当肿瘤体积达到约 250 mm³ 时,将小鼠随机分组开始治疗。[4]
\n\n为了构建 PARP 抑制剂耐药小鼠肿瘤模型,将 4 × 10⁶ 个 KP3.33 (Brca1 +/+) 细胞或 KB1PM5 (Brca1 −/− Tp53bp1 −/−) 小鼠乳腺肿瘤细胞肌内注射到 6 周龄 FVB 雌性小鼠的后肢肌肉中。每个实验组包含 5 只小鼠。当肿瘤体积达到约 250 mm³ 时,将小鼠随机分组并开始治疗。[4]
\n\n为了构建 MDA-MB-436 细胞来源的异种移植瘤,将 4 × 10⁶ 个细胞肌内注射到 6 周龄 CB17-SCID 雌性小鼠的后肢肌肉中。当肿瘤体积达到约 220 mm³ 时(细胞注射后 6 天),开始治疗。每个实验组包含五只小鼠。[4]
\n\nTalazoparib(BMN 673,Selleckchem)溶于10%二甲基乙酰胺、6% HS溶液和84% PBS中,以0.33 mg/kg/天的剂量口服给药,连续给药五天,然后停药两天,再给药五天(Wang et al, 2016)。吡啶斯他汀溶于生理盐水中,以7.5 mg/kg/天的剂量静脉注射给药,连续给药五天,然后停药两天,再给药五天。 NU-7441(Selleckchem)溶于5% DMSO、40% PEG300和5% Tween-80的混合溶液中,以10 mg/kg/天的剂量腹腔注射,连续给药5天,之后停药2天,再继续给药5天(Zhao等,2006)。紫杉醇溶于生理盐水中,于治疗的第1天和第8天以20 mg/kg/天的剂量静脉注射(Bizzaro等,2018)。与其他化合物联合用药时,紫杉醇于治疗的第5天和第12天静脉注射,吡啶斯他汀和NU-7441分别静脉注射和腹腔注射,连续给药4天,之后停药3天,再继续给药4天。 NU-7441 在给予吡啶斯他汀前 2 小时给药。在指定时间点,使用游标卡尺测量肿瘤的二维体积,并根据肿瘤体积估算肿瘤重量(1 mg = 1 mm³)。采用学生 t 检验(非配对,双尾)进行单组两两比较。当 P < 0.05 时,差异被认为具有统计学意义。小鼠的生存曲线采用 Kaplan-Meier 法绘制,并使用对数秩检验评估统计学意义。数据采用 GraphPad Prism 8.3 软件绘制。[4]
\n\nPDTX 模型构建[4]
\n前瞻性地收集了携带 gBRCA 基因的乳腺癌患者的新鲜肿瘤样本,用于在机构伦理审查委员会 (IRB) 批准的方案和相关知情同意书下,或由剑桥郡国家研究伦理服务中心 (REC) 批准(REC 参考编号:08/H0308/178)(Bruna 等,2016)移植到小鼠体内。\n\nVHI0179 患者来源肿瘤异种移植模型 (PDTX) 由携带 BRCA1 种系截断且因 REV7 突变而对奥拉帕尼耐药的患者乳腺肿瘤构建而成。所有患者均签署了书面知情同意书,实验符合世界医学协会《赫尔辛基宣言》和美国卫生与公众服务部《贝尔蒙特报告》中规定的原则。将冷冻肿瘤组织块(15–20 mm³)包被Matrigel基质胶后,通过腰背部一侧皮下切口植入一只6周龄CB17-SCID雌性小鼠体内。当肿瘤体积达到约400 mm³时,将肿瘤从处死的小鼠体内取出,切成约15–20 mm³的组织块,再次皮下植入14只CB17-SCID雌性小鼠体内。当肿瘤体积达到约200 mm³时,将小鼠随机分为载体组和治疗组,开始治疗。每个实验组包含7只小鼠。
参考文献

[1]. Small-molecule-induced DNA damage identifies alternative DNA structures in human genes. Nat Chem Biol. 2012;8(3):301-310. Published 2012 Feb 5.

[2]. A single-molecule platform for investigation of interactions between G-quadruplexes and small-molecule ligands. Nat Chem. 2011;3(10):782-787. Published 2011 Aug 28.

[3]. The G-quadruplex DNA stabilizing drug pyridostatin promotes DNA damage and downregulates transcription of Brca1 in neurons. Aging (Albany NY). 2017;9(9):1957-1970.

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C35H34N10O7
分子量
706.70726
精确质量
596.249
CAS号
1085412-37-8
相关CAS号
Pyridostatin hydrochloride;1781882-65-2; 1472611-44-1 (TFA salt)
PubChem CID
25227847
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
密度
1.4±0.1 g/cm3
沸点
753.8±60.0 °C at 760 mmHg
闪点
409.7±32.9 °C
蒸汽压
0.0±2.5 mmHg at 25°C
折射率
1.726
LogP
0.59
tPSA
202.62
氢键供体(HBD)数目
5
氢键受体(HBA)数目
11
可旋转键数目(RBC)
13
重原子数目
44
分子复杂度/Complexity
850
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
VGHSATQVJCTKEF-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C31H32N8O5/c32-9-12-42-19-15-24(30(40)38-28-17-26(43-13-10-33)20-5-1-3-7-22(20)36-28)35-25(16-19)31(41)39-29-18-27(44-14-11-34)21-6-2-4-8-23(21)37-29/h1-8,15-18H,9-14,32-34H2,(H,36,38,40)(H,37,39,41)
化学名
4-(2-aminoethoxy)-2-N,6-N-bis[4-(2-aminoethoxy)quinolin-2-yl]pyridine-2,6-dicarboxamide
别名
Pyridostatin; 1085412-37-8; Pyridostain; 4-(2-Aminoethoxy)-N2,N6-bis(4-(2-aminoethoxy)quinolin-2-yl)pyridine-2,6-dicarboxamide; RR-82; RR 82; 4-(2-aminoethoxy)-2-N,6-N-bis[4-(2-aminoethoxy)quinolin-2-yl]pyridine-2,6-dicarboxamide; RR82 hydrochloride;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.4150 mL 7.0750 mL 14.1501 mL
5 mM 0.2830 mL 1.4150 mL 2.8300 mL
10 mM 0.1415 mL 0.7075 mL 1.4150 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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